MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_016051	CTC	2	6	868040	868045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478104
15502	NC_016051	CCT	2	6	868081	868086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478104
15503	NC_016051	CTC	2	6	868141	868146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478104
15504	NC_016051	TCG	2	6	868166	868171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478104
15505	NC_016051	CTC	2	6	868213	868218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478104
15506	NC_016051	A	6	6	868306	868311	100 %	0 %	0 %	0 %	223478104
15507	NC_016051	CTC	2	6	868352	868357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478104
15508	NC_016051	TCC	2	6	868359	868364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478104
15509	NC_016051	CAT	2	6	868405	868410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478104
15510	NC_016051	TCG	2	6	868526	868531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478104
15511	NC_016051	GC	3	6	868640	868645	0 %	0 %	50 %	50 %	223478104
15512	NC_016051	AGA	2	6	868692	868697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478104
15513	NC_016051	CTC	2	6	868748	868753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478104
15514	NC_016051	ACG	2	6	868766	868771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478104
15515	NC_016051	GTTC	2	8	868972	868979	0 %	50 %	25 %	25 %	223478125
15516	NC_016051	CCG	2	6	868980	868985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478125
15517	NC_016051	AAC	2	6	869024	869029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478125
15518	NC_016051	CGTC	2	8	869128	869135	0 %	25 %	25 %	50 %	223478125
15519	NC_016051	CTC	2	6	869139	869144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478125
15520	NC_016051	CCG	2	6	869148	869153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478125
15521	NC_016051	TCG	2	6	869157	869162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478125
15522	NC_016051	CTT	2	6	869183	869188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478125
15523	NC_016051	TCG	2	6	869268	869273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478125
15524	NC_016051	CCT	2	6	869308	869313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478125
15525	NC_016051	GCCTC	2	10	869326	869335	0 %	20 %	20 %	60 %	223478125
15526	NC_016051	CTT	2	6	869447	869452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478125
15527	NC_016051	TTC	2	6	869456	869461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478125
15528	NC_016051	GGTC	2	8	869584	869591	0 %	25 %	50 %	25 %	223478125
15529	NC_016051	GC	3	6	869638	869643	0 %	0 %	50 %	50 %	223478125
15530	NC_016051	CCG	2	6	869652	869657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478125
15531	NC_016051	TCG	2	6	869664	869669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478125
15532	NC_016051	TCCT	2	8	869706	869713	0 %	50 %	0 %	50 %	223478125
15533	NC_016051	CTC	2	6	869717	869722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478125
15534	NC_016051	TCGC	2	8	869760	869767	0 %	25 %	25 %	50 %	223478125
15535	NC_016051	GCTCG	2	10	869803	869812	0 %	20 %	40 %	40 %	223478125
15536	NC_016051	TAT	2	6	869876	869881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478125
15537	NC_016051	CT	3	6	869892	869897	0 %	50 %	0 %	50 %	223478125
15538	NC_016051	CGT	2	6	869905	869910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478125
15539	NC_016051	ATG	2	6	869934	869939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478125
15540	NC_016051	GGA	2	6	869992	869997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478125
15541	NC_016051	CT	3	6	870010	870015	0 %	50 %	0 %	50 %	223478125
15542	NC_016051	CTC	2	6	870182	870187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478200
15543	NC_016051	CTC	2	6	870212	870217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478200
15544	NC_016051	TATCG	2	10	870365	870374	20 %	40 %	20 %	20 %	223478200
15545	NC_016051	CCT	3	9	870457	870465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478200
15546	NC_016051	TGA	2	6	870565	870570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478200
15547	NC_016051	CTC	2	6	870810	870815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478052
15548	NC_016051	GA	3	6	870832	870837	50 %	0 %	50 %	0 %	223478052
15549	NC_016051	CTC	2	6	870912	870917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478052
15550	NC_016051	CTC	2	6	870989	870994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478052
15551	NC_016051	GGAAGC	2	12	871007	871018	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	223478052
15552	NC_016051	CTC	3	9	871072	871080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478052
15553	NC_016051	CTGG	2	8	871154	871161	0 %	25 %	50 %	25 %	223478052
15554	NC_016051	CCT	2	6	871286	871291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478052
15555	NC_016051	TC	3	6	871299	871304	0 %	50 %	0 %	50 %	223478052
15556	NC_016051	AGCC	2	8	871384	871391	25 %	0 %	25 %	50 %	223478052
15557	NC_016051	CCG	2	6	871462	871467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478052
