MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_016051	CTC	2	6	508462	508467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477286
9002	NC_016051	GAC	2	6	508488	508493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477286
9003	NC_016051	GTC	2	6	508792	508797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477183
9004	NC_016051	ACC	2	6	508831	508836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477183
9005	NC_016051	ACT	2	6	508859	508864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477183
9006	NC_016051	AGA	2	6	508949	508954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477183
9007	NC_016051	GAG	2	6	508960	508965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477183
9008	NC_016051	TGGA	2	8	509029	509036	25 %	25 %	50 %	0 %	223477183
9009	NC_016051	CGA	2	6	509085	509090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477183
9010	NC_016051	GCG	2	6	509129	509134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477183
9011	NC_016051	CCA	2	6	509135	509140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477183
9012	NC_016051	TCG	2	6	509162	509167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477183
9013	NC_016051	CTA	2	6	509196	509201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477183
9014	NC_016051	CGA	2	6	509265	509270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477183
9015	NC_016051	CAA	2	6	509301	509306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477183
9016	NC_016051	CCGC	2	8	509335	509342	0 %	0 %	25 %	75 %	223477183
9017	NC_016051	GAG	2	6	509353	509358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477183
9018	NC_016051	AGGCCA	2	12	509375	509386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477183
9019	NC_016051	TGG	2	6	509410	509415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477183
9020	NC_016051	AAG	2	6	509425	509430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477183
9021	NC_016051	CAGC	2	8	509497	509504	25 %	0 %	25 %	50 %	223477042
9022	NC_016051	GA	3	6	509591	509596	50 %	0 %	50 %	0 %	223477042
9023	NC_016051	CCG	2	6	509616	509621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477042
9024	NC_016051	CTC	2	6	509737	509742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477042
9025	NC_016051	GCCT	2	8	509759	509766	0 %	25 %	25 %	50 %	223477042
9026	NC_016051	TGA	2	6	509767	509772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477042
9027	NC_016051	AGA	2	6	509844	509849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477042
9028	NC_016051	GAG	2	6	509861	509866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477042
9029	NC_016051	GAG	2	6	509939	509944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477042
9030	NC_016051	GGA	2	6	509985	509990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477042
9031	NC_016051	CGGA	2	8	509997	510004	25 %	0 %	50 %	25 %	223477042
9032	NC_016051	TGA	2	6	510082	510087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477042
9033	NC_016051	AAG	2	6	510093	510098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477042
9034	NC_016051	ATG	2	6	510123	510128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477042
9035	NC_016051	CGC	2	6	510170	510175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477042
9036	NC_016051	CGCCTT	2	12	510194	510205	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	223477042
9037	NC_016051	CAA	3	9	510232	510240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477042
9038	NC_016051	GAG	2	6	510285	510290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477042
9039	NC_016051	TCG	2	6	510298	510303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477042
9040	NC_016051	AGG	3	9	510309	510317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477042
9041	NC_016051	CCG	2	6	510617	510622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525768
9042	NC_016051	TCC	2	6	510679	510684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525768
9043	NC_016051	GAA	2	6	510903	510908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525768
9044	NC_016051	TGCC	2	8	510915	510922	0 %	25 %	25 %	50 %	350525768
9045	NC_016051	CTT	2	6	510988	510993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525768
9046	NC_016051	GC	3	6	511007	511012	0 %	0 %	50 %	50 %	350525768
9047	NC_016051	CAC	2	6	511021	511026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477253
9048	NC_016051	ATG	2	6	511059	511064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477253
9049	NC_016051	CGAG	2	8	511144	511151	25 %	0 %	50 %	25 %	223477253
9050	NC_016051	TC	3	6	511166	511171	0 %	50 %	0 %	50 %	223477253
9051	NC_016051	GAA	2	6	511202	511207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477253
9052	NC_016051	GAA	2	6	511214	511219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477253
9053	NC_016051	CTC	2	6	511306	511311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477253
9054	NC_016051	TAGA	2	8	511346	511353	50 %	25 %	25 %	0 %	223477253
9055	NC_016051	GAA	2	6	511370	511375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477253
9056	NC_016051	ACC	2	6	511383	511388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477253
9057	NC_016051	TCC	2	6	511450	511455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477253
9058	NC_016051	CCGC	2	8	511515	511522	0 %	0 %	25 %	75 %	223477253
9059	NC_016051	ACC	2	6	511531	511536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477253
9060	NC_016051	GAA	2	6	511686	511691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477044
9061	NC_016051	TTC	2	6	511791	511796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477044
9062	NC_016051	ATG	2	6	511812	511817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477044
9063	NC_016051	TTA	2	6	511889	511894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477044
9064	NC_016051	ACG	2	6	511897	511902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477044
9065	NC_016051	GGA	2	6	511925	511930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477044
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9067	NC_016051	CGA	2	6	511982	511987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477044
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9069	NC_016051	AGG	2	6	512107	512112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477044
9070	NC_016051	TTC	2	6	512242	512247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477044
9071	NC_016051	CAT	2	6	512256	512261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477044
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9073	NC_016051	CGAGGA	2	12	512291	512302	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	223477044
9074	NC_016051	CGAG	2	8	512306	512313	25 %	0 %	50 %	25 %	223477044
9075	NC_016051	GTGTAG	2	12	512347	512358	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	223477044
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9077	NC_016051	CGA	2	6	512378	512383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477044
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9080	NC_016051	AGT	2	6	512450	512455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477044
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9085	NC_016051	TCG	2	6	512651	512656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477044
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9087	NC_016051	GTA	2	6	512835	512840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477044
9088	NC_016051	GAG	2	6	512889	512894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477044
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9091	NC_016051	CGA	2	6	513218	513223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477116
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9093	NC_016051	TCG	2	6	513244	513249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477116
9094	NC_016051	CGT	2	6	513290	513295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477116
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9101	NC_016051	CGA	2	6	513548	513553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477116
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9103	NC_016051	GTAG	2	8	513752	513759	25 %	25 %	50 %	0 %	223477244
9104	NC_016051	CAG	2	6	513761	513766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477244
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9113	NC_016051	GAGC	2	8	514235	514242	25 %	0 %	50 %	25 %	223477288
9114	NC_016051	AGGCC	2	10	514259	514268	20 %	0 %	40 %	40 %	223477288
9115	NC_016051	TC	3	6	514311	514316	0 %	50 %	0 %	50 %	223477288
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9243	NC_016051	CCGAGG	2	12	520519	520530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	350525769
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9483	NC_016051	TTCG	2	8	533275	533282	0 %	50 %	25 %	25 %	223477080
9484	NC_016051	GAG	2	6	533383	533388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477080
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9487	NC_016051	TAC	2	6	533473	533478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477080
9488	NC_016051	TAC	2	6	533494	533499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477080
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9491	NC_016051	TGA	2	6	533573	533578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477080
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