MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_016051	GGA	2	6	1501860	1501865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477553
27002	NC_016051	CTA	2	6	1501869	1501874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477553
27003	NC_016051	CTG	2	6	1501900	1501905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477553
27004	NC_016051	AG	3	6	1502017	1502022	50 %	0 %	50 %	0 %	223477553
27005	NC_016051	AG	3	6	1502028	1502033	50 %	0 %	50 %	0 %	223477553
27006	NC_016051	TCA	2	6	1502063	1502068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477553
27007	NC_016051	GGC	2	6	1502085	1502090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477553
27008	NC_016051	CGA	2	6	1502123	1502128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477553
27009	NC_016051	CCG	2	6	1502131	1502136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477553
27010	NC_016051	AGG	2	6	1502228	1502233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477553
27011	NC_016051	G	6	6	1502294	1502299	0 %	0 %	100 %	0 %	223477553
27012	NC_016051	TAA	2	6	1502306	1502311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477553
27013	NC_016051	CCG	2	6	1502467	1502472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477553
27014	NC_016051	GGA	2	6	1502502	1502507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477553
27015	NC_016051	GGAG	2	8	1502542	1502549	25 %	0 %	75 %	0 %	223477553
27016	NC_016051	GAA	2	6	1502577	1502582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477553
27017	NC_016051	GAG	2	6	1502625	1502630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477553
27018	NC_016051	TCG	2	6	1502639	1502644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477553
27019	NC_016051	AGG	2	6	1502700	1502705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477553
27020	NC_016051	GAA	2	6	1502706	1502711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477553
27021	NC_016051	CCT	2	6	1502726	1502731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477353
27022	NC_016051	CTC	2	6	1502736	1502741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477353
27023	NC_016051	GTA	2	6	1502760	1502765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477353
27024	NC_016051	TCCT	2	8	1502785	1502792	0 %	50 %	0 %	50 %	223477353
27025	NC_016051	TCGCTA	2	12	1502807	1502818	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	223477353
27026	NC_016051	TAT	2	6	1502829	1502834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477353
27027	NC_016051	CAGGAG	2	12	1502847	1502858	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	223477353
27028	NC_016051	TCGGT	2	10	1502888	1502897	0 %	40 %	40 %	20 %	223477353
27029	NC_016051	ATC	2	6	1502929	1502934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477353
27030	NC_016051	GCCGCT	2	12	1502961	1502972	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	223477353
27031	NC_016051	GCA	2	6	1503017	1503022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477353
27032	NC_016051	ATC	2	6	1503076	1503081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477353
27033	NC_016051	TAT	2	6	1503150	1503155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477353
27034	NC_016051	GTG	2	6	1503186	1503191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477353
27035	NC_016051	GAC	2	6	1503213	1503218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477353
27036	NC_016051	CCT	2	6	1503240	1503245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477353
27037	NC_016051	TGA	2	6	1503302	1503307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477353
27038	NC_016051	GGC	2	6	1503349	1503354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477353
27039	NC_016051	CGCCA	2	10	1503366	1503375	20 %	0 %	20 %	60 %	223477353
27040	NC_016051	CGG	2	6	1503420	1503425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477353
27041	NC_016051	GAA	2	6	1503438	1503443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477353
27042	NC_016051	TGT	2	6	1503473	1503478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477353
27043	NC_016051	CCT	2	6	1503512	1503517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477353
27044	NC_016051	GAC	2	6	1503570	1503575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477353
27045	NC_016051	CTC	2	6	1503639	1503644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477353
27046	NC_016051	CTC	3	9	1503657	1503665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477353
27047	NC_016051	GAA	2	6	1503666	1503671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477353
27048	NC_016051	GTC	2	6	1503678	1503683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477353
27049	NC_016051	CGT	2	6	1503716	1503721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477353
27050	NC_016051	TGT	2	6	1503740	1503745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477353
27051	NC_016051	CTC	3	9	1503747	1503755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477353
27052	NC_016051	TCG	2	6	1503778	1503783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477353
27053	NC_016051	GAA	2	6	1503849	1503854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477353
27054	NC_016051	TTC	2	6	1503865	1503870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477353
27055	NC_016051	CTT	2	6	1503912	1503917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477353
27056	NC_016051	GATC	2	8	1503935	1503942	25 %	25 %	25 %	25 %	223477353
27057	NC_016051	CCT	2	6	1503951	1503956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477353
27058	NC_016051	GAA	2	6	1503960	1503965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477353
27059	NC_016051	CGA	2	6	1503983	1503988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477353
27060	NC_016051	GGC	3	9	1504002	1504010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477353
27061	NC_016051	GAA	2	6	1504065	1504070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477353
27062	NC_016051	GCG	2	6	1504078	1504083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477353
