MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_016051	ATCGT	2	10	1471861	1471870	20 %	40 %	20 %	20 %	223477470
26503	NC_016051	CCG	2	6	1471912	1471917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477470
26504	NC_016051	GTA	2	6	1471941	1471946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477470
26505	NC_016051	GCCA	2	8	1471966	1471973	25 %	0 %	25 %	50 %	223477470
26506	NC_016051	C	6	6	1471980	1471985	0 %	0 %	0 %	100 %	223477470
26507	NC_016051	TC	3	6	1472093	1472098	0 %	50 %	0 %	50 %	223477572
26508	NC_016051	GAG	2	6	1472204	1472209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477572
26509	NC_016051	CGC	2	6	1472219	1472224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477572
26510	NC_016051	GCG	2	6	1472238	1472243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477572
26511	NC_016051	TGA	2	6	1472278	1472283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477572
26512	NC_016051	GAT	2	6	1472297	1472302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477572
26513	NC_016051	CAC	2	6	1472343	1472348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477580
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26516	NC_016051	GC	3	6	1472727	1472732	0 %	0 %	50 %	50 %	223477577
26517	NC_016051	GAG	2	6	1472814	1472819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477577
26518	NC_016051	CGA	3	9	1472831	1472839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477577
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26521	NC_016051	G	7	7	1473038	1473044	0 %	0 %	100 %	0 %	223477485
26522	NC_016051	GCGTTA	2	12	1473109	1473120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	223477485
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26535	NC_016051	GAA	2	6	1474212	1474217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477630
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26964	NC_016051	GCT	2	6	1499856	1499861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525924
26965	NC_016051	GA	3	6	1499864	1499869	50 %	0 %	50 %	0 %	350525924
26966	NC_016051	GAGG	2	8	1499880	1499887	25 %	0 %	75 %	0 %	350525924
26967	NC_016051	GAA	2	6	1499926	1499931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525924
26968	NC_016051	GAT	2	6	1499952	1499957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477611
26969	NC_016051	GCT	2	6	1499964	1499969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477611
26970	NC_016051	TCG	2	6	1500019	1500024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477611
26971	NC_016051	AC	3	6	1500108	1500113	50 %	0 %	0 %	50 %	223477611
26972	NC_016051	GCG	2	6	1500132	1500137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477611
26973	NC_016051	GGT	2	6	1500168	1500173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477611
26974	NC_016051	AAGG	2	8	1500175	1500182	50 %	0 %	50 %	0 %	223477611
26975	NC_016051	CTT	2	6	1500285	1500290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477611
26976	NC_016051	ATA	2	6	1500316	1500321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477611
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26980	NC_016051	CTG	2	6	1500574	1500579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477611
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26983	NC_016051	GTC	2	6	1500859	1500864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477611
26984	NC_016051	ATC	2	6	1500916	1500921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477611
26985	NC_016051	CGG	2	6	1500944	1500949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477611
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26990	NC_016051	GGA	2	6	1501060	1501065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477611
26991	NC_016051	CTC	2	6	1501102	1501107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477306
26992	NC_016051	TCT	3	9	1501205	1501213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477306
26993	NC_016051	AGT	2	6	1501223	1501228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477306
26994	NC_016051	CGC	2	6	1501241	1501246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477306
26995	NC_016051	CTC	2	6	1501260	1501265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477306
26996	NC_016051	GGTC	2	8	1501280	1501287	0 %	25 %	50 %	25 %	223477306
26997	NC_016051	AGGT	2	8	1501300	1501307	25 %	25 %	50 %	0 %	223477306
26998	NC_016051	CTT	2	6	1501356	1501361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477306
26999	NC_016051	TCC	2	6	1501432	1501437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477306
27000	NC_016051	TCG	2	6	1501670	1501675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477306

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