MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016051	CTT	2	6	110503	110508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478500
2003	NC_016051	TCG	2	6	110571	110576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478500
2004	NC_016051	GGA	2	6	110629	110634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478500
2005	NC_016051	GCC	2	6	110645	110650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478500
2006	NC_016051	CTG	2	6	110654	110659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478500
2007	NC_016051	GAG	2	6	110864	110869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478500
2008	NC_016051	GC	3	6	110885	110890	0 %	0 %	50 %	50 %	223478500
2009	NC_016051	CTC	2	6	110993	110998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478500
2010	NC_016051	TCC	2	6	111059	111064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478500
2011	NC_016051	GGT	2	6	111118	111123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478500
2012	NC_016051	GAGGG	2	10	111210	111219	20 %	0 %	80 %	0 %	350525698
2013	NC_016051	TCA	2	6	111316	111321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525698
2014	NC_016051	TGC	2	6	111459	111464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478779
2015	NC_016051	CGA	2	6	111480	111485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478779
2016	NC_016051	CGA	2	6	111514	111519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478779
2017	NC_016051	ACG	3	9	111584	111592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478779
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2021	NC_016051	GTC	2	6	111749	111754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478779
2022	NC_016051	TGA	2	6	111760	111765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478779
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2038	NC_016051	CG	3	6	112779	112784	0 %	0 %	50 %	50 %	350525699
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2120	NC_016051	CCA	2	6	116720	116725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478945
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2241	NC_016051	CTT	2	6	123800	123805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478909
2242	NC_016051	TCA	2	6	123823	123828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478909
2243	NC_016051	TCG	2	6	123942	123947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478909
2244	NC_016051	AAG	2	6	123948	123953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478909
2245	NC_016051	GAA	2	6	124121	124126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478909
2246	NC_016051	GAC	2	6	124172	124177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478909
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2253	NC_016051	CTG	2	6	124647	124652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478940
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2265	NC_016051	TGCTTC	2	12	125373	125384	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	350525706
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2358	NC_016051	CGG	2	6	130196	130201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478643
2359	NC_016051	TCC	2	6	130253	130258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478643
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2361	NC_016051	TCG	2	6	130308	130313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478581
2362	NC_016051	ACG	2	6	130362	130367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478581
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2364	NC_016051	TCG	2	6	130551	130556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478581
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2374	NC_016051	TTC	2	6	131099	131104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478853
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2472	NC_016051	GTAGCC	2	12	136090	136101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	223478859
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2479	NC_016051	CTCG	2	8	136402	136409	0 %	25 %	25 %	50 %	223478859
2480	NC_016051	GAGAA	2	10	136415	136424	60 %	0 %	40 %	0 %	223478859
2481	NC_016051	TCT	2	6	136440	136445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478859
2482	NC_016051	TCG	2	6	136460	136465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478859
2483	NC_016051	CGAA	2	8	136472	136479	50 %	0 %	25 %	25 %	223478859
2484	NC_016051	TCC	2	6	136528	136533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478859
2485	NC_016051	TTC	2	6	136572	136577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478520
2486	NC_016051	TGGG	2	8	136602	136609	0 %	25 %	75 %	0 %	223478520
2487	NC_016051	TCG	2	6	136696	136701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478520
2488	NC_016051	AGG	2	6	136702	136707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478520
2489	NC_016051	GAG	2	6	136719	136724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478520
2490	NC_016051	CTC	3	9	136812	136820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478520
2491	NC_016051	CTC	2	6	136887	136892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478520
2492	NC_016051	TCG	2	6	136918	136923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478520
2493	NC_016051	GTA	2	6	136938	136943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478520
2494	NC_016051	TCG	2	6	136969	136974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478520
2495	NC_016051	GC	4	8	136976	136983	0 %	0 %	50 %	50 %	223478520
2496	NC_016051	CGA	2	6	137051	137056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478520
2497	NC_016051	GGGGA	2	10	137059	137068	20 %	0 %	80 %	0 %	223478520
2498	NC_016051	CGG	2	6	137075	137080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478520
2499	NC_016051	AGT	2	6	137141	137146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478520
2500	NC_016051	ACG	2	6	137179	137184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478520

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