MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016051	CTT	2	6	337308	337313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478931
6002	NC_016051	TCA	2	6	337330	337335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478931
6003	NC_016051	AGGT	2	8	337351	337358	25 %	25 %	50 %	0 %	223478931
6004	NC_016051	CTG	2	6	337362	337367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478931
6005	NC_016051	GAAG	2	8	337374	337381	50 %	0 %	50 %	0 %	223478931
6006	NC_016051	CGG	2	6	337397	337402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478931
6007	NC_016051	AGA	2	6	337407	337412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478931
6008	NC_016051	GCTG	2	8	337448	337455	0 %	25 %	50 %	25 %	223478931
6009	NC_016051	CTT	2	6	337458	337463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478931
6010	NC_016051	TCC	2	6	337492	337497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478931
6011	NC_016051	TCT	2	6	337517	337522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478931
6012	NC_016051	TCA	2	6	337561	337566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478931
6013	NC_016051	ATG	2	6	337582	337587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478931
6014	NC_016051	CAA	2	6	337637	337642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478931
6015	NC_016051	CGGG	2	8	337676	337683	0 %	0 %	75 %	25 %	223478931
6016	NC_016051	CGA	2	6	337733	337738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478931
6017	NC_016051	CTT	2	6	337749	337754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478931
6018	NC_016051	CTC	2	6	337761	337766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478931
6019	NC_016051	TCT	2	6	338301	338306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478762
6020	NC_016051	GAAG	2	8	338349	338356	50 %	0 %	50 %	0 %	223478762
6021	NC_016051	ATC	2	6	338365	338370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6022	NC_016051	GGA	2	6	338448	338453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478762
6023	NC_016051	TCG	2	6	338462	338467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6024	NC_016051	GGA	2	6	338529	338534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478762
6025	NC_016051	ACC	2	6	338632	338637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478762
6026	NC_016051	ACA	2	6	338645	338650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478762
6027	NC_016051	TCC	2	6	338729	338734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478762
6028	NC_016051	ATC	2	6	338761	338766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6029	NC_016051	CGA	2	6	338784	338789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6030	NC_016051	CTA	2	6	338805	338810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6031	NC_016051	TCG	2	6	338840	338845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6032	NC_016051	TAC	2	6	338929	338934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6033	NC_016051	TAC	2	6	338959	338964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6034	NC_016051	CCT	2	6	338970	338975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478762
6035	NC_016051	CAA	2	6	338997	339002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478762
6036	NC_016051	TCG	2	6	339074	339079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6037	NC_016051	GAA	2	6	339084	339089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478762
6038	NC_016051	ACA	2	6	339125	339130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478762
6039	NC_016051	CGA	2	6	339191	339196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6040	NC_016051	CCACGG	2	12	339264	339275	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	223478762
6041	NC_016051	CCA	2	6	339444	339449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478762
6042	NC_016051	TCC	2	6	339481	339486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478762
6043	NC_016051	ACG	2	6	339497	339502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6044	NC_016051	ACT	2	6	339521	339526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6045	NC_016051	ACT	2	6	339545	339550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6046	NC_016051	ACG	2	6	339581	339586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6047	NC_016051	ACC	2	6	339592	339597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478762
6048	NC_016051	ACG	2	6	339680	339685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6049	NC_016051	CAG	2	6	339720	339725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6050	NC_016051	GAT	2	6	339777	339782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478762
6051	NC_016051	ACA	2	6	339818	339823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478762
6052	NC_016051	CTA	2	6	339834	339839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6053	NC_016051	GC	3	6	339951	339956	0 %	0 %	50 %	50 %	223478762
6054	NC_016051	TCC	2	6	340043	340048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478762
6055	NC_016051	ATCTAC	2	12	340072	340083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6056	NC_016051	CCT	2	6	340113	340118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478762
6057	NC_016051	AGA	3	9	340124	340132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478762
6058	NC_016051	GTTCA	2	10	340153	340162	20 %	40 %	20 %	20 %	223478762
6059	NC_016051	ACA	2	6	340175	340180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478762
6060	NC_016051	GTC	2	6	340357	340362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6061	NC_016051	TTCA	2	8	340398	340405	25 %	50 %	0 %	25 %	223478762
6062	NC_016051	ACT	2	6	340418	340423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6063	NC_016051	CGA	2	6	340467	340472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6064	NC_016051	ACT	2	6	340589	340594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6065	NC_016051	CGA	2	6	340650	340655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6066	NC_016051	TCG	2	6	340742	340747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6067	NC_016051	ACG	2	6	340850	340855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478762
6068	NC_016051	GA	3	6	340906	340911	50 %	0 %	50 %	0 %	223478762
6069	NC_016051	CGG	2	6	340932	340937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478762
6070	NC_016051	AC	3	6	340944	340949	50 %	0 %	0 %	50 %	223478762
6071	NC_016051	ACT	2	6	341102	341107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
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6073	NC_016051	GCCA	2	8	341216	341223	25 %	0 %	25 %	50 %	223478762
6074	NC_016051	GAG	2	6	341263	341268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478762
