MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016051	AGG	2	6	81329	81334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478976
1502	NC_016051	ACG	2	6	81354	81359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478976
1503	NC_016051	GAG	2	6	81527	81532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478976
1504	NC_016051	CAT	2	6	81559	81564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478976
1505	NC_016051	CGG	2	6	81574	81579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478976
1506	NC_016051	CGGG	2	8	81604	81611	0 %	0 %	75 %	25 %	223478976
1507	NC_016051	CTC	2	6	81614	81619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478976
1508	NC_016051	GAG	2	6	81677	81682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478976
1509	NC_016051	AGG	2	6	81743	81748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223479006
1510	NC_016051	GAA	2	6	81847	81852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223479006
1511	NC_016051	CTC	2	6	81853	81858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223479006
1512	NC_016051	AAG	2	6	81922	81927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223479006
1513	NC_016051	CTA	2	6	81939	81944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223479006
1514	NC_016051	CAA	2	6	81948	81953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223479006
1515	NC_016051	CGCT	2	8	81979	81986	0 %	25 %	25 %	50 %	223479006
1516	NC_016051	GAG	2	6	82003	82008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223479006
1517	NC_016051	ACG	2	6	82034	82039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223479006
1518	NC_016051	CGA	2	6	82044	82049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223479006
1519	NC_016051	GGA	2	6	82133	82138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223479006
1520	NC_016051	ACT	2	6	82226	82231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223479006
1521	NC_016051	TGA	2	6	82262	82267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223479006
1522	NC_016051	GA	3	6	82320	82325	50 %	0 %	50 %	0 %	223479006
1523	NC_016051	CTG	2	6	82439	82444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223479006
1524	NC_016051	GAG	2	6	82498	82503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223479006
1525	NC_016051	GAAC	2	8	82547	82554	50 %	0 %	25 %	25 %	223479006
1526	NC_016051	AGG	2	6	82615	82620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223479006
1527	NC_016051	CTT	2	6	82706	82711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525694
1528	NC_016051	TGC	2	6	82798	82803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525694
1529	NC_016051	CGG	2	6	82900	82905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525694
1530	NC_016051	CGT	2	6	82973	82978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525694
1531	NC_016051	GAG	2	6	83033	83038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525694
1532	NC_016051	CTC	2	6	83080	83085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525694
1533	NC_016051	GAAC	2	8	83137	83144	50 %	0 %	25 %	25 %	350525694
1534	NC_016051	TGA	2	6	83244	83249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525694
1535	NC_016051	CTT	2	6	83288	83293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525694
1536	NC_016051	AGG	2	6	83316	83321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525694
1537	NC_016051	GAA	2	6	83432	83437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525694
1538	NC_016051	GTT	2	6	83502	83507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525694
1539	NC_016051	AT	3	6	83569	83574	50 %	50 %	0 %	0 %	350525694
1540	NC_016051	GAA	2	6	83651	83656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525694
1541	NC_016051	CGA	2	6	83674	83679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525694
1542	NC_016051	GCC	2	6	83700	83705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525694
1543	NC_016051	CGA	2	6	83879	83884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478496
1544	NC_016051	TTC	3	9	83887	83895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478496
1545	NC_016051	CGA	2	6	83938	83943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478496
1546	NC_016051	GGC	2	6	84039	84044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478496
1547	NC_016051	TCG	2	6	84124	84129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478496
1548	NC_016051	CGA	2	6	84152	84157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478496
1549	NC_016051	GAA	2	6	84188	84193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478496
1550	NC_016051	AGT	2	6	84230	84235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478496
1551	NC_016051	TCA	2	6	84241	84246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478496
1552	NC_016051	AAG	2	6	84249	84254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478496
1553	NC_016051	TGA	2	6	84292	84297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478496
1554	NC_016051	GGAAG	2	10	84395	84404	40 %	0 %	60 %	0 %	223478496
1555	NC_016051	GAA	2	6	84443	84448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478496
1556	NC_016051	TGG	2	6	84484	84489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478496
1557	NC_016051	TGC	2	6	84491	84496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478496
1558	NC_016051	CGTCAT	2	12	84554	84565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	223478496
1559	NC_016051	CAC	2	6	84731	84736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478496
1560	NC_016051	CGT	2	6	84740	84745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478496
1561	NC_016051	GGCGTC	2	12	84750	84761	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	223478496
1562	NC_016051	TCG	2	6	84784	84789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478496
1563	NC_016051	AGCG	2	8	84797	84804	25 %	0 %	50 %	25 %	223478496
1564	NC_016051	CGG	2	6	84830	84835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478496
1565	NC_016051	CT	3	6	84899	84904	0 %	50 %	0 %	50 %	223478496
1566	NC_016051	GTC	2	6	84939	84944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478496
