MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 51517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_016052	AATA	2	8	2113971	2113978	75 %	25 %	0 %	0 %	352518283
43003	NC_016052	TAA	2	6	2113986	2113991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518283
43004	NC_016052	CCA	2	6	2114008	2114013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352518283
43005	NC_016052	TAA	2	6	2114058	2114063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518283
43006	NC_016052	GTC	2	6	2114230	2114235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518283
43007	NC_016052	TTC	2	6	2114249	2114254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518283
43008	NC_016052	A	6	6	2114763	2114768	100 %	0 %	0 %	0 %	352518284
43009	NC_016052	CAG	2	6	2114827	2114832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518284
43010	NC_016052	CG	3	6	2114941	2114946	0 %	0 %	50 %	50 %	352518284
43011	NC_016052	CTT	2	6	2115001	2115006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518284
43012	NC_016052	TCTT	2	8	2115032	2115039	0 %	75 %	0 %	25 %	352518284
43013	NC_016052	TCA	2	6	2115063	2115068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518284
43014	NC_016052	TTC	2	6	2115083	2115088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518284
43015	NC_016052	TCC	2	6	2115105	2115110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352518284
43016	NC_016052	T	6	6	2115145	2115150	0 %	100 %	0 %	0 %	352518284
43017	NC_016052	ACT	2	6	2115602	2115607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518285
43018	NC_016052	CAG	2	6	2115610	2115615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518285
43019	NC_016052	A	8	8	2115617	2115624	100 %	0 %	0 %	0 %	352518285
43020	NC_016052	CAA	2	6	2115667	2115672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352518285
43021	NC_016052	GAAAAA	2	12	2115715	2115726	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	352518285
43022	NC_016052	A	7	7	2115722	2115728	100 %	0 %	0 %	0 %	352518285
43023	NC_016052	TGG	2	6	2115773	2115778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352518285
43024	NC_016052	ATT	2	6	2115799	2115804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518285
43025	NC_016052	TTA	2	6	2115811	2115816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518285
43026	NC_016052	TAA	2	6	2115854	2115859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518285
43027	NC_016052	TAT	2	6	2115867	2115872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518285
43028	NC_016052	A	6	6	2115889	2115894	100 %	0 %	0 %	0 %	352518285
43029	NC_016052	AAG	2	6	2116136	2116141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352518285
43030	NC_016052	TAG	2	6	2116173	2116178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518285
43031	NC_016052	CT	3	6	2116179	2116184	0 %	50 %	0 %	50 %	352518285
43032	NC_016052	CG	3	6	2116198	2116203	0 %	0 %	50 %	50 %	352518285
43033	NC_016052	AAAC	2	8	2116279	2116286	75 %	0 %	0 %	25 %	352518285
43034	NC_016052	TAC	2	6	2116340	2116345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518285
43035	NC_016052	TTTGG	2	10	2116382	2116391	0 %	60 %	40 %	0 %	352518285
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43037	NC_016052	TTGCTG	2	12	2116451	2116462	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	352518285
43038	NC_016052	ACA	2	6	2116530	2116535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352518285
43039	NC_016052	TAT	2	6	2116539	2116544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518285
43040	NC_016052	CAA	2	6	2116577	2116582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352518285
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43042	NC_016052	TCC	2	6	2116646	2116651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352518285
43043	NC_016052	A	6	6	2116658	2116663	100 %	0 %	0 %	0 %	352518285
43044	NC_016052	AAT	2	6	2116669	2116674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518285
43045	NC_016052	AT	3	6	2116721	2116726	50 %	50 %	0 %	0 %	352518285
43046	NC_016052	AGA	2	6	2116758	2116763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352518285
43047	NC_016052	A	7	7	2116831	2116837	100 %	0 %	0 %	0 %	352518285
43048	NC_016052	TGA	2	6	2116860	2116865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518285
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43050	NC_016052	ATG	2	6	2116916	2116921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518285
43051	NC_016052	GGC	2	6	2116942	2116947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352518285
43052	NC_016052	GATGT	2	10	2116951	2116960	20 %	40 %	40 %	0 %	352518285
43053	NC_016052	TAG	2	6	2116982	2116987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518285
43054	NC_016052	ATT	2	6	2117024	2117029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518285
43055	NC_016052	TAA	2	6	2117030	2117035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518285
43056	NC_016052	TCGAG	2	10	2117053	2117062	20 %	20 %	40 %	20 %	352518285
43057	NC_016052	A	7	7	2117089	2117095	100 %	0 %	0 %	0 %	352518285
43058	NC_016052	AAAAG	2	10	2117106	2117115	80 %	0 %	20 %	0 %	352518285
43059	NC_016052	TGA	3	9	2117124	2117132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518285
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43066	NC_016052	TTG	2	6	2117417	2117422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352518285
