MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016051	CGA	2	6	54710	54715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478576
1003	NC_016051	TCG	2	6	54730	54735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478576
1004	NC_016051	CTA	2	6	54752	54757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478576
1005	NC_016051	CCG	2	6	54777	54782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478576
1006	NC_016051	CAA	2	6	54806	54811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478576
1007	NC_016051	GAGAC	2	10	54888	54897	40 %	0 %	40 %	20 %	223478576
1008	NC_016051	ATC	2	6	54963	54968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478576
1009	NC_016051	ATG	2	6	55006	55011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478576
1010	NC_016051	GGGGCA	2	12	55045	55056	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	223478576
1011	NC_016051	CGGC	2	8	55120	55127	0 %	0 %	50 %	50 %	223478576
1012	NC_016051	CAG	2	6	55136	55141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478576
1013	NC_016051	GC	3	6	55169	55174	0 %	0 %	50 %	50 %	223478576
1014	NC_016051	AAG	2	6	55212	55217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478576
1015	NC_016051	GGA	2	6	55268	55273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478576
1016	NC_016051	CTCG	2	8	55376	55383	0 %	25 %	25 %	50 %	223478576
1017	NC_016051	GGA	2	6	55424	55429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478576
1018	NC_016051	AAG	2	6	55461	55466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478576
1019	NC_016051	CAA	2	6	55652	55657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478576
1020	NC_016051	GAG	3	9	55734	55742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478576
1021	NC_016051	CGA	2	6	55769	55774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478576
1022	NC_016051	GAG	2	6	55782	55787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478576
1023	NC_016051	TCA	2	6	55792	55797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478576
1024	NC_016051	GAG	2	6	55811	55816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478576
1025	NC_016051	CG	3	6	55927	55932	0 %	0 %	50 %	50 %	223478576
1026	NC_016051	AGG	2	6	55935	55940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478576
1027	NC_016051	CCG	2	6	55963	55968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478576
1028	NC_016051	GAT	2	6	56051	56056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478576
1029	NC_016051	CTCG	2	8	56144	56151	0 %	25 %	25 %	50 %	223478576
1030	NC_016051	CG	3	6	56213	56218	0 %	0 %	50 %	50 %	223478576
1031	NC_016051	ACG	2	6	56224	56229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478576
1032	NC_016051	CGA	2	6	56255	56260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478576
1033	NC_016051	TGG	2	6	56277	56282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478576
1034	NC_016051	GAGCCG	2	12	56283	56294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	223478576
1035	NC_016051	GGCC	2	8	56299	56306	0 %	0 %	50 %	50 %	223478576
1036	NC_016051	CAA	2	6	56312	56317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478576
1037	NC_016051	GAG	2	6	56351	56356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478576
1038	NC_016051	AG	3	6	56355	56360	50 %	0 %	50 %	0 %	223478576
1039	NC_016051	GAG	2	6	56385	56390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478576
1040	NC_016051	AGA	2	6	56476	56481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478576
1041	NC_016051	TCT	2	6	56572	56577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478543
1042	NC_016051	GTC	2	6	56661	56666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478543
1043	NC_016051	CTG	2	6	56689	56694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478543
1044	NC_016051	GCT	2	6	56744	56749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478543
1045	NC_016051	TCC	2	6	56803	56808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478543
1046	NC_016051	TCC	2	6	56815	56820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478543
1047	NC_016051	GCC	2	6	56962	56967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478543
1048	NC_016051	TCT	2	6	57008	57013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478543
1049	NC_016051	CAG	2	6	57018	57023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478543
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1051	NC_016051	TGT	2	6	57050	57055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478543
1052	NC_016051	GAG	2	6	57064	57069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478543
1053	NC_016051	TCG	2	6	57130	57135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478543
1054	NC_016051	TCAT	2	8	57139	57146	25 %	50 %	0 %	25 %	223478543
1055	NC_016051	TCA	2	6	57150	57155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478795
1056	NC_016051	TCG	2	6	57251	57256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478795
1057	NC_016051	TCG	2	6	57312	57317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478795
1058	NC_016051	CTC	2	6	57328	57333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478795
1059	NC_016051	GTC	2	6	57478	57483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478795
1060	NC_016051	CTTC	2	8	57525	57532	0 %	50 %	0 %	50 %	223478795
1061	NC_016051	CGC	2	6	57541	57546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478795
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1063	NC_016051	CTC	2	6	57592	57597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478795
1064	NC_016051	CCT	2	6	57609	57614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478795
1065	NC_016051	TCTCCT	2	12	57621	57632	0 %	50 %	0 %	50 %	223478795
1066	NC_016051	GGA	2	6	57643	57648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478795
