MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 51517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016052	CGAT	2	8	214331	214338	25 %	25 %	25 %	25 %	352516370
4502	NC_016052	CCA	2	6	214410	214415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352516370
4503	NC_016052	CTT	2	6	214449	214454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516370
4504	NC_016052	CGA	2	6	214460	214465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516370
4505	NC_016052	TGG	2	6	214497	214502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516370
4506	NC_016052	T	6	6	214510	214515	0 %	100 %	0 %	0 %	352516370
4507	NC_016052	GAA	3	9	214755	214763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516370
4508	NC_016052	TCA	2	6	214791	214796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516370
4509	NC_016052	T	6	6	214813	214818	0 %	100 %	0 %	0 %	352516370
4510	NC_016052	TGA	2	6	214853	214858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516370
4511	NC_016052	A	6	6	214884	214889	100 %	0 %	0 %	0 %	352516370
4512	NC_016052	AAGG	2	8	214952	214959	50 %	0 %	50 %	0 %	352516370
4513	NC_016052	A	6	6	215360	215365	100 %	0 %	0 %	0 %	352516371
4514	NC_016052	TAC	2	6	215442	215447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516371
4515	NC_016052	CT	3	6	215556	215561	0 %	50 %	0 %	50 %	352516372
4516	NC_016052	TCT	2	6	215690	215695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516372
4517	NC_016052	TA	3	6	215755	215760	50 %	50 %	0 %	0 %	352516372
4518	NC_016052	TAAG	2	8	215821	215828	50 %	25 %	25 %	0 %	352516372
4519	NC_016052	CTGC	2	8	216702	216709	0 %	25 %	25 %	50 %	352516373
4520	NC_016052	TCA	2	6	216781	216786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516373
4521	NC_016052	TGT	2	6	216796	216801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516373
4522	NC_016052	T	6	6	216859	216864	0 %	100 %	0 %	0 %	352516373
4523	NC_016052	A	6	6	216869	216874	100 %	0 %	0 %	0 %	352516373
4524	NC_016052	GCC	2	6	216875	216880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352516373
4525	NC_016052	GTC	2	6	217106	217111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516373
4526	NC_016052	ATAA	2	8	217415	217422	75 %	25 %	0 %	0 %	352516373
4527	NC_016052	CTT	3	9	217429	217437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516373
4528	NC_016052	ATGT	2	8	217567	217574	25 %	50 %	25 %	0 %	352516373
4529	NC_016052	TTG	2	6	217613	217618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516373
4530	NC_016052	CTT	2	6	217624	217629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516373
4531	NC_016052	TTA	2	6	217653	217658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516373
4532	NC_016052	CAAT	2	8	217684	217691	50 %	25 %	0 %	25 %	352516373
4533	NC_016052	T	6	6	217794	217799	0 %	100 %	0 %	0 %	352516373
4534	NC_016052	ATG	2	6	218099	218104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516374
4535	NC_016052	TGAA	2	8	218148	218155	50 %	25 %	25 %	0 %	352516374
4536	NC_016052	CTT	2	6	218172	218177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516374
4537	NC_016052	AT	3	6	218210	218215	50 %	50 %	0 %	0 %	352516374
4538	NC_016052	A	6	6	218222	218227	100 %	0 %	0 %	0 %	352516374
4539	NC_016052	GAA	2	6	218243	218248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516374
4540	NC_016052	TCA	2	6	218272	218277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516374
4541	NC_016052	A	7	7	218323	218329	100 %	0 %	0 %	0 %	352516374
4542	NC_016052	ATT	2	6	218650	218655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516375
4543	NC_016052	A	7	7	218658	218664	100 %	0 %	0 %	0 %	352516375
4544	NC_016052	ATCA	2	8	218740	218747	50 %	25 %	0 %	25 %	352516375
4545	NC_016052	ACTT	2	8	218797	218804	25 %	50 %	0 %	25 %	352516375
4546	NC_016052	ATT	2	6	218836	218841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516375
4547	NC_016052	CAAA	2	8	218856	218863	75 %	0 %	0 %	25 %	352516375
4548	NC_016052	CAA	2	6	218911	218916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516375
4549	NC_016052	CTT	3	9	218989	218997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516375
4550	NC_016052	ATTC	2	8	219010	219017	25 %	50 %	0 %	25 %	352516375
4551	NC_016052	GAA	2	6	219085	219090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516375
4552	NC_016052	TGA	2	6	219117	219122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516375
4553	NC_016052	GAT	2	6	219534	219539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516376