15558	NC_016051	ATC	2	6	871479	871484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478052
15559	NC_016051	CAC	2	6	871508	871513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478052
15560	NC_016051	CTG	2	6	871840	871845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478112
15561	NC_016051	GC	3	6	871851	871856	0 %	0 %	50 %	50 %	223478112
15562	NC_016051	GC	3	6	871874	871879	0 %	0 %	50 %	50 %	223478112
15563	NC_016051	TTC	2	6	871972	871977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478112
15564	NC_016051	CTC	3	9	872011	872019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478112
15565	NC_016051	GGT	2	6	872086	872091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478112
15566	NC_016051	GCT	2	6	872115	872120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478112
15567	NC_016051	TC	3	6	872136	872141	0 %	50 %	0 %	50 %	223478112
15568	NC_016051	GTG	2	6	872142	872147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478112
15569	NC_016051	CCA	2	6	872398	872403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478089
15570	NC_016051	GAG	2	6	872423	872428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478089
15571	NC_016051	GGA	2	6	872440	872445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478089
15572	NC_016051	ATC	2	6	872454	872459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478089
15573	NC_016051	CCTT	2	8	872482	872489	0 %	50 %	0 %	50 %	223478089
15574	NC_016051	AAT	2	6	872504	872509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478089
15575	NC_016051	GA	3	6	872540	872545	50 %	0 %	50 %	0 %	223478089
15576	NC_016051	CGAAGA	2	12	872596	872607	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	223478089
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15578	NC_016051	CTCTTT	2	12	872721	872732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478089
15579	NC_016051	GAG	2	6	872792	872797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478089
15580	NC_016051	GCC	2	6	872847	872852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478089
15581	NC_016051	GTA	2	6	872945	872950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478089
15582	NC_016051	GGA	2	6	872956	872961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478089
15583	NC_016051	ACG	2	6	873003	873008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478089
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15585	NC_016051	AGG	2	6	873051	873056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478089
15586	NC_016051	GAG	2	6	873110	873115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478089
15587	NC_016051	GGA	2	6	873121	873126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478089
15588	NC_016051	GAGC	2	8	873173	873180	25 %	0 %	50 %	25 %	223478089
15589	NC_016051	GGA	2	6	873190	873195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478089
15590	NC_016051	CAGGG	2	10	873201	873210	20 %	0 %	60 %	20 %	223478089
15591	NC_016051	GAG	2	6	873254	873259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478089
15592	NC_016051	CGG	2	6	873538	873543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478151
15593	NC_016051	TCG	3	9	873726	873734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478151
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15596	NC_016051	TGAT	2	8	873847	873854	25 %	50 %	25 %	0 %	223478151
15597	NC_016051	GGA	2	6	873857	873862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478163
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15601	NC_016051	GGA	2	6	873941	873946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478163
15602	NC_016051	ATA	2	6	873975	873980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478163
15603	NC_016051	CTC	2	6	874032	874037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478163
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15605	NC_016051	CTC	2	6	874089	874094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478163
15606	NC_016051	AG	3	6	874112	874117	50 %	0 %	50 %	0 %	223478163
15607	NC_016051	TCG	2	6	874162	874167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478163
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15611	NC_016051	TGT	2	6	874280	874285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478163
15612	NC_016051	TAC	2	6	874302	874307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478163
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15617	NC_016051	AG	3	6	874437	874442	50 %	0 %	50 %	0 %	350525834
15618	NC_016051	GAG	2	6	874451	874456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525834
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15742	NC_016051	GTA	2	6	881759	881764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525836
15743	NC_016051	TCA	2	6	881775	881780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525836
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15981	NC_016051	ACG	2	6	895648	895653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478357
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