MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_016051	CCG	2	6	1330032	1330037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477873
24002	NC_016051	CCTC	2	8	1330078	1330085	0 %	25 %	0 %	75 %	223477873
24003	NC_016051	CCTG	2	8	1330146	1330153	0 %	25 %	25 %	50 %	223477873
24004	NC_016051	CGG	2	6	1330154	1330159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477873
24005	NC_016051	CATC	2	8	1330171	1330178	25 %	25 %	0 %	50 %	223477873
24006	NC_016051	AAT	2	6	1330204	1330209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478039
24007	NC_016051	GGC	2	6	1330362	1330367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478039
24008	NC_016051	CAT	2	6	1330389	1330394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478039
24009	NC_016051	TCA	2	6	1330432	1330437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478039
24010	NC_016051	AGG	2	6	1330532	1330537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477983
24011	NC_016051	GGAC	2	8	1330554	1330561	25 %	0 %	50 %	25 %	223477983
24012	NC_016051	TCA	2	6	1330562	1330567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477983
24013	NC_016051	TCG	2	6	1330610	1330615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477983
24014	NC_016051	GAG	2	6	1330620	1330625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477983
24015	NC_016051	GGA	2	6	1330641	1330646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477983
24016	NC_016051	GGA	3	9	1330653	1330661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477983
24017	NC_016051	CCT	2	6	1330671	1330676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477983
24018	NC_016051	TCC	2	6	1330703	1330708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477983
24019	NC_016051	GCACCT	2	12	1330779	1330790	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	223477983
24020	NC_016051	GGA	2	6	1330863	1330868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477983
24021	NC_016051	GAACCT	2	12	1330872	1330883	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	223477983
24022	NC_016051	GA	3	6	1330888	1330893	50 %	0 %	50 %	0 %	223477983
24023	NC_016051	GAG	3	9	1330915	1330923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477983
24024	NC_016051	TTA	2	6	1331221	1331226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478019
24025	NC_016051	CAT	2	6	1331234	1331239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478019
24026	NC_016051	CAG	2	6	1331241	1331246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478019
24027	NC_016051	AAC	2	6	1331249	1331254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478019
24028	NC_016051	TAA	2	6	1331491	1331496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478019
24029	NC_016051	TGGG	2	8	1331519	1331526	0 %	25 %	75 %	0 %	223478019
24030	NC_016051	TGA	2	6	1331528	1331533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478019
24031	NC_016051	GTT	2	6	1331628	1331633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478019
24032	NC_016051	AGA	2	6	1331744	1331749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478019
24033	NC_016051	ATG	2	6	1331797	1331802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478019
24034	NC_016051	GAA	2	6	1331807	1331812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478019
24035	NC_016051	GGCTGT	2	12	1331825	1331836	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	223478019
24036	NC_016051	ACCC	2	8	1331848	1331855	25 %	0 %	0 %	75 %	223478019
24037	NC_016051	TTG	2	6	1331890	1331895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478019
24038	NC_016051	TACT	2	8	1331901	1331908	25 %	50 %	0 %	25 %	223478019
24039	NC_016051	AGGA	2	8	1331959	1331966	50 %	0 %	50 %	0 %	223478019
24040	NC_016051	TTC	2	6	1331982	1331987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478019
24041	NC_016051	GTG	2	6	1332005	1332010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478019
24042	NC_016051	CGA	2	6	1332071	1332076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478019
24043	NC_016051	GGA	2	6	1332083	1332088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478019
24044	NC_016051	CGG	2	6	1332098	1332103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478019
24045	NC_016051	TAC	2	6	1332132	1332137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478019
24046	NC_016051	AAG	2	6	1332309	1332314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478019
24047	NC_016051	AG	3	6	1332313	1332318	50 %	0 %	50 %	0 %	223478019
24048	NC_016051	TCA	3	9	1332322	1332330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478019
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24050	NC_016051	ACA	2	6	1332432	1332437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478019
24051	NC_016051	GAG	2	6	1332489	1332494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478019
24052	NC_016051	GAC	2	6	1332515	1332520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478019
