MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016051	GGTTT	2	10	196030	196039	0 %	60 %	40 %	0 %	223478432
3502	NC_016051	GAAG	2	8	196043	196050	50 %	0 %	50 %	0 %	223478432
3503	NC_016051	TC	3	6	196154	196159	0 %	50 %	0 %	50 %	223478432
3504	NC_016051	CGC	2	6	196288	196293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478592
3505	NC_016051	TCC	2	6	196304	196309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478592
3506	NC_016051	ACG	2	6	196397	196402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478592
3507	NC_016051	TCA	2	6	196422	196427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478592
3508	NC_016051	AC	3	6	196458	196463	50 %	0 %	0 %	50 %	223478592
3509	NC_016051	CT	3	6	196472	196477	0 %	50 %	0 %	50 %	223478592
3510	NC_016051	GGA	2	6	196500	196505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478592
3511	NC_016051	CCT	2	6	196510	196515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478592
3512	NC_016051	GTAG	2	8	196545	196552	25 %	25 %	50 %	0 %	223478592
3513	NC_016051	TTC	2	6	196591	196596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478592
3514	NC_016051	CGC	2	6	196785	196790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478592
3515	NC_016051	CG	3	6	196806	196811	0 %	0 %	50 %	50 %	223478592
3516	NC_016051	CCT	2	6	196824	196829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478592
3517	NC_016051	GAG	2	6	196993	196998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478436
3518	NC_016051	GTC	2	6	197041	197046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478436
3519	NC_016051	AAG	2	6	197047	197052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478436
3520	NC_016051	GA	3	6	197062	197067	50 %	0 %	50 %	0 %	223478436
3521	NC_016051	AGGA	2	8	197242	197249	50 %	0 %	50 %	0 %	223478436
3522	NC_016051	GGA	2	6	197281	197286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478436
3523	NC_016051	GAG	2	6	197458	197463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478436
3524	NC_016051	GTC	2	6	197578	197583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478436
3525	NC_016051	GC	3	6	197591	197596	0 %	0 %	50 %	50 %	223478436
3526	NC_016051	CGA	2	6	197660	197665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478436
3527	NC_016051	CAG	2	6	197760	197765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478436
3528	NC_016051	GA	3	6	197766	197771	50 %	0 %	50 %	0 %	223478436
3529	NC_016051	ACG	2	6	197789	197794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478436
3530	NC_016051	GGA	2	6	197892	197897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478436
3531	NC_016051	GC	3	6	198036	198041	0 %	0 %	50 %	50 %	223478436
3532	NC_016051	GAG	2	6	198046	198051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478436
3533	NC_016051	AAGA	2	8	198228	198235	75 %	0 %	25 %	0 %	223478436
3534	NC_016051	CTC	2	6	198238	198243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478436
3535	NC_016051	TGGGA	2	10	198302	198311	20 %	20 %	60 %	0 %	223478813
3536	NC_016051	GGT	2	6	198386	198391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478813
3537	NC_016051	GAG	2	6	198471	198476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478813
3538	NC_016051	AG	3	6	198499	198504	50 %	0 %	50 %	0 %	223478813
3539	NC_016051	GTC	2	6	198628	198633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478660
3540	NC_016051	TGA	2	6	198744	198749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478660
3541	NC_016051	AGT	2	6	198807	198812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478660
3542	NC_016051	TAC	2	6	198886	198891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478660
3543	NC_016051	TGA	3	9	198915	198923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478660
3544	NC_016051	GAGC	2	8	199106	199113	25 %	0 %	50 %	25 %	223478794
3545	NC_016051	GAG	2	6	199140	199145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478794
3546	NC_016051	AAG	2	6	199149	199154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478794
3547	NC_016051	GGAA	2	8	199155	199162	50 %	0 %	50 %	0 %	223478794
3548	NC_016051	CCG	2	6	199218	199223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478794
3549	NC_016051	AGG	2	6	199237	199242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478794
3550	NC_016051	CTG	2	6	199272	199277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478794
3551	NC_016051	ATA	2	6	199362	199367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478794
3552	NC_016051	TCG	2	6	199447	199452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478794
3553	NC_016051	AGGA	2	8	199455	199462	50 %	0 %	50 %	0 %	223478794
3554	NC_016051	AGG	2	6	199465	199470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478794
3555	NC_016051	TCG	2	6	199504	199509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478794
3556	NC_016051	ACC	2	6	199534	199539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478794
3557	NC_016051	GGT	2	6	199553	199558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478794
3558	NC_016051	CGA	2	6	199588	199593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478794
3559	NC_016051	GGC	2	6	199650	199655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478794
3560	NC_016051	ATC	2	6	199704	199709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478794
3561	NC_016051	CG	3	6	199761	199766	0 %	0 %	50 %	50 %	223478794
3562	NC_016051	GAG	2	6	199794	199799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478794
