MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_016051	AGCTG	2	10	1634320	1634329	20 %	20 %	40 %	20 %	223477483
29503	NC_016051	TGA	2	6	1634362	1634367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477483
29504	NC_016051	TTG	2	6	1634403	1634408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477483
29505	NC_016051	GA	4	8	1634411	1634418	50 %	0 %	50 %	0 %	223477483
29506	NC_016051	CTG	2	6	1635169	1635174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525944
29507	NC_016051	GCG	2	6	1635230	1635235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525944
29508	NC_016051	ACT	2	6	1635269	1635274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525944
29509	NC_016051	CGT	2	6	1635288	1635293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525944
29510	NC_016051	GAA	2	6	1635415	1635420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525944
29511	NC_016051	CGG	2	6	1635660	1635665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525944
29512	NC_016051	TTA	2	6	1635666	1635671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350525944
29513	NC_016051	AAG	2	6	1635694	1635699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525944
29514	NC_016051	GCC	2	6	1635718	1635723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525944
29515	NC_016051	GA	3	6	1636135	1636140	50 %	0 %	50 %	0 %	223477641
29516	NC_016051	GAC	2	6	1636160	1636165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477641
29517	NC_016051	CAG	2	6	1636226	1636231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477641
29518	NC_016051	GAG	2	6	1636343	1636348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477641
29519	NC_016051	CTA	2	6	1636408	1636413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477641
29520	NC_016051	TGA	2	6	1636479	1636484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477641
29521	NC_016051	GAAA	2	8	1636493	1636500	75 %	0 %	25 %	0 %	223477641
29522	NC_016051	GAA	2	6	1636510	1636515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477405
29523	NC_016051	GAAA	2	8	1636526	1636533	75 %	0 %	25 %	0 %	223477405
29524	NC_016051	G	6	6	1636568	1636573	0 %	0 %	100 %	0 %	223477405
29525	NC_016051	ACG	2	6	1636574	1636579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477405
29526	NC_016051	GA	3	6	1636600	1636605	50 %	0 %	50 %	0 %	223477405
29527	NC_016051	TCG	2	6	1636703	1636708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477405
29528	NC_016051	TCG	2	6	1636712	1636717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477405
29529	NC_016051	CGAG	2	8	1636904	1636911	25 %	0 %	50 %	25 %	223477405
29530	NC_016051	GA	3	6	1636930	1636935	50 %	0 %	50 %	0 %	223477405
29531	NC_016051	CAA	2	6	1636979	1636984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477405
29532	NC_016051	TC	3	6	1637055	1637060	0 %	50 %	0 %	50 %	223477567
29533	NC_016051	AAGG	2	8	1637123	1637130	50 %	0 %	50 %	0 %	223477567
29534	NC_016051	CTG	2	6	1637147	1637152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477567
29535	NC_016051	CT	3	6	1637214	1637219	0 %	50 %	0 %	50 %	223477567
29536	NC_016051	TCC	2	6	1637279	1637284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477424
29537	NC_016051	GA	3	6	1637384	1637389	50 %	0 %	50 %	0 %	223477424
29538	NC_016051	CCCG	2	8	1637399	1637406	0 %	0 %	25 %	75 %	223477424
29539	NC_016051	CT	3	6	1637616	1637621	0 %	50 %	0 %	50 %	223477424
29540	NC_016051	AGC	2	6	1637626	1637631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477424
29541	NC_016051	TCT	2	6	1637788	1637793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477424
29542	NC_016051	TCC	2	6	1637861	1637866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477587
29543	NC_016051	TCC	2	6	1637872	1637877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477587
29544	NC_016051	GAA	2	6	1637892	1637897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477587
29545	NC_016051	CTC	2	6	1637910	1637915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477587
29546	NC_016051	GGGA	2	8	1637917	1637924	25 %	0 %	75 %	0 %	223477587
29547	NC_016051	GCG	2	6	1638031	1638036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477587
29548	NC_016051	CGA	2	6	1638119	1638124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477587
29549	NC_016051	ACG	2	6	1638157	1638162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477587
29550	NC_016051	C	6	6	1638196	1638201	0 %	0 %	0 %	100 %	223477587
29551	NC_016051	CAG	2	6	1638213	1638218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477587
29552	NC_016051	TCC	2	6	1638396	1638401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477587
29553	NC_016051	TCC	2	6	1638423	1638428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525945
29554	NC_016051	CTC	2	6	1638431	1638436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525945
29555	NC_016051	CTT	2	6	1638488	1638493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525945
29556	NC_016051	AGT	2	6	1638526	1638531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525945
29557	NC_016051	CG	3	6	1638604	1638609	0 %	0 %	50 %	50 %	350525945
29558	NC_016051	ACG	3	9	1638726	1638734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525945
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29560	NC_016051	GA	3	6	1638786	1638791	50 %	0 %	50 %	0 %	350525945
29561	NC_016051	CTT	2	6	1638833	1638838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525945
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29567	NC_016051	TCG	2	6	1639282	1639287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477331
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29963	NC_016051	TCC	2	6	1660204	1660209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477655
29964	NC_016051	CGA	2	6	1660256	1660261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477655
29965	NC_016051	TTC	2	6	1660267	1660272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477655
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29967	NC_016051	CCT	2	6	1660331	1660336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477655
29968	NC_016051	CTT	2	6	1660403	1660408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477655
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29970	NC_016051	CTT	2	6	1660457	1660462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477655
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29974	NC_016051	CTT	2	6	1660617	1660622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477655
29975	NC_016051	CCT	2	6	1660625	1660630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477655
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29980	NC_016051	CGT	2	6	1660787	1660792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477655
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29984	NC_016051	TC	3	6	1660927	1660932	0 %	50 %	0 %	50 %	223477655
29985	NC_016051	CCA	2	6	1660997	1661002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477655
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29988	NC_016051	GCTC	2	8	1661135	1661142	0 %	25 %	25 %	50 %	223477655
29989	NC_016051	TCT	2	6	1661195	1661200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477655
29990	NC_016051	GAT	2	6	1661202	1661207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477655
29991	NC_016051	G	6	6	1661216	1661221	0 %	0 %	100 %	0 %	223477655
29992	NC_016051	GGC	2	6	1661271	1661276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477655
29993	NC_016051	TCC	2	6	1661333	1661338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477602
29994	NC_016051	TCG	2	6	1661358	1661363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477602
29995	NC_016051	AGT	2	6	1661397	1661402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477602
29996	NC_016051	CAG	2	6	1661465	1661470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477602
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29998	NC_016051	TCC	2	6	1661517	1661522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477602
29999	NC_016051	TTG	2	6	1661702	1661707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525947
30000	NC_016051	CGG	2	6	1661718	1661723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525947

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