MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_016051	GAC	2	6	999239	999244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478283
18002	NC_016051	GAA	2	6	999251	999256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478283
18003	NC_016051	GAGGAC	2	12	999275	999286	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	223478283
18004	NC_016051	GGACGA	2	12	999289	999300	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	223478283
18005	NC_016051	AG	3	6	999309	999314	50 %	0 %	50 %	0 %	223478283
18006	NC_016051	CTT	2	6	999394	999399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478283
18007	NC_016051	GGCG	2	8	999438	999445	0 %	0 %	75 %	25 %	223478283
18008	NC_016051	CAG	2	6	999529	999534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478283
18009	NC_016051	ATC	2	6	999599	999604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478283
18010	NC_016051	TCC	2	6	999629	999634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478283
18011	NC_016051	CCT	2	6	999705	999710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478283
18012	NC_016051	GAG	2	6	999712	999717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478283
18013	NC_016051	CGA	2	6	999738	999743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478283
18014	NC_016051	AGC	2	6	999788	999793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478283
18015	NC_016051	G	6	6	999854	999859	0 %	0 %	100 %	0 %	223478283
18016	NC_016051	CCG	2	6	999862	999867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478283
18017	NC_016051	ACC	2	6	999884	999889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478283
18018	NC_016051	CGC	2	6	999924	999929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478283
18019	NC_016051	CCG	2	6	999962	999967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478283
18020	NC_016051	TCA	2	6	999998	1000003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478283
18021	NC_016051	C	6	6	1000032	1000037	0 %	0 %	0 %	100 %	223478283
18022	NC_016051	C	6	6	1000101	1000106	0 %	0 %	0 %	100 %	223478283
18023	NC_016051	A	6	6	1000155	1000160	100 %	0 %	0 %	0 %	223478283
18024	NC_016051	ATC	2	6	1000208	1000213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478283
18025	NC_016051	CTC	2	6	1000297	1000302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478283
18026	NC_016051	CGA	2	6	1000314	1000319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478283
18027	NC_016051	CATC	2	8	1000377	1000384	25 %	25 %	0 %	50 %	223478283
18028	NC_016051	CTT	2	6	1000412	1000417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478399
18029	NC_016051	CTTT	2	8	1000420	1000427	0 %	75 %	0 %	25 %	223478399
18030	NC_016051	CTCG	2	8	1000466	1000473	0 %	25 %	25 %	50 %	223478399
18031	NC_016051	CCA	2	6	1000474	1000479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478399
18032	NC_016051	CTTC	2	8	1000486	1000493	0 %	50 %	0 %	50 %	223478399
18033	NC_016051	TCGT	2	8	1000512	1000519	0 %	50 %	25 %	25 %	223478399
18034	NC_016051	GCC	2	6	1000593	1000598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478399
18035	NC_016051	GCCT	2	8	1000623	1000630	0 %	25 %	25 %	50 %	223478399
18036	NC_016051	CGG	2	6	1000849	1000854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478399
18037	NC_016051	CGC	2	6	1000940	1000945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478399
18038	NC_016051	CTC	2	6	1000949	1000954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478399
18039	NC_016051	GATGGC	2	12	1000955	1000966	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	223478399
18040	NC_016051	GC	3	6	1001129	1001134	0 %	0 %	50 %	50 %	223478399
18041	NC_016051	CCA	2	6	1001212	1001217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478399
18042	NC_016051	CGGGTT	2	12	1002298	1002309	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	223478130
18043	NC_016051	GAG	2	6	1002423	1002428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478130
18044	NC_016051	CTT	2	6	1002495	1002500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478130
18045	NC_016051	CTC	2	6	1002523	1002528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478130
18046	NC_016051	TCT	2	6	1002621	1002626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478130
18047	NC_016051	GCC	2	6	1002742	1002747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478130
18048	NC_016051	AGT	2	6	1002823	1002828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478130
18049	NC_016051	GAC	2	6	1002834	1002839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478130
18050	NC_016051	TCG	2	6	1002946	1002951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478130
18051	NC_016051	TTG	2	6	1003094	1003099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478130
18052	NC_016051	GCC	2	6	1003210	1003215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478130
18053	NC_016051	TC	3	6	1003309	1003314	0 %	50 %	0 %	50 %	223478130
18054	NC_016051	GTTTTT	2	12	1003367	1003378	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	223478130
18055	NC_016051	GAT	2	6	1003490	1003495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478425
18056	NC_016051	CAG	2	6	1003504	1003509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478425
18057	NC_016051	CGA	2	6	1003532	1003537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478425
18058	NC_016051	TTC	2	6	1003563	1003568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478425
18059	NC_016051	GAG	2	6	1003581	1003586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478425
18060	NC_016051	GA	3	6	1003593	1003598	50 %	0 %	50 %	0 %	223478425
18061	NC_016051	CCG	2	6	1003606	1003611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478425
18062	NC_016051	TCT	2	6	1003636	1003641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478425
18063	NC_016051	GAC	2	6	1003848	1003853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478425
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18065	NC_016051	GCGA	2	8	1004007	1004014	25 %	0 %	50 %	25 %	223478425
18066	NC_016051	CGT	2	6	1004030	1004035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478425
18067	NC_016051	CGGCC	2	10	1004066	1004075	0 %	0 %	40 %	60 %	223478425
