MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016051	TG	3	6	166522	166527	0 %	50 %	50 %	0 %	223478452
3002	NC_016051	CGA	2	6	166533	166538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478452
3003	NC_016051	GAT	2	6	166540	166545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478452
3004	NC_016051	TTC	2	6	166546	166551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478452
3005	NC_016051	C	6	6	166563	166568	0 %	0 %	0 %	100 %	223478452
3006	NC_016051	TCG	2	6	166583	166588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478452
3007	NC_016051	GA	3	6	166774	166779	50 %	0 %	50 %	0 %	223478452
3008	NC_016051	TCA	2	6	166983	166988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525708
3009	NC_016051	TCC	2	6	167308	167313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478715
3010	NC_016051	TTC	2	6	167337	167342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478715
3011	NC_016051	GAG	2	6	167415	167420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478715
3012	NC_016051	AG	3	6	167474	167479	50 %	0 %	50 %	0 %	223478715
3013	NC_016051	CTTC	2	8	167490	167497	0 %	50 %	0 %	50 %	223478715
3014	NC_016051	GAAGGT	2	12	167555	167566	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	223478715
3015	NC_016051	TCC	2	6	167587	167592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478715
3016	NC_016051	CCTCG	2	10	167700	167709	0 %	20 %	20 %	60 %	223478715
3017	NC_016051	GTA	2	6	167787	167792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478715
3018	NC_016051	TCC	2	6	167845	167850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478715
3019	NC_016051	CCT	2	6	167859	167864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478715
3020	NC_016051	T	6	6	167961	167966	0 %	100 %	0 %	0 %	223478715
3021	NC_016051	GTC	2	6	168030	168035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478715
3022	NC_016051	ACC	2	6	168076	168081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478715
3023	NC_016051	CGAG	2	8	168098	168105	25 %	0 %	50 %	25 %	223478715
3024	NC_016051	TCCT	2	8	168112	168119	0 %	50 %	0 %	50 %	223478715
3025	NC_016051	TGG	2	6	168121	168126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478715
3026	NC_016051	TCG	2	6	168292	168297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478715
3027	NC_016051	TCGCC	2	10	168314	168323	0 %	20 %	20 %	60 %	223478715
3028	NC_016051	CAT	2	6	168357	168362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478715
3029	NC_016051	CTG	2	6	168363	168368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478715
3030	NC_016051	GTCC	2	8	168387	168394	0 %	25 %	25 %	50 %	223478715
3031	NC_016051	ATT	2	6	168427	168432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478715
3032	NC_016051	TGAA	2	8	168437	168444	50 %	25 %	25 %	0 %	223478715
3033	NC_016051	TC	3	6	168528	168533	0 %	50 %	0 %	50 %	223478715
3034	NC_016051	GTG	2	6	168552	168557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478715
3035	NC_016051	CTT	2	6	168582	168587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478715
3036	NC_016051	GCTG	2	8	168617	168624	0 %	25 %	50 %	25 %	223478715
3037	NC_016051	GC	3	6	168734	168739	0 %	0 %	50 %	50 %	223478715
3038	NC_016051	TCC	2	6	168808	168813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478715
3039	NC_016051	GAC	2	6	168873	168878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478715
3040	NC_016051	CAGC	2	8	168899	168906	25 %	0 %	25 %	50 %	223478715
3041	NC_016051	TCC	2	6	168907	168912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478715
3042	NC_016051	ATC	2	6	168973	168978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478715
3043	NC_016051	CTC	2	6	168989	168994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478715
3044	NC_016051	TCG	2	6	169021	169026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478715
3045	NC_016051	CGT	2	6	169043	169048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478715
3046	NC_016051	CAG	2	6	169091	169096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478715
3047	NC_016051	TAT	2	6	169104	169109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478715
3048	NC_016051	GTC	2	6	169128	169133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478715
3049	NC_016051	TGCCT	2	10	169245	169254	0 %	40 %	20 %	40 %	223478715
3050	NC_016051	GGA	2	6	169262	169267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478715
3051	NC_016051	CTC	2	6	169389	169394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478715
3052	NC_016051	TGA	2	6	169409	169414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478715
3053	NC_016051	TC	3	6	169425	169430	0 %	50 %	0 %	50 %	223478715
3054	NC_016051	TCG	2	6	169444	169449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478715
3055	NC_016051	GA	3	6	169611	169616	50 %	0 %	50 %	0 %	350525709
3056	NC_016051	GGC	2	6	169628	169633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525709
3057	NC_016051	GAG	2	6	169764	169769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525709
3058	NC_016051	AGCA	2	8	169773	169780	50 %	0 %	25 %	25 %	350525709
3059	NC_016051	GAG	2	6	169851	169856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525709
3060	NC_016051	CTG	2	6	169881	169886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525709
3061	NC_016051	A	6	6	170073	170078	100 %	0 %	0 %	0 %	350525709
3062	NC_016051	CAG	2	6	170107	170112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478445
3063	NC_016051	CGG	2	6	170211	170216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478445