4554	NC_016052	ATT	2	6	219586	219591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516376
4555	NC_016052	AAC	2	6	219635	219640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516376
4556	NC_016052	ATT	2	6	219642	219647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516376
4557	NC_016052	CCA	2	6	219659	219664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352516376
4558	NC_016052	AAG	2	6	219704	219709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516376
4559	NC_016052	GTC	2	6	219793	219798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516376
4560	NC_016052	GTTT	2	8	219825	219832	0 %	75 %	25 %	0 %	352516376
4561	NC_016052	TGA	2	6	219846	219851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516376
4562	NC_016052	ATT	2	6	219868	219873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516376
4563	NC_016052	AGAA	2	8	219884	219891	75 %	0 %	25 %	0 %	352516376
4564	NC_016052	CAA	2	6	219925	219930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516377
4565	NC_016052	TGA	2	6	220103	220108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516377
4566	NC_016052	CA	3	6	220136	220141	50 %	0 %	0 %	50 %	352516377
4567	NC_016052	ATT	2	6	220161	220166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516377
4568	NC_016052	GCA	2	6	220179	220184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516377
4569	NC_016052	TTA	2	6	220196	220201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516377
4570	NC_016052	AGC	2	6	220241	220246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516377
4571	NC_016052	T	6	6	220319	220324	0 %	100 %	0 %	0 %	352516377
4572	NC_016052	AGA	2	6	220331	220336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516377
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4574	NC_016052	AGAAC	2	10	220367	220376	60 %	0 %	20 %	20 %	352516377
4575	NC_016052	AAG	2	6	220420	220425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516377
4576	NC_016052	ACTT	2	8	220601	220608	25 %	50 %	0 %	25 %	352516377
4577	NC_016052	CT	4	8	220632	220639	0 %	50 %	0 %	50 %	352516377
4578	NC_016052	CAAA	2	8	220656	220663	75 %	0 %	0 %	25 %	352516377
4579	NC_016052	GTAT	2	8	220827	220834	25 %	50 %	25 %	0 %	352516377
4580	NC_016052	AAG	2	6	220870	220875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516377
4581	NC_016052	AAT	2	6	220953	220958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516377
4582	NC_016052	GCTT	2	8	220968	220975	0 %	50 %	25 %	25 %	352516377
4583	NC_016052	GA	3	6	221037	221042	50 %	0 %	50 %	0 %	352516378
4584	NC_016052	TTA	2	6	221044	221049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516378
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4587	NC_016052	CTAC	2	8	221186	221193	25 %	25 %	0 %	50 %	352516378
4588	NC_016052	ACG	2	6	221213	221218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516378
4589	NC_016052	TTATT	2	10	221241	221250	20 %	80 %	0 %	0 %	352516378
4590	NC_016052	AGA	3	9	221305	221313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516378
4591	NC_016052	GTT	2	6	221366	221371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516378
4592	NC_016052	GAA	2	6	221375	221380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516378
4593	NC_016052	A	6	6	221394	221399	100 %	0 %	0 %	0 %	352516378
4594	NC_016052	ATT	3	9	221444	221452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516379
4595	NC_016052	TGG	2	6	221527	221532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516379
4596	NC_016052	AAT	2	6	221547	221552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516379
4597	NC_016052	TACA	2	8	221622	221629	50 %	25 %	0 %	25 %	352516379
4598	NC_016052	TGAT	2	8	221700	221707	25 %	50 %	25 %	0 %	352516379
4599	NC_016052	CATCG	2	10	221714	221723	20 %	20 %	20 %	40 %	352516380
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4601	NC_016052	AAGA	2	8	221789	221796	75 %	0 %	25 %	0 %	352516380
4602	NC_016052	ATC	2	6	221814	221819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516380
4603	NC_016052	AAG	2	6	221838	221843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516380
4604	NC_016052	A	7	7	221847	221853	100 %	0 %	0 %	0 %	352516380
4605	NC_016052	AACA	2	8	221895	221902	75 %	0 %	0 %	25 %	352516380
4606	NC_016052	AAG	2	6	221973	221978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516380
4607	NC_016052	CTT	2	6	221984	221989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516380
