MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016051	CGTG	2	8	562155	562162	0 %	25 %	50 %	25 %	223477195
10002	NC_016051	CGGG	2	8	562332	562339	0 %	0 %	75 %	25 %	223477195
10003	NC_016051	CTC	2	6	562369	562374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477195
10004	NC_016051	AGT	2	6	562605	562610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477170
10005	NC_016051	CAA	2	6	562673	562678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477170
10006	NC_016051	ACC	2	6	562693	562698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477170
10007	NC_016051	CAC	2	6	562739	562744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477170
10008	NC_016051	CAACG	2	10	562745	562754	40 %	0 %	20 %	40 %	223477170
10009	NC_016051	GAGG	2	8	562808	562815	25 %	0 %	75 %	0 %	223477170
10010	NC_016051	TCC	2	6	562843	562848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477170
10011	NC_016051	AGA	2	6	562888	562893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477170
10012	NC_016051	GAT	2	6	562917	562922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477170
10013	NC_016051	GC	3	6	562927	562932	0 %	0 %	50 %	50 %	223477170
10014	NC_016051	TACC	2	8	563057	563064	25 %	25 %	0 %	50 %	223477170
10015	NC_016051	CGC	2	6	563186	563191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477170
10016	NC_016051	TGG	2	6	563277	563282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477170
10017	NC_016051	CA	3	6	563298	563303	50 %	0 %	0 %	50 %	223477170
10018	NC_016051	TCC	2	6	563440	563445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476962
10019	NC_016051	AGA	2	6	563452	563457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476962
10020	NC_016051	TC	4	8	563491	563498	0 %	50 %	0 %	50 %	223476962
10021	NC_016051	TCG	2	6	563533	563538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476962
10022	NC_016051	GGA	2	6	563608	563613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476962
10023	NC_016051	AGGG	2	8	563661	563668	25 %	0 %	75 %	0 %	223476962
10024	NC_016051	ACA	2	6	563677	563682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476962
10025	NC_016051	GCG	2	6	563692	563697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476962
10026	NC_016051	CGT	2	6	563759	563764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476962
10027	NC_016051	GGA	2	6	563811	563816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476962
10028	NC_016051	CTC	2	6	563828	563833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476962
10029	NC_016051	CTG	2	6	563841	563846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476962
10030	NC_016051	GAA	2	6	563918	563923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476962
10031	NC_016051	AGG	2	6	563965	563970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476962
10032	NC_016051	GGC	2	6	563987	563992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476962
10033	NC_016051	AGC	2	6	564057	564062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476962
10034	NC_016051	GAA	2	6	564137	564142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476962
10035	NC_016051	ATA	2	6	564159	564164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223476962
10036	NC_016051	AG	3	6	564191	564196	50 %	0 %	50 %	0 %	223476962
10037	NC_016051	GAT	2	6	564212	564217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476962
10038	NC_016051	GAT	2	6	564228	564233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476962
10039	NC_016051	GTG	2	6	564323	564328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223476962
10040	NC_016051	GGGAT	2	10	564362	564371	20 %	20 %	60 %	0 %	223476962
10041	NC_016051	GAA	2	6	564386	564391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476962
10042	NC_016051	TTC	2	6	564414	564419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476962
10043	NC_016051	CGG	2	6	564428	564433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476962
10044	NC_016051	GAGC	2	8	564484	564491	25 %	0 %	50 %	25 %	223476962
10045	NC_016051	CTCC	2	8	564527	564534	0 %	25 %	0 %	75 %	223476962
10046	NC_016051	GCA	2	6	564544	564549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476962
10047	NC_016051	GCC	2	6	564606	564611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476962
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10050	NC_016051	GGC	2	6	564710	564715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476962
10051	NC_016051	ATC	2	6	564771	564776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476962
10052	NC_016051	CT	3	6	564895	564900	0 %	50 %	0 %	50 %	223476962
10053	NC_016051	GCGT	2	8	564909	564916	0 %	25 %	50 %	25 %	223476962
10054	NC_016051	CT	3	6	564924	564929	0 %	50 %	0 %	50 %	223476962
10055	NC_016051	ACT	2	6	564958	564963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476962
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10057	NC_016051	GGA	2	6	565061	565066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476962
10058	NC_016051	GGC	2	6	565196	565201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476962
10059	NC_016051	TTCA	2	8	565205	565212	25 %	50 %	0 %	25 %	223476962
10060	NC_016051	A	6	6	565260	565265	100 %	0 %	0 %	0 %	223476962
10061	NC_016051	TTG	2	6	565423	565428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476962
10062	NC_016051	GCC	2	6	565442	565447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476962
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10064	NC_016051	GTT	2	6	565474	565479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477278
10065	NC_016051	TCA	2	6	565577	565582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477278
10066	NC_016051	TTACC	2	10	565722	565731	20 %	40 %	0 %	40 %	223477278
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10068	NC_016051	ACTG	2	8	565755	565762	25 %	25 %	25 %	25 %	223477278
10069	NC_016051	TG	3	6	565761	565766	0 %	50 %	50 %	0 %	223477278
10070	NC_016051	TCT	2	6	565778	565783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477278
