MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_016051	GCC	2	6	1728855	1728860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477552
31002	NC_016051	GAGAAG	2	12	1728882	1728893	50 %	0 %	50 %	0 %	223477552
31003	NC_016051	CTA	2	6	1728899	1728904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477552
31004	NC_016051	AGG	2	6	1728910	1728915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477552
31005	NC_016051	GAA	2	6	1728929	1728934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477552
31006	NC_016051	GCC	2	6	1728954	1728959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477552
31007	NC_016051	GAG	2	6	1728981	1728986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477552
31008	NC_016051	GGA	2	6	1729001	1729006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477552
31009	NC_016051	GAG	2	6	1729023	1729028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477552
31010	NC_016051	TAC	2	6	1729077	1729082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477552
31011	NC_016051	AGG	2	6	1729087	1729092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477552
31012	NC_016051	AGG	2	6	1729096	1729101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477552
31013	NC_016051	GGA	2	6	1729115	1729120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477552
31014	NC_016051	AG	3	6	1729149	1729154	50 %	0 %	50 %	0 %	223477552
31015	NC_016051	TGG	2	6	1729224	1729229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477552
31016	NC_016051	AGA	2	6	1729277	1729282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477552
31017	NC_016051	GAA	2	6	1729289	1729294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477552
31018	NC_016051	GAG	2	6	1729299	1729304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477552
31019	NC_016051	GAA	2	6	1729332	1729337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477552
31020	NC_016051	GGA	2	6	1729469	1729474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477511
31021	NC_016051	GAC	2	6	1729497	1729502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477511
31022	NC_016051	CGT	2	6	1729547	1729552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477511
31023	NC_016051	CGA	2	6	1729556	1729561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477511
31024	NC_016051	ATA	2	6	1729599	1729604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477511
31025	NC_016051	CCT	3	9	1729607	1729615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477511
31026	NC_016051	TCC	2	6	1729616	1729621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477511
31027	NC_016051	ATG	3	9	1729755	1729763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477511
31028	NC_016051	GAA	3	9	1729796	1729804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477511
31029	NC_016051	TTGA	2	8	1729872	1729879	25 %	50 %	25 %	0 %	223477504
31030	NC_016051	CGG	2	6	1729912	1729917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477504
31031	NC_016051	GGCT	2	8	1729926	1729933	0 %	25 %	50 %	25 %	223477504
31032	NC_016051	CGG	2	6	1729976	1729981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477504
31033	NC_016051	GGA	2	6	1730012	1730017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477504
31034	NC_016051	TCG	2	6	1730128	1730133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477504
31035	NC_016051	GTT	2	6	1730136	1730141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477504
31036	NC_016051	CTC	2	6	1730199	1730204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477504
31037	NC_016051	GC	3	6	1730209	1730214	0 %	0 %	50 %	50 %	223477504
31038	NC_016051	GAC	2	6	1730216	1730221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477504
31039	NC_016051	GATGGA	2	12	1730255	1730266	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	223477504
31040	NC_016051	CGA	2	6	1730315	1730320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477504
31041	NC_016051	GTC	2	6	1730346	1730351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477504
31042	NC_016051	GCC	2	6	1730523	1730528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477504
31043	NC_016051	ATA	2	6	1730649	1730654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477504
31044	NC_016051	TTC	2	6	1730679	1730684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477504
31045	NC_016051	CGG	2	6	1730804	1730809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477504
31046	NC_016051	TGA	2	6	1730938	1730943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477504
31047	NC_016051	CTC	2	6	1730973	1730978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477504
31048	NC_016051	GCTT	2	8	1730981	1730988	0 %	50 %	25 %	25 %	223477504
31049	NC_016051	AGGG	2	8	1730991	1730998	25 %	0 %	75 %	0 %	223477504
31050	NC_016051	CTC	2	6	1731017	1731022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477631
31051	NC_016051	TCC	2	6	1731036	1731041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477631
31052	NC_016051	CT	3	6	1731051	1731056	0 %	50 %	0 %	50 %	223477631
31053	NC_016051	CTC	2	6	1731106	1731111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477631
31054	NC_016051	GAA	2	6	1731124	1731129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477631
31055	NC_016051	CGC	3	9	1731131	1731139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477631
31056	NC_016051	GAT	2	6	1731269	1731274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525960
31057	NC_016051	GAA	2	6	1731296	1731301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525960
31058	NC_016051	AGC	2	6	1731310	1731315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525960
31059	NC_016051	GGA	2	6	1731329	1731334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525960
31060	NC_016051	AGG	2	6	1731349	1731354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525960
31061	NC_016051	CGT	2	6	1731398	1731403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525960
31062	NC_016051	GTC	2	6	1731414	1731419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525960
31063	NC_016051	GA	3	6	1731424	1731429	50 %	0 %	50 %	0 %	350525960
31064	NC_016051	GAG	2	6	1731456	1731461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525960
31065	NC_016051	GAAA	2	8	1731551	1731558	75 %	0 %	25 %	0 %	350525960
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31067	NC_016051	GTC	2	6	1731633	1731638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477589
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31069	NC_016051	TCCT	2	8	1731799	1731806	0 %	50 %	0 %	50 %	223477589
31070	NC_016051	GAG	2	6	1731810	1731815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477589
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31088	NC_016051	TGA	2	6	1732733	1732738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477589
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31102	NC_016051	CGTC	2	8	1733379	1733386	0 %	25 %	25 %	50 %	223477443
31103	NC_016051	GCCG	2	8	1733401	1733408	0 %	0 %	50 %	50 %	223477443
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31116	NC_016051	GT	3	6	1734222	1734227	0 %	50 %	50 %	0 %	223477437
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31233	NC_016051	ATC	2	6	1740267	1740272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477583
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31462	NC_016051	C	7	7	1755389	1755395	0 %	0 %	0 %	100 %	350525964
31463	NC_016051	TCC	2	6	1755444	1755449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525964
31464	NC_016051	CTC	3	9	1755451	1755459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525964
31465	NC_016051	TCC	2	6	1755551	1755556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525964
31466	NC_016051	GA	3	6	1755638	1755643	50 %	0 %	50 %	0 %	350525964
31467	NC_016051	TCA	2	6	1755672	1755677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525964
31468	NC_016051	CTC	2	6	1755688	1755693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525964
31469	NC_016051	TCC	3	9	1755719	1755727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525964
31470	NC_016051	CCT	2	6	1755747	1755752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525964
31471	NC_016051	AAGG	2	8	1755781	1755788	50 %	0 %	50 %	0 %	350525964
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31483	NC_016051	CGA	2	6	1756535	1756540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477373
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31485	NC_016051	CG	3	6	1756586	1756591	0 %	0 %	50 %	50 %	223477428
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31491	NC_016051	TGG	2	6	1756999	1757004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477431
31492	NC_016051	AGG	2	6	1757018	1757023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477431
31493	NC_016051	TGGA	2	8	1757164	1757171	25 %	25 %	50 %	0 %	223477431
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