MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016051	CAT	2	6	475	480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478601
2	NC_016051	ACG	2	6	502	507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478601
3	NC_016051	AGCGT	2	10	522	531	20 %	20 %	40 %	20 %	223478601
4	NC_016051	TGA	2	6	533	538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478601
5	NC_016051	CTC	2	6	606	611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478601
6	NC_016051	CT	3	6	622	627	0 %	50 %	0 %	50 %	223478601
7	NC_016051	TGT	2	6	758	763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478601
8	NC_016051	TGT	2	6	767	772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478601
9	NC_016051	TATCG	2	10	1044	1053	20 %	40 %	20 %	20 %	223478601
10	NC_016051	TTA	2	6	1292	1297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478601
11	NC_016051	AGT	2	6	1466	1471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478744
12	NC_016051	TGG	2	6	1489	1494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478744
13	NC_016051	A	6	6	1495	1500	100 %	0 %	0 %	0 %	223478744
14	NC_016051	CTT	2	6	1508	1513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478744
15	NC_016051	CAG	3	9	1525	1533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478744
16	NC_016051	GCG	2	6	1614	1619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478744
17	NC_016051	GTT	2	6	1622	1627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478744
18	NC_016051	GC	3	6	1655	1660	0 %	0 %	50 %	50 %	223478744
19	NC_016051	A	7	7	1664	1670	100 %	0 %	0 %	0 %	223478744
20	NC_016051	CCG	2	6	1671	1676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478744
21	NC_016051	AGA	2	6	1677	1682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478744
22	NC_016051	CCA	2	6	1696	1701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478744
23	NC_016051	AGC	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478744
24	NC_016051	GGCC	2	8	1725	1732	0 %	0 %	50 %	50 %	223478744
25	NC_016051	CT	3	6	1747	1752	0 %	50 %	0 %	50 %	223478744
26	NC_016051	A	6	6	1754	1759	100 %	0 %	0 %	0 %	223478744
27	NC_016051	GCTCA	2	10	2242	2251	20 %	20 %	20 %	40 %	223478599
28	NC_016051	CTA	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478599
29	NC_016051	AAGC	2	8	2331	2338	50 %	0 %	25 %	25 %	223478599
30	NC_016051	TCA	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478599
31	NC_016051	AG	3	6	3074	3079	50 %	0 %	50 %	0 %	223478957
32	NC_016051	TAC	2	6	3231	3236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478957
33	NC_016051	C	6	6	3244	3249	0 %	0 %	0 %	100 %	223478957
34	NC_016051	TC	3	6	3278	3283	0 %	50 %	0 %	50 %	223478957
35	NC_016051	GGA	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478957
36	NC_016051	ACT	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478957
37	NC_016051	GA	3	6	3431	3436	50 %	0 %	50 %	0 %	223478957
38	NC_016051	GAG	2	6	3459	3464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478957
39	NC_016051	GA	3	6	3469	3474	50 %	0 %	50 %	0 %	223478957
40	NC_016051	CCT	2	6	3502	3507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478957
41	NC_016051	CGG	2	6	3626	3631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478957
42	NC_016051	GAG	2	6	3678	3683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478957
43	NC_016051	GGA	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478957
44	NC_016051	GAT	2	6	3788	3793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478957
45	NC_016051	GGAA	2	8	3797	3804	50 %	0 %	50 %	0 %	223478957
46	NC_016051	CG	3	6	3848	3853	0 %	0 %	50 %	50 %	223478957
47	NC_016051	TGG	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478957
48	NC_016051	CGT	2	6	3920	3925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478957
49	NC_016051	GGA	2	6	3974	3979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478957
50	NC_016051	CAC	2	6	4035	4040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478957
51	NC_016051	CAA	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478957
52	NC_016051	ATA	2	6	4065	4070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478957
53	NC_016051	TTG	2	6	4127	4132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478957
54	NC_016051	ATG	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525683
55	NC_016051	GAT	2	6	4187	4192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525683
56	NC_016051	TCA	2	6	4236	4241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525683
57	NC_016051	GAC	2	6	4244	4249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525683
58	NC_016051	GGA	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525683
59	NC_016051	CCA	2	6	4313	4318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350525683
60	NC_016051	TTA	2	6	4387	4392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350525683
61	NC_016051	CCT	2	6	4396	4401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525683
62	NC_016051	TCTTTT	2	12	4444	4455	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	350525683
63	NC_016051	GAT	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525683
64	NC_016051	TCA	2	6	4546	4551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525683
65	NC_016051	AGA	2	6	4763	4768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478926
66	NC_016051	ACG	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478926
67	NC_016051	TGA	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478926
68	NC_016051	CGT	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478926
69	NC_016051	CTC	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478926
70	NC_016051	TCC	2	6	5251	5256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478926
71	NC_016051	GAG	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478926
72	NC_016051	CTC	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478926
