MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 51517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016052	AGA	2	6	185842	185847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516338
4003	NC_016052	AGA	2	6	185887	185892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516338
4004	NC_016052	A	6	6	185992	185997	100 %	0 %	0 %	0 %	352516338
4005	NC_016052	A	6	6	186216	186221	100 %	0 %	0 %	0 %	352516338
4006	NC_016052	A	6	6	186251	186256	100 %	0 %	0 %	0 %	352516338
4007	NC_016052	AGG	2	6	186289	186294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352516338
4008	NC_016052	AGA	2	6	186301	186306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516338
4009	NC_016052	A	6	6	186330	186335	100 %	0 %	0 %	0 %	352516338
4010	NC_016052	A	6	6	186347	186352	100 %	0 %	0 %	0 %	352516338
4011	NC_016052	AAACA	2	10	186606	186615	80 %	0 %	0 %	20 %	352516339
4012	NC_016052	TGA	2	6	186625	186630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516339
4013	NC_016052	GCG	2	6	186641	186646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352516339
4014	NC_016052	A	6	6	186656	186661	100 %	0 %	0 %	0 %	352516339
4015	NC_016052	TAG	2	6	186669	186674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516339
4016	NC_016052	CGTTG	2	10	186820	186829	0 %	40 %	40 %	20 %	352516339
4017	NC_016052	TACT	2	8	186856	186863	25 %	50 %	0 %	25 %	352516339
4018	NC_016052	CAAA	2	8	186890	186897	75 %	0 %	0 %	25 %	352516339
4019	NC_016052	ATTT	2	8	186903	186910	25 %	75 %	0 %	0 %	352516339
4020	NC_016052	AAG	2	6	186915	186920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516339
4021	NC_016052	TTTC	2	8	186942	186949	0 %	75 %	0 %	25 %	352516339
4022	NC_016052	A	6	6	186986	186991	100 %	0 %	0 %	0 %	352516339
4023	NC_016052	GAT	2	6	187100	187105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516339
4024	NC_016052	CAA	2	6	187110	187115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516339
4025	NC_016052	CAA	2	6	187208	187213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516339
4026	NC_016052	ATT	2	6	187296	187301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516339
4027	NC_016052	A	7	7	187327	187333	100 %	0 %	0 %	0 %	352516339
4028	NC_016052	GCT	2	6	187346	187351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516339
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4030	NC_016052	GCTG	2	8	187390	187397	0 %	25 %	50 %	25 %	352516339
4031	NC_016052	TGA	2	6	187411	187416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516339
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4033	NC_016052	TGA	2	6	187453	187458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516339
4034	NC_016052	AGC	2	6	187468	187473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516339
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4036	NC_016052	GCT	2	6	187544	187549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516339
4037	NC_016052	GAA	2	6	187556	187561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516339
4038	NC_016052	A	7	7	187591	187597	100 %	0 %	0 %	0 %	352516339
4039	NC_016052	GCT	3	9	187598	187606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516339
4040	NC_016052	GATTTT	2	12	187700	187711	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	352516340
4041	NC_016052	ATTG	2	8	187765	187772	25 %	50 %	25 %	0 %	352516340
4042	NC_016052	AATA	2	8	187829	187836	75 %	25 %	0 %	0 %	352516340
4043	NC_016052	CGT	2	6	187856	187861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516340
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4046	NC_016052	ATTG	2	8	187996	188003	25 %	50 %	25 %	0 %	352516340
4047	NC_016052	AAG	2	6	188004	188009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516340
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4049	NC_016052	GTTA	2	8	188099	188106	25 %	50 %	25 %	0 %	352516340
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4052	NC_016052	TGG	2	6	188268	188273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516340
4053	NC_016052	ACG	2	6	188342	188347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516340
4054	NC_016052	CA	4	8	188353	188360	50 %	0 %	0 %	50 %	352516340
4055	NC_016052	GTG	2	6	188379	188384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516340
4056	NC_016052	A	7	7	188416	188422	100 %	0 %	0 %	0 %	352516340
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4058	NC_016052	GAT	2	6	188510	188515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516340
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4060	NC_016052	AGC	2	6	188673	188678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516340
4061	NC_016052	TAAA	2	8	188703	188710	75 %	25 %	0 %	0 %	352516340
4062	NC_016052	AAAGAA	2	12	188795	188806	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	352516340
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4064	NC_016052	AAG	2	6	188880	188885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516340
4065	NC_016052	ACTG	2	8	188896	188903	25 %	25 %	25 %	25 %	352516340
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4067	NC_016052	GTT	2	6	189111	189116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516341
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4070	NC_016052	TAT	2	6	189236	189241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516341
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4072	NC_016052	TGG	2	6	189400	189405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516341
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4075	NC_016052	GTG	2	6	189466	189471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516341
4076	NC_016052	TTTG	2	8	189486	189493	0 %	75 %	25 %	0 %	352516341
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4079	NC_016052	GAT	2	6	189570	189575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516341
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4081	NC_016052	TAATGA	2	12	189714	189725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	352516342
