MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_016051	CCA	2	6	1757471	1757476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477547
31502	NC_016051	GTC	3	9	1757499	1757507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477547
31503	NC_016051	GGC	2	6	1757525	1757530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477547
31504	NC_016051	GGAG	2	8	1757566	1757573	25 %	0 %	75 %	0 %	223477547
31505	NC_016051	CGG	2	6	1757589	1757594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477547
31506	NC_016051	CAC	2	6	1757596	1757601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477547
31507	NC_016051	ACC	2	6	1757651	1757656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477547
31508	NC_016051	CGG	2	6	1757662	1757667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477547
31509	NC_016051	ACG	3	9	1757682	1757690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477547
31510	NC_016051	GAG	2	6	1757878	1757883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477564
31511	NC_016051	CGG	2	6	1757916	1757921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477564
31512	NC_016051	CTT	2	6	1757959	1757964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477564
31513	NC_016051	TAT	2	6	1758007	1758012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477564
31514	NC_016051	CCA	2	6	1758030	1758035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477564
31515	NC_016051	TCT	2	6	1758075	1758080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477564
31516	NC_016051	TTC	2	6	1758086	1758091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477564
31517	NC_016051	TGT	2	6	1758105	1758110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477564
31518	NC_016051	GGA	2	6	1758147	1758152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477564
31519	NC_016051	CTC	2	6	1758172	1758177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477564
31520	NC_016051	TCA	2	6	1758284	1758289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477564
31521	NC_016051	CTT	2	6	1758292	1758297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477564
31522	NC_016051	CTT	2	6	1758322	1758327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477564
31523	NC_016051	TCC	3	9	1758369	1758377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477564
31524	NC_016051	GGT	2	6	1758391	1758396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477564
31525	NC_016051	AG	3	6	1758449	1758454	50 %	0 %	50 %	0 %	223477564
31526	NC_016051	ACGT	2	8	1758470	1758477	25 %	25 %	25 %	25 %	223477564
31527	NC_016051	CAC	2	6	1758478	1758483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477564
31528	NC_016051	CTTC	2	8	1758513	1758520	0 %	50 %	0 %	50 %	223477564
31529	NC_016051	GGCA	2	8	1758638	1758645	25 %	0 %	50 %	25 %	223477564
31530	NC_016051	GA	3	6	1758661	1758666	50 %	0 %	50 %	0 %	223477564
31531	NC_016051	TAT	2	6	1758721	1758726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477564
31532	NC_016051	AAG	2	6	1758815	1758820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477535
31533	NC_016051	AAG	2	6	1758854	1758859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477535
31534	NC_016051	AGG	2	6	1758909	1758914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477535
31535	NC_016051	TCC	2	6	1759002	1759007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477535
31536	NC_016051	ACG	2	6	1759016	1759021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477535
31537	NC_016051	AAGC	2	8	1759030	1759037	50 %	0 %	25 %	25 %	223477535
31538	NC_016051	C	6	6	1759037	1759042	0 %	0 %	0 %	100 %	223477535
31539	NC_016051	ATG	2	6	1759133	1759138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477535
31540	NC_016051	TGG	2	6	1759328	1759333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477535
31541	NC_016051	AGG	2	6	1759344	1759349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477535
31542	NC_016051	CTC	2	6	1759373	1759378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477535
31543	NC_016051	GAG	2	6	1759381	1759386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477535
31544	NC_016051	ACC	2	6	1759440	1759445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477535
31545	NC_016051	GA	3	6	1759493	1759498	50 %	0 %	50 %	0 %	223477535
31546	NC_016051	CAG	2	6	1759533	1759538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477535
31547	NC_016051	CTC	2	6	1759613	1759618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477535
31548	NC_016051	CTC	2	6	1759706	1759711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477535
31549	NC_016051	CTC	2	6	1759847	1759852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477535
31550	NC_016051	GGCATA	2	12	1759853	1759864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	223477535
31551	NC_016051	GAA	2	6	1759883	1759888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477535
31552	NC_016051	GAGATA	2	12	1759913	1759924	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	223477535
31553	NC_016051	AAG	2	6	1759937	1759942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477535
31554	NC_016051	AAG	2	6	1759976	1759981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477535
31555	NC_016051	GAG	2	6	1759997	1760002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477535
31556	NC_016051	AAG	2	6	1760104	1760109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477423
31557	NC_016051	AGG	2	6	1760110	1760115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477423
31558	NC_016051	GAG	2	6	1760146	1760151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477423
31559	NC_016051	CT	3	6	1760211	1760216	0 %	50 %	0 %	50 %	223477423
31560	NC_016051	CGG	2	6	1760286	1760291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477423
31561	NC_016051	TC	3	6	1760308	1760313	0 %	50 %	0 %	50 %	223477423
31562	NC_016051	CT	3	6	1760340	1760345	0 %	50 %	0 %	50 %	223477423
31563	NC_016051	TGAGC	2	10	1760421	1760430	20 %	20 %	40 %	20 %	223477423
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31569	NC_016051	GAA	2	6	1760828	1760833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477423
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31587	NC_016051	CG	3	6	1761854	1761859	0 %	0 %	50 %	50 %	223477412
31588	NC_016051	CTTA	2	8	1761894	1761901	25 %	50 %	0 %	25 %	223477412
31589	NC_016051	GA	3	6	1761944	1761949	50 %	0 %	50 %	0 %	223477412
31590	NC_016051	CTTGG	2	10	1761968	1761977	0 %	40 %	40 %	20 %	223477412
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31600	NC_016051	A	6	6	1763722	1763727	100 %	0 %	0 %	0 %	223477649
31601	NC_016051	TGA	2	6	1763763	1763768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477649
31602	NC_016051	TCAT	2	8	1763969	1763976	25 %	50 %	0 %	25 %	223477649
31603	NC_016051	CGT	2	6	1764111	1764116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477649
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31605	NC_016051	TGA	2	6	1765768	1765773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525965
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31607	NC_016051	TGG	2	6	1765905	1765910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525965
31608	NC_016051	GGT	2	6	1766056	1766061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525965
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31611	NC_016051	GAA	3	9	1766101	1766109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525965
31612	NC_016051	GTCCT	2	10	1766150	1766159	0 %	40 %	20 %	40 %	223477472
31613	NC_016051	TCT	2	6	1766188	1766193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477472
31614	NC_016051	CGA	2	6	1766343	1766348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477472
31615	NC_016051	TCT	2	6	1766391	1766396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477472
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