MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_016051	GTA	2	6	2014067	2014072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478538
36002	NC_016051	CCG	2	6	2014149	2014154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478538
36003	NC_016051	CGC	2	6	2014165	2014170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478538
36004	NC_016051	TTA	2	6	2014189	2014194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478538
36005	NC_016051	CCA	2	6	2014234	2014239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478538
36006	NC_016051	CGG	2	6	2014285	2014290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478538
36007	NC_016051	CCT	2	6	2014340	2014345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478538
36008	NC_016051	CTCC	2	8	2014361	2014368	0 %	25 %	0 %	75 %	223478538
36009	NC_016051	GAA	2	6	2014388	2014393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478538
36010	NC_016051	C	6	6	2014404	2014409	0 %	0 %	0 %	100 %	223478538
36011	NC_016051	CAC	2	6	2014478	2014483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478989
36012	NC_016051	GAG	2	6	2014588	2014593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478989
36013	NC_016051	TCC	2	6	2014595	2014600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478989
36014	NC_016051	AGT	2	6	2014620	2014625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478989
36015	NC_016051	ACCCTG	2	12	2014666	2014677	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	223478989
36016	NC_016051	GAG	2	6	2014723	2014728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478989
36017	NC_016051	ACG	2	6	2014730	2014735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478989
36018	NC_016051	CGT	2	6	2014743	2014748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478989
36019	NC_016051	AGA	2	6	2014803	2014808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478989
36020	NC_016051	CTC	2	6	2014897	2014902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478989
36021	NC_016051	CGA	2	6	2014951	2014956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478989
36022	NC_016051	TCCC	2	8	2014979	2014986	0 %	25 %	0 %	75 %	223478989
36023	NC_016051	GGA	2	6	2014995	2015000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478989
36024	NC_016051	CTC	2	6	2015056	2015061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478989
36025	NC_016051	CCTT	2	8	2015091	2015098	0 %	50 %	0 %	50 %	223478989
36026	NC_016051	GA	3	6	2015099	2015104	50 %	0 %	50 %	0 %	223478989
36027	NC_016051	GTC	2	6	2015171	2015176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478989
36028	NC_016051	AGA	2	6	2015241	2015246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478989
36029	NC_016051	GGTG	2	8	2015283	2015290	0 %	25 %	75 %	0 %	223478989
36030	NC_016051	TCG	2	6	2015445	2015450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478989
36031	NC_016051	ACC	2	6	2015461	2015466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350525994
36032	NC_016051	CTC	2	6	2015599	2015604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525994
36033	NC_016051	TCG	2	6	2015751	2015756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525994
36034	NC_016051	GTA	2	6	2015767	2015772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525994
36035	NC_016051	GAG	2	6	2015899	2015904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525994
36036	NC_016051	CAG	2	6	2015914	2015919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525994
36037	NC_016051	GCC	2	6	2015953	2015958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525994
36038	NC_016051	CCT	2	6	2015988	2015993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525994
36039	NC_016051	ATC	2	6	2016029	2016034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525994
36040	NC_016051	TCC	2	6	2016035	2016040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525994
36041	NC_016051	CGCT	2	8	2016041	2016048	0 %	25 %	25 %	50 %	350525994
36042	NC_016051	ATA	2	6	2016160	2016165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525994
36043	NC_016051	TCG	2	6	2016231	2016236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525994
36044	NC_016051	GGA	2	6	2016249	2016254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525994
36045	NC_016051	TCG	2	6	2016267	2016272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525994
36046	NC_016051	CGA	2	6	2016294	2016299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525994
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36048	NC_016051	CGT	2	6	2016336	2016341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525994
36049	NC_016051	CG	3	6	2016346	2016351	0 %	0 %	50 %	50 %	350525994
36050	NC_016051	GAG	2	6	2016438	2016443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478946
36051	NC_016051	GGC	2	6	2016450	2016455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478946
36052	NC_016051	CTC	2	6	2016489	2016494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478946
36053	NC_016051	CGG	2	6	2016549	2016554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478946
36054	NC_016051	TGTAC	2	10	2016605	2016614	20 %	40 %	20 %	20 %	223478946
36055	NC_016051	GA	3	6	2016627	2016632	50 %	0 %	50 %	0 %	223478946
36056	NC_016051	TG	3	6	2016646	2016651	0 %	50 %	50 %	0 %	223478946
36057	NC_016051	GTT	2	6	2016666	2016671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478946
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36059	NC_016051	CGTG	2	8	2016761	2016768	0 %	25 %	50 %	25 %	223478946
36060	NC_016051	GAT	2	6	2016774	2016779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478946
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36062	NC_016051	GTG	2	6	2016807	2016812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478946
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36065	NC_016051	GAG	2	6	2016876	2016881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478946
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36070	NC_016051	CTT	2	6	2017016	2017021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478946
36071	NC_016051	TC	3	6	2017042	2017047	0 %	50 %	0 %	50 %	223478946
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36073	NC_016051	GGTTG	2	10	2017080	2017089	0 %	40 %	60 %	0 %	223478946
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36101	NC_016051	TTCCTG	2	12	2018273	2018284	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	223478600
36102	NC_016051	CG	3	6	2018354	2018359	0 %	0 %	50 %	50 %	223478963
36103	NC_016051	ACG	2	6	2018416	2018421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478963
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36105	NC_016051	AGT	2	6	2018447	2018452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478963
36106	NC_016051	CCA	2	6	2018531	2018536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478963
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36108	NC_016051	AG	4	8	2018770	2018777	50 %	0 %	50 %	0 %	223478963
36109	NC_016051	AGCC	2	8	2018818	2018825	25 %	0 %	25 %	50 %	223478963
36110	NC_016051	CAA	2	6	2018960	2018965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478963
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36113	NC_016051	CACCG	2	10	2019168	2019177	20 %	0 %	20 %	60 %	223478963
36114	NC_016051	CAT	2	6	2019186	2019191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478963
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36117	NC_016051	CTT	2	6	2019294	2019299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478963
36118	NC_016051	AGC	2	6	2019378	2019383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478787
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36347	NC_016051	CAA	2	6	2031513	2031518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478970
36348	NC_016051	CGGT	2	8	2031620	2031627	0 %	25 %	50 %	25 %	223478970
36349	NC_016051	CGG	2	6	2031648	2031653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478970
36350	NC_016051	AAG	2	6	2031655	2031660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478970
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36353	NC_016051	CTT	2	6	2031815	2031820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478819
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36382	NC_016051	CAT	2	6	2033122	2033127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478650
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36450	NC_016051	GAACG	2	10	2036779	2036788	40 %	0 %	40 %	20 %	223478435
36451	NC_016051	CCAA	2	8	2036822	2036829	50 %	0 %	0 %	50 %	223478435
36452	NC_016051	ATA	2	6	2036837	2036842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478435
36453	NC_016051	GAA	2	6	2036854	2036859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478435
36454	NC_016051	CGA	2	6	2036872	2036877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478435
36455	NC_016051	AGG	2	6	2037063	2037068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478435
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36457	NC_016051	ATG	2	6	2037084	2037089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478435
36458	NC_016051	GAAAG	2	10	2037094	2037103	60 %	0 %	40 %	0 %	223478435
36459	NC_016051	CTC	2	6	2037128	2037133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478435
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36461	NC_016051	CCGA	2	8	2037197	2037204	25 %	0 %	25 %	50 %	223478435
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36463	NC_016051	CTG	2	6	2037265	2037270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478435
36464	NC_016051	GAACG	2	10	2037502	2037511	40 %	0 %	40 %	20 %	223478435
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