MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_016051	CTC	2	6	1053821	1053826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478368
19002	NC_016051	CTT	2	6	1053830	1053835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478368
19003	NC_016051	GTA	2	6	1053839	1053844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478368
19004	NC_016051	CTT	2	6	1053904	1053909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478368
19005	NC_016051	T	6	6	1053915	1053920	0 %	100 %	0 %	0 %	223478368
19006	NC_016051	CGT	2	6	1053943	1053948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478368
19007	NC_016051	CGA	2	6	1054012	1054017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478368
19008	NC_016051	CGT	2	6	1054018	1054023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478368
19009	NC_016051	CGA	2	6	1054042	1054047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478368
19010	NC_016051	CAG	2	6	1054061	1054066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478368
19011	NC_016051	GAG	2	6	1054100	1054105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478368
19012	NC_016051	GCCCC	2	10	1054161	1054170	0 %	0 %	20 %	80 %	223478368
19013	NC_016051	TCC	2	6	1054227	1054232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478368
19014	NC_016051	GTC	2	6	1054233	1054238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478368
19015	NC_016051	TCG	2	6	1054243	1054248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478368
19016	NC_016051	TGA	2	6	1054260	1054265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478368
19017	NC_016051	CGC	2	6	1054413	1054418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478204
19018	NC_016051	CTC	2	6	1054419	1054424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478204
19019	NC_016051	TTCC	2	8	1054498	1054505	0 %	50 %	0 %	50 %	223478204
19020	NC_016051	GAC	2	6	1054506	1054511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478204
19021	NC_016051	CTC	2	6	1054583	1054588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478204
19022	NC_016051	GCT	2	6	1054612	1054617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478204
19023	NC_016051	CGA	2	6	1054622	1054627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478204
19024	NC_016051	CT	3	6	1054684	1054689	0 %	50 %	0 %	50 %	223478204
19025	NC_016051	GAC	2	6	1054713	1054718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478204
19026	NC_016051	CTTT	2	8	1054730	1054737	0 %	75 %	0 %	25 %	223478204
19027	NC_016051	CAT	2	6	1054836	1054841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478204
19028	NC_016051	TCC	2	6	1054846	1054851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478204
19029	NC_016051	CGC	2	6	1054875	1054880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478204
19030	NC_016051	GGA	2	6	1054934	1054939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478204
19031	NC_016051	TCC	2	6	1054945	1054950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478204
19032	NC_016051	ATC	2	6	1054984	1054989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478204
19033	NC_016051	CAT	2	6	1055043	1055048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478204
19034	NC_016051	GGA	2	6	1055081	1055086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478204
19035	NC_016051	CTC	2	6	1055115	1055120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478204
19036	NC_016051	TCGG	2	8	1055125	1055132	0 %	25 %	50 %	25 %	223478204
19037	NC_016051	A	6	6	1055187	1055192	100 %	0 %	0 %	0 %	223478204
19038	NC_016051	CCG	2	6	1055193	1055198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478204
19039	NC_016051	TCC	2	6	1055204	1055209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478204
19040	NC_016051	GGA	2	6	1055399	1055404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478167
19041	NC_016051	GAG	2	6	1055432	1055437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478167
19042	NC_016051	GGA	2	6	1055464	1055469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478167
19043	NC_016051	ACG	2	6	1055623	1055628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478167
19044	NC_016051	AAC	2	6	1055715	1055720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478167
19045	NC_016051	GGAA	2	8	1055772	1055779	50 %	0 %	50 %	0 %	223478167
19046	NC_016051	GGA	2	6	1055789	1055794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478167
19047	NC_016051	CTG	2	6	1055796	1055801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478167
19048	NC_016051	ATC	2	6	1055916	1055921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478167
19049	NC_016051	GAA	2	6	1055922	1055927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478167
19050	NC_016051	GAG	2	6	1056157	1056162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478376
19051	NC_016051	GCT	2	6	1056301	1056306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478376
19052	NC_016051	TCG	3	9	1056342	1056350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478376
19053	NC_016051	CGCC	2	8	1056370	1056377	0 %	0 %	25 %	75 %	223478376
19054	NC_016051	ATA	2	6	1056398	1056403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478376
19055	NC_016051	CTA	2	6	1056406	1056411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478376
19056	NC_016051	TTC	2	6	1056437	1056442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478376
19057	NC_016051	TCG	2	6	1056450	1056455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478376
19058	NC_016051	CTCGG	2	10	1056488	1056497	0 %	20 %	40 %	40 %	223478376
19059	NC_016051	CCCT	2	8	1056527	1056534	0 %	25 %	0 %	75 %	223478376
19060	NC_016051	CTC	2	6	1056545	1056550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478376
19061	NC_016051	CCA	2	6	1056561	1056566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478376
19062	NC_016051	AGCGG	2	10	1056587	1056596	20 %	0 %	60 %	20 %	223478376
19063	NC_016051	TCT	2	6	1056609	1056614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478376
19064	NC_016051	ACCT	2	8	1056641	1056648	25 %	25 %	0 %	50 %	223478376
19065	NC_016051	GAG	2	6	1056662	1056667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478376
19066	NC_016051	CGG	2	6	1056681	1056686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478376
19067	NC_016051	TCG	2	6	1056735	1056740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478376
19068	NC_016051	GCG	2	6	1056741	1056746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478376
19069	NC_016051	GTC	2	6	1056815	1056820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478376
19070	NC_016051	TCA	2	6	1056927	1056932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478376
19071	NC_016051	GAG	2	6	1056970	1056975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478376
19072	NC_016051	CGA	2	6	1057012	1057017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478376
19073	NC_016051	TCG	2	6	1057119	1057124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478376
19074	NC_016051	CAG	2	6	1057157	1057162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478376
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19081	NC_016051	TCA	2	6	1057668	1057673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478156
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19084	NC_016051	CAG	2	6	1057772	1057777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478156
19085	NC_016051	AGGG	2	8	1057856	1057863	25 %	0 %	75 %	0 %	223478156
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19087	NC_016051	TAC	2	6	1057913	1057918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478156
19088	NC_016051	CGA	2	6	1057953	1057958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478156
19089	NC_016051	CAA	2	6	1058017	1058022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478156
19090	NC_016051	GCC	2	6	1058038	1058043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478156
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19097	NC_016051	CGT	2	6	1058314	1058319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478156
19098	NC_016051	AGA	2	6	1058370	1058375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478156
19099	NC_016051	TCC	2	6	1058382	1058387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478156
19100	NC_016051	CTG	2	6	1058417	1058422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478156
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19102	NC_016051	CTC	2	6	1058510	1058515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478156
19103	NC_016051	CAA	2	6	1058536	1058541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478156
19104	NC_016051	CGA	2	6	1058586	1058591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478156
19105	NC_016051	TGA	2	6	1058598	1058603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478156
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19109	NC_016051	GCA	2	6	1058815	1058820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478156
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19224	NC_016051	TCC	2	6	1064247	1064252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478065
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19226	NC_016051	GGGA	2	8	1064305	1064312	25 %	0 %	75 %	0 %	223478065
19227	NC_016051	CTC	2	6	1064457	1064462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478362
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