MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 51517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016052	CAA	2	6	162817	162822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516317
3502	NC_016052	A	6	6	162857	162862	100 %	0 %	0 %	0 %	352516317
3503	NC_016052	TGA	2	6	162897	162902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516317
3504	NC_016052	A	8	8	162905	162912	100 %	0 %	0 %	0 %	352516317
3505	NC_016052	A	7	7	162941	162947	100 %	0 %	0 %	0 %	352516317
3506	NC_016052	GAA	2	6	162967	162972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516317
3507	NC_016052	AAAG	2	8	162994	163001	75 %	0 %	25 %	0 %	352516317
3508	NC_016052	A	6	6	163067	163072	100 %	0 %	0 %	0 %	352516317
3509	NC_016052	A	8	8	163076	163083	100 %	0 %	0 %	0 %	352516317
3510	NC_016052	T	7	7	163132	163138	0 %	100 %	0 %	0 %	352516317
3511	NC_016052	TTA	2	6	163168	163173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516317
3512	NC_016052	TAT	2	6	163188	163193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516317
3513	NC_016052	AAGAAA	2	12	163226	163237	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	352516317
3514	NC_016052	T	6	6	163252	163257	0 %	100 %	0 %	0 %	352516317
3515	NC_016052	AAC	2	6	163286	163291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516317
3516	NC_016052	CCA	2	6	163294	163299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352516317
3517	NC_016052	TCGA	2	8	163315	163322	25 %	25 %	25 %	25 %	352516317
3518	NC_016052	TTC	2	6	163323	163328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516317
3519	NC_016052	AGAA	2	8	163395	163402	75 %	0 %	25 %	0 %	352516317
3520	NC_016052	AGA	2	6	163434	163439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516317
3521	NC_016052	TAA	2	6	163454	163459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516317
3522	NC_016052	TAC	2	6	163461	163466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516317
3523	NC_016052	A	8	8	163474	163481	100 %	0 %	0 %	0 %	352516317
3524	NC_016052	GGA	2	6	163507	163512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352516317
3525	NC_016052	CT	3	6	163520	163525	0 %	50 %	0 %	50 %	352516317
3526	NC_016052	TGCT	2	8	163556	163563	0 %	50 %	25 %	25 %	352516317
3527	NC_016052	TTG	2	6	163568	163573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516317
3528	NC_016052	TG	3	6	163582	163587	0 %	50 %	50 %	0 %	352516317
3529	NC_016052	TTG	2	6	163597	163602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516317
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3532	NC_016052	GAA	3	9	163699	163707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516317
3533	NC_016052	CAA	2	6	163723	163728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516317
3534	NC_016052	A	6	6	163736	163741	100 %	0 %	0 %	0 %	352516317
3535	NC_016052	ATG	2	6	163747	163752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516317
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3537	NC_016052	AGA	2	6	163851	163856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516317
3538	NC_016052	TCT	2	6	163858	163863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516317
3539	NC_016052	A	6	6	163895	163900	100 %	0 %	0 %	0 %	352516317
3540	NC_016052	A	6	6	163984	163989	100 %	0 %	0 %	0 %	352516317
3541	NC_016052	CAA	2	6	164029	164034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516317
3542	NC_016052	ACAA	2	8	164064	164071	75 %	0 %	0 %	25 %	352516317
3543	NC_016052	AAG	2	6	164072	164077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516317
3544	NC_016052	A	8	8	164180	164187	100 %	0 %	0 %	0 %	352516317
3545	NC_016052	AGA	2	6	164199	164204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516317
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3549	NC_016052	GAA	2	6	164326	164331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516317
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3552	NC_016052	AAG	2	6	164396	164401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516317
3553	NC_016052	TTA	2	6	164458	164463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516317
3554	NC_016052	T	6	6	164469	164474	0 %	100 %	0 %	0 %	352516317
3555	NC_016052	AAC	2	6	164501	164506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516317
3556	NC_016052	TTG	2	6	164518	164523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516317
3557	NC_016052	ATT	2	6	164537	164542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516317
3558	NC_016052	A	6	6	164569	164574	100 %	0 %	0 %	0 %	352516317
3559	NC_016052	GAA	2	6	164614	164619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516317
3560	NC_016052	TTA	2	6	164723	164728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516317
3561	NC_016052	TGA	2	6	164730	164735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516317
3562	NC_016052	TGGT	2	8	164736	164743	0 %	50 %	50 %	0 %	352516317
3563	NC_016052	TTA	2	6	164873	164878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516317
3564	NC_016052	A	7	7	164940	164946	100 %	0 %	0 %	0 %	352516318
3565	NC_016052	ACGT	2	8	165004	165011	25 %	25 %	25 %	25 %	352516318
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3568	NC_016052	A	7	7	165254	165260	100 %	0 %	0 %	0 %	352516318
3569	NC_016052	GAA	2	6	165270	165275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516318
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3572	NC_016052	AATA	2	8	165342	165349	75 %	25 %	0 %	0 %	352516318
3573	NC_016052	A	6	6	165351	165356	100 %	0 %	0 %	0 %	352516318
3574	NC_016052	T	6	6	165360	165365	0 %	100 %	0 %	0 %	352516318
3575	NC_016052	ATC	2	6	165388	165393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516318
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3593	NC_016052	TTTAC	2	10	166376	166385	20 %	60 %	0 %	20 %	352516319
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3606	NC_016052	TCA	3	9	166859	166867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516319
3607	NC_016052	TCC	2	6	166879	166884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352516319
3608	NC_016052	GCT	2	6	166892	166897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516319
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3610	NC_016052	CAG	2	6	167117	167122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516320
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3612	NC_016052	TGCT	2	8	167154	167161	0 %	50 %	25 %	25 %	352516320
3613	NC_016052	TTGAAA	2	12	167190	167201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	352516320
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3615	NC_016052	CAT	2	6	167330	167335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516320
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3623	NC_016052	TCT	2	6	167519	167524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516321
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3742	NC_016052	A	6	6	172560	172565	100 %	0 %	0 %	0 %	352516325
3743	NC_016052	TTCTT	2	10	172593	172602	0 %	80 %	0 %	20 %	352516325
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3994	NC_016052	AAAC	2	8	185555	185562	75 %	0 %	0 %	25 %	352516337
3995	NC_016052	AAG	2	6	185568	185573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516338
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3997	NC_016052	T	6	6	185593	185598	0 %	100 %	0 %	0 %	352516338
3998	NC_016052	AAG	2	6	185613	185618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516338
3999	NC_016052	A	6	6	185651	185656	100 %	0 %	0 %	0 %	352516338
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