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4085	NC_016052	A	6	6	190329	190334	100 %	0 %	0 %	0 %	352516343
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4088	NC_016052	CTT	2	6	190413	190418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516343
4089	NC_016052	TTA	2	6	190521	190526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516343
4090	NC_016052	ATT	2	6	190597	190602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516343
4091	NC_016052	ATG	2	6	190614	190619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516343
4092	NC_016052	TACAG	2	10	190672	190681	40 %	20 %	20 %	20 %	352516343
4093	NC_016052	TGA	2	6	190692	190697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516343
4094	NC_016052	TGG	2	6	190725	190730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516343
4095	NC_016052	CCT	2	6	190746	190751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352516343
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4097	NC_016052	TAT	2	6	190818	190823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516343
4098	NC_016052	GAT	2	6	190841	190846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516343
4099	NC_016052	GTA	2	6	190973	190978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516343
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4101	NC_016052	GTTT	2	8	191013	191020	0 %	75 %	25 %	0 %	352516343
4102	NC_016052	ATG	2	6	191067	191072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516343
4103	NC_016052	ATG	2	6	191105	191110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516343
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4105	NC_016052	TGT	2	6	191236	191241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516343
4106	NC_016052	TATTT	2	10	191249	191258	20 %	80 %	0 %	0 %	352516343
4107	NC_016052	AAT	2	6	191294	191299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516343
4108	NC_016052	ATT	2	6	191327	191332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516343
4109	NC_016052	ATG	2	6	191333	191338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516343
4110	NC_016052	TGG	2	6	191448	191453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516343
4111	NC_016052	CAA	2	6	191487	191492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516343
4112	NC_016052	A	7	7	191571	191577	100 %	0 %	0 %	0 %	352516344
4113	NC_016052	AAG	2	6	191597	191602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516344
4114	NC_016052	AAG	2	6	191624	191629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516344
4115	NC_016052	AAC	2	6	191642	191647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516344
4116	NC_016052	GA	3	6	191661	191666	50 %	0 %	50 %	0 %	352516344
4117	NC_016052	T	6	6	191689	191694	0 %	100 %	0 %	0 %	352516344
4118	NC_016052	AGATA	2	10	191733	191742	60 %	20 %	20 %	0 %	352516344
4119	NC_016052	GAA	2	6	191758	191763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516344
4120	NC_016052	CAT	2	6	191876	191881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516344
4121	NC_016052	A	7	7	191897	191903	100 %	0 %	0 %	0 %	352516344
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4123	NC_016052	TCT	2	6	192102	192107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516345
4124	NC_016052	ATG	2	6	192145	192150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516345
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4127	NC_016052	TCG	2	6	192293	192298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516346
4128	NC_016052	CTT	2	6	192324	192329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516346
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4360	NC_016052	A	7	7	205519	205525	100 %	0 %	0 %	0 %	352516359
4361	NC_016052	GATCG	2	10	205566	205575	20 %	20 %	40 %	20 %	352516359
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4364	NC_016052	TAC	2	6	205646	205651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516359
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4368	NC_016052	ATT	2	6	205797	205802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516359
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4372	NC_016052	CT	3	6	206018	206023	0 %	50 %	0 %	50 %	352516360
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4397	NC_016052	A	6	6	208846	208851	100 %	0 %	0 %	0 %	352516365
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4401	NC_016052	TA	3	6	209147	209152	50 %	50 %	0 %	0 %	352516365
4402	NC_016052	TGAA	2	8	209174	209181	50 %	25 %	25 %	0 %	352516365
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4405	NC_016052	AAATGA	2	12	209352	209363	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	352516365
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4483	NC_016052	GTAA	2	8	213246	213253	50 %	25 %	25 %	0 %	352516369
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4489	NC_016052	A	6	6	213412	213417	100 %	0 %	0 %	0 %	352516369
4490	NC_016052	AGT	2	6	213452	213457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516369
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4492	NC_016052	T	6	6	213485	213490	0 %	100 %	0 %	0 %	352516369
4493	NC_016052	AAT	2	6	213534	213539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516369
4494	NC_016052	ATCTG	2	10	213848	213857	20 %	40 %	20 %	20 %	352516370
4495	NC_016052	GCC	2	6	213874	213879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352516370
4496	NC_016052	GTT	2	6	213906	213911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516370
4497	NC_016052	ATC	2	6	214090	214095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516370
4498	NC_016052	CAG	2	6	214206	214211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516370
4499	NC_016052	CTT	2	6	214215	214220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516370
4500	NC_016052	TCA	2	6	214293	214298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516370

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