MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_016051	GGA	2	6	590215	590220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477124
10503	NC_016051	ATA	2	6	590257	590262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477124
10504	NC_016051	ATA	2	6	590314	590319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477124
10505	NC_016051	GCG	2	6	590320	590325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477124
10506	NC_016051	TCG	2	6	590549	590554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477124
10507	NC_016051	GAAG	2	8	590808	590815	50 %	0 %	50 %	0 %	223477066
10508	NC_016051	AGA	2	6	591084	591089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476944
10509	NC_016051	TCG	2	6	591162	591167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476944
10510	NC_016051	CTGTT	2	10	591204	591213	0 %	60 %	20 %	20 %	223476944
10511	NC_016051	CGA	2	6	591249	591254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476944
10512	NC_016051	ACC	2	6	591292	591297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476944
10513	NC_016051	CAA	2	6	591328	591333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476944
10514	NC_016051	CGA	2	6	591355	591360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476944
10515	NC_016051	AGG	2	6	591380	591385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
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10517	NC_016051	GA	3	6	591542	591547	50 %	0 %	50 %	0 %	223476944
10518	NC_016051	A	6	6	591592	591597	100 %	0 %	0 %	0 %	223476944
10519	NC_016051	AAG	2	6	591620	591625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476944
10520	NC_016051	GGA	2	6	591628	591633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
10521	NC_016051	TCT	2	6	591652	591657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476944
10522	NC_016051	AGG	2	6	591663	591668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
10523	NC_016051	GA	3	6	591698	591703	50 %	0 %	50 %	0 %	223476944
10524	NC_016051	ACG	2	6	591705	591710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476944
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10526	NC_016051	GA	3	6	591771	591776	50 %	0 %	50 %	0 %	223476944
10527	NC_016051	GAG	2	6	591800	591805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
10528	NC_016051	GAG	3	9	591830	591838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
10529	NC_016051	AGGGAA	2	12	591890	591901	50 %	0 %	50 %	0 %	223476944
10530	NC_016051	GGA	2	6	591925	591930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
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10532	NC_016051	CAAAGG	2	12	592056	592067	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	223476944
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10535	NC_016051	TCG	2	6	592188	592193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476944
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10537	NC_016051	AAG	2	6	592274	592279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476944
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10539	NC_016051	CGAGG	2	10	592462	592471	20 %	0 %	60 %	20 %	223476944
10540	NC_016051	GAAGA	2	10	592496	592505	60 %	0 %	40 %	0 %	223476944
10541	NC_016051	GAG	2	6	592550	592555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
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10543	NC_016051	CGG	2	6	592705	592710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476944
10544	NC_016051	GTT	2	6	592727	592732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476944
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10551	NC_016051	TCG	2	6	592932	592937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476944
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10553	NC_016051	GGC	2	6	592994	592999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476944
10554	NC_016051	GCT	2	6	593002	593007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476944
10555	NC_016051	GAG	2	6	593011	593016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
10556	NC_016051	GGC	2	6	593030	593035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476944
10557	NC_016051	CGA	2	6	593071	593076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476944
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10559	NC_016051	CTC	2	6	593246	593251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476944
10560	NC_016051	GGA	2	6	593254	593259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
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10562	NC_016051	AGG	2	6	593475	593480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
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10587	NC_016051	GGGC	2	8	594728	594735	0 %	0 %	75 %	25 %	350525788
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10593	NC_016051	C	6	6	594922	594927	0 %	0 %	0 %	100 %	350525788
10594	NC_016051	TAC	2	6	594967	594972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525788
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10602	NC_016051	ACGA	2	8	595230	595237	50 %	0 %	25 %	25 %	223477001
10603	NC_016051	CAC	2	6	595272	595277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477001
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10607	NC_016051	GA	3	6	595445	595450	50 %	0 %	50 %	0 %	223477001
10608	NC_016051	ACATAG	2	12	595559	595570	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	223477002
10609	NC_016051	TGC	2	6	595598	595603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477002
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10612	NC_016051	CCG	2	6	595762	595767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477002
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10615	NC_016051	GAA	2	6	595863	595868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477002
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10979	NC_016051	CGG	2	6	616020	616025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476967
10980	NC_016051	GGA	2	6	616048	616053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476967
10981	NC_016051	GAAGAG	2	12	616078	616089	50 %	0 %	50 %	0 %	223476967
10982	NC_016051	TTC	2	6	616105	616110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476967
10983	NC_016051	GGA	2	6	616131	616136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476967
10984	NC_016051	ACCT	2	8	616177	616184	25 %	25 %	0 %	50 %	223476967
10985	NC_016051	TGG	2	6	616205	616210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223476967
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10987	NC_016051	GGA	2	6	616241	616246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476967
10988	NC_016051	CGCC	2	8	616286	616293	0 %	0 %	25 %	75 %	223476967
10989	NC_016051	ACT	2	6	616301	616306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476967
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10991	NC_016051	CAA	2	6	616482	616487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476967
10992	NC_016051	GTC	2	6	616516	616521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476967
10993	NC_016051	TGAT	2	8	616545	616552	25 %	50 %	25 %	0 %	223476967
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10995	NC_016051	GAG	2	6	616691	616696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477249
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10997	NC_016051	CCG	2	6	617008	617013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477249
10998	NC_016051	GGGCG	2	10	617018	617027	0 %	0 %	80 %	20 %	223477249
10999	NC_016051	CGG	2	6	617066	617071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477249
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