18068	NC_016051	CGA	2	6	1004105	1004110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478425
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18070	NC_016051	CAG	2	6	1004312	1004317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478425
18071	NC_016051	TGA	2	6	1004353	1004358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478425
18072	NC_016051	CGA	2	6	1004406	1004411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478181
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18074	NC_016051	CGG	2	6	1004436	1004441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478181
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18076	NC_016051	CG	3	6	1004476	1004481	0 %	0 %	50 %	50 %	223478181
18077	NC_016051	GCGAG	2	10	1004486	1004495	20 %	0 %	60 %	20 %	223478181
18078	NC_016051	CTA	2	6	1004523	1004528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478181
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18084	NC_016051	CTA	3	9	1004733	1004741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478181
18085	NC_016051	GAG	2	6	1004799	1004804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478110
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18087	NC_016051	TCA	2	6	1004875	1004880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478110
18088	NC_016051	ATA	2	6	1004940	1004945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478110
18089	NC_016051	GAG	2	6	1004979	1004984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478110
18090	NC_016051	ACG	2	6	1005097	1005102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478110
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18098	NC_016051	CTC	2	6	1005848	1005853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478415
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18100	NC_016051	TGA	2	6	1005939	1005944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478415
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18102	NC_016051	GGC	3	9	1006058	1006066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478415
18103	NC_016051	TGTA	2	8	1006067	1006074	25 %	50 %	25 %	0 %	223478415
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18105	NC_016051	AGGG	2	8	1006157	1006164	25 %	0 %	75 %	0 %	223478415
18106	NC_016051	AGG	2	6	1006176	1006181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478415
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18111	NC_016051	GAT	2	6	1006413	1006418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478280
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18116	NC_016051	CAA	2	6	1006848	1006853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478280
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18224	NC_016051	GATATC	2	12	1012423	1012434	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	350525854
18225	NC_016051	GGT	2	6	1012454	1012459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525854
18226	NC_016051	TGG	2	6	1012475	1012480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525854
18227	NC_016051	AAC	2	6	1012629	1012634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478337
18228	NC_016051	CAA	2	6	1012640	1012645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478337
18229	NC_016051	AACA	2	8	1012646	1012653	75 %	0 %	0 %	25 %	223478337
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18231	NC_016051	GA	3	6	1012738	1012743	50 %	0 %	50 %	0 %	223478337
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18349	NC_016051	CGA	2	6	1019150	1019155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478385
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18463	NC_016051	TCC	2	6	1024171	1024176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478303
18464	NC_016051	TCC	2	6	1024233	1024238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478133
18465	NC_016051	C	6	6	1024237	1024242	0 %	0 %	0 %	100 %	223478133
18466	NC_016051	GTT	2	6	1024284	1024289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478133
18467	NC_016051	GAA	2	6	1024290	1024295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478133
18468	NC_016051	TCG	2	6	1024354	1024359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478133
18469	NC_016051	GTA	2	6	1024413	1024418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478133
18470	NC_016051	CGC	2	6	1024427	1024432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478133
18471	NC_016051	CTC	2	6	1024506	1024511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478133
18472	NC_016051	ATC	2	6	1024558	1024563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478133
18473	NC_016051	GAA	2	6	1024566	1024571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478133
18474	NC_016051	CTC	2	6	1024593	1024598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478133
18475	NC_016051	CT	3	6	1024600	1024605	0 %	50 %	0 %	50 %	223478133
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18479	NC_016051	CTG	2	6	1024872	1024877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478133
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18482	NC_016051	GTG	2	6	1025078	1025083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478395
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18485	NC_016051	AATC	2	8	1025183	1025190	50 %	25 %	0 %	25 %	223478395
18486	NC_016051	TCC	2	6	1025242	1025247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478395
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18491	NC_016051	T	6	6	1025414	1025419	0 %	100 %	0 %	0 %	223478395
18492	NC_016051	CT	3	6	1025430	1025435	0 %	50 %	0 %	50 %	223478395
18493	NC_016051	CCA	2	6	1025570	1025575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478395
18494	NC_016051	CTC	2	6	1025592	1025597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478395
18495	NC_016051	TCC	2	6	1025607	1025612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478395
18496	NC_016051	TC	3	6	1025637	1025642	0 %	50 %	0 %	50 %	223478395
18497	NC_016051	TTGT	2	8	1025708	1025715	0 %	75 %	25 %	0 %	223478395
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18499	NC_016051	CGG	2	6	1025804	1025809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478395
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