MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_016051	ATC	2	6	476653	476658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477164
8502	NC_016051	TCC	2	6	476668	476673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477164
8503	NC_016051	GGAA	2	8	476693	476700	50 %	0 %	50 %	0 %	223477164
8504	NC_016051	CGA	2	6	476717	476722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477164
8505	NC_016051	ATG	2	6	476743	476748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477164
8506	NC_016051	CGA	2	6	476780	476785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477164
8507	NC_016051	CTT	2	6	476853	476858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477164
8508	NC_016051	ATG	2	6	476869	476874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477164
8509	NC_016051	TCG	2	6	476899	476904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477164
8510	NC_016051	ACC	2	6	476925	476930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477164
8511	NC_016051	GAT	2	6	476946	476951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477164
8512	NC_016051	GAC	2	6	476973	476978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477164
8513	NC_016051	CTT	2	6	477011	477016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477164
8514	NC_016051	CGA	2	6	477089	477094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477164
8515	NC_016051	CGC	2	6	477348	477353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476942
8516	NC_016051	GGC	2	6	477354	477359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476942
8517	NC_016051	TGG	2	6	477377	477382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223476942
8518	NC_016051	AGC	2	6	477415	477420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476942
8519	NC_016051	ACG	2	6	477424	477429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476942
8520	NC_016051	CCG	2	6	477446	477451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476942
8521	NC_016051	TCA	2	6	477461	477466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476942
8522	NC_016051	GGA	2	6	477516	477521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476942
8523	NC_016051	CGAG	2	8	477605	477612	25 %	0 %	50 %	25 %	223476942
8524	NC_016051	GAA	2	6	477786	477791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476942
8525	NC_016051	GGC	2	6	477793	477798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476942
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8527	NC_016051	CCT	2	6	477918	477923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476942
8528	NC_016051	CAT	2	6	477930	477935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476942
8529	NC_016051	GCC	2	6	478048	478053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476942
8530	NC_016051	GAT	3	9	478146	478154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476942
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8532	NC_016051	GTC	2	6	478279	478284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476942
8533	NC_016051	CGG	3	9	478302	478310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476942
8534	NC_016051	GTG	2	6	478360	478365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223476942
8535	NC_016051	ATAGGC	2	12	478369	478380	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	223476942
8536	NC_016051	CGA	2	6	478479	478484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476942
8537	NC_016051	CGG	2	6	478518	478523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476942
8538	NC_016051	TCA	2	6	478529	478534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476942
8539	NC_016051	GGA	2	6	478554	478559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476942
8540	NC_016051	CGG	2	6	478595	478600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476942
8541	NC_016051	GAG	2	6	478608	478613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476942
8542	NC_016051	GA	4	8	478744	478751	50 %	0 %	50 %	0 %	223477296
8543	NC_016051	AGA	2	6	478758	478763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477296
8544	NC_016051	AGGC	2	8	478772	478779	25 %	0 %	50 %	25 %	223477296
8545	NC_016051	GGTC	2	8	478798	478805	0 %	25 %	50 %	25 %	223477296
8546	NC_016051	ACG	2	6	478823	478828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477296
8547	NC_016051	GGAC	2	8	478854	478861	25 %	0 %	50 %	25 %	223477296
8548	NC_016051	AC	4	8	478860	478867	50 %	0 %	0 %	50 %	223477296
8549	NC_016051	GAG	2	6	478871	478876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477296
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8551	NC_016051	CGCGGA	2	12	478909	478920	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	223477296
8552	NC_016051	TGA	2	6	479040	479045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477296
8553	NC_016051	CGA	2	6	479046	479051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477296
8554	NC_016051	TCG	2	6	479088	479093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477296
8555	NC_016051	GCG	2	6	479096	479101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477296
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8591	NC_016051	ATC	2	6	481006	481011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477171
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8601	NC_016051	CCTT	2	8	484813	484820	0 %	50 %	0 %	50 %	223477086
8602	NC_016051	ATA	2	6	484830	484835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477086
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8604	NC_016051	ACG	2	6	484912	484917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477086
8605	NC_016051	CGTGC	2	10	484922	484931	0 %	20 %	40 %	40 %	223477086
8606	NC_016051	GAG	2	6	484988	484993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477086
8607	NC_016051	AAG	2	6	485007	485012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477086
8608	NC_016051	AGGG	2	8	485067	485074	25 %	0 %	75 %	0 %	223477086
8609	NC_016051	CGA	2	6	485075	485080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477086
8610	NC_016051	GA	3	6	485079	485084	50 %	0 %	50 %	0 %	223477086
8611	NC_016051	CCGG	2	8	485118	485125	0 %	0 %	50 %	50 %	223477086
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8616	NC_016051	GAG	2	6	485444	485449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477216
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8618	NC_016051	CTCG	2	8	485620	485627	0 %	25 %	25 %	50 %	223477216
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