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6077	NC_016051	TAG	2	6	341411	341416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478762
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6079	NC_016051	ACCT	2	8	341473	341480	25 %	25 %	0 %	50 %	223478762
6080	NC_016051	GCT	2	6	341517	341522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478762
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6084	NC_016051	ATG	3	9	341644	341652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478762
6085	NC_016051	TAC	2	6	341695	341700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
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6087	NC_016051	TAC	2	6	341842	341847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
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6089	NC_016051	CAA	2	6	341961	341966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478762
6090	NC_016051	CTA	2	6	341973	341978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6091	NC_016051	TGA	2	6	342032	342037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478762
6092	NC_016051	CAT	2	6	342048	342053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478762
6093	NC_016051	GAG	2	6	342199	342204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478942
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6101	NC_016051	TCG	2	6	342877	342882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478751
6102	NC_016051	CTC	2	6	342934	342939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478751
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6104	NC_016051	TCC	2	6	342976	342981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478751
6105	NC_016051	ATCGC	2	10	343060	343069	20 %	20 %	20 %	40 %	223478751
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6110	NC_016051	TCG	2	6	343237	343242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478751
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6116	NC_016051	CCT	2	6	343627	343632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478803
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6118	NC_016051	GTT	2	6	343823	343828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478880
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6241	NC_016051	TCA	2	6	350212	350217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478772
6242	NC_016051	GCT	2	6	350334	350339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478772
6243	NC_016051	TCCA	2	8	350352	350359	25 %	25 %	0 %	50 %	223478772
6244	NC_016051	GA	3	6	350501	350506	50 %	0 %	50 %	0 %	223478865
6245	NC_016051	AGGATA	2	12	350549	350560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	223478865
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6247	NC_016051	TCG	2	6	350634	350639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478865
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6251	NC_016051	CTT	2	6	351132	351137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478629
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6253	NC_016051	TCG	2	6	351191	351196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478629
6254	NC_016051	TCA	2	6	351260	351265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478629
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6260	NC_016051	CAG	2	6	351427	351432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478629
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6273	NC_016051	CGA	2	6	351993	351998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478629
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6331	NC_016051	GC	3	6	355025	355030	0 %	0 %	50 %	50 %	223478846
6332	NC_016051	GAT	2	6	355064	355069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478846
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6344	NC_016051	A	6	6	355681	355686	100 %	0 %	0 %	0 %	350525736
6345	NC_016051	GTT	2	6	355705	355710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525736
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6347	NC_016051	ACT	2	6	355790	355795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525736
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6349	NC_016051	TCA	2	6	355864	355869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525736
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6351	NC_016051	TCAA	2	8	355981	355988	50 %	25 %	0 %	25 %	350525736
6352	NC_016051	ATA	2	6	356152	356157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525736
6353	NC_016051	GACT	2	8	356181	356188	25 %	25 %	25 %	25 %	350525736
6354	NC_016051	TGTACC	2	12	356252	356263	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	350525736
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6357	NC_016051	TTG	2	6	356380	356385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525736
6358	NC_016051	TGC	2	6	356397	356402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525736
6359	NC_016051	CA	3	6	356497	356502	50 %	0 %	0 %	50 %	350525736
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6482	NC_016051	CTG	2	6	364176	364181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476856
6483	NC_016051	ATA	2	6	364220	364225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525741
6484	NC_016051	CCT	2	6	364246	364251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525741
6485	NC_016051	GAA	2	6	364281	364286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525741
6486	NC_016051	TTCGT	2	10	364301	364310	0 %	60 %	20 %	20 %	350525741
6487	NC_016051	GAG	2	6	364526	364531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525741
6488	NC_016051	GTC	2	6	364570	364575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525742
6489	NC_016051	CTC	2	6	364585	364590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525742
6490	NC_016051	CCT	2	6	364659	364664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525742
6491	NC_016051	CAG	2	6	364666	364671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525742
6492	NC_016051	TGA	2	6	364731	364736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525742
6493	NC_016051	TGC	2	6	364810	364815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525742
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6495	NC_016051	T	6	6	365048	365053	0 %	100 %	0 %	0 %	350525742
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6497	NC_016051	AGG	2	6	365112	365117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476853
6498	NC_016051	GGGT	2	8	365165	365172	0 %	25 %	75 %	0 %	223476853
6499	NC_016051	AGT	2	6	365199	365204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476853
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