MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016051	TCA	2	6	282244	282249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525730
5002	NC_016051	CGT	2	6	282329	282334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525730
5003	NC_016051	CGA	2	6	282341	282346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525730
5004	NC_016051	CGA	2	6	282437	282442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525730
5005	NC_016051	GCC	2	6	282483	282488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525730
5006	NC_016051	CTCACC	2	12	282601	282612	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	350525730
5007	NC_016051	GAGC	2	8	282627	282634	25 %	0 %	50 %	25 %	350525730
5008	NC_016051	GAAGTC	2	12	282660	282671	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	350525730
5009	NC_016051	ACTCT	2	10	282737	282746	20 %	40 %	0 %	40 %	350525730
5010	NC_016051	AGT	2	6	282764	282769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525730
5011	NC_016051	TAT	2	6	282828	282833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350525730
5012	NC_016051	TCC	2	6	282865	282870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
5013	NC_016051	GAG	2	6	282897	282902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525730
5014	NC_016051	CTCTT	2	10	282913	282922	0 %	60 %	0 %	40 %	350525730
5015	NC_016051	GGAG	2	8	283076	283083	25 %	0 %	75 %	0 %	350525730
5016	NC_016051	GAG	2	6	283086	283091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525730
5017	NC_016051	CCT	2	6	283100	283105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
5018	NC_016051	TC	3	6	283266	283271	0 %	50 %	0 %	50 %	350525730
5019	NC_016051	GAG	2	6	283293	283298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525730
5020	NC_016051	CTC	2	6	283374	283379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
5021	NC_016051	GTT	2	6	283410	283415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5022	NC_016051	CTT	2	6	283422	283427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525730
5023	NC_016051	GAGG	2	8	283428	283435	25 %	0 %	75 %	0 %	350525730
5024	NC_016051	CCT	2	6	283481	283486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
5025	NC_016051	GTT	2	6	283538	283543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5026	NC_016051	GAG	3	9	283554	283562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525730
5027	NC_016051	TTC	2	6	283566	283571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525730
5028	NC_016051	GC	3	6	283582	283587	0 %	0 %	50 %	50 %	350525730
5029	NC_016051	CCT	2	6	283643	283648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
5030	NC_016051	GAG	3	9	283671	283679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525730
5031	NC_016051	TCG	2	6	283690	283695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525730
5032	NC_016051	GGTTTT	2	12	283861	283872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5033	NC_016051	AGC	2	6	283887	283892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525730
5034	NC_016051	CGC	2	6	283895	283900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525730
5035	NC_016051	AGG	2	6	283906	283911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525730
5036	NC_016051	CGG	2	6	283922	283927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525730
5037	NC_016051	G	6	6	283995	284000	0 %	0 %	100 %	0 %	350525730
5038	NC_016051	GTA	2	6	284011	284016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525730
5039	NC_016051	GTT	2	6	284017	284022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5040	NC_016051	GTT	2	6	284059	284064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5041	NC_016051	GTG	2	6	284065	284070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525730
5042	NC_016051	TGG	2	6	284079	284084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525730
5043	NC_016051	GA	3	6	284097	284102	50 %	0 %	50 %	0 %	350525730
5044	NC_016051	GTT	2	6	284113	284118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5045	NC_016051	CTC	2	6	284154	284159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
5046	NC_016051	GGCT	2	8	284298	284305	0 %	25 %	50 %	25 %	350525730
5047	NC_016051	GTC	2	6	284353	284358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525730
5048	NC_016051	GTT	2	6	284431	284436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5049	NC_016051	GTT	2	6	284560	284565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5050	NC_016051	GTT	2	6	284722	284727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5051	NC_016051	CTTT	2	8	284782	284789	0 %	75 %	0 %	25 %	350525730
5052	NC_016051	CTA	2	6	286071	286076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478763
5053	NC_016051	TGA	2	6	286109	286114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478763
5054	NC_016051	TCC	2	6	286154	286159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478763
5055	NC_016051	CT	3	6	286242	286247	0 %	50 %	0 %	50 %	223478763
5056	NC_016051	CTT	2	6	286253	286258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478763
5057	NC_016051	TCCC	2	8	286303	286310	0 %	25 %	0 %	75 %	223478763
5058	NC_016051	TCCCT	2	10	286339	286348	0 %	40 %	0 %	60 %	223478763
5059	NC_016051	C	6	6	286469	286474	0 %	0 %	0 %	100 %	223478763
5060	NC_016051	CGC	2	6	286490	286495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478763
5061	NC_016051	AGT	2	6	286508	286513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478763
5062	NC_016051	CGA	2	6	286541	286546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478763
5063	NC_016051	GTA	2	6	286560	286565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478763
5064	NC_016051	TCC	2	6	286571	286576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478763
5065	NC_016051	TCCT	2	8	286591	286598	0 %	50 %	0 %	50 %	223478763
5066	NC_016051	AAGT	2	8	286729	286736	50 %	25 %	25 %	0 %	223478763
5067	NC_016051	TTCCT	2	10	286743	286752	0 %	60 %	0 %	40 %	223478763
5068	NC_016051	CTC	2	6	286755	286760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478763
5069	NC_016051	CAT	3	9	286767	286775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478763
5070	NC_016051	CTC	2	6	286800	286805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478763
5071	NC_016051	GAA	2	6	286806	286811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478763
5072	NC_016051	TGA	2	6	286820	286825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478763
5073	NC_016051	GTA	2	6	286863	286868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478763
5074	NC_016051	GCC	2	6	286878	286883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478763
5075	NC_016051	AGAC	2	8	286886	286893	50 %	0 %	25 %	25 %	223478763
5076	NC_016051	CAC	2	6	286899	286904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478763
5077	NC_016051	TTA	2	6	286976	286981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478763