73	NC_016051	GTC	2	6	5424	5429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478926
74	NC_016051	ATC	2	6	5449	5454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478926
75	NC_016051	CG	3	6	5501	5506	0 %	0 %	50 %	50 %	223478926
76	NC_016051	TGA	2	6	5552	5557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478926
77	NC_016051	CTG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478926
78	NC_016051	CTC	2	6	5601	5606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478926
79	NC_016051	TCT	2	6	5722	5727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478926
80	NC_016051	GCG	2	6	5732	5737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478926
81	NC_016051	ACG	2	6	5800	5805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478926
82	NC_016051	TGA	2	6	5858	5863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478926
83	NC_016051	ATG	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478926
84	NC_016051	GCTTC	2	10	5990	5999	0 %	40 %	20 %	40 %	223478926
85	NC_016051	CGT	2	6	6017	6022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478926
86	NC_016051	TTA	2	6	6032	6037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478926
87	NC_016051	CAG	2	6	6064	6069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478926
88	NC_016051	TAT	2	6	6171	6176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478926
89	NC_016051	CTGC	2	8	6225	6232	0 %	25 %	25 %	50 %	223478926
90	NC_016051	CCCAGT	2	12	6239	6250	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	223478926
91	NC_016051	GGA	2	6	6278	6283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478926
92	NC_016051	CTT	2	6	6366	6371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478926
93	NC_016051	TC	3	6	6405	6410	0 %	50 %	0 %	50 %	223478926
94	NC_016051	GT	3	6	6412	6417	0 %	50 %	50 %	0 %	223478926
95	NC_016051	TCC	2	6	6439	6444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478926
96	NC_016051	TCT	2	6	6464	6469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478926
97	NC_016051	TCT	2	6	6485	6490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478926
98	NC_016051	ATG	2	6	6565	6570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478926
99	NC_016051	CAGG	2	8	6572	6579	25 %	0 %	50 %	25 %	223478926
100	NC_016051	GAC	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478926
101	NC_016051	CTT	2	6	6714	6719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478926
102	NC_016051	CGA	2	6	6722	6727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478926
103	NC_016051	CA	3	6	6768	6773	50 %	0 %	0 %	50 %	223478926
104	NC_016051	TCG	3	9	6794	6802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478926
105	NC_016051	AGCG	2	8	6828	6835	25 %	0 %	50 %	25 %	223478926
106	NC_016051	GTA	2	6	6846	6851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478926
107	NC_016051	TCC	2	6	6862	6867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478926
108	NC_016051	AGG	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478926
109	NC_016051	CTT	2	6	6954	6959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478926
110	NC_016051	GTC	2	6	7002	7007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478926
111	NC_016051	TGA	2	6	7052	7057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478926
112	NC_016051	GGA	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478926
113	NC_016051	TCGG	2	8	7165	7172	0 %	25 %	50 %	25 %	223478926
114	NC_016051	GC	3	6	7233	7238	0 %	0 %	50 %	50 %	223478926
115	NC_016051	GAT	2	6	7239	7244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478926
116	NC_016051	TCG	2	6	7336	7341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478926
117	NC_016051	TTC	2	6	7414	7419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478926
118	NC_016051	GGCC	2	8	7530	7537	0 %	0 %	50 %	50 %	223478486
119	NC_016051	GAG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478486
120	NC_016051	GCAA	2	8	7841	7848	50 %	0 %	25 %	25 %	223478486
121	NC_016051	TCG	2	6	7875	7880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478486
122	NC_016051	AG	3	6	7884	7889	50 %	0 %	50 %	0 %	223478486
123	NC_016051	CAG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478486
124	NC_016051	GAA	2	6	7945	7950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478486
125	NC_016051	CAG	2	6	7969	7974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478486
126	NC_016051	AG	3	6	7981	7986	50 %	0 %	50 %	0 %	223478486
127	NC_016051	GAG	3	9	7984	7992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478486
128	NC_016051	TGT	2	6	8073	8078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478486
129	NC_016051	ACC	2	6	8135	8140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478486
130	NC_016051	CCG	2	6	8171	8176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478486
131	NC_016051	CCA	2	6	8183	8188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478486
132	NC_016051	CCT	2	6	8348	8353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478486
133	NC_016051	CAC	2	6	8362	8367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478486
134	NC_016051	GACCCT	2	12	8407	8418	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	223478486
135	NC_016051	CCG	2	6	8438	8443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478486
136	NC_016051	TAT	2	6	8786	8791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350525684
137	NC_016051	GCC	2	6	8808	8813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525684
138	NC_016051	CTT	2	6	8827	8832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525684
139	NC_016051	CTT	2	6	8888	8893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525684
140	NC_016051	CGA	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525684
141	NC_016051	TC	3	6	9150	9155	0 %	50 %	0 %	50 %	350525684
