MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016051	TCAC	2	8	254238	254245	25 %	25 %	0 %	50 %	350525723
4502	NC_016051	CGG	2	6	254315	254320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525723
4503	NC_016051	ACC	2	6	254345	254350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350525723
4504	NC_016051	AAT	2	6	254381	254386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525723
4505	NC_016051	CCG	2	6	254436	254441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525723
4506	NC_016051	T	6	6	254446	254451	0 %	100 %	0 %	0 %	350525723
4507	NC_016051	AGCC	2	8	254527	254534	25 %	0 %	25 %	50 %	350525723
4508	NC_016051	CG	3	6	254567	254572	0 %	0 %	50 %	50 %	350525723
4509	NC_016051	C	6	6	254581	254586	0 %	0 %	0 %	100 %	350525723
4510	NC_016051	CCG	2	6	254592	254597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525723
4511	NC_016051	TCT	2	6	254602	254607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525723
4512	NC_016051	GAA	2	6	254638	254643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525723
4513	NC_016051	CCA	2	6	254655	254660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350525723
4514	NC_016051	T	6	6	254721	254726	0 %	100 %	0 %	0 %	350525723
4515	NC_016051	ACA	2	6	254778	254783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350525723
4516	NC_016051	TCC	2	6	254825	254830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525723
4517	NC_016051	T	6	6	254836	254841	0 %	100 %	0 %	0 %	350525723
4518	NC_016051	TTC	2	6	254908	254913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525723
4519	NC_016051	ACG	2	6	254919	254924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525723
4520	NC_016051	TCC	2	6	254975	254980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525723
4521	NC_016051	T	6	6	254986	254991	0 %	100 %	0 %	0 %	350525723
4522	NC_016051	GAA	2	6	255022	255027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525723
4523	NC_016051	ACT	2	6	255038	255043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525723
4524	NC_016051	CTA	2	6	255070	255075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525723
4525	NC_016051	CCG	2	6	255129	255134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525723
4526	NC_016051	TCG	2	6	255189	255194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525723
4527	NC_016051	TCC	2	6	255459	255464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478973
4528	NC_016051	CCT	2	6	255538	255543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478973
4529	NC_016051	CTC	2	6	255561	255566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478973
4530	NC_016051	CCT	2	6	255598	255603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478973
4531	NC_016051	AGG	2	6	255663	255668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478973
4532	NC_016051	TCT	2	6	255773	255778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478973
4533	NC_016051	GAG	2	6	255782	255787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478973
4534	NC_016051	CAG	2	6	255809	255814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478973
4535	NC_016051	AAC	2	6	255815	255820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478973
4536	NC_016051	GAC	2	6	255836	255841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478973
4537	NC_016051	GTT	2	6	255845	255850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478973
4538	NC_016051	TCA	2	6	255870	255875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478973
4539	NC_016051	CCG	2	6	255913	255918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478973
4540	NC_016051	GCGA	2	8	255927	255934	25 %	0 %	50 %	25 %	223478973
4541	NC_016051	TCCGC	2	10	255953	255962	0 %	20 %	20 %	60 %	223478973
4542	NC_016051	TC	4	8	256086	256093	0 %	50 %	0 %	50 %	223478973
4543	NC_016051	TCC	2	6	256122	256127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478973
4544	NC_016051	CTC	2	6	256181	256186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478973
4545	NC_016051	CCCTTC	2	12	256206	256217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478973
4546	NC_016051	GA	3	6	256233	256238	50 %	0 %	50 %	0 %	223478973
4547	NC_016051	CAT	2	6	256270	256275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478973
4548	NC_016051	TCA	2	6	256293	256298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478973
4549	NC_016051	CT	3	6	256432	256437	0 %	50 %	0 %	50 %	223478973
4550	NC_016051	CTTT	2	8	256605	256612	0 %	75 %	0 %	25 %	223478973
4551	NC_016051	GATC	2	8	256684	256691	25 %	25 %	25 %	25 %	223478973
4552	NC_016051	CT	3	6	256716	256721	0 %	50 %	0 %	50 %	223478973
4553	NC_016051	AGG	2	6	256812	256817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478973
4554	NC_016051	TTC	2	6	256818	256823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478973
4555	NC_016051	CTT	2	6	256897	256902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478973
4556	NC_016051	TGA	2	6	256931	256936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478973
4557	NC_016051	GAG	2	6	257094	257099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478973
4558	NC_016051	CGC	2	6	257132	257137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478973
4559	NC_016051	GTT	2	6	257237	257242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478973
4560	NC_016051	CTTG	2	8	257380	257387	0 %	50 %	25 %	25 %	223478973
4561	NC_016051	GCC	2	6	257406	257411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478973
4562	NC_016051	CGG	2	6	257485	257490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478973
4563	NC_016051	ATC	2	6	257526	257531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478973
4564	NC_016051	TC	3	6	257567	257572	0 %	50 %	0 %	50 %	223478973
4565	NC_016051	TCTGC	2	10	257611	257620	0 %	40 %	20 %	40 %	223478973
4566	NC_016051	GTA	2	6	257627	257632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478973
4567	NC_016051	GA	3	6	257661	257666	50 %	0 %	50 %	0 %	223478973
4568	NC_016051	CTGGC	2	10	257703	257712	0 %	20 %	40 %	40 %	223478973
4569	NC_016051	CGTC	2	8	257749	257756	0 %	25 %	25 %	50 %	223478973
4570	NC_016051	CCT	2	6	257773	257778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478973
4571	NC_016051	CCGC	2	8	257920	257927	0 %	0 %	25 %	75 %	223478973
4572	NC_016051	GAC	2	6	258005	258010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478973
4573	NC_016051	CAG	2	6	258149	258154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478973
4574	NC_016051	CGC	3	9	258166	258174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478973
4575	NC_016051	TTC	2	6	258183	258188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478973
