MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Taylorella asinigenitalis MCE3 chromosome

Total Repeats: 29338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016043	GAT	2	6	46	51	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589353
2	NC_016043	TAT	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589353
3	NC_016043	AGC	2	6	66	71	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589353
4	NC_016043	ACA	2	6	198	203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589353
5	NC_016043	ACT	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589353
6	NC_016043	GAG	2	6	328	333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589353
7	NC_016043	GAT	2	6	334	339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589353
8	NC_016043	CCGA	2	8	410	417	25 %	0 %	25 %	50 %	348589353
9	NC_016043	GAA	2	6	448	453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589353
10	NC_016043	CTA	2	6	473	478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589353
11	NC_016043	GTAG	2	8	568	575	25 %	25 %	50 %	0 %	348589353
12	NC_016043	ATT	2	6	591	596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589353
13	NC_016043	ATGC	2	8	634	641	25 %	25 %	25 %	25 %	348589353
14	NC_016043	T	6	6	656	661	0 %	100 %	0 %	0 %	348589353
15	NC_016043	ATGC	2	8	691	698	25 %	25 %	25 %	25 %	348589353
16	NC_016043	TAC	2	6	706	711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589353
17	NC_016043	GAT	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589353
18	NC_016043	AGTA	2	8	769	776	50 %	25 %	25 %	0 %	348589353
19	NC_016043	GAT	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589353
20	NC_016043	ATT	2	6	813	818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589353
21	NC_016043	AG	3	6	828	833	50 %	0 %	50 %	0 %	348589353
22	NC_016043	CAG	2	6	838	843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589353
23	NC_016043	AGT	2	6	888	893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589353
24	NC_016043	AAATC	2	10	924	933	60 %	20 %	0 %	20 %	348589353
25	NC_016043	ATTGAA	2	12	973	984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	348589353
26	NC_016043	CCT	2	6	985	990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348589353
27	NC_016043	TTC	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589353
28	NC_016043	CT	3	6	1067	1072	0 %	50 %	0 %	50 %	348589353
29	NC_016043	ATT	2	6	1259	1264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589353
30	NC_016043	AT	4	8	1283	1290	50 %	50 %	0 %	0 %	348589353
31	NC_016043	CAA	2	6	1409	1414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589353
32	NC_016043	T	6	6	1544	1549	0 %	100 %	0 %	0 %	348589354
33	NC_016043	A	6	6	1604	1609	100 %	0 %	0 %	0 %	348589354
34	NC_016043	CAT	2	6	1613	1618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589354
35	NC_016043	AGA	2	6	1776	1781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589354
36	NC_016043	TTAAC	2	10	1898	1907	40 %	40 %	0 %	20 %	348589354
37	NC_016043	CAG	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589354
38	NC_016043	TTTAC	2	10	1924	1933	20 %	60 %	0 %	20 %	348589354
39	NC_016043	TGC	2	6	2148	2153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589354
40	NC_016043	TCT	2	6	2179	2184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589354
41	NC_016043	TAG	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589354
42	NC_016043	TTA	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589354
43	NC_016043	GTT	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589354
44	NC_016043	TCT	2	6	2583	2588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589354
45	NC_016043	TCTA	2	8	2628	2635	25 %	50 %	0 %	25 %	348589354
46	NC_016043	GTG	2	6	2639	2644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589354
47	NC_016043	TCA	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589354
48	NC_016043	TTA	2	6	2659	2664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589354
49	NC_016043	AGA	2	6	2676	2681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589354
50	NC_016043	TGA	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589354
51	NC_016043	TGT	2	6	2697	2702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589354
52	NC_016043	AT	3	6	2764	2769	50 %	50 %	0 %	0 %	348589355
53	NC_016043	ACG	2	6	2796	2801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589355
54	NC_016043	AGT	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589355
55	NC_016043	GAA	2	6	3048	3053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589355
56	NC_016043	TGG	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589355
57	NC_016043	TGG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589355
58	NC_016043	TCG	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589355
59	NC_016043	CTTT	2	8	3365	3372	0 %	75 %	0 %	25 %	348589355
60	NC_016043	AAT	2	6	3377	3382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589355
61	NC_016043	TGA	2	6	3403	3408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589355
62	NC_016043	GAA	2	6	3422	3427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589355
