MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016051	TCC	2	6	309763	309768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478603
5502	NC_016051	TCG	2	6	309799	309804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478603
5503	NC_016051	AGC	2	6	309805	309810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478603
5504	NC_016051	GCT	3	9	309854	309862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478603
5505	NC_016051	GCC	2	6	309864	309869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478603
5506	NC_016051	TGG	2	6	309877	309882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478603
5507	NC_016051	TCC	2	6	309949	309954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478603
5508	NC_016051	CTC	2	6	310131	310136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478603
5509	NC_016051	ATC	2	6	310147	310152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478603
5510	NC_016051	CGT	2	6	310158	310163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478603
5511	NC_016051	GAG	2	6	310188	310193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478603
5512	NC_016051	CGG	2	6	310238	310243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478603
5513	NC_016051	GAC	2	6	310355	310360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478781
5514	NC_016051	CTC	2	6	310406	310411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478781
5515	NC_016051	GGT	2	6	310444	310449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478781
5516	NC_016051	TGA	2	6	310534	310539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478781
5517	NC_016051	TTC	2	6	310554	310559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478781
5518	NC_016051	TCG	2	6	310561	310566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478781
5519	NC_016051	GAG	2	6	310776	310781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478781
5520	NC_016051	GGC	2	6	310798	310803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478781
5521	NC_016051	GAAC	2	8	310930	310937	50 %	0 %	25 %	25 %	223478781
5522	NC_016051	GTT	2	6	310943	310948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478781
5523	NC_016051	ACG	2	6	310957	310962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478781
5524	NC_016051	GAA	2	6	311006	311011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478781
5525	NC_016051	CAGGAA	2	12	311045	311056	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	223478781
5526	NC_016051	GCCG	2	8	311083	311090	0 %	0 %	50 %	50 %	223478781
5527	NC_016051	TCT	2	6	311158	311163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478781
5528	NC_016051	GAG	2	6	311168	311173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478781
5529	NC_016051	ATG	2	6	311187	311192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478781
5530	NC_016051	TGGTA	2	10	311372	311381	20 %	40 %	40 %	0 %	223478781
5531	NC_016051	CGC	2	6	311423	311428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478781
5532	NC_016051	GCC	3	9	311460	311468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478781
5533	NC_016051	C	6	6	311556	311561	0 %	0 %	0 %	100 %	223478781
5534	NC_016051	GCC	2	6	311601	311606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478781
5535	NC_016051	GGC	2	6	311637	311642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478781
5536	NC_016051	AAC	2	6	311672	311677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478781
5537	NC_016051	GAC	2	6	311702	311707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478781
5538	NC_016051	ATG	2	6	311730	311735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478781
5539	NC_016051	GAA	2	6	311741	311746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478781
5540	NC_016051	AGA	2	6	311895	311900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478781
5541	NC_016051	AGG	2	6	311904	311909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478781
5542	NC_016051	CAG	2	6	311912	311917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478781
5543	NC_016051	GAG	2	6	312030	312035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478630
5544	NC_016051	CAG	2	6	312137	312142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478630
5545	NC_016051	GAG	2	6	312161	312166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478630
5546	NC_016051	GCC	3	9	312186	312194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478630
5547	NC_016051	TCC	2	6	312282	312287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478630
5548	NC_016051	TAT	2	6	312341	312346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478630
5549	NC_016051	GAC	2	6	312377	312382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478630
5550	NC_016051	CTT	2	6	312401	312406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478630
5551	NC_016051	AGT	2	6	312409	312414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478630
5552	NC_016051	GGC	2	6	312455	312460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478630
5553	NC_016051	GTT	2	6	312503	312508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478630
5554	NC_016051	GGGA	2	8	312519	312526	25 %	0 %	75 %	0 %	223478630
5555	NC_016051	CTT	2	6	312560	312565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478630
5556	NC_016051	TAT	2	6	312578	312583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478630
5557	NC_016051	TCA	2	6	312691	312696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478630
5558	NC_016051	TTC	2	6	312708	312713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478630
5559	NC_016051	CA	3	6	312744	312749	50 %	0 %	0 %	50 %	223478630
5560	NC_016051	GAT	2	6	312758	312763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478630
5561	NC_016051	CTT	2	6	312848	312853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478630