4576	NC_016051	ACTTC	2	10	258252	258261	20 %	40 %	0 %	40 %	223478973
4577	NC_016051	CGT	2	6	258289	258294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478973
4578	NC_016051	GTA	2	6	258302	258307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478973
4579	NC_016051	CG	3	6	258424	258429	0 %	0 %	50 %	50 %	223478973
4580	NC_016051	TCCG	2	8	258443	258450	0 %	25 %	25 %	50 %	223478973
4581	NC_016051	AGG	2	6	258456	258461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478973
4582	NC_016051	CGG	2	6	258484	258489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478973
4583	NC_016051	CCT	2	6	258546	258551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478973
4584	NC_016051	CAG	2	6	258566	258571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478973
4585	NC_016051	CGA	2	6	258742	258747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478973
4586	NC_016051	CAC	2	6	258857	258862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478973
4587	NC_016051	CTC	2	6	259095	259100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
4588	NC_016051	TCT	2	6	259151	259156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478518
4589	NC_016051	AGCG	2	8	259201	259208	25 %	0 %	50 %	25 %	223478518
4590	NC_016051	CCT	2	6	259209	259214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
4591	NC_016051	CCT	2	6	259286	259291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
4592	NC_016051	CTC	2	6	259338	259343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
4593	NC_016051	TGA	2	6	259397	259402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478518
4594	NC_016051	TCC	2	6	259442	259447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
4595	NC_016051	TCG	2	6	259471	259476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478518
4596	NC_016051	GTTG	2	8	259491	259498	0 %	50 %	50 %	0 %	223478518
4597	NC_016051	TCAG	2	8	259552	259559	25 %	25 %	25 %	25 %	223478518
4598	NC_016051	TCC	2	6	259574	259579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
4599	NC_016051	TCG	2	6	259610	259615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478518
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4601	NC_016051	GAA	2	6	259743	259748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478518
4602	NC_016051	CGG	3	9	259766	259774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478518
4603	NC_016051	GAG	2	6	259782	259787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478518
4604	NC_016051	TGGA	2	8	259837	259844	25 %	25 %	50 %	0 %	223478518
4605	NC_016051	GAC	2	6	259869	259874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478518
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4607	NC_016051	TCC	2	6	260001	260006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
4608	NC_016051	GCC	2	6	260010	260015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478518
4609	NC_016051	CCTT	2	8	260023	260030	0 %	50 %	0 %	50 %	223478518
4610	NC_016051	CTC	2	6	260067	260072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
4611	NC_016051	CCT	2	6	260075	260080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
4612	NC_016051	CTT	2	6	260097	260102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478518
4613	NC_016051	CTT	2	6	260106	260111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478518
4614	NC_016051	TCG	2	6	260134	260139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478518
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4616	NC_016051	CTT	2	6	260181	260186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478518
4617	NC_016051	CTTT	2	8	260207	260214	0 %	75 %	0 %	25 %	223478518
4618	NC_016051	CAG	2	6	260256	260261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478518
4619	NC_016051	GAG	2	6	260392	260397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525724
4620	NC_016051	CTC	2	6	260422	260427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525724
4621	NC_016051	CTC	2	6	260478	260483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525724
4622	NC_016051	TCGC	2	8	260501	260508	0 %	25 %	25 %	50 %	350525724
4623	NC_016051	AACATC	2	12	260546	260557	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	350525724
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4625	NC_016051	CGT	2	6	260589	260594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525724
4626	NC_016051	AGGT	2	8	260639	260646	25 %	25 %	50 %	0 %	350525724
4627	NC_016051	ACTG	2	8	260672	260679	25 %	25 %	25 %	25 %	350525724
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4631	NC_016051	TCG	2	6	260771	260776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525724
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4648	NC_016051	GTA	2	6	261865	261870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525724
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4653	NC_016051	TCTT	2	8	261971	261978	0 %	75 %	0 %	25 %	350525724
4654	NC_016051	AACTTC	2	12	262006	262017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525724
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4660	NC_016051	AAGGA	2	10	263685	263694	60 %	0 %	40 %	0 %	350525725
4661	NC_016051	CT	3	6	263771	263776	0 %	50 %	0 %	50 %	350525725
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4735	NC_016051	ATTTG	2	10	267820	267829	20 %	60 %	20 %	0 %	350525727
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4739	NC_016051	CTCTTA	2	12	268062	268073	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	350525727
4740	NC_016051	CTTT	2	8	268108	268115	0 %	75 %	0 %	25 %	350525727
4741	NC_016051	AGA	2	6	268222	268227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525727
4742	NC_016051	TC	3	6	268253	268258	0 %	50 %	0 %	50 %	350525727
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4869	NC_016051	TCT	3	9	276317	276325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478962
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4989	NC_016051	CGG	2	6	281886	281891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525730
4990	NC_016051	CAT	2	6	281916	281921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525730
4991	NC_016051	CTGA	2	8	281925	281932	25 %	25 %	25 %	25 %	350525730
4992	NC_016051	AGA	2	6	281972	281977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525730
4993	NC_016051	CTT	2	6	282024	282029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525730
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4997	NC_016051	CTC	2	6	282093	282098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
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