MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016051	AGC	2	6	224551	224556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478675
4002	NC_016051	GCTCC	2	10	224690	224699	0 %	20 %	20 %	60 %	223478675
4003	NC_016051	CCT	2	6	224774	224779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478675
4004	NC_016051	GAA	2	6	224900	224905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478675
4005	NC_016051	GGAAC	2	10	224932	224941	40 %	0 %	40 %	20 %	223478675
4006	NC_016051	ACC	2	6	224983	224988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478675
4007	NC_016051	AGG	2	6	225106	225111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478675
4008	NC_016051	GCG	2	6	225145	225150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478675
4009	NC_016051	GGC	2	6	225164	225169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478675
4010	NC_016051	CTA	2	6	225218	225223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478675
4011	NC_016051	AAG	2	6	225252	225257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478675
4012	NC_016051	CAT	2	6	225284	225289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478675
4013	NC_016051	ACA	2	6	225331	225336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478675
4014	NC_016051	T	6	6	225536	225541	0 %	100 %	0 %	0 %	223478925
4015	NC_016051	T	6	6	225548	225553	0 %	100 %	0 %	0 %	223478925
4016	NC_016051	GAA	2	6	225596	225601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478925
4017	NC_016051	CGC	2	6	225772	225777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478925
4018	NC_016051	AG	3	6	225885	225890	50 %	0 %	50 %	0 %	223478925
4019	NC_016051	GC	3	6	225926	225931	0 %	0 %	50 %	50 %	223478925
4020	NC_016051	CTCG	2	8	225947	225954	0 %	25 %	25 %	50 %	223478925
4021	NC_016051	TATC	2	8	226125	226132	25 %	50 %	0 %	25 %	223478925
4022	NC_016051	GTC	2	6	226202	226207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525718
4023	NC_016051	TGA	2	6	226219	226224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525718
4024	NC_016051	T	6	6	226265	226270	0 %	100 %	0 %	0 %	350525718
4025	NC_016051	ACC	2	6	226305	226310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350525718
4026	NC_016051	TCT	3	9	226461	226469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478930
4027	NC_016051	GAG	2	6	226489	226494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478930
4028	NC_016051	CCT	2	6	226626	226631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478930
4029	NC_016051	GTC	2	6	226636	226641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478930
4030	NC_016051	TCC	2	6	226740	226745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478930
4031	NC_016051	CCT	2	6	226770	226775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478930
4032	NC_016051	GAT	2	6	226912	226917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478930
4033	NC_016051	GGC	2	6	226966	226971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478930
4034	NC_016051	CGAG	2	8	226983	226990	25 %	0 %	50 %	25 %	223478930
4035	NC_016051	TC	3	6	226996	227001	0 %	50 %	0 %	50 %	223478930
4036	NC_016051	CCT	2	6	227008	227013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478930
4037	NC_016051	CTC	2	6	227050	227055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478930
4038	NC_016051	TCC	2	6	227061	227066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478930
4039	NC_016051	AGG	2	6	227227	227232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478674
4040	NC_016051	GGC	2	6	227283	227288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478674
4041	NC_016051	CGT	2	6	227349	227354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478674
4042	NC_016051	GAG	3	9	227440	227448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478674
4043	NC_016051	GAG	2	6	227467	227472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478674
4044	NC_016051	GGA	2	6	227475	227480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478674
4045	NC_016051	GAA	2	6	227497	227502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478674
4046	NC_016051	GAG	2	6	227551	227556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478674
4047	NC_016051	CTC	2	6	227557	227562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478674
4048	NC_016051	AGG	2	6	227582	227587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478674
4049	NC_016051	CA	3	6	227590	227595	50 %	0 %	0 %	50 %	223478674
4050	NC_016051	GGA	2	6	227613	227618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478674
4051	NC_016051	GCG	2	6	227861	227866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478984
4052	NC_016051	ACG	2	6	227964	227969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478984
4053	NC_016051	CCA	2	6	228010	228015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478984
4054	NC_016051	CAG	2	6	228286	228291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478984
4055	NC_016051	TTG	2	6	228297	228302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478984
4056	NC_016051	TGC	2	6	228313	228318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478984
4057	NC_016051	TGG	2	6	228342	228347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478984
4058	NC_016051	TCA	2	6	228504	228509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478984
4059	NC_016051	TCCC	2	8	228518	228525	0 %	25 %	0 %	75 %	223478984
4060	NC_016051	CTT	2	6	228536	228541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478984
4061	NC_016051	CATT	2	8	228603	228610	25 %	50 %	0 %	25 %	223478984
4062	NC_016051	CGT	2	6	228673	228678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478984
4063	NC_016051	CGG	2	6	228679	228684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478984