5078	NC_016051	AGT	2	6	287012	287017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478763
5079	NC_016051	CTT	2	6	287028	287033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478763
5080	NC_016051	TGAG	2	8	287045	287052	25 %	25 %	50 %	0 %	223478763
5081	NC_016051	GAC	2	6	287058	287063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478763
5082	NC_016051	GAG	2	6	287088	287093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478763
5083	NC_016051	CT	3	6	287169	287174	0 %	50 %	0 %	50 %	223478763
5084	NC_016051	AGG	2	6	287176	287181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478763
5085	NC_016051	CCT	2	6	287237	287242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478763
5086	NC_016051	CAA	2	6	287318	287323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478763
5087	NC_016051	TGG	2	6	287626	287631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223479002
5088	NC_016051	GAG	2	6	287656	287661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223479002
5089	NC_016051	CTCG	2	8	287709	287716	0 %	25 %	25 %	50 %	223479002
5090	NC_016051	TCG	2	6	287738	287743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223479002
5091	NC_016051	CTC	2	6	287779	287784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223479002
5092	NC_016051	CTC	2	6	287794	287799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223479002
5093	NC_016051	TCT	2	6	287825	287830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223479002
5094	NC_016051	CGA	2	6	287850	287855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223479002
5095	NC_016051	CGA	2	6	287937	287942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223479002
5096	NC_016051	TGG	2	6	287962	287967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223479002
5097	NC_016051	ATA	2	6	287974	287979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223479002
5098	NC_016051	A	6	6	287994	287999	100 %	0 %	0 %	0 %	223479002
5099	NC_016051	ACG	2	6	288008	288013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223479002
5100	NC_016051	CTCCGT	2	12	288030	288041	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	223479002
5101	NC_016051	AGG	2	6	288076	288081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223479002
5102	NC_016051	GGA	2	6	288089	288094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223479002
5103	NC_016051	TAC	2	6	288127	288132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223479002
5104	NC_016051	ACT	2	6	288155	288160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223479002
5105	NC_016051	CGG	2	6	288204	288209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223479002
5106	NC_016051	CGC	2	6	288213	288218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223479002
5107	NC_016051	GAG	2	6	288276	288281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223479002
5108	NC_016051	GGAGAA	2	12	288285	288296	50 %	0 %	50 %	0 %	223479002
5109	NC_016051	CAT	2	6	288330	288335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223479002
5110	NC_016051	GAG	2	6	288405	288410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223479002
5111	NC_016051	GTC	2	6	288478	288483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223479002
5112	NC_016051	GAA	3	9	288486	288494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223479002
5113	NC_016051	TTA	2	6	288624	288629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223479002
5114	NC_016051	GTT	2	6	288661	288666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223479002
5115	NC_016051	CGG	2	6	288735	288740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223479002
5116	NC_016051	GA	3	6	288741	288746	50 %	0 %	50 %	0 %	223479002
5117	NC_016051	CAT	2	6	288783	288788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223479002
5118	NC_016051	CTT	2	6	288976	288981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478856
5119	NC_016051	CGG	2	6	288991	288996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478856
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5121	NC_016051	GAT	2	6	289036	289041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478856
5122	NC_016051	CTT	2	6	289090	289095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478856
5123	NC_016051	TTG	2	6	289181	289186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478856
5124	NC_016051	CTC	2	6	289202	289207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478856
5125	NC_016051	CTC	2	6	289291	289296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478856
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5237	NC_016051	CTCAG	2	10	296489	296498	20 %	20 %	20 %	40 %	223478631
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5363	NC_016051	AGG	2	6	302659	302664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525732
5364	NC_016051	AGG	2	6	302686	302691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525732
5365	NC_016051	CGG	2	6	302894	302899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525732
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5482	NC_016051	ACA	2	6	308803	308808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478444
5483	NC_016051	GCG	2	6	308814	308819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478444
5484	NC_016051	GCG	2	6	308847	308852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478444
5485	NC_016051	CTC	2	6	308949	308954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478444
5486	NC_016051	AGCC	2	8	309050	309057	25 %	0 %	25 %	50 %	223478444
5487	NC_016051	TCT	2	6	309058	309063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478444
5488	NC_016051	CCG	2	6	309072	309077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478444
5489	NC_016051	GGA	2	6	309113	309118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478444
5490	NC_016051	TCG	2	6	309293	309298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478603
5491	NC_016051	GAG	2	6	309414	309419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478603
5492	NC_016051	ACG	2	6	309439	309444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478603
5493	NC_016051	TCTT	2	8	309460	309467	0 %	75 %	0 %	25 %	223478603
5494	NC_016051	CAC	2	6	309510	309515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478603
5495	NC_016051	CT	3	6	309523	309528	0 %	50 %	0 %	50 %	223478603
5496	NC_016051	AACG	2	8	309585	309592	50 %	0 %	25 %	25 %	223478603
5497	NC_016051	CGGC	2	8	309596	309603	0 %	0 %	50 %	50 %	223478603
5498	NC_016051	GCT	2	6	309648	309653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478603
5499	NC_016051	CATTGC	2	12	309675	309686	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	223478603
5500	NC_016051	CGTAA	2	10	309702	309711	40 %	20 %	20 %	20 %	223478603

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