3064	NC_016051	CGG	2	6	170229	170234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478445
3065	NC_016051	CTT	3	9	170256	170264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478445
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3067	NC_016051	TCT	2	6	170348	170353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478445
3068	NC_016051	GACC	2	8	170360	170367	25 %	0 %	25 %	50 %	223478445
3069	NC_016051	ACG	2	6	170419	170424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478445
3070	NC_016051	CTT	2	6	170463	170468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478445
3071	NC_016051	TCG	2	6	170533	170538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478445
3072	NC_016051	CCTCTG	2	12	170586	170597	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	223478445
3073	NC_016051	CCG	2	6	170599	170604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478445
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3080	NC_016051	CGA	2	6	170927	170932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478445
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3089	NC_016051	CGT	2	6	171484	171489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478575
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3091	NC_016051	GCT	2	6	171549	171554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478575
3092	NC_016051	ACC	2	6	171559	171564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478575
3093	NC_016051	CCT	2	6	171640	171645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478575
3094	NC_016051	CCT	2	6	171651	171656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478575
3095	NC_016051	ACC	2	6	171680	171685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478575
3096	NC_016051	TCC	2	6	171788	171793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478575
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3099	NC_016051	TTC	2	6	171861	171866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478575
3100	NC_016051	CGAA	2	8	171963	171970	50 %	0 %	25 %	25 %	223478575
3101	NC_016051	TCC	2	6	172071	172076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478561
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3104	NC_016051	GAG	2	6	172154	172159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478561
3105	NC_016051	ATC	2	6	172185	172190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478561
3106	NC_016051	CCA	2	6	172211	172216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478561
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3108	NC_016051	GCG	2	6	172273	172278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478561
3109	NC_016051	GCCT	2	8	172304	172311	0 %	25 %	25 %	50 %	223478561
3110	NC_016051	GAT	2	6	172364	172369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478561
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3112	NC_016051	CAG	2	6	172526	172531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478561
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3116	NC_016051	TCC	2	6	172721	172726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478561
3117	NC_016051	GACTAT	2	12	172775	172786	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	223478561
3118	NC_016051	GAAG	2	8	172799	172806	50 %	0 %	50 %	0 %	223478561
3119	NC_016051	CAG	2	6	172832	172837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478561
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3121	NC_016051	G	6	6	172913	172918	0 %	0 %	100 %	0 %	223478561
3122	NC_016051	TAGG	2	8	172922	172929	25 %	25 %	50 %	0 %	223478561
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3229	NC_016051	CTT	2	6	178930	178935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525711
3230	NC_016051	CTC	2	6	178945	178950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525711
3231	NC_016051	CTG	2	6	179054	179059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525711
3232	NC_016051	CAA	2	6	179100	179105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350525711
3233	NC_016051	GAG	2	6	179149	179154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525711
3234	NC_016051	GTA	2	6	179164	179169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525711
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3236	NC_016051	ACT	2	6	179240	179245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525711
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3238	NC_016051	CTG	2	6	180333	180338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525712
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3240	NC_016051	TGT	2	6	180374	180379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525712
3241	NC_016051	CTT	2	6	180389	180394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525712
3242	NC_016051	CTT	2	6	180401	180406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525712
3243	NC_016051	TAC	2	6	181658	181663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478703
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3245	NC_016051	GTA	2	6	181730	181735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478703
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3357	NC_016051	GAC	2	6	187868	187873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478687
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3483	NC_016051	CAG	2	6	194784	194789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478708
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