4064	NC_016051	CAA	2	6	228705	228710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478984
4065	NC_016051	TGCG	2	8	228724	228731	0 %	25 %	50 %	25 %	223478984
4066	NC_016051	TCG	2	6	228756	228761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478984
4067	NC_016051	AGCA	2	8	228776	228783	50 %	0 %	25 %	25 %	223478984
4068	NC_016051	CAG	2	6	228896	228901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478984
4069	NC_016051	ACA	2	6	228921	228926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478984
4070	NC_016051	GCG	2	6	229040	229045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478984
4071	NC_016051	GAC	2	6	229081	229086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478984
4072	NC_016051	CCA	2	6	229098	229103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478984
4073	NC_016051	CCT	2	6	229179	229184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478984
4074	NC_016051	CATGG	2	10	229210	229219	20 %	20 %	40 %	20 %	223478984
4075	NC_016051	GGCC	2	8	229242	229249	0 %	0 %	50 %	50 %	223478984
4076	NC_016051	CAG	2	6	229386	229391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478984
4077	NC_016051	ATA	2	6	229448	229453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478984
4078	NC_016051	GAG	2	6	229523	229528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478984
4079	NC_016051	CGC	2	6	229531	229536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478984
4080	NC_016051	AGA	2	6	229592	229597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478747
4081	NC_016051	CTT	2	6	229605	229610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478747
4082	NC_016051	CCG	2	6	229729	229734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478747
4083	NC_016051	CGA	2	6	229809	229814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478747
4084	NC_016051	GA	3	6	229866	229871	50 %	0 %	50 %	0 %	223478679
4085	NC_016051	AGG	2	6	229886	229891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478679
4086	NC_016051	ACG	2	6	229939	229944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478679
4087	NC_016051	ATC	2	6	230065	230070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478679
4088	NC_016051	CGAG	2	8	230084	230091	25 %	0 %	50 %	25 %	223478679
4089	NC_016051	GAA	2	6	230136	230141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478679
4090	NC_016051	C	6	6	230299	230304	0 %	0 %	0 %	100 %	223478679
4091	NC_016051	AGA	2	6	230395	230400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478679
4092	NC_016051	AGG	3	9	230468	230476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478679
4093	NC_016051	CTC	2	6	230500	230505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478679
4094	NC_016051	TCG	2	6	230528	230533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478679
4095	NC_016051	GAA	2	6	230631	230636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478679
4096	NC_016051	GAA	2	6	230689	230694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478679
4097	NC_016051	GAA	2	6	230740	230745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478679
4098	NC_016051	GA	3	6	230749	230754	50 %	0 %	50 %	0 %	223478679
4099	NC_016051	CAT	2	6	231170	231175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478808
4100	NC_016051	CAAGGA	2	12	231278	231289	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	223478808
4101	NC_016051	GGT	2	6	231303	231308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478808
4102	NC_016051	GCTA	2	8	231324	231331	25 %	25 %	25 %	25 %	223478808
4103	NC_016051	CCT	2	6	231395	231400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478808
4104	NC_016051	CTG	2	6	231417	231422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478808
4105	NC_016051	TAC	2	6	231504	231509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478808
4106	NC_016051	TCT	2	6	231691	231696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478808
4107	NC_016051	AGCCCG	2	12	231709	231720	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	223478808
4108	NC_016051	GAG	2	6	231949	231954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478632
4109	NC_016051	GGA	2	6	231974	231979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478632
4110	NC_016051	TCA	2	6	231988	231993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478632
4111	NC_016051	GCC	2	6	231998	232003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478632
4112	NC_016051	CTC	2	6	232017	232022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478632
4113	NC_016051	CGA	2	6	232112	232117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478632
4114	NC_016051	GAA	2	6	232131	232136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478632
4115	NC_016051	AGA	2	6	232189	232194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478555
4116	NC_016051	GAC	2	6	232337	232342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478555
4117	NC_016051	TTC	2	6	232365	232370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478555
4118	NC_016051	ACT	2	6	232386	232391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478555
4119	NC_016051	AAC	2	6	232463	232468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478555
4120	NC_016051	CTGG	2	8	232528	232535	0 %	25 %	50 %	25 %	223478555
4121	NC_016051	TCGTTC	2	12	232591	232602	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	223478633
4122	NC_016051	ACGG	2	8	232630	232637	25 %	0 %	50 %	25 %	223478633
4123	NC_016051	AAT	2	6	232748	232753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478633
4124	NC_016051	GAA	2	6	232767	232772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478633
4125	NC_016051	CGG	2	6	232808	232813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478633