5562	NC_016051	TCG	2	6	312861	312866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478630
5563	NC_016051	CTC	2	6	313254	313259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478540
5564	NC_016051	GAC	2	6	313277	313282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478540
5565	NC_016051	CAT	2	6	313306	313311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478540
5566	NC_016051	CGAG	2	8	313330	313337	25 %	0 %	50 %	25 %	223478540
5567	NC_016051	TTC	2	6	313343	313348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478540
5568	NC_016051	TCT	2	6	313402	313407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478540
5569	NC_016051	CCTCG	2	10	313421	313430	0 %	20 %	20 %	60 %	223478540
5570	NC_016051	CCAGC	2	10	313546	313555	20 %	0 %	20 %	60 %	223478540
5571	NC_016051	GC	3	6	313554	313559	0 %	0 %	50 %	50 %	223478540
5572	NC_016051	GCG	2	6	313579	313584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478540
5573	NC_016051	CTT	2	6	313637	313642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478540
5574	NC_016051	TGA	2	6	313657	313662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478540
5575	NC_016051	GGA	2	6	313738	313743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478540
5576	NC_016051	GAG	2	6	313799	313804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478540
5577	NC_016051	CTT	2	6	313813	313818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478540
5578	NC_016051	TCG	2	6	313893	313898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478540
5579	NC_016051	AAC	2	6	313937	313942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478540
5580	NC_016051	TCC	2	6	313951	313956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478540
5581	NC_016051	CG	3	6	313968	313973	0 %	0 %	50 %	50 %	223478540
5582	NC_016051	GAG	2	6	313995	314000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478540
5583	NC_016051	TAT	2	6	314009	314014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478540
5584	NC_016051	ATC	2	6	314265	314270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478611
5585	NC_016051	CCGGC	2	10	314275	314284	0 %	0 %	40 %	60 %	223478611
5586	NC_016051	GCC	2	6	314295	314300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478611
5587	NC_016051	TGG	2	6	314365	314370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478611
5588	NC_016051	C	6	6	314482	314487	0 %	0 %	0 %	100 %	223478611
5589	NC_016051	GA	3	6	314529	314534	50 %	0 %	50 %	0 %	223478611
5590	NC_016051	CCA	2	6	314645	314650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478611
5591	NC_016051	CTA	2	6	314672	314677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478611
5592	NC_016051	CGT	2	6	314714	314719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478611
5593	NC_016051	CTC	2	6	314769	314774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478611
5594	NC_016051	CCG	2	6	314801	314806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478611
5595	NC_016051	GAG	2	6	314853	314858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478611
5596	NC_016051	ATC	2	6	314895	314900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478611
5597	NC_016051	CGT	2	6	314957	314962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478611
5598	NC_016051	TGT	2	6	314996	315001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478611
5599	NC_016051	AGG	2	6	315073	315078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478611
5600	NC_016051	TTC	2	6	315087	315092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478611
5601	NC_016051	CGT	2	6	315101	315106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478611
5602	NC_016051	AAG	2	6	315180	315185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478611
5603	NC_016051	TCCCCG	2	12	315202	315213	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	223478611
5604	NC_016051	CGA	2	6	315368	315373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478663
5605	NC_016051	ATT	2	6	315400	315405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478663
5606	NC_016051	AC	3	6	315429	315434	50 %	0 %	0 %	50 %	223478663
5607	NC_016051	GAG	2	6	315468	315473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478663
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5609	NC_016051	TCC	2	6	315531	315536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478663
5610	NC_016051	AAG	2	6	315568	315573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478663
5611	NC_016051	ACC	2	6	315594	315599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478663
5612	NC_016051	CGG	2	6	315602	315607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478663
5613	NC_016051	GAG	2	6	315612	315617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478663
5614	NC_016051	CTT	2	6	315761	315766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478663
5615	NC_016051	GCGA	2	8	315810	315817	25 %	0 %	50 %	25 %	223478663
5616	NC_016051	GAAGGA	2	12	315860	315871	50 %	0 %	50 %	0 %	223478663
5617	NC_016051	CTT	2	6	315959	315964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478663
5618	NC_016051	GAA	2	6	315969	315974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478663
5619	NC_016051	CAA	2	6	316025	316030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478663
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5621	NC_016051	GAC	2	6	316145	316150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478663
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5623	NC_016051	GCT	2	6	316271	316276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478663
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5984	NC_016051	TGA	2	6	336572	336577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478931
5985	NC_016051	CT	3	6	336587	336592	0 %	50 %	0 %	50 %	223478931
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