4608	NC_016052	CAA	2	6	222017	222022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516380
4609	NC_016052	ATT	2	6	222050	222055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516380
4610	NC_016052	GCCA	2	8	222073	222080	25 %	0 %	25 %	50 %	352516380
4611	NC_016052	GTT	2	6	222119	222124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516380
4612	NC_016052	AT	3	6	222153	222158	50 %	50 %	0 %	0 %	352516380
4613	NC_016052	CAA	2	6	222160	222165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516380
4614	NC_016052	AGA	2	6	222190	222195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516380
4615	NC_016052	TGAT	2	8	222198	222205	25 %	50 %	25 %	0 %	352516380
4616	NC_016052	TGT	2	6	222208	222213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516380
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4618	NC_016052	GCT	2	6	222338	222343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516380
4619	NC_016052	TGG	2	6	222348	222353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516380
4620	NC_016052	CAG	2	6	222372	222377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516380
4621	NC_016052	AAC	2	6	222409	222414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516380
4622	NC_016052	AGA	2	6	222436	222441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516380
4623	NC_016052	GCT	3	9	222479	222487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516380
4624	NC_016052	AGA	2	6	222511	222516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516380
4625	NC_016052	AAC	2	6	222654	222659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516381
4626	NC_016052	GCA	2	6	222714	222719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516381
4627	NC_016052	CGTT	2	8	222730	222737	0 %	50 %	25 %	25 %	352516381
4628	NC_016052	AAT	2	6	222746	222751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516381
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4632	NC_016052	TAA	2	6	222991	222996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516381
4633	NC_016052	GAC	2	6	222998	223003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516381
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4643	NC_016052	CTC	2	6	223283	223288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352516382
4644	NC_016052	TGT	2	6	223305	223310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516382
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4650	NC_016052	TGC	2	6	223577	223582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516382
4651	NC_016052	CAT	2	6	223588	223593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516382
4652	NC_016052	TCAAAT	2	12	223626	223637	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	352516382
4653	NC_016052	TCA	2	6	223713	223718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516382
4654	NC_016052	TCT	2	6	223725	223730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516382
4655	NC_016052	TTC	2	6	223757	223762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516382
4656	NC_016052	TAT	2	6	223795	223800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516382
4657	NC_016052	GGC	2	6	223890	223895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352516382
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4659	NC_016052	AT	3	6	223942	223947	50 %	50 %	0 %	0 %	352516382
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4663	NC_016052	GTTT	2	8	224013	224020	0 %	75 %	25 %	0 %	352516382
4664	NC_016052	GTG	2	6	224076	224081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516382
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4673	NC_016052	AAG	2	6	224376	224381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516383
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4678	NC_016052	AATA	3	12	224574	224585	75 %	25 %	0 %	0 %	352516383
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4680	NC_016052	AGTA	2	8	224635	224642	50 %	25 %	25 %	0 %	352516383
4681	NC_016052	TTG	2	6	224702	224707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516383
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4689	NC_016052	GT	3	6	225024	225029	0 %	50 %	50 %	0 %	352516384
4690	NC_016052	CTT	2	6	225104	225109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516384
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4692	NC_016052	CTT	2	6	225207	225212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516384