4126	NC_016051	TCG	2	6	232872	232877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478633
4127	NC_016051	TGG	2	6	232915	232920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478633
4128	NC_016051	TC	3	6	232988	232993	0 %	50 %	0 %	50 %	223478633
4129	NC_016051	GCTC	2	8	233090	233097	0 %	25 %	25 %	50 %	223478633
4130	NC_016051	A	6	6	233321	233326	100 %	0 %	0 %	0 %	223478633
4131	NC_016051	CTC	2	6	233499	233504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478646
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4137	NC_016051	CGT	2	6	233822	233827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478646
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4139	NC_016051	CTG	2	6	233874	233879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478646
4140	NC_016051	GATACA	2	12	233929	233940	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	223478646
4141	NC_016051	GGTAA	2	10	234024	234033	40 %	20 %	40 %	0 %	223478646
4142	NC_016051	GAG	2	6	234117	234122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478646
4143	NC_016051	GAA	2	6	234195	234200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478646
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4229	NC_016051	TACG	2	8	238687	238694	25 %	25 %	25 %	25 %	223478563
4230	NC_016051	TA	3	6	238740	238745	50 %	50 %	0 %	0 %	223478563
4231	NC_016051	TA	3	6	238810	238815	50 %	50 %	0 %	0 %	223478563
4232	NC_016051	TAT	2	6	238840	238845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478563
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4234	NC_016051	TA	3	6	238930	238935	50 %	50 %	0 %	0 %	223478563
4235	NC_016051	AAGA	2	8	238998	239005	75 %	0 %	25 %	0 %	223478563
4236	NC_016051	CATT	2	8	239010	239017	25 %	50 %	0 %	25 %	223478563
4237	NC_016051	CAC	2	6	239081	239086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478563
4238	NC_016051	CACT	2	8	239124	239131	25 %	25 %	0 %	50 %	223478563
4239	NC_016051	GTC	2	6	239185	239190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478563
4240	NC_016051	TGCA	2	8	239252	239259	25 %	25 %	25 %	25 %	223478563
4241	NC_016051	CAC	2	6	239260	239265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478563
4242	NC_016051	GAT	2	6	239305	239310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478563
4243	NC_016051	AAT	2	6	239346	239351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478563
4244	NC_016051	GTTGA	2	10	239423	239432	20 %	40 %	40 %	0 %	223478563
4245	NC_016051	AG	3	6	239457	239462	50 %	0 %	50 %	0 %	223478563
4246	NC_016051	GTT	2	6	239476	239481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478563
4247	NC_016051	TCT	2	6	239529	239534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478563
4248	NC_016051	CCGGAA	2	12	239555	239566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478563
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4251	NC_016051	TGACT	2	10	239619	239628	20 %	40 %	20 %	20 %	223478563
4252	NC_016051	TCG	2	6	239733	239738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478563
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4256	NC_016051	TA	3	6	240156	240161	50 %	50 %	0 %	0 %	223478640
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4264	NC_016051	CAGGA	2	10	240546	240555	40 %	0 %	40 %	20 %	223478640
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4267	NC_016051	TCAGGC	2	12	240721	240732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	223478736
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4271	NC_016051	TTGA	2	8	240962	240969	25 %	50 %	25 %	0 %	223478736
4272	NC_016051	AGA	2	6	241022	241027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478736
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4275	NC_016051	AT	3	6	241462	241467	50 %	50 %	0 %	0 %	223479001
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4364	NC_016051	CTGC	2	8	245745	245752	0 %	25 %	25 %	50 %	223478713
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4472	NC_016051	GTT	2	6	251242	251247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478954
4473	NC_016051	GAACC	2	10	251326	251335	40 %	0 %	20 %	40 %	223478954
4474	NC_016051	TGT	2	6	251365	251370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525720
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4484	NC_016051	GCG	2	6	251824	251829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525720
4485	NC_016051	CCT	2	6	251866	251871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525720
4486	NC_016051	TG	3	6	251957	251962	0 %	50 %	50 %	0 %	350525720
4487	NC_016051	GCG	2	6	252004	252009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525720
4488	NC_016051	TGA	2	6	252175	252180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525720
4489	NC_016051	CGT	2	6	252304	252309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525720
4490	NC_016051	TGA	2	6	252361	252366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525720
4491	NC_016051	TC	3	6	252380	252385	0 %	50 %	0 %	50 %	350525720
4492	NC_016051	CGA	2	6	252409	252414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525720
4493	NC_016051	TCTT	2	8	252423	252430	0 %	75 %	0 %	25 %	350525720
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4495	NC_016051	CCT	2	6	252459	252464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525720
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4497	NC_016051	TTTTC	2	10	252916	252925	0 %	80 %	0 %	20 %	350525721
4498	NC_016051	CTTCA	2	10	252980	252989	20 %	40 %	0 %	40 %	350525722
4499	NC_016051	GAG	2	6	253074	253079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525722
4500	NC_016051	GGT	2	6	254192	254197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525723

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