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1070	NC_016051	TTC	2	6	57736	57741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478795
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1072	NC_016051	GCA	2	6	57986	57991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478607
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1074	NC_016051	TGC	2	6	58148	58153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478607
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1079	NC_016051	CGC	2	6	58335	58340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478607
1080	NC_016051	TTC	2	6	58456	58461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478607
1081	NC_016051	GCACTC	2	12	58537	58548	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	223478607
1082	NC_016051	CTG	2	6	58570	58575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478607
1083	NC_016051	CGG	2	6	58584	58589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478607
1084	NC_016051	AAT	2	6	58590	58595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478607
1085	NC_016051	CTCC	2	8	58629	58636	0 %	25 %	0 %	75 %	223478607
1086	NC_016051	GCG	2	6	58669	58674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478607
1087	NC_016051	CCA	2	6	58682	58687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478607
1088	NC_016051	GC	3	6	58727	58732	0 %	0 %	50 %	50 %	223478607
1089	NC_016051	TC	3	6	58752	58757	0 %	50 %	0 %	50 %	223478607
1090	NC_016051	GAC	2	6	58758	58763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478607
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1093	NC_016051	GCT	2	6	58851	58856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478607
1094	NC_016051	GCCTAC	2	12	58891	58902	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	223478607
1095	NC_016051	ACA	2	6	58928	58933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478607
1096	NC_016051	CAA	2	6	58968	58973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478607
1097	NC_016051	TGG	2	6	59021	59026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478607
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1099	NC_016051	TCG	2	6	59122	59127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478815
1100	NC_016051	CCT	2	6	59248	59253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478815
1101	NC_016051	TGG	2	6	59329	59334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478815
1102	NC_016051	CAG	2	6	59366	59371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478815
1103	NC_016051	GAG	2	6	59382	59387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478815
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1105	NC_016051	GAG	2	6	59436	59441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478815
1106	NC_016051	CTC	2	6	59520	59525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478815
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1108	NC_016051	GCC	2	6	59669	59674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478815
1109	NC_016051	TAA	2	6	59802	59807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478815
1110	NC_016051	TGG	2	6	59897	59902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478534
1111	NC_016051	GAG	2	6	59914	59919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478534
1112	NC_016051	CTT	2	6	59928	59933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478534
1113	NC_016051	ATC	2	6	59953	59958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478534
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1115	NC_016051	AAG	2	6	59971	59976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478534
1116	NC_016051	GA	3	6	60022	60027	50 %	0 %	50 %	0 %	223478534
1117	NC_016051	TCA	4	12	60206	60217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478534
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1119	NC_016051	AGGA	2	8	60242	60249	50 %	0 %	50 %	0 %	223478534
1120	NC_016051	AAG	2	6	60250	60255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478534
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1124	NC_016051	ACT	2	6	60530	60535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478534
1125	NC_016051	ACG	3	9	60542	60550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478534
1126	NC_016051	CGT	2	6	60558	60563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478534
1127	NC_016051	GGAA	2	8	60592	60599	50 %	0 %	50 %	0 %	223478534
1128	NC_016051	CTGG	2	8	60706	60713	0 %	25 %	50 %	25 %	223478534
1129	NC_016051	CAT	2	6	60846	60851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478534
1130	NC_016051	CGG	2	6	60858	60863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478534
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1239	NC_016051	GCTG	2	8	66959	66966	0 %	25 %	50 %	25 %	223478515
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1246	NC_016051	TGA	2	6	67302	67307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478515
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1248	NC_016051	TGA	2	6	67359	67364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478515
1249	NC_016051	GTA	2	6	67402	67407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478515
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1253	NC_016051	CGT	2	6	67546	67551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478515
1254	NC_016051	CGT	2	6	67578	67583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478515
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1497	NC_016051	AGT	2	6	81196	81201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478976
1498	NC_016051	CGG	2	6	81223	81228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478976
1499	NC_016051	CG	4	8	81273	81280	0 %	0 %	50 %	50 %	223478976
1500	NC_016051	GAG	2	6	81287	81292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478976

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