MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016051	CGG	2	6	617176	617181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477249
11002	NC_016051	GTC	2	6	617214	617219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477249
11003	NC_016051	AGCG	2	8	617234	617241	25 %	0 %	50 %	25 %	223477249
11004	NC_016051	GAG	2	6	617439	617444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477249
11005	NC_016051	TGG	2	6	617503	617508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477249
11006	NC_016051	TCC	2	6	617512	617517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477249
11007	NC_016051	CTC	2	6	617565	617570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477249
11008	NC_016051	GAA	2	6	617584	617589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477249
11009	NC_016051	TCG	2	6	617590	617595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477249
11010	NC_016051	CAG	2	6	617652	617657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477249
11011	NC_016051	CAA	2	6	617660	617665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477249
11012	NC_016051	GAG	2	6	617667	617672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477249
11013	NC_016051	CCGC	2	8	617718	617725	0 %	0 %	25 %	75 %	223477249
11014	NC_016051	ATG	2	6	617793	617798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477249
11015	NC_016051	GAG	2	6	617843	617848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477249
11016	NC_016051	AGCG	2	8	618025	618032	25 %	0 %	50 %	25 %	223477018
11017	NC_016051	TAC	2	6	618116	618121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477018
11018	NC_016051	TCT	2	6	618240	618245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477018
11019	NC_016051	CGG	2	6	618295	618300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477018
11020	NC_016051	GTC	2	6	618437	618442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477018
11021	NC_016051	CGG	2	6	618445	618450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477018
11022	NC_016051	TTCCCG	2	12	618458	618469	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	223477018
11023	NC_016051	GCC	2	6	618530	618535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477018
11024	NC_016051	GTG	2	6	618639	618644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477018
11025	NC_016051	GAG	2	6	618674	618679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477018
11026	NC_016051	ACC	3	9	618723	618731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477018
11027	NC_016051	CCA	2	6	618733	618738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477018
11028	NC_016051	CGC	2	6	618793	618798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477018
11029	NC_016051	GAG	2	6	618842	618847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477018
11030	NC_016051	CCA	2	6	618889	618894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477018
11031	NC_016051	TCG	2	6	618900	618905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477018
11032	NC_016051	GGC	2	6	618940	618945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477018
11033	NC_016051	CAA	2	6	618976	618981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477018
11034	NC_016051	CCT	2	6	618985	618990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477018
11035	NC_016051	CGAGC	2	10	619018	619027	20 %	0 %	40 %	40 %	223477018
11036	NC_016051	GAC	2	6	619076	619081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477018
11037	NC_016051	CCG	2	6	619105	619110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477018
11038	NC_016051	AGG	2	6	619125	619130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477018
11039	NC_016051	CTA	2	6	619186	619191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477018
11040	NC_016051	TTC	2	6	619384	619389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477274
11041	NC_016051	TC	3	6	619483	619488	0 %	50 %	0 %	50 %	223477274
11042	NC_016051	CTT	2	6	619681	619686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477274
11043	NC_016051	CGA	2	6	619722	619727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477274
11044	NC_016051	TAT	2	6	619741	619746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477274
11045	NC_016051	ATT	2	6	619799	619804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477274
11046	NC_016051	GAG	2	6	619922	619927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477274
11047	NC_016051	CGA	2	6	619932	619937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477274
11048	NC_016051	GTA	2	6	620103	620108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476952
11049	NC_016051	CTT	2	6	620141	620146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476952
11050	NC_016051	TCC	2	6	620187	620192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476952
11051	NC_016051	TCC	2	6	620249	620254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476952
11052	NC_016051	CTC	2	6	620325	620330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476952
11053	NC_016051	TCG	2	6	620336	620341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476952
11054	NC_016051	CCG	2	6	620473	620478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476952
11055	NC_016051	CAT	2	6	620484	620489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476952
11056	NC_016051	GAG	2	6	620496	620501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476952
11057	NC_016051	GC	4	8	620531	620538	0 %	0 %	50 %	50 %	223476952
11058	NC_016051	TGG	2	6	620581	620586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223476952