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10072	NC_016051	GTT	2	6	565911	565916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477278
10073	NC_016051	TGA	2	6	565929	565934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477278
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10077	NC_016051	AGGG	2	8	566022	566029	25 %	0 %	75 %	0 %	223477278
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10081	NC_016051	G	6	6	566122	566127	0 %	0 %	100 %	0 %	223477278
10082	NC_016051	G	6	6	566144	566149	0 %	0 %	100 %	0 %	223477278
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10086	NC_016051	CGA	2	6	566438	566443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477194
10087	NC_016051	CGAG	2	8	566455	566462	25 %	0 %	50 %	25 %	223477194
10088	NC_016051	CCT	2	6	566483	566488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477194
10089	NC_016051	GAG	2	6	566510	566515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477194
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10091	NC_016051	GCTG	2	8	566549	566556	0 %	25 %	50 %	25 %	223477194
10092	NC_016051	TAG	2	6	566589	566594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477194
10093	NC_016051	TCTT	2	8	566644	566651	0 %	75 %	0 %	25 %	223477152
10094	NC_016051	GCC	2	6	566652	566657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477152
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10103	NC_016051	GCCT	2	8	567039	567046	0 %	25 %	25 %	50 %	223477152
10104	NC_016051	TCTCC	2	10	567122	567131	0 %	40 %	0 %	60 %	223477152
10105	NC_016051	TC	3	6	567133	567138	0 %	50 %	0 %	50 %	223477152
10106	NC_016051	ATG	2	6	567350	567355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525781
10107	NC_016051	G	6	6	567396	567401	0 %	0 %	100 %	0 %	350525781
10108	NC_016051	CTGGC	2	10	567407	567416	0 %	20 %	40 %	40 %	350525781
10109	NC_016051	TCC	2	6	567557	567562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525781
10110	NC_016051	CCG	2	6	567881	567886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525781
10111	NC_016051	CGT	2	6	567897	567902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525781
10112	NC_016051	CCG	2	6	567956	567961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525781
10113	NC_016051	CTG	2	6	568037	568042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525781
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10115	NC_016051	GCC	2	6	568217	568222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477054
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10118	NC_016051	ACG	2	6	568322	568327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477054
10119	NC_016051	CTT	2	6	568333	568338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477054
10120	NC_016051	GGC	2	6	568529	568534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477054
10121	NC_016051	CTC	2	6	568558	568563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477054
10122	NC_016051	CCG	2	6	568628	568633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477054
10123	NC_016051	TTA	2	6	568638	568643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477054
10124	NC_016051	CTCGGG	2	12	568660	568671	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	223477054
10125	NC_016051	CGCT	2	8	568814	568821	0 %	25 %	25 %	50 %	223477054
10126	NC_016051	CCTG	2	8	568822	568829	0 %	25 %	25 %	50 %	223477054
10127	NC_016051	TGA	2	6	568833	568838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477054
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10129	NC_016051	TCG	2	6	568937	568942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477054
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10133	NC_016051	GAC	2	6	569143	569148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477054
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10136	NC_016051	TGA	2	6	569256	569261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477054
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10225	NC_016051	CTT	2	6	573496	573501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477071
10226	NC_016051	ACGG	2	8	573532	573539	25 %	0 %	50 %	25 %	223477071
10227	NC_016051	CTTT	2	8	573565	573572	0 %	75 %	0 %	25 %	223477071
10228	NC_016051	CTT	2	6	573799	573804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477071
10229	NC_016051	GTA	2	6	573832	573837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477071
10230	NC_016051	CG	3	6	573841	573846	0 %	0 %	50 %	50 %	223477071
10231	NC_016051	CTC	2	6	573854	573859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477071
10232	NC_016051	TC	4	8	573885	573892	0 %	50 %	0 %	50 %	223477071
10233	NC_016051	CCT	2	6	573967	573972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477191
10234	NC_016051	ACC	2	6	574245	574250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477191
10235	NC_016051	TGT	2	6	574303	574308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477191
10236	NC_016051	CTCC	2	8	574344	574351	0 %	25 %	0 %	75 %	223477141
10237	NC_016051	AG	3	6	574361	574366	50 %	0 %	50 %	0 %	223477141
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10239	NC_016051	GAG	2	6	574447	574452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477141
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10345	NC_016051	GGAA	2	8	579931	579938	50 %	0 %	50 %	0 %	223477174
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10478	NC_016051	GCC	2	6	589082	589087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477117
10479	NC_016051	GGCC	2	8	589099	589106	0 %	0 %	50 %	50 %	223477117
10480	NC_016051	GAT	2	6	589174	589179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477117
10481	NC_016051	TCG	2	6	589215	589220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477117
10482	NC_016051	GAG	2	6	589249	589254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477117
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