142	NC_016051	CAG	2	6	9205	9210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525684
143	NC_016051	CCCT	2	8	9219	9226	0 %	25 %	0 %	75 %	350525684
144	NC_016051	CTC	2	6	9236	9241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525684
145	NC_016051	GAA	2	6	9291	9296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525684
146	NC_016051	GAAG	2	8	9298	9305	50 %	0 %	50 %	0 %	350525684
147	NC_016051	CTC	2	6	9365	9370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525684
148	NC_016051	GAG	2	6	9389	9394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525684
149	NC_016051	GTC	2	6	9395	9400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525684
150	NC_016051	TCC	2	6	10612	10617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478916
151	NC_016051	GAG	3	9	10619	10627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478916
152	NC_016051	ATT	2	6	10632	10637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478916
153	NC_016051	GGC	2	6	10652	10657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478916
154	NC_016051	CCA	2	6	10677	10682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478916
155	NC_016051	GTGGTA	2	12	10695	10706	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	223478916
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157	NC_016051	GTC	2	6	10725	10730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478916
158	NC_016051	TTGAGC	2	12	10752	10763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	223478916
159	NC_016051	TCC	2	6	10797	10802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478916
160	NC_016051	CTT	2	6	10814	10819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478916
161	NC_016051	GGT	2	6	10919	10924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478916
162	NC_016051	CCT	2	6	10981	10986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478916
163	NC_016051	TGG	2	6	11040	11045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478916
164	NC_016051	GGA	2	6	11056	11061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478916
165	NC_016051	GTT	2	6	11079	11084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478916
166	NC_016051	GA	3	6	11158	11163	50 %	0 %	50 %	0 %	223478916
167	NC_016051	CAG	2	6	11180	11185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478916
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170	NC_016051	CTT	2	6	11609	11614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478916
171	NC_016051	GCT	2	6	11638	11643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478916
172	NC_016051	CCT	2	6	11644	11649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478916
173	NC_016051	GAG	2	6	11675	11680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478916
174	NC_016051	CG	3	6	11689	11694	0 %	0 %	50 %	50 %	223478916
175	NC_016051	AGCGTC	2	12	11714	11725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	223478916
176	NC_016051	ACC	3	9	11726	11734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478916
177	NC_016051	TCC	2	6	11737	11742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478916
178	NC_016051	TGG	2	6	11875	11880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478916
179	NC_016051	GGA	2	6	11923	11928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478916
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184	NC_016051	GGT	2	6	12308	12313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478916
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210	NC_016051	CGTTGA	2	12	13794	13805	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	223478724
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222	NC_016051	ATA	3	9	14377	14385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478724
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246	NC_016051	ATC	2	6	15640	15645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478695
247	NC_016051	GACC	2	8	15659	15666	25 %	0 %	25 %	50 %	223478695
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249	NC_016051	CCA	2	6	15696	15701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478695
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251	NC_016051	GTC	2	6	15727	15732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478695
252	NC_016051	CTT	2	6	15837	15842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478695
253	NC_016051	GAT	2	6	15867	15872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478695
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255	NC_016051	CTC	2	6	15928	15933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478695
256	NC_016051	CAA	2	6	15975	15980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478695
257	NC_016051	GAG	2	6	15994	15999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478695
258	NC_016051	GAGC	2	8	16008	16015	25 %	0 %	50 %	25 %	223478695
259	NC_016051	AAG	3	9	16033	16041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478695
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261	NC_016051	GGA	2	6	16122	16127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478695
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386	NC_016051	TCG	2	6	22518	22523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478725
387	NC_016051	TCA	2	6	22531	22536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478725
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389	NC_016051	TCA	2	6	22590	22595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478725
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499	NC_016051	CTT	2	6	28579	28584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478664
500	NC_016051	GCG	2	6	28587	28592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478664

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