MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_016051	ATC	2	6	1816549	1816554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476900
32502	NC_016051	ATT	2	6	1816587	1816592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223476900
32503	NC_016051	GTA	2	6	1816613	1816618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476900
32504	NC_016051	CATA	2	8	1816638	1816645	50 %	25 %	0 %	25 %	223476900
32505	NC_016051	GATAA	2	10	1816715	1816724	60 %	20 %	20 %	0 %	223476900
32506	NC_016051	AT	3	6	1816744	1816749	50 %	50 %	0 %	0 %	223476900
32507	NC_016051	A	6	6	1816762	1816767	100 %	0 %	0 %	0 %	223476900
32508	NC_016051	GGA	2	6	1816807	1816812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476900
32509	NC_016051	A	6	6	1816858	1816863	100 %	0 %	0 %	0 %	223476900
32510	NC_016051	GGA	2	6	1816867	1816872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476900
32511	NC_016051	ATT	2	6	1816883	1816888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223476900
32512	NC_016051	AT	3	6	1816984	1816989	50 %	50 %	0 %	0 %	223476900
32513	NC_016051	CTA	2	6	1817038	1817043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476900
32514	NC_016051	AAG	2	6	1817112	1817117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476900
32515	NC_016051	TTGC	2	8	1817123	1817130	0 %	50 %	25 %	25 %	223476900
32516	NC_016051	TA	3	6	1817141	1817146	50 %	50 %	0 %	0 %	223476900
32517	NC_016051	TAG	2	6	1817301	1817306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476900
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32519	NC_016051	ATT	2	6	1817387	1817392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223476900
32520	NC_016051	AAG	2	6	1817450	1817455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476900
32521	NC_016051	GA	4	8	1817469	1817476	50 %	0 %	50 %	0 %	223476900
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32523	NC_016051	TAG	2	6	1817580	1817585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476900
32524	NC_016051	TTA	2	6	1817712	1817717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223476900
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32527	NC_016051	AT	3	6	1817797	1817802	50 %	50 %	0 %	0 %	223476900
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32532	NC_016051	TAC	2	6	1817926	1817931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476900
32533	NC_016051	AT	3	6	1817961	1817966	50 %	50 %	0 %	0 %	223476900
32534	NC_016051	AG	3	6	1818072	1818077	50 %	0 %	50 %	0 %	223476900
32535	NC_016051	A	6	6	1818095	1818100	100 %	0 %	0 %	0 %	223476900
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32537	NC_016051	A	6	6	1818180	1818185	100 %	0 %	0 %	0 %	223476900
32538	NC_016051	TGA	2	6	1818199	1818204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476900
32539	NC_016051	TAC	2	6	1818236	1818241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476900
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32541	NC_016051	CAGG	2	8	1818956	1818963	25 %	0 %	50 %	25 %	223476871
32542	NC_016051	ATC	2	6	1818973	1818978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476871
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32544	NC_016051	GAA	2	6	1819055	1819060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476871
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32546	NC_016051	TC	4	8	1819574	1819581	0 %	50 %	0 %	50 %	223476875
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32552	NC_016051	TAGT	2	8	1819855	1819862	25 %	50 %	25 %	0 %	223476875
32553	NC_016051	AGAT	2	8	1819892	1819899	50 %	25 %	25 %	0 %	223476875
32554	NC_016051	CTT	2	6	1820000	1820005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476875
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32603	NC_016051	TCT	2	6	1822270	1822275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476881
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32853	NC_016051	ACC	2	6	1835979	1835984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350525974
32854	NC_016051	GTC	2	6	1835988	1835993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525974
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32964	NC_016051	CGTCAC	2	12	1844009	1844020	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	223476915
32965	NC_016051	GTC	2	6	1844058	1844063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476915
32966	NC_016051	CCA	2	6	1844218	1844223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476915
32967	NC_016051	CGT	2	6	1844258	1844263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476915
32968	NC_016051	GGA	2	6	1844297	1844302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476915
32969	NC_016051	AAG	2	6	1844316	1844321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476915
32970	NC_016051	CCGA	2	8	1844376	1844383	25 %	0 %	25 %	50 %	223476915
32971	NC_016051	ACCT	2	8	1844391	1844398	25 %	25 %	0 %	50 %	223476915
32972	NC_016051	CGA	2	6	1844432	1844437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
32973	NC_016051	TCGAC	2	10	1844461	1844470	20 %	20 %	20 %	40 %	223476915
32974	NC_016051	GGC	2	6	1844529	1844534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476915
32975	NC_016051	CGC	2	6	1844603	1844608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476915
32976	NC_016051	GAC	2	6	1844736	1844741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
32977	NC_016051	ACT	2	6	1844769	1844774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
32978	NC_016051	TCAATG	2	12	1844812	1844823	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	223476915
32979	NC_016051	CCT	2	6	1844939	1844944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476915
32980	NC_016051	TTG	2	6	1844995	1845000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476915
32981	NC_016051	CGG	2	6	1845017	1845022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476915
32982	NC_016051	ACC	3	9	1845072	1845080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476915
32983	NC_016051	CAG	2	6	1845115	1845120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
32984	NC_016051	GTT	2	6	1845132	1845137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476915
32985	NC_016051	CAC	2	6	1845215	1845220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476915
32986	NC_016051	CCG	2	6	1845229	1845234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476915
32987	NC_016051	GAG	2	6	1845243	1845248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476915
32988	NC_016051	CGA	3	9	1845272	1845280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915
32989	NC_016051	ACC	2	6	1845288	1845293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476915
32990	NC_016051	ATC	2	6	1845489	1845494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
32991	NC_016051	ATG	2	6	1845625	1845630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476915
32992	NC_016051	CTG	2	6	1845661	1845666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476915
32993	NC_016051	AAC	2	6	1845669	1845674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476915
32994	NC_016051	CCAA	2	8	1845696	1845703	50 %	0 %	0 %	50 %	223476915
32995	NC_016051	ACT	2	6	1845814	1845819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476915
32996	NC_016051	AAG	2	6	1845867	1845872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476915
32997	NC_016051	AGG	2	6	1845988	1845993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476915
32998	NC_016051	AAG	2	6	1846062	1846067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476915
32999	NC_016051	TTCGAG	2	12	1846110	1846121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	223476915
33000	NC_016051	CGA	2	6	1846163	1846168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476915

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