27063	NC_016051	GCC	2	6	1504194	1504199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477634
27064	NC_016051	CTC	3	9	1504210	1504218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477634
27065	NC_016051	GCC	2	6	1504231	1504236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477634
27066	NC_016051	ACC	2	6	1504315	1504320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477634
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27068	NC_016051	ACC	2	6	1504351	1504356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477634
27069	NC_016051	GTA	2	6	1504386	1504391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477634
27070	NC_016051	CGC	3	9	1504491	1504499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477634
27071	NC_016051	C	6	6	1504499	1504504	0 %	0 %	0 %	100 %	223477634
27072	NC_016051	GTA	2	6	1504551	1504556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477634
27073	NC_016051	TGA	3	9	1504580	1504588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477634
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27075	NC_016051	GCTG	2	8	1504604	1504611	0 %	25 %	50 %	25 %	223477634
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27083	NC_016051	CCG	2	6	1504915	1504920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477634
27084	NC_016051	CCT	2	6	1504976	1504981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477634
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27086	NC_016051	CGG	2	6	1505061	1505066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477634
27087	NC_016051	AGC	2	6	1505140	1505145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477634
27088	NC_016051	AGG	2	6	1505194	1505199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477634
27089	NC_016051	TCG	2	6	1505212	1505217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477634
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27094	NC_016051	GCGA	2	8	1505407	1505414	25 %	0 %	50 %	25 %	223477634
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27098	NC_016051	CGT	2	6	1505610	1505615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477517
27099	NC_016051	GAA	2	6	1505632	1505637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477517
27100	NC_016051	ACG	3	9	1505672	1505680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477517
27101	NC_016051	GAC	2	6	1505743	1505748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477517
27102	NC_016051	TCG	2	6	1505771	1505776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477517
27103	NC_016051	CG	3	6	1505838	1505843	0 %	0 %	50 %	50 %	223477517
27104	NC_016051	GTC	2	6	1505869	1505874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477517
27105	NC_016051	AGT	2	6	1505904	1505909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477517
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27107	NC_016051	CCG	2	6	1506026	1506031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477517
27108	NC_016051	TCG	2	6	1506098	1506103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477517
27109	NC_016051	TCG	2	6	1506158	1506163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477517
27110	NC_016051	TGA	2	6	1506219	1506224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477517
27111	NC_016051	CAC	2	6	1506259	1506264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477517
27112	NC_016051	CGG	2	6	1506300	1506305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477517
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27114	NC_016051	CTG	2	6	1506607	1506612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477517
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27220	NC_016051	C	6	6	1511520	1511525	0 %	0 %	0 %	100 %	223477508
27221	NC_016051	TGA	2	6	1511680	1511685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477508
27222	NC_016051	ACG	2	6	1511814	1511819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477508
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27224	NC_016051	GGAAA	2	10	1512014	1512023	60 %	0 %	40 %	0 %	223477456
27225	NC_016051	GTT	2	6	1512074	1512079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477456
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27227	NC_016051	CGA	2	6	1512186	1512191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477456
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27229	NC_016051	CGG	2	6	1512259	1512264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477549
27230	NC_016051	TCA	2	6	1512367	1512372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477549
27231	NC_016051	TTC	2	6	1512396	1512401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477549
27232	NC_016051	TGA	2	6	1512421	1512426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477549
27233	NC_016051	CT	3	6	1512465	1512470	0 %	50 %	0 %	50 %	223477549
27234	NC_016051	TCC	2	6	1512561	1512566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477549
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27341	NC_016051	CTC	2	6	1519392	1519397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477606
27342	NC_016051	CGT	2	6	1519472	1519477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477606
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27352	NC_016051	GTC	2	6	1520126	1520131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477407
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27461	NC_016051	CTT	2	6	1526329	1526334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477603
27462	NC_016051	GGA	2	6	1526343	1526348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477603
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27467	NC_016051	CGA	2	6	1526622	1526627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477603
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27494	NC_016051	TCT	2	6	1528269	1528274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525927
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