MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016051	CCA	2	6	645749	645754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477043
11502	NC_016051	ACG	2	6	645786	645791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477043
11503	NC_016051	CG	3	6	645877	645882	0 %	0 %	50 %	50 %	223477043
11504	NC_016051	TCG	2	6	645886	645891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477043
11505	NC_016051	AGT	2	6	645985	645990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477043
11506	NC_016051	TCCGT	2	10	646053	646062	0 %	40 %	20 %	40 %	223477043
11507	NC_016051	CTT	2	6	646064	646069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477043
11508	NC_016051	GAG	2	6	646085	646090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477043
11509	NC_016051	GGT	2	6	646121	646126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477043
11510	NC_016051	TCG	2	6	646132	646137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477043
11511	NC_016051	TCG	3	9	646146	646154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477043
11512	NC_016051	GCTC	2	8	646210	646217	0 %	25 %	25 %	50 %	223477043
11513	NC_016051	CCTT	2	8	646396	646403	0 %	50 %	0 %	50 %	223477043
11514	NC_016051	CTT	2	6	646424	646429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477043
11515	NC_016051	TCG	2	6	646512	646517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477043
11516	NC_016051	TGT	2	6	646555	646560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477043
11517	NC_016051	TCG	2	6	646644	646649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477043
11518	NC_016051	GTA	2	6	646718	646723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477043
11519	NC_016051	TCC	2	6	646725	646730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477043
11520	NC_016051	TTC	2	6	646752	646757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477043
11521	NC_016051	GTT	2	6	646889	646894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477043
11522	NC_016051	TCT	2	6	646910	646915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477043
11523	NC_016051	ACG	3	9	646935	646943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477043
11524	NC_016051	CTT	2	6	646967	646972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477043
11525	NC_016051	CCT	2	6	647016	647021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476965
11526	NC_016051	CCT	2	6	647181	647186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476965
11527	NC_016051	CTG	2	6	647244	647249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476965
11528	NC_016051	GTC	2	6	647259	647264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476965
11529	NC_016051	TCG	2	6	647512	647517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476965
11530	NC_016051	TCG	2	6	647549	647554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476965
11531	NC_016051	GTC	2	6	647556	647561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476965
11532	NC_016051	TC	3	6	647589	647594	0 %	50 %	0 %	50 %	223476965
11533	NC_016051	CCTG	2	8	647626	647633	0 %	25 %	25 %	50 %	223476965
11534	NC_016051	CTT	2	6	647748	647753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476965
11535	NC_016051	TGA	2	6	647762	647767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476965
11536	NC_016051	CCG	2	6	647836	647841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476965
11537	NC_016051	GAC	2	6	647892	647897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476965
11538	NC_016051	CG	3	6	647918	647923	0 %	0 %	50 %	50 %	223476965
11539	NC_016051	CTT	2	6	647967	647972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476965
11540	NC_016051	TCC	2	6	648034	648039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476965
11541	NC_016051	GGA	2	6	648050	648055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476965
11542	NC_016051	CTT	2	6	648093	648098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476965
11543	NC_016051	TTAG	2	8	648223	648230	25 %	50 %	25 %	0 %	223476965
11544	NC_016051	CCG	2	6	648256	648261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476965
11545	NC_016051	TTC	2	6	648325	648330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476965
11546	NC_016051	T	6	6	648765	648770	0 %	100 %	0 %	0 %	223477103
11547	NC_016051	CCT	2	6	648779	648784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477103
11548	NC_016051	TTC	2	6	648843	648848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477103
11549	NC_016051	TTC	2	6	648868	648873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477103
11550	NC_016051	CGA	2	6	648905	648910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477103
11551	NC_016051	CTC	2	6	648932	648937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477103
11552	NC_016051	ATC	2	6	648970	648975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477103
11553	NC_016051	CTCG	2	8	649041	649048	0 %	25 %	25 %	50 %	223477013
11554	NC_016051	CCG	2	6	649079	649084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477013
11555	NC_016051	CTC	2	6	649170	649175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477013
11556	NC_016051	CCA	2	6	649187	649192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477013
11557	NC_016051	AGG	2	6	649198	649203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477013
11558	NC_016051	CTC	2	6	649236	649241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477013
11559	NC_016051	CTT	2	6	649259	649264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477013
11560	NC_016051	ACT	2	6	649288	649293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477013
11561	NC_016051	GCG	2	6	649522	649527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477013
11562	NC_016051	TTA	2	6	649529	649534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477013
