MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_016051	TCG	3	9	1528598	1528606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525927
27503	NC_016051	CAA	2	6	1528635	1528640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350525927
27504	NC_016051	CCT	3	9	1528680	1528688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525927
27505	NC_016051	AGGG	2	8	1528708	1528715	25 %	0 %	75 %	0 %	350525927
27506	NC_016051	GGA	2	6	1528807	1528812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525927
27507	NC_016051	CTC	2	6	1528912	1528917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525927
27508	NC_016051	AACG	2	8	1528936	1528943	50 %	0 %	25 %	25 %	350525927
27509	NC_016051	GTA	2	6	1528996	1529001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525927
27510	NC_016051	GTA	2	6	1529014	1529019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525927
27511	NC_016051	CCT	2	6	1529079	1529084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477351
27512	NC_016051	GAG	2	6	1529106	1529111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477351
27513	NC_016051	CTGA	2	8	1529130	1529137	25 %	25 %	25 %	25 %	223477351
27514	NC_016051	CTT	2	6	1529142	1529147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477351
27515	NC_016051	G	6	6	1529156	1529161	0 %	0 %	100 %	0 %	223477351
27516	NC_016051	TCG	2	6	1529359	1529364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477351
27517	NC_016051	ACG	2	6	1529371	1529376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477351
27518	NC_016051	CCT	2	6	1529420	1529425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477351
27519	NC_016051	TCT	2	6	1529444	1529449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477351
27520	NC_016051	GCC	2	6	1529563	1529568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477351
27521	NC_016051	TCG	2	6	1529596	1529601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477351
27522	NC_016051	CGT	2	6	1529663	1529668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477351
27523	NC_016051	CCT	3	9	1529684	1529692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477351
27524	NC_016051	CG	3	6	1529711	1529716	0 %	0 %	50 %	50 %	223477351
27525	NC_016051	TAT	2	6	1529757	1529762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477351
27526	NC_016051	AG	3	6	1529778	1529783	50 %	0 %	50 %	0 %	223477351
27527	NC_016051	GAGTA	2	10	1529806	1529815	40 %	20 %	40 %	0 %	223477351
27528	NC_016051	CTT	2	6	1529829	1529834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477351
27529	NC_016051	TCG	2	6	1529851	1529856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477351
27530	NC_016051	TAT	2	6	1529862	1529867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477351
27531	NC_016051	CCT	2	6	1529894	1529899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477351
27532	NC_016051	TCG	2	6	1529917	1529922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477351
27533	NC_016051	CGA	2	6	1529933	1529938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477351
27534	NC_016051	CGC	2	6	1529951	1529956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477351
27535	NC_016051	TCC	2	6	1529959	1529964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477351
27536	NC_016051	CTC	2	6	1530075	1530080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477351
27537	NC_016051	CCGGTC	2	12	1530109	1530120	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	223477351
27538	NC_016051	CTCC	2	8	1530198	1530205	0 %	25 %	0 %	75 %	223477351
27539	NC_016051	CCT	2	6	1530245	1530250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477351
27540	NC_016051	TCT	2	6	1530263	1530268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477351
27541	NC_016051	GTC	2	6	1530306	1530311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477351
27542	NC_016051	CTT	2	6	1531371	1531376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525928
27543	NC_016051	CCT	2	6	1531512	1531517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525928
27544	NC_016051	TCG	2	6	1531534	1531539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525928
27545	NC_016051	GAG	2	6	1531545	1531550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525928
27546	NC_016051	GAT	2	6	1531551	1531556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525928
27547	NC_016051	ATT	2	6	1531574	1531579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350525928
27548	NC_016051	AGC	2	6	1531609	1531614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525928
27549	NC_016051	GGCT	2	8	1531667	1531674	0 %	25 %	50 %	25 %	350525928
27550	NC_016051	GAG	3	9	1531699	1531707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525928
27551	NC_016051	GAAA	2	8	1531709	1531716	75 %	0 %	25 %	0 %	350525928
27552	NC_016051	TCG	2	6	1531886	1531891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525928
27553	NC_016051	ACG	2	6	1532048	1532053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525928
27554	NC_016051	TAC	2	6	1532146	1532151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525928
27555	NC_016051	CGA	2	6	1532181	1532186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525928
27556	NC_016051	GAG	2	6	1532220	1532225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525928
27557	NC_016051	GAA	3	9	1532437	1532445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477408
27558	NC_016051	TGA	2	6	1532449	1532454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477408
27559	NC_016051	GAG	2	6	1532468	1532473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477408
27560	NC_016051	GAG	2	6	1532477	1532482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477408
27561	NC_016051	AGA	2	6	1532520	1532525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477408
27562	NC_016051	AAAAGG	2	12	1532526	1532537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477408
27563	NC_016051	CCG	2	6	1532580	1532585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477408
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27565	NC_016051	GC	3	6	1532734	1532739	0 %	0 %	50 %	50 %	223477408
27566	NC_016051	CGA	2	6	1532740	1532745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477408
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27568	NC_016051	CA	3	6	1532883	1532888	50 %	0 %	0 %	50 %	223477408
27569	NC_016051	CGG	2	6	1532932	1532937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477408
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27588	NC_016051	TC	4	8	1534394	1534401	0 %	50 %	0 %	50 %	223477509
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27600	NC_016051	CT	3	6	1534887	1534892	0 %	50 %	0 %	50 %	223477458
27601	NC_016051	TTC	2	6	1534984	1534989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477458
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27963	NC_016051	CTC	2	6	1553362	1553367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477337
27964	NC_016051	CAC	2	6	1553427	1553432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477337
27965	NC_016051	CTGT	2	8	1553488	1553495	0 %	50 %	25 %	25 %	223477337
27966	NC_016051	TTC	2	6	1553620	1553625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477337
27967	NC_016051	GGTG	2	8	1553633	1553640	0 %	25 %	75 %	0 %	223477337
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27969	NC_016051	GGCGTG	2	12	1553721	1553732	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	223477337
27970	NC_016051	TCT	2	6	1553939	1553944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477560
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27973	NC_016051	GTTG	2	8	1554111	1554118	0 %	50 %	50 %	0 %	223477560
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27978	NC_016051	TTA	2	6	1554269	1554274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477560
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27989	NC_016051	GTT	2	6	1554908	1554913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477545
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27993	NC_016051	ACG	2	6	1555044	1555049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477545
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27999	NC_016051	ATC	2	6	1555383	1555388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477545
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