MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016051	ACG	2	6	390299	390304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477188
7002	NC_016051	GCTG	2	8	390380	390387	0 %	25 %	50 %	25 %	223477188
7003	NC_016051	CTC	2	6	390397	390402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477188
7004	NC_016051	CGA	2	6	390408	390413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477188
7005	NC_016051	GAG	2	6	390448	390453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477188
7006	NC_016051	GAG	2	6	390490	390495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477188
7007	NC_016051	CGGG	2	8	390501	390508	0 %	0 %	75 %	25 %	223477188
7008	NC_016051	TCT	2	6	390662	390667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477188
7009	NC_016051	CAG	2	6	390732	390737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477188
7010	NC_016051	GCTC	2	8	390750	390757	0 %	25 %	25 %	50 %	223477188
7011	NC_016051	CCT	2	6	390786	390791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477188
7012	NC_016051	CGG	2	6	390807	390812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477188
7013	NC_016051	CTT	2	6	390831	390836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477188
7014	NC_016051	TCC	2	6	390848	390853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477188
7015	NC_016051	CCTCGG	2	12	390969	390980	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	223477188
7016	NC_016051	CGA	2	6	391017	391022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477188
7017	NC_016051	TCA	2	6	391088	391093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477188
7018	NC_016051	TCG	2	6	391100	391105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477188
7019	NC_016051	TTC	2	6	391111	391116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477188
7020	NC_016051	TCG	2	6	391130	391135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477188
7021	NC_016051	ATCT	2	8	391144	391151	25 %	50 %	0 %	25 %	223477188
7022	NC_016051	CT	3	6	391174	391179	0 %	50 %	0 %	50 %	223477188
7023	NC_016051	GAG	2	6	391210	391215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477188
7024	NC_016051	TCC	2	6	391244	391249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477188
7025	NC_016051	GGA	2	6	391259	391264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477188
7026	NC_016051	CTC	2	6	391270	391275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477188
7027	NC_016051	TCG	2	6	391328	391333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477188
7028	NC_016051	AAT	2	6	391479	391484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477188
7029	NC_016051	ATG	2	6	391558	391563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477188
7030	NC_016051	ACG	2	6	391606	391611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477188
7031	NC_016051	CCA	2	6	391631	391636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477188
7032	NC_016051	CTC	2	6	391711	391716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477188
7033	NC_016051	GGA	2	6	391772	391777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477109
7034	NC_016051	TCA	2	6	391789	391794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477109
7035	NC_016051	AAT	2	6	391862	391867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477109
7036	NC_016051	CTC	2	6	391872	391877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477109
7037	NC_016051	GAG	2	6	391896	391901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477109
7038	NC_016051	AAGG	2	8	391937	391944	50 %	0 %	50 %	0 %	223477109
7039	NC_016051	CTG	2	6	391962	391967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477109
7040	NC_016051	AAGGTG	2	12	391971	391982	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	223477109
7041	NC_016051	GGA	2	6	392126	392131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477299
7042	NC_016051	CAAAC	2	10	392194	392203	60 %	0 %	0 %	40 %	223477299
7043	NC_016051	CTG	2	6	392213	392218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477299
7044	NC_016051	CGA	2	6	392245	392250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477299
7045	NC_016051	GA	3	6	392280	392285	50 %	0 %	50 %	0 %	223477299
7046	NC_016051	GAG	2	6	392300	392305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477299
7047	NC_016051	CGG	2	6	392365	392370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477299
7048	NC_016051	GAG	2	6	392387	392392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477299
7049	NC_016051	AACTTC	2	12	392438	392449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477299
7050	NC_016051	GAA	2	6	392473	392478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477299
7051	NC_016051	GAG	2	6	392573	392578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477299
7052	NC_016051	TCG	2	6	392604	392609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477299
7053	NC_016051	CGT	2	6	392623	392628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477299
7054	NC_016051	AAG	2	6	392633	392638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477299
7055	NC_016051	GAG	2	6	392645	392650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477299
7056	NC_016051	AGG	2	6	392664	392669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477299
7057	NC_016051	ACT	2	6	392745	392750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477299
7058	NC_016051	TCT	2	6	392778	392783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477299
7059	NC_016051	TCA	2	6	392835	392840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477299
7060	NC_016051	CGT	3	9	393058	393066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477299
7061	NC_016051	GTC	2	6	393098	393103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477299
7062	NC_016051	GAA	2	6	393163	393168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477299
7063	NC_016051	GAG	2	6	393173	393178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477299
7064	NC_016051	CGA	2	6	393210	393215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477299
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7067	NC_016051	CGA	2	6	393313	393318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477299
7068	NC_016051	CAT	2	6	393447	393452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477036
7069	NC_016051	AG	3	6	393486	393491	50 %	0 %	50 %	0 %	223477036
7070	NC_016051	CGC	2	6	393528	393533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477036
7071	NC_016051	G	6	6	393558	393563	0 %	0 %	100 %	0 %	223477036
7072	NC_016051	TGA	2	6	393671	393676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477036
7073	NC_016051	GCA	2	6	393731	393736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477036
7074	NC_016051	CGA	3	9	393773	393781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477036
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7077	NC_016051	ACGA	2	8	393943	393950	50 %	0 %	25 %	25 %	223477036
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7080	NC_016051	GAG	2	6	394107	394112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477036
7081	NC_016051	CCT	2	6	394127	394132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477036
7082	NC_016051	AAG	2	6	394147	394152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477036
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7085	NC_016051	T	6	6	394220	394225	0 %	100 %	0 %	0 %	223477036
7086	NC_016051	TGA	2	6	394342	394347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477112
7087	NC_016051	ACG	2	6	394516	394521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477112
7088	NC_016051	CGG	2	6	394648	394653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477112
7089	NC_016051	CTC	2	6	394686	394691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477112
7090	NC_016051	GAT	2	6	394806	394811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477112
7091	NC_016051	AGATC	2	10	394841	394850	40 %	20 %	20 %	20 %	223477112
7092	NC_016051	CGA	2	6	394900	394905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477225
7093	NC_016051	GA	3	6	395024	395029	50 %	0 %	50 %	0 %	223477225
7094	NC_016051	TCC	2	6	395097	395102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477225
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7099	NC_016051	GAA	2	6	395329	395334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477225
7100	NC_016051	GAG	2	6	395339	395344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477225
7101	NC_016051	TGG	2	6	395346	395351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477225
7102	NC_016051	GAG	2	6	395412	395417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477049
7103	NC_016051	GAG	2	6	395463	395468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477049
7104	NC_016051	CCG	2	6	395493	395498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477049
7105	NC_016051	GCT	2	6	395504	395509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477049
7106	NC_016051	GAG	2	6	395583	395588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477049
7107	NC_016051	CGA	2	6	395591	395596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477049
7108	NC_016051	GGA	2	6	395660	395665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477049
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7110	NC_016051	CTT	2	6	395936	395941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477037
7111	NC_016051	TCAACG	2	12	395970	395981	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	223477037
7112	NC_016051	CCCT	2	8	396063	396070	0 %	25 %	0 %	75 %	223477037
7113	NC_016051	CCT	2	6	396085	396090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477037
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7118	NC_016051	GGA	2	6	396319	396324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477037
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7120	NC_016051	TCT	2	6	396403	396408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477037
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7499	NC_016051	AT	3	6	418538	418543	50 %	50 %	0 %	0 %	350525755
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