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4696	NC_016052	T	6	6	225455	225460	0 %	100 %	0 %	0 %	352516384
4697	NC_016052	TTTA	2	8	225466	225473	25 %	75 %	0 %	0 %	352516384
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4700	NC_016052	CTA	2	6	225648	225653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516384
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4702	NC_016052	CGA	2	6	225788	225793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516384
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4704	NC_016052	TGT	2	6	225886	225891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516384
4705	NC_016052	TCCACT	2	12	225895	225906	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	352516384
4706	NC_016052	TCG	2	6	225956	225961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516384
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4708	NC_016052	TCAA	2	8	226007	226014	50 %	25 %	0 %	25 %	352516384
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4713	NC_016052	TATTAG	2	12	226505	226516	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	352516385
4714	NC_016052	ATGA	2	8	226594	226601	50 %	25 %	25 %	0 %	352516385
4715	NC_016052	AGA	2	6	226638	226643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516385
4716	NC_016052	CA	3	6	226737	226742	50 %	0 %	0 %	50 %	352516385
4717	NC_016052	GAA	3	9	226780	226788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516385
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4723	NC_016052	AAC	2	6	227181	227186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516385
4724	NC_016052	GTT	2	6	227290	227295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516385
4725	NC_016052	TGA	2	6	227339	227344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516385
4726	NC_016052	ATA	2	6	227369	227374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516385
4727	NC_016052	TTC	2	6	227416	227421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516385
4728	NC_016052	GCGAT	2	10	227429	227438	20 %	20 %	40 %	20 %	352516385
4729	NC_016052	TAAA	2	8	227445	227452	75 %	25 %	0 %	0 %	352516385
4730	NC_016052	A	6	6	227450	227455	100 %	0 %	0 %	0 %	352516385
4731	NC_016052	GCT	2	6	227624	227629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516386
4732	NC_016052	GAAA	2	8	227683	227690	75 %	0 %	25 %	0 %	352516386
4733	NC_016052	AAT	2	6	227726	227731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516386
4734	NC_016052	GAC	2	6	227757	227762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516386
4735	NC_016052	T	6	6	227802	227807	0 %	100 %	0 %	0 %	352516386
4736	NC_016052	ATA	2	6	227818	227823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516386
4737	NC_016052	AAT	2	6	227879	227884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516386
4738	NC_016052	ACA	2	6	227921	227926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516386
4739	NC_016052	AAT	2	6	227983	227988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516386
4740	NC_016052	T	6	6	227993	227998	0 %	100 %	0 %	0 %	352516386
4741	NC_016052	A	6	6	228041	228046	100 %	0 %	0 %	0 %	352516386
4742	NC_016052	GAA	2	6	228074	228079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516386
4743	NC_016052	CCA	2	6	228092	228097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352516386
4744	NC_016052	TAT	2	6	228105	228110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516386
4745	NC_016052	TTCA	2	8	228121	228128	25 %	50 %	0 %	25 %	352516386
4746	NC_016052	ATA	2	6	228153	228158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516386
4747	NC_016052	ATA	2	6	228182	228187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516386
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4993	NC_016052	A	6	6	239916	239921	100 %	0 %	0 %	0 %	352516398
4994	NC_016052	AAAGT	2	10	239942	239951	60 %	20 %	20 %	0 %	352516398
4995	NC_016052	TTG	2	6	239962	239967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516398
4996	NC_016052	CAA	2	6	239980	239985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516398
4997	NC_016052	GTA	2	6	240013	240018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516398
4998	NC_016052	AGTC	2	8	240025	240032	25 %	25 %	25 %	25 %	352516398
4999	NC_016052	AAAC	2	8	240094	240101	75 %	0 %	0 %	25 %	352516398
5000	NC_016052	T	6	6	240111	240116	0 %	100 %	0 %	0 %	352516398

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