1567	NC_016051	ACGG	2	8	84949	84956	25 %	0 %	50 %	25 %	223478496
1568	NC_016051	ATG	2	6	84996	85001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478496
1569	NC_016051	TAC	2	6	85020	85025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478496
1570	NC_016051	GTGG	2	8	85122	85129	0 %	25 %	75 %	0 %	223478496
1571	NC_016051	TCA	2	6	85360	85365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478448
1572	NC_016051	GAG	2	6	85377	85382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478448
1573	NC_016051	GGT	2	6	85428	85433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478448
1574	NC_016051	GTG	2	6	85539	85544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478448
1575	NC_016051	CGA	2	6	85556	85561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478448
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1577	NC_016051	T	6	6	85601	85606	0 %	100 %	0 %	0 %	223478448
1578	NC_016051	GGA	2	6	85634	85639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478448
1579	NC_016051	ATA	2	6	85650	85655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478448
1580	NC_016051	ACA	2	6	85891	85896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478448
1581	NC_016051	GAA	2	6	85995	86000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478448
1582	NC_016051	GTC	2	6	86112	86117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478448
1583	NC_016051	TCC	2	6	86167	86172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478448
1584	NC_016051	CAA	2	6	86237	86242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478448
1585	NC_016051	ATT	2	6	86321	86326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478705
1586	NC_016051	GGT	2	6	86329	86334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478705
1587	NC_016051	AGG	2	6	86379	86384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478705
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1589	NC_016051	GAG	2	6	86507	86512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478705
1590	NC_016051	GTT	2	6	86542	86547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478842
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1592	NC_016051	GCTC	2	8	86621	86628	0 %	25 %	25 %	50 %	223478842
1593	NC_016051	TC	3	6	86673	86678	0 %	50 %	0 %	50 %	223478842
1594	NC_016051	CGAG	2	8	86688	86695	25 %	0 %	50 %	25 %	223478842
1595	NC_016051	CTA	2	6	86718	86723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478842
1596	NC_016051	ACGA	2	8	86857	86864	50 %	0 %	25 %	25 %	223478842
1597	NC_016051	CTT	2	6	86934	86939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478842
1598	NC_016051	ACC	2	6	87054	87059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478996
1599	NC_016051	TCT	2	6	87100	87105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478996
1600	NC_016051	CGG	2	6	87107	87112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478996
1601	NC_016051	ACG	2	6	87160	87165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478996
1602	NC_016051	CCA	2	6	87200	87205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478996
1603	NC_016051	CGG	2	6	87224	87229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478996
1604	NC_016051	TTG	2	6	87265	87270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478996
1605	NC_016051	AAT	2	6	87278	87283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478996
1606	NC_016051	CCG	2	6	87363	87368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478996
1607	NC_016051	GAG	2	6	87386	87391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478996
1608	NC_016051	CTCGGT	2	12	87891	87902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478485
1609	NC_016051	GGA	2	6	87906	87911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478485
1610	NC_016051	TC	3	6	87963	87968	0 %	50 %	0 %	50 %	223478485
1611	NC_016051	CGC	2	6	88047	88052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478485
1612	NC_016051	TCG	2	6	88057	88062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478485
1613	NC_016051	CGA	2	6	88100	88105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478485
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1617	NC_016051	AGT	2	6	88283	88288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478485
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1620	NC_016051	AGG	2	6	88372	88377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478485
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1622	NC_016051	ACGAGC	2	12	88429	88440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478485
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1875	NC_016051	TCC	2	6	101415	101420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478567
1876	NC_016051	CTC	2	6	101480	101485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478567
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1879	NC_016051	GTC	2	6	101657	101662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478567
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1904	NC_016051	CCGA	2	8	103140	103147	25 %	0 %	25 %	50 %	223478504
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1989	NC_016051	CGA	2	6	109658	109663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478728
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1992	NC_016051	GA	3	6	110014	110019	50 %	0 %	50 %	0 %	223478500
1993	NC_016051	TC	3	6	110053	110058	0 %	50 %	0 %	50 %	223478500
1994	NC_016051	GAA	2	6	110074	110079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478500
1995	NC_016051	GGCC	2	8	110080	110087	0 %	0 %	50 %	50 %	223478500
1996	NC_016051	GAA	2	6	110098	110103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478500
1997	NC_016051	TCC	2	6	110265	110270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478500
1998	NC_016051	ATA	2	6	110273	110278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478500
1999	NC_016051	CCTC	2	8	110289	110296	0 %	25 %	0 %	75 %	223478500
2000	NC_016051	CCA	2	6	110445	110450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478500

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