11563	NC_016051	TCTT	2	8	649541	649548	0 %	75 %	0 %	25 %	223477013
11564	NC_016051	GTA	3	9	649662	649670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477013
11565	NC_016051	CGT	2	6	649686	649691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477013
11566	NC_016051	GAC	2	6	649857	649862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477017
11567	NC_016051	GAG	2	6	649996	650001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477017
11568	NC_016051	GA	3	6	650004	650009	50 %	0 %	50 %	0 %	223477017
11569	NC_016051	AGGTCC	2	12	650021	650032	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	223477017
11570	NC_016051	CCTG	2	8	650160	650167	0 %	25 %	25 %	50 %	223477017
11571	NC_016051	GA	3	6	650264	650269	50 %	0 %	50 %	0 %	223477017
11572	NC_016051	AGG	2	6	650351	650356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477017
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11574	NC_016051	CCT	2	6	650386	650391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477227
11575	NC_016051	GAG	2	6	650405	650410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477227
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11579	NC_016051	CTT	2	6	650573	650578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477227
11580	NC_016051	TGA	2	6	650653	650658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477227
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11584	NC_016051	TAC	2	6	651188	651193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477158
11585	NC_016051	AGT	2	6	651226	651231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477158
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11587	NC_016051	CAG	2	6	651296	651301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477158
11588	NC_016051	CGA	2	6	651307	651312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477158
11589	NC_016051	GC	3	6	651393	651398	0 %	0 %	50 %	50 %	223477158
11590	NC_016051	GAG	2	6	651467	651472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477158
11591	NC_016051	CT	3	6	651482	651487	0 %	50 %	0 %	50 %	223477158
11592	NC_016051	ATG	3	9	651534	651542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477158
11593	NC_016051	CTT	2	6	651581	651586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477158
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11599	NC_016051	AGG	2	6	651969	651974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477158
11600	NC_016051	TAT	2	6	651980	651985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477158
11601	NC_016051	CCA	2	6	652033	652038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477158
11602	NC_016051	GAA	2	6	652070	652075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477158
11603	NC_016051	GAC	2	6	652094	652099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477158
11604	NC_016051	GAG	2	6	652109	652114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477158
11605	NC_016051	TGT	2	6	652201	652206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477158
11606	NC_016051	CGA	2	6	652216	652221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477158
11607	NC_016051	TCA	2	6	652279	652284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477158
11608	NC_016051	ACC	2	6	652684	652689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477207
11609	NC_016051	CTC	2	6	652968	652973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477207
11610	NC_016051	CT	3	6	652991	652996	0 %	50 %	0 %	50 %	223477207
11611	NC_016051	CTCAAT	2	12	653067	653078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477207
11612	NC_016051	TGG	2	6	653087	653092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477207
11613	NC_016051	CAT	2	6	653124	653129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477207
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11615	NC_016051	GAC	2	6	653302	653307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525794
11616	NC_016051	CGGCT	2	10	653673	653682	0 %	20 %	40 %	40 %	223477091
11617	NC_016051	CGC	2	6	653759	653764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477091
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11619	NC_016051	C	6	6	653781	653786	0 %	0 %	0 %	100 %	223477257
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11977	NC_016051	GCC	2	6	672109	672114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476998
11978	NC_016051	CTTC	2	8	672132	672139	0 %	50 %	0 %	50 %	223476998
11979	NC_016051	CAT	2	6	672156	672161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477275
11980	NC_016051	CTT	2	6	672162	672167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477275
11981	NC_016051	CCTGTC	2	12	672210	672221	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	223477275
11982	NC_016051	CTC	3	9	672255	672263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477275
11983	NC_016051	TCT	2	6	672269	672274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477275
11984	NC_016051	TCT	2	6	672299	672304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477275
11985	NC_016051	TCC	2	6	672344	672349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477275
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11987	NC_016051	CTT	2	6	672414	672419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477275
11988	NC_016051	AGCG	2	8	672458	672465	25 %	0 %	50 %	25 %	223477275
11989	NC_016051	CGG	2	6	672479	672484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477275
11990	NC_016051	CCG	2	6	672580	672585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477275
11991	NC_016051	GTT	2	6	672603	672608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477275
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12000	NC_016051	CG	3	6	673138	673143	0 %	0 %	50 %	50 %	223477247

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