24053	NC_016051	ACC	2	6	1332576	1332581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478019
24054	NC_016051	GAC	2	6	1332600	1332605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478019
24055	NC_016051	TCA	2	6	1332622	1332627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478019
24056	NC_016051	ACGA	2	8	1332630	1332637	50 %	0 %	25 %	25 %	223478019
24057	NC_016051	AG	3	6	1332678	1332683	50 %	0 %	50 %	0 %	223478019
24058	NC_016051	AGG	2	6	1332691	1332696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478019
24059	NC_016051	GAA	2	6	1332833	1332838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478019
24060	NC_016051	GTTG	2	8	1332882	1332889	0 %	50 %	50 %	0 %	223478019
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24062	NC_016051	AAC	2	6	1333002	1333007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478019
24063	NC_016051	AGTA	2	8	1333032	1333039	50 %	25 %	25 %	0 %	223478019
24064	NC_016051	AC	3	6	1333080	1333085	50 %	0 %	0 %	50 %	223478019
24065	NC_016051	GAA	2	6	1333112	1333117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478019
24066	NC_016051	CGA	2	6	1333235	1333240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478019
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24069	NC_016051	TAA	2	6	1333507	1333512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478019
24070	NC_016051	GAA	2	6	1333529	1333534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478019
24071	NC_016051	CACT	2	8	1333562	1333569	25 %	25 %	0 %	50 %	223478019
24072	NC_016051	TTTGC	2	10	1333632	1333641	0 %	60 %	20 %	20 %	223478019
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24076	NC_016051	TATT	2	8	1333918	1333925	25 %	75 %	0 %	0 %	223477742
24077	NC_016051	CCA	2	6	1333961	1333966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477742
24078	NC_016051	GAGG	2	8	1334051	1334058	25 %	0 %	75 %	0 %	223477742
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24085	NC_016051	ATC	2	6	1334583	1334588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477840
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24087	NC_016051	A	6	6	1334617	1334622	100 %	0 %	0 %	0 %	223477840
24088	NC_016051	GTC	2	6	1334771	1334776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477840
24089	NC_016051	A	6	6	1334904	1334909	100 %	0 %	0 %	0 %	223477840
24090	NC_016051	GTT	2	6	1334916	1334921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477840
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24100	NC_016051	TAT	2	6	1335387	1335392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477840
24101	NC_016051	TCTT	2	8	1335636	1335643	0 %	75 %	0 %	25 %	223477833
24102	NC_016051	CTT	2	6	1335698	1335703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477833
24103	NC_016051	CGG	2	6	1335722	1335727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477833
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24105	NC_016051	TC	3	6	1335756	1335761	0 %	50 %	0 %	50 %	223477833
24106	NC_016051	GC	3	6	1335793	1335798	0 %	0 %	50 %	50 %	223477833
24107	NC_016051	CTC	2	6	1335819	1335824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477833
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24109	NC_016051	GAGC	2	8	1335920	1335927	25 %	0 %	50 %	25 %	223477833
24110	NC_016051	AGG	2	6	1335942	1335947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477833
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24114	NC_016051	GA	3	6	1336167	1336172	50 %	0 %	50 %	0 %	223477833
24115	NC_016051	GC	3	6	1336210	1336215	0 %	0 %	50 %	50 %	223477833
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24117	NC_016051	GAG	2	6	1336364	1336369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477833
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24230	NC_016051	CGA	2	6	1343420	1343425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477856
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24347	NC_016051	TTTC	2	8	1354618	1354625	0 %	75 %	0 %	25 %	223477804
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24455	NC_016051	ATC	2	6	1361627	1361632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477720
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24462	NC_016051	CCG	2	6	1362024	1362029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477720
24463	NC_016051	AAAAC	2	10	1362069	1362078	80 %	0 %	0 %	20 %	223477720
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24465	NC_016051	T	7	7	1362096	1362102	0 %	100 %	0 %	0 %	223477720
24466	NC_016051	GGA	2	6	1362229	1362234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477952
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24469	NC_016051	TCG	2	6	1362459	1362464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477952
24470	NC_016051	ACC	2	6	1362639	1362644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477952
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