3563	NC_016051	ACG	2	6	199804	199809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478794
3564	NC_016051	AAG	2	6	199860	199865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478794
3565	NC_016051	AGG	2	6	199935	199940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478794
3566	NC_016051	AAG	2	6	199968	199973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478794
3567	NC_016051	CGG	2	6	200092	200097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478794
3568	NC_016051	GAG	2	6	200100	200105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478794
3569	NC_016051	AAG	2	6	200112	200117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478794
3570	NC_016051	GC	3	6	200138	200143	0 %	0 %	50 %	50 %	223478794
3571	NC_016051	GAG	2	6	200177	200182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478794
3572	NC_016051	CGGA	2	8	200191	200198	25 %	0 %	50 %	25 %	223478794
3573	NC_016051	CCG	2	6	200274	200279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478794
3574	NC_016051	GAG	2	6	200280	200285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478794
3575	NC_016051	AAG	2	6	200286	200291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478794
3576	NC_016051	ACG	2	6	200389	200394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478794
3577	NC_016051	CGA	2	6	200399	200404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478794
3578	NC_016051	GAG	2	6	200412	200417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478794
3579	NC_016051	GAA	2	6	200423	200428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478794
3580	NC_016051	GTC	2	6	200466	200471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478794
3581	NC_016051	AAG	2	6	200484	200489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478794
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3583	NC_016051	GAG	2	6	200577	200582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478794
3584	NC_016051	CCG	2	6	200617	200622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478794
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3586	NC_016051	ATC	2	6	200679	200684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478794
3587	NC_016051	TCA	2	6	200713	200718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478794
3588	NC_016051	GCTC	2	8	200803	200810	0 %	25 %	25 %	50 %	223478794
3589	NC_016051	GAA	2	6	200816	200821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478794
3590	NC_016051	TC	3	6	200924	200929	0 %	50 %	0 %	50 %	223478956
3591	NC_016051	AC	3	6	200956	200961	50 %	0 %	0 %	50 %	223478956
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3593	NC_016051	CGA	2	6	201016	201021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478956
3594	NC_016051	ATC	2	6	201033	201038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478956
3595	NC_016051	AGG	2	6	201076	201081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478956
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3597	NC_016051	GA	3	6	201164	201169	50 %	0 %	50 %	0 %	223478956
3598	NC_016051	CCG	2	6	201181	201186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478956
3599	NC_016051	GCTA	2	8	201231	201238	25 %	25 %	25 %	25 %	223478956
3600	NC_016051	CAA	2	6	201263	201268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478956
3601	NC_016051	TCG	2	6	201280	201285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478956
3602	NC_016051	TGG	2	6	201305	201310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478956
3603	NC_016051	CTC	2	6	201352	201357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478956
3604	NC_016051	TCC	2	6	201456	201461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478822
3605	NC_016051	CTT	2	6	201490	201495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478822
3606	NC_016051	GAG	3	9	201581	201589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478822
3607	NC_016051	GTG	2	6	201650	201655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478822
3608	NC_016051	GAC	2	6	201656	201661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478822
3609	NC_016051	GCA	2	6	201663	201668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478822
3610	NC_016051	ATG	2	6	201702	201707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478822
3611	NC_016051	TCA	2	6	201720	201725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478822
3612	NC_016051	GA	3	6	201783	201788	50 %	0 %	50 %	0 %	223478822
3613	NC_016051	CGAC	2	8	201798	201805	25 %	0 %	25 %	50 %	223478822
3614	NC_016051	TTG	2	6	201843	201848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478822
3615	NC_016051	CGT	2	6	201868	201873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478822
3616	NC_016051	GGC	2	6	201881	201886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478822
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3618	NC_016051	TGA	2	6	201976	201981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478822
3619	NC_016051	GA	3	6	202018	202023	50 %	0 %	50 %	0 %	223478822
3620	NC_016051	TCG	2	6	202047	202052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478822
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3622	NC_016051	GGT	2	6	202105	202110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478822
3623	NC_016051	GGT	2	6	202182	202187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478822
3624	NC_016051	TGG	2	6	202257	202262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478822
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