11059	NC_016051	AAG	2	6	620617	620622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476952
11060	NC_016051	CGC	2	6	620651	620656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476952
11061	NC_016051	CTT	2	6	620826	620831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476952
11062	NC_016051	CCA	2	6	620858	620863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476952
11063	NC_016051	CGAGGC	2	12	620885	620896	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	223476952
11064	NC_016051	CCTTC	2	10	620963	620972	0 %	40 %	0 %	60 %	223476952
11065	NC_016051	TTC	2	6	621104	621109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477159
11066	NC_016051	CTTC	2	8	621291	621298	0 %	50 %	0 %	50 %	223477159
11067	NC_016051	TGA	2	6	621414	621419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477159
11068	NC_016051	TAA	2	6	621726	621731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477159
11069	NC_016051	CCT	2	6	621739	621744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477159
11070	NC_016051	C	6	6	621769	621774	0 %	0 %	0 %	100 %	223477159
11071	NC_016051	T	6	6	622192	622197	0 %	100 %	0 %	0 %	223477272
11072	NC_016051	CGA	2	6	622208	622213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477272
11073	NC_016051	CCG	2	6	622307	622312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477272
11074	NC_016051	AGC	2	6	622378	622383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477272
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11076	NC_016051	CTT	2	6	622642	622647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477057
11077	NC_016051	CTC	2	6	622692	622697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477057
11078	NC_016051	TCC	3	9	622735	622743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477057
11079	NC_016051	CTT	2	6	622758	622763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477057
11080	NC_016051	CAC	2	6	622770	622775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477057
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11084	NC_016051	CTC	2	6	622987	622992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477154
11085	NC_016051	TCC	2	6	623033	623038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477154
11086	NC_016051	TCG	2	6	623069	623074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477154
11087	NC_016051	TC	3	6	623098	623103	0 %	50 %	0 %	50 %	223477154
11088	NC_016051	TCG	2	6	623168	623173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477154
11089	NC_016051	GAC	2	6	623200	623205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477154
11090	NC_016051	GC	3	6	623680	623685	0 %	0 %	50 %	50 %	223477271
11091	NC_016051	CGAGAA	2	12	623722	623733	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	223477271
11092	NC_016051	AG	3	6	623762	623767	50 %	0 %	50 %	0 %	223477271
11093	NC_016051	GAGCT	2	10	623912	623921	20 %	20 %	40 %	20 %	223477271
11094	NC_016051	TCG	2	6	623925	623930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477271
11095	NC_016051	GGT	2	6	623980	623985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477271
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11098	NC_016051	GAG	2	6	624099	624104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525792
11099	NC_016051	GAC	3	9	624199	624207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525792
11100	NC_016051	GGAA	2	8	624286	624293	50 %	0 %	50 %	0 %	350525792
11101	NC_016051	TCG	2	6	624299	624304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525792
11102	NC_016051	CGG	2	6	624305	624310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525792
11103	NC_016051	GCT	2	6	624360	624365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525792
11104	NC_016051	ATG	2	6	624394	624399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525792
11105	NC_016051	GAT	2	6	624445	624450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525792
11106	NC_016051	CCT	2	6	624493	624498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477078
11107	NC_016051	AG	4	8	624557	624564	50 %	0 %	50 %	0 %	223477078
11108	NC_016051	GGCA	2	8	624614	624621	25 %	0 %	50 %	25 %	223477078
11109	NC_016051	TCG	2	6	624665	624670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477078
11110	NC_016051	ACA	2	6	624687	624692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477078
11111	NC_016051	ACC	2	6	624774	624779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477078
11112	NC_016051	TCC	2	6	624788	624793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477078
11113	NC_016051	TCG	2	6	624819	624824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477078
11114	NC_016051	CAG	2	6	624881	624886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477078
11115	NC_016051	CG	3	6	624900	624905	0 %	0 %	50 %	50 %	223477078
11116	NC_016051	GAA	2	6	624910	624915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477078
11117	NC_016051	CCT	2	6	624922	624927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477078
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11119	NC_016051	ATA	2	6	625013	625018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477078
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11235	NC_016051	GGGT	2	8	631516	631523	0 %	25 %	75 %	0 %	223477184
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11354	NC_016051	CAT	2	6	637295	637300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477047
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