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43071	NC_016052	A	7	7	2117628	2117634	100 %	0 %	0 %	0 %	352518285
43072	NC_016052	ATT	2	6	2117671	2117676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518285
43073	NC_016052	TTTG	2	8	2117682	2117689	0 %	75 %	25 %	0 %	352518285
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43077	NC_016052	TACAG	2	10	2117924	2117933	40 %	20 %	20 %	20 %	352518285
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43085	NC_016052	TTAT	2	8	2118215	2118222	25 %	75 %	0 %	0 %	352518285
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43089	NC_016052	CAA	2	6	2118583	2118588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352518286
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43092	NC_016052	CAAT	2	8	2118723	2118730	50 %	25 %	0 %	25 %	352518286
43093	NC_016052	T	7	7	2118786	2118792	0 %	100 %	0 %	0 %	352518286
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43101	NC_016052	AT	3	6	2119155	2119160	50 %	50 %	0 %	0 %	352518286
43102	NC_016052	ATC	2	6	2119217	2119222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518286
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43111	NC_016052	GTTT	2	8	2119688	2119695	0 %	75 %	25 %	0 %	352518286
43112	NC_016052	CTG	2	6	2119699	2119704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518286
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43115	NC_016052	T	6	6	2119863	2119868	0 %	100 %	0 %	0 %	352518286
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43117	NC_016052	ATA	2	6	2119904	2119909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518286
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43227	NC_016052	AGT	2	6	2125776	2125781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352518291
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43230	NC_016052	TTC	2	6	2125924	2125929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518291
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43232	NC_016052	TGT	2	6	2125953	2125958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352518292
43233	NC_016052	GCA	2	6	2125981	2125986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518292
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43462	NC_016052	T	6	6	2136319	2136324	0 %	100 %	0 %	0 %	352518299
43463	NC_016052	T	7	7	2136334	2136340	0 %	100 %	0 %	0 %	352518299
43464	NC_016052	CAT	2	6	2136512	2136517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518300
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43470	NC_016052	CTT	2	6	2136794	2136799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518300
43471	NC_016052	TCCA	2	8	2136816	2136823	25 %	25 %	0 %	50 %	352518300
43472	NC_016052	TTC	2	6	2136825	2136830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518300
43473	NC_016052	TAA	2	6	2136864	2136869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518300
43474	NC_016052	TAT	2	6	2136875	2136880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352518300
43475	NC_016052	TG	3	6	2136928	2136933	0 %	50 %	50 %	0 %	352518300
43476	NC_016052	TTTC	2	8	2136977	2136984	0 %	75 %	0 %	25 %	352518300
43477	NC_016052	TCA	2	6	2137081	2137086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518300
43478	NC_016052	ATC	2	6	2137110	2137115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518300
43479	NC_016052	TGCT	2	8	2137155	2137162	0 %	50 %	25 %	25 %	352518300
43480	NC_016052	TCC	2	6	2137167	2137172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352518300
43481	NC_016052	T	6	6	2137230	2137235	0 %	100 %	0 %	0 %	352518300
43482	NC_016052	TAA	2	6	2137276	2137281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518301
43483	NC_016052	AAC	2	6	2137321	2137326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352518301
43484	NC_016052	TTG	2	6	2137342	2137347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352518301
43485	NC_016052	AAT	2	6	2137360	2137365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518301
43486	NC_016052	TCA	2	6	2137412	2137417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518301
43487	NC_016052	CCATCG	2	12	2137437	2137448	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	352518301
43488	NC_016052	GTT	2	6	2137467	2137472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352518301
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43490	NC_016052	TGC	2	6	2137502	2137507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352518301
43491	NC_016052	GCA	2	6	2137532	2137537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352518301
43492	NC_016052	TCT	2	6	2137541	2137546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518301
43493	NC_016052	T	6	6	2137549	2137554	0 %	100 %	0 %	0 %	352518301
43494	NC_016052	TCT	2	6	2137571	2137576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352518301
43495	NC_016052	AAT	2	6	2137631	2137636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518301
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43497	NC_016052	CTA	2	6	2137659	2137664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352518301
43498	NC_016052	TAA	2	6	2137711	2137716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352518301
43499	NC_016052	A	6	6	2137715	2137720	100 %	0 %	0 %	0 %	352518301
43500	NC_016052	CAA	2	6	2137791	2137796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352518301

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