MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016051	GCCCC	2	10	137193	137202	0 %	0 %	20 %	80 %	223478520
2502	NC_016051	CGGG	2	8	137220	137227	0 %	0 %	75 %	25 %	223478520
2503	NC_016051	TC	3	6	137229	137234	0 %	50 %	0 %	50 %	223478520
2504	NC_016051	AGG	2	6	137254	137259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478520
2505	NC_016051	GAG	2	6	137313	137318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478788
2506	NC_016051	CTC	2	6	137403	137408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478788
2507	NC_016051	CTC	2	6	137463	137468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478788
2508	NC_016051	CCCTGC	2	12	137609	137620	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	223478788
2509	NC_016051	ATG	2	6	137746	137751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478788
2510	NC_016051	TGG	2	6	137765	137770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478788
2511	NC_016051	GGTT	2	8	137798	137805	0 %	50 %	50 %	0 %	223478788
2512	NC_016051	CTT	2	6	137826	137831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478788
2513	NC_016051	TCG	2	6	137846	137851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478788
2514	NC_016051	TCGCTC	2	12	137896	137907	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	223478788
2515	NC_016051	GCG	2	6	137920	137925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478788
2516	NC_016051	GAG	2	6	138012	138017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478788
2517	NC_016051	CTC	2	6	138049	138054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478788
2518	NC_016051	CCT	2	6	138182	138187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478788
2519	NC_016051	CCCT	2	8	138205	138212	0 %	25 %	0 %	75 %	223478788
2520	NC_016051	ATT	2	6	138229	138234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478788
2521	NC_016051	CGA	2	6	138272	138277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478788
2522	NC_016051	GAC	2	6	138303	138308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478788
2523	NC_016051	TCC	2	6	138340	138345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478788
2524	NC_016051	CGA	2	6	138555	138560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478741
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2527	NC_016051	AGAGC	2	10	138810	138819	40 %	0 %	40 %	20 %	223478741
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2529	NC_016051	TCC	2	6	138885	138890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478741
2530	NC_016051	GAG	2	6	138958	138963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478741
2531	NC_016051	TCG	2	6	139256	139261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478741
2532	NC_016051	GTC	2	6	139285	139290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478741
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2534	NC_016051	CCG	2	6	139529	139534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478741
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2539	NC_016051	TCT	2	6	139698	139703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478741
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2541	NC_016051	CCT	2	6	139731	139736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478741
2542	NC_016051	CCTCG	2	10	139756	139765	0 %	20 %	20 %	60 %	223478741
2543	NC_016051	CTC	2	6	140020	140025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478789
2544	NC_016051	CGT	2	6	140112	140117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478789
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2546	NC_016051	TCA	2	6	140169	140174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478789
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2549	NC_016051	CTT	2	6	140340	140345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478789
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2553	NC_016051	GC	3	6	140726	140731	0 %	0 %	50 %	50 %	223478844
2554	NC_016051	GAG	2	6	140808	140813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478844
2555	NC_016051	GAGC	2	8	140844	140851	25 %	0 %	50 %	25 %	223478844
2556	NC_016051	G	6	6	140885	140890	0 %	0 %	100 %	0 %	223478844
2557	NC_016051	TC	3	6	140973	140978	0 %	50 %	0 %	50 %	223478844
2558	NC_016051	ACG	2	6	141322	141327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478844
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2565	NC_016051	GGAAA	2	10	141657	141666	60 %	0 %	40 %	0 %	223478844
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2984	NC_016051	GGAA	2	8	166019	166026	50 %	0 %	50 %	0 %	223478966
2985	NC_016051	AGA	3	9	166057	166065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478966
2986	NC_016051	TCT	2	6	166135	166140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478966
2987	NC_016051	CTTC	2	8	166144	166151	0 %	50 %	0 %	50 %	223478966
2988	NC_016051	GGCCTC	2	12	166170	166181	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	223478966
2989	NC_016051	AGG	2	6	166184	166189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478966
2990	NC_016051	GA	3	6	166240	166245	50 %	0 %	50 %	0 %	223478966
2991	NC_016051	CTT	2	6	166271	166276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478966
2992	NC_016051	CTC	3	9	166296	166304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478966
2993	NC_016051	GAT	2	6	166318	166323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478966
2994	NC_016051	CGA	2	6	166329	166334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478452
2995	NC_016051	CTC	2	6	166357	166362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478452
2996	NC_016051	CGT	2	6	166371	166376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478452
2997	NC_016051	CTC	2	6	166444	166449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478452
2998	NC_016051	TCC	2	6	166454	166459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478452
2999	NC_016051	GTC	2	6	166471	166476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478452
3000	NC_016051	CGG	2	6	166516	166521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478452

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