MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_016051	CCT	2	6	1661772	1661777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525947
30003	NC_016051	CCA	2	6	1661883	1661888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350525947
30004	NC_016051	CTT	3	9	1661905	1661913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525947
30005	NC_016051	TCC	2	6	1661930	1661935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525947
30006	NC_016051	ATG	2	6	1661954	1661959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525947
30007	NC_016051	CCG	2	6	1661966	1661971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525947
30008	NC_016051	GGCC	2	8	1661979	1661986	0 %	0 %	50 %	50 %	350525947
30009	NC_016051	GAC	2	6	1662022	1662027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525947
30010	NC_016051	GTC	2	6	1662073	1662078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525947
30011	NC_016051	GAA	2	6	1662124	1662129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525947
30012	NC_016051	CCT	2	6	1662153	1662158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525947
30013	NC_016051	CCT	2	6	1662603	1662608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525948
30014	NC_016051	C	7	7	1662663	1662669	0 %	0 %	0 %	100 %	350525948
30015	NC_016051	CTC	2	6	1662703	1662708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525948
30016	NC_016051	ACG	2	6	1662760	1662765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525948
30017	NC_016051	CGG	2	6	1662887	1662892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525948
30018	NC_016051	CG	3	6	1662911	1662916	0 %	0 %	50 %	50 %	350525948
30019	NC_016051	AAG	2	6	1663147	1663152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525948
30020	NC_016051	GCC	2	6	1663183	1663188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525948
30021	NC_016051	TCGGC	2	10	1663193	1663202	0 %	20 %	40 %	40 %	350525948
30022	NC_016051	CCAG	2	8	1663247	1663254	25 %	0 %	25 %	50 %	350525948
30023	NC_016051	GTC	2	6	1663270	1663275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525948
30024	NC_016051	TCA	2	6	1663316	1663321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525948
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30026	NC_016051	CGG	2	6	1663567	1663572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477312
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30028	NC_016051	TCC	2	6	1663619	1663624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477312
30029	NC_016051	ACG	2	6	1663673	1663678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477312
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30031	NC_016051	GTCT	2	8	1663759	1663766	0 %	50 %	25 %	25 %	223477312
30032	NC_016051	ACG	2	6	1663775	1663780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477312
30033	NC_016051	TCT	2	6	1663840	1663845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477312
30034	NC_016051	GCTC	2	8	1663860	1663867	0 %	25 %	25 %	50 %	223477312
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30036	NC_016051	G	6	6	1663942	1663947	0 %	0 %	100 %	0 %	223477312
30037	NC_016051	AGG	2	6	1663979	1663984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477312
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30039	NC_016051	CCTCGT	2	12	1664011	1664022	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	223477312
30040	NC_016051	GAG	2	6	1664080	1664085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477312
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30042	NC_016051	CTG	2	6	1664236	1664241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477312
30043	NC_016051	CTTC	2	8	1664304	1664311	0 %	50 %	0 %	50 %	223477312
30044	NC_016051	CCT	2	6	1664361	1664366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477312
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30048	NC_016051	TGT	2	6	1664547	1664552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477312
30049	NC_016051	CTC	2	6	1664563	1664568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477312
30050	NC_016051	CTGTT	2	10	1664570	1664579	0 %	60 %	20 %	20 %	223477312
30051	NC_016051	TTC	2	6	1664620	1664625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477312
30052	NC_016051	TGA	2	6	1664664	1664669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477312
30053	NC_016051	CA	3	6	1664810	1664815	50 %	0 %	0 %	50 %	223477348
30054	NC_016051	GGGT	2	8	1664820	1664827	0 %	25 %	75 %	0 %	223477348
30055	NC_016051	GAAG	2	8	1664839	1664846	50 %	0 %	50 %	0 %	223477348
30056	NC_016051	AGG	2	6	1664901	1664906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477348
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30059	NC_016051	TC	3	6	1665000	1665005	0 %	50 %	0 %	50 %	223477348
30060	NC_016051	ACA	2	6	1665072	1665077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477348
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30085	NC_016051	CTC	3	9	1666495	1666503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477420
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30091	NC_016051	GGCC	2	8	1666962	1666969	0 %	0 %	50 %	50 %	223477329
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30100	NC_016051	TCCCT	2	10	1667662	1667671	0 %	40 %	0 %	60 %	223477335
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30116	NC_016051	CGG	2	6	1668323	1668328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477319
30117	NC_016051	TCA	2	6	1668353	1668358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477319
30118	NC_016051	GAG	2	6	1668415	1668420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477319
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30464	NC_016051	CGA	2	6	1685598	1685603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477595
30465	NC_016051	TCCTC	2	10	1685638	1685647	0 %	40 %	0 %	60 %	223477595
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30467	NC_016051	GTC	2	6	1685731	1685736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477595
30468	NC_016051	GCC	2	6	1685807	1685812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477595
30469	NC_016051	TCG	2	6	1685924	1685929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477595
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30471	NC_016051	CTC	2	6	1686000	1686005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477595
30472	NC_016051	TCG	2	6	1686095	1686100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477595
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30475	NC_016051	ATA	2	6	1686173	1686178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477595
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30479	NC_016051	GGAT	2	8	1686471	1686478	25 %	25 %	50 %	0 %	350525951
30480	NC_016051	AAGG	2	8	1686499	1686506	50 %	0 %	50 %	0 %	350525951
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30484	NC_016051	TAT	2	6	1690983	1690988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350525953
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30487	NC_016051	CCT	2	6	1691079	1691084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525953
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30490	NC_016051	AAC	2	6	1693230	1693235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350525954
30491	NC_016051	G	6	6	1693282	1693287	0 %	0 %	100 %	0 %	350525954
30492	NC_016051	AGA	2	6	1693354	1693359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525954
30493	NC_016051	GCCA	2	8	1693402	1693409	25 %	0 %	25 %	50 %	350525954
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30495	NC_016051	TAT	2	6	1694937	1694942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477515
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30497	NC_016051	TTTC	2	8	1695064	1695071	0 %	75 %	0 %	25 %	223477515
30498	NC_016051	GTAG	2	8	1695275	1695282	25 %	25 %	50 %	0 %	223477515
30499	NC_016051	CAG	2	6	1695336	1695341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477515
30500	NC_016051	AG	3	6	1695363	1695368	50 %	0 %	50 %	0 %	223477515

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