63	NC_016043	AAACAA	2	12	3472	3483	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	348589355
64	NC_016043	AAAT	2	8	3514	3521	75 %	25 %	0 %	0 %	348589355
65	NC_016043	CTG	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589355
66	NC_016043	GAG	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589355
67	NC_016043	ATGA	2	8	3581	3588	50 %	25 %	25 %	0 %	348589355
68	NC_016043	ACAA	2	8	3605	3612	75 %	0 %	0 %	25 %	348589355
69	NC_016043	CGG	2	6	3628	3633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589355
70	NC_016043	AATA	2	8	3677	3684	75 %	25 %	0 %	0 %	348589355
71	NC_016043	TA	3	6	3683	3688	50 %	50 %	0 %	0 %	348589355
72	NC_016043	A	6	6	3707	3712	100 %	0 %	0 %	0 %	348589355
73	NC_016043	CAG	2	6	3793	3798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589355
74	NC_016043	AGA	2	6	3844	3849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589355
75	NC_016043	ATG	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589355
76	NC_016043	AT	3	6	3906	3911	50 %	50 %	0 %	0 %	348589355
77	NC_016043	AAAAG	2	10	3974	3983	80 %	0 %	20 %	0 %	348589355
78	NC_016043	TA	3	6	4056	4061	50 %	50 %	0 %	0 %	348589355
79	NC_016043	AAGG	2	8	4098	4105	50 %	0 %	50 %	0 %	348589355
80	NC_016043	ATC	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589355
81	NC_016043	TAT	3	9	4270	4278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589355
82	NC_016043	T	6	6	4332	4337	0 %	100 %	0 %	0 %	348589355
83	NC_016043	ACC	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348589355
84	NC_016043	GAT	2	6	4442	4447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589355
85	NC_016043	GAA	2	6	4451	4456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589355
86	NC_016043	AAT	2	6	4513	4518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589355
87	NC_016043	TA	3	6	4553	4558	50 %	50 %	0 %	0 %	348589355
88	NC_016043	TGT	2	6	4765	4770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589355
89	NC_016043	CAT	2	6	4807	4812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589355
90	NC_016043	GCT	2	6	4916	4921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589355
91	NC_016043	ACT	2	6	5051	5056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589355
92	NC_016043	GCC	2	6	5073	5078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348589355
93	NC_016043	TCG	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589355
94	NC_016043	AGCCCA	2	12	5364	5375	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	348589356
95	NC_016043	CA	3	6	5374	5379	50 %	0 %	0 %	50 %	348589356
96	NC_016043	T	6	6	5400	5405	0 %	100 %	0 %	0 %	348589356
97	NC_016043	TTC	2	6	5442	5447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589356
98	NC_016043	TGG	2	6	5483	5488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589356
99	NC_016043	AT	3	6	5535	5540	50 %	50 %	0 %	0 %	348589356
100	NC_016043	TC	3	6	5611	5616	0 %	50 %	0 %	50 %	348589356
101	NC_016043	TTGC	2	8	5653	5660	0 %	50 %	25 %	25 %	348589356
102	NC_016043	CTG	2	6	5680	5685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589356
103	NC_016043	GAT	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589356
104	NC_016043	TCC	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348589356
105	NC_016043	CGG	2	6	5905	5910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589356
106	NC_016043	GTA	2	6	5980	5985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589356
107	NC_016043	GAC	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589356
108	NC_016043	TC	3	6	6245	6250	0 %	50 %	0 %	50 %	348589357
109	NC_016043	CAA	2	6	6259	6264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589357
110	NC_016043	GCTT	2	8	6332	6339	0 %	50 %	25 %	25 %	348589357
111	NC_016043	AT	3	6	6408	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	348589357
112	NC_016043	TCA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589357
113	NC_016043	AAG	2	6	6527	6532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589357
114	NC_016043	CTT	2	6	6556	6561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589357
115	NC_016043	GAA	2	6	6562	6567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589357
116	NC_016043	GGC	2	6	6616	6621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589357
117	NC_016043	CGA	2	6	6681	6686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589357
118	NC_016043	GAT	2	6	6768	6773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589357
119	NC_016043	GTT	2	6	6796	6801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589357
120	NC_016043	CGCA	2	8	6942	6949	25 %	0 %	25 %	50 %	348589357
121	NC_016043	A	7	7	6949	6955	100 %	0 %	0 %	0 %	348589357
122	NC_016043	GCC	2	6	6961	6966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348589357
123	NC_016043	GA	3	6	7057	7062	50 %	0 %	50 %	0 %	348589358
124	NC_016043	TCGC	2	8	7168	7175	0 %	25 %	25 %	50 %	348589358
125	NC_016043	GAA	2	6	7201	7206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589358
126	NC_016043	CT	3	6	7382	7387	0 %	50 %	0 %	50 %	348589358
127	NC_016043	GCA	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589358
128	NC_016043	CAT	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589358
