MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 55808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015958	ATC	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016448
2	NC_015958	CCA	2	6	178	183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345016448
3	NC_015958	ACA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016448
4	NC_015958	TGA	2	6	227	232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016448
5	NC_015958	TAT	2	6	235	240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016448
6	NC_015958	A	6	6	266	271	100 %	0 %	0 %	0 %	345016448
7	NC_015958	TAA	2	6	274	279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016448
8	NC_015958	AT	3	6	287	292	50 %	50 %	0 %	0 %	345016448
9	NC_015958	ACG	2	6	304	309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016448
10	NC_015958	AGA	2	6	356	361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
11	NC_015958	GAA	3	9	363	371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
12	NC_015958	AGAAAA	2	12	395	406	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	345016448
13	NC_015958	CCA	2	6	418	423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345016448
14	NC_015958	TGC	2	6	494	499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345016448
15	NC_015958	TTTA	3	12	542	553	25 %	75 %	0 %	0 %	345016448
16	NC_015958	GGA	2	6	555	560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016448
17	NC_015958	ATGC	2	8	585	592	25 %	25 %	25 %	25 %	345016448
18	NC_015958	TACGT	2	10	639	648	20 %	40 %	20 %	20 %	345016448
19	NC_015958	AGTT	2	8	667	674	25 %	50 %	25 %	0 %	345016448
20	NC_015958	GAA	2	6	699	704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
21	NC_015958	GAT	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016448
22	NC_015958	A	6	6	765	770	100 %	0 %	0 %	0 %	345016448
23	NC_015958	GAAC	2	8	771	778	50 %	0 %	25 %	25 %	345016448
24	NC_015958	AAG	2	6	781	786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
25	NC_015958	ACC	2	6	851	856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345016448
26	NC_015958	AGA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
27	NC_015958	CCA	2	6	927	932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345016448
28	NC_015958	AAAG	2	8	962	969	75 %	0 %	25 %	0 %	345016448
29	NC_015958	CGA	2	6	995	1000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016448
30	NC_015958	A	6	6	1021	1026	100 %	0 %	0 %	0 %	345016448
31	NC_015958	AG	3	6	1041	1046	50 %	0 %	50 %	0 %	345016448
32	NC_015958	TAA	2	6	1060	1065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016448
33	NC_015958	TAA	2	6	1145	1150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016448
34	NC_015958	AAG	3	9	1180	1188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
35	NC_015958	AGA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
36	NC_015958	A	6	6	1241	1246	100 %	0 %	0 %	0 %	345016448
37	NC_015958	GAA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
38	NC_015958	TAC	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016448
39	NC_015958	A	6	6	1363	1368	100 %	0 %	0 %	0 %	345016448
40	NC_015958	TC	3	6	1397	1402	0 %	50 %	0 %	50 %	345016448
41	NC_015958	A	7	7	1675	1681	100 %	0 %	0 %	0 %	345016449
42	NC_015958	TG	4	8	1689	1696	0 %	50 %	50 %	0 %	345016449
43	NC_015958	ATT	2	6	1707	1712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016449
44	NC_015958	G	6	6	1736	1741	0 %	0 %	100 %	0 %	345016449
45	NC_015958	ACT	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016449
46	NC_015958	TTC	2	6	1766	1771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016449
47	NC_015958	GTCAA	2	10	1799	1808	40 %	20 %	20 %	20 %	345016449
48	NC_015958	AGA	3	9	1863	1871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016449
49	NC_015958	T	6	6	1898	1903	0 %	100 %	0 %	0 %	345016449
50	NC_015958	TAA	2	6	2090	2095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016449
51	NC_015958	TA	3	6	2211	2216	50 %	50 %	0 %	0 %	345016449
52	NC_015958	AGA	2	6	2292	2297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016449
53	NC_015958	AGA	2	6	2313	2318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016449
54	NC_015958	AGAGAT	2	12	2328	2339	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345016449
55	NC_015958	GAAG	2	8	2404	2411	50 %	0 %	50 %	0 %	345016449
56	NC_015958	AAT	2	6	2524	2529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016449
57	NC_015958	TTA	2	6	2558	2563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016449
58	NC_015958	TCT	2	6	2569	2574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016449
59	NC_015958	TTA	2	6	2659	2664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016449
60	NC_015958	TAA	3	9	2729	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016449
61	NC_015958	AT	3	6	2840	2845	50 %	50 %	0 %	0 %	345016450
62	NC_015958	GGA	2	6	2889	2894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016450
63	NC_015958	ATTT	2	8	2906	2913	25 %	75 %	0 %	0 %	345016450
64	NC_015958	A	6	6	2961	2966	100 %	0 %	0 %	0 %	345016450
65	NC_015958	A	6	6	3080	3085	100 %	0 %	0 %	0 %	345016451
66	NC_015958	AATA	2	8	3102	3109	75 %	25 %	0 %	0 %	345016451
67	NC_015958	TTA	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016451
68	NC_015958	TAA	2	6	3209	3214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016451
69	NC_015958	ATT	2	6	3227	3232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016451
70	NC_015958	AAT	2	6	3246	3251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016451
71	NC_015958	A	7	7	3271	3277	100 %	0 %	0 %	0 %	345016451
72	NC_015958	AATAA	2	10	3328	3337	80 %	20 %	0 %	0 %	345016451