129	NC_016043	TC	3	6	7441	7446	0 %	50 %	0 %	50 %	348589358
130	NC_016043	GGTT	2	8	7529	7536	0 %	50 %	50 %	0 %	348589358
131	NC_016043	ACC	2	6	7556	7561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348589358
132	NC_016043	ATC	2	6	7580	7585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589358
133	NC_016043	ACTC	2	8	7621	7628	25 %	25 %	0 %	50 %	348589358
134	NC_016043	CACAGC	2	12	7669	7680	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	348589358
135	NC_016043	CTT	2	6	7733	7738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589358
136	NC_016043	ATT	2	6	7860	7865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589358
137	NC_016043	TCA	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589358
138	NC_016043	TCC	2	6	7895	7900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348589358
139	NC_016043	AAG	2	6	7970	7975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589358
140	NC_016043	ACG	2	6	8094	8099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589359
141	NC_016043	TGA	2	6	8161	8166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589359
142	NC_016043	TTGT	2	8	8249	8256	0 %	75 %	25 %	0 %	348589359
143	NC_016043	TGG	2	6	8269	8274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589359
144	NC_016043	ATG	2	6	8312	8317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589359
145	NC_016043	TCT	2	6	8350	8355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589359
146	NC_016043	TTC	2	6	8386	8391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589359
147	NC_016043	CGTTG	2	10	8407	8416	0 %	40 %	40 %	20 %	348589359
148	NC_016043	CTT	2	6	8504	8509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589359
149	NC_016043	TAT	2	6	8566	8571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589359
150	NC_016043	GGC	2	6	8614	8619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589359
151	NC_016043	CTC	2	6	8649	8654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348589359
152	NC_016043	ATG	2	6	8679	8684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589359
153	NC_016043	TC	3	6	8698	8703	0 %	50 %	0 %	50 %	348589359
154	NC_016043	TGG	2	6	8711	8716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589359
155	NC_016043	AGTT	2	8	8896	8903	25 %	50 %	25 %	0 %	348589360
156	NC_016043	AAT	2	6	8977	8982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589360
157	NC_016043	T	6	6	9027	9032	0 %	100 %	0 %	0 %	348589360
158	NC_016043	AAG	2	6	9058	9063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589360
159	NC_016043	TG	3	6	9129	9134	0 %	50 %	50 %	0 %	348589360
160	NC_016043	TAG	2	6	9147	9152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589360
161	NC_016043	CAT	2	6	9164	9169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589360
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163	NC_016043	A	7	7	9193	9199	100 %	0 %	0 %	0 %	348589360
164	NC_016043	GAG	2	6	9242	9247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589360
165	NC_016043	TG	3	6	9318	9323	0 %	50 %	50 %	0 %	348589360
166	NC_016043	ATTG	2	8	9334	9341	25 %	50 %	25 %	0 %	348589360
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169	NC_016043	CGG	2	6	9465	9470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589360
170	NC_016043	CGT	2	6	9585	9590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589360
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172	NC_016043	GAG	2	6	9710	9715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589360
173	NC_016043	GTTG	2	8	9753	9760	0 %	50 %	50 %	0 %	348589360
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176	NC_016043	ATT	2	6	9867	9872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589361
177	NC_016043	TA	3	6	9887	9892	50 %	50 %	0 %	0 %	348589361
178	NC_016043	GGA	2	6	9903	9908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589361
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197	NC_016043	AAG	2	6	11073	11078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589361
198	NC_016043	TAA	2	6	11214	11219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589361
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249	NC_016043	A	7	7	13936	13942	100 %	0 %	0 %	0 %	348589363
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251	NC_016043	TGA	2	6	13966	13971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589363
252	NC_016043	T	6	6	14020	14025	0 %	100 %	0 %	0 %	348589363
253	NC_016043	AAGCGA	2	12	14044	14055	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	348589363
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259	NC_016043	CA	3	6	14228	14233	50 %	0 %	0 %	50 %	348589364
260	NC_016043	AGCA	2	8	14247	14254	50 %	0 %	25 %	25 %	348589364
261	NC_016043	TTC	2	6	14373	14378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589364
262	NC_016043	ATA	2	6	14394	14399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589364
263	NC_016043	TC	3	6	14408	14413	0 %	50 %	0 %	50 %	348589364
264	NC_016043	AAGC	2	8	14471	14478	50 %	0 %	25 %	25 %	348589364
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