73	NC_015958	T	6	6	3377	3382	0 %	100 %	0 %	0 %	345016451
74	NC_015958	ATA	2	6	3400	3405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016451
75	NC_015958	AAG	2	6	3407	3412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016451
76	NC_015958	TAA	2	6	3503	3508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016451
77	NC_015958	AAG	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016451
78	NC_015958	TGA	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016451
79	NC_015958	TAG	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016451
80	NC_015958	AAT	2	6	3600	3605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016451
81	NC_015958	A	6	6	3627	3632	100 %	0 %	0 %	0 %	345016451
82	NC_015958	A	7	7	3648	3654	100 %	0 %	0 %	0 %	345016451
83	NC_015958	CAG	2	6	3680	3685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016451
84	NC_015958	GAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016451
85	NC_015958	A	7	7	3742	3748	100 %	0 %	0 %	0 %	345016451
86	NC_015958	TAGATT	2	12	3776	3787	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	345016451
87	NC_015958	ACA	2	6	3799	3804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016451
88	NC_015958	ATT	2	6	3835	3840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016451
89	NC_015958	TTC	2	6	3867	3872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016451
90	NC_015958	A	6	6	3930	3935	100 %	0 %	0 %	0 %	345016451
91	NC_015958	GAT	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016451
92	NC_015958	AGAA	2	8	3997	4004	75 %	0 %	25 %	0 %	345016451
93	NC_015958	AT	3	6	4005	4010	50 %	50 %	0 %	0 %	345016451
94	NC_015958	TAC	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016451
95	NC_015958	A	6	6	4126	4131	100 %	0 %	0 %	0 %	345016452
96	NC_015958	GGC	2	6	4146	4151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345016452
97	NC_015958	GTA	2	6	4158	4163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016452
98	NC_015958	CTA	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016452
99	NC_015958	GAA	3	9	4245	4253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016452
100	NC_015958	TAT	2	6	4322	4327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016452
101	NC_015958	TTAT	3	12	4324	4335	25 %	75 %	0 %	0 %	345016452
102	NC_015958	AAG	2	6	4361	4366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016452
103	NC_015958	A	6	6	4372	4377	100 %	0 %	0 %	0 %	345016452
104	NC_015958	A	6	6	4408	4413	100 %	0 %	0 %	0 %	345016453
105	NC_015958	A	6	6	4420	4425	100 %	0 %	0 %	0 %	345016453
106	NC_015958	TTG	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016453
107	NC_015958	AAG	2	6	4446	4451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016453
108	NC_015958	ATT	2	6	4479	4484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016453
109	NC_015958	GTAA	2	8	4494	4501	50 %	25 %	25 %	0 %	345016453
110	NC_015958	A	6	6	4510	4515	100 %	0 %	0 %	0 %	345016453
111	NC_015958	GAAAG	2	10	4536	4545	60 %	0 %	40 %	0 %	345016453
112	NC_015958	TGA	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016453
113	NC_015958	ATAA	2	8	4623	4630	75 %	25 %	0 %	0 %	345016453
114	NC_015958	TAAT	2	8	4672	4679	50 %	50 %	0 %	0 %	345016453
115	NC_015958	GGA	2	6	4692	4697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016453
116	NC_015958	AGA	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016453
117	NC_015958	A	6	6	4788	4793	100 %	0 %	0 %	0 %	345016453
118	NC_015958	T	6	6	4874	4879	0 %	100 %	0 %	0 %	345016453
119	NC_015958	ACA	2	6	4921	4926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016453
120	NC_015958	T	7	7	4937	4943	0 %	100 %	0 %	0 %	345016453
121	NC_015958	ATT	2	6	4969	4974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016453
122	NC_015958	T	7	7	4973	4979	0 %	100 %	0 %	0 %	345016453
123	NC_015958	GGC	2	6	4989	4994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345016453
124	NC_015958	ACT	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016453
125	NC_015958	TA	3	6	5012	5017	50 %	50 %	0 %	0 %	345016453
126	NC_015958	AGGA	2	8	5063	5070	50 %	0 %	50 %	0 %	345016453
127	NC_015958	CAA	2	6	5103	5108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016453
128	NC_015958	AG	4	8	5132	5139	50 %	0 %	50 %	0 %	345016453
129	NC_015958	TGTGA	2	10	5181	5190	20 %	40 %	40 %	0 %	345016453
130	NC_015958	AGT	2	6	5300	5305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016453
131	NC_015958	AG	3	6	5329	5334	50 %	0 %	50 %	0 %	345016453
132	NC_015958	AAG	3	9	5455	5463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016453
133	NC_015958	TGG	2	6	5472	5477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016453
134	NC_015958	ATG	2	6	5503	5508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016453
135	NC_015958	ATGA	2	8	5532	5539	50 %	25 %	25 %	0 %	345016453
136	NC_015958	CAG	2	6	5542	5547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016453
137	NC_015958	ATA	2	6	5581	5586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016453
138	NC_015958	TTTTG	2	10	5702	5711	0 %	80 %	20 %	0 %	345016453
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271	NC_015958	TAT	2	6	11221	11226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016457
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281	NC_015958	CTATG	2	10	11657	11666	20 %	40 %	20 %	20 %	345016458
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372	NC_015958	A	7	7	16312	16318	100 %	0 %	0 %	0 %	345016461
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400	NC_015958	TAA	2	6	17778	17783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016462
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