MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 55808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_015958	T	6	6	2400262	2400267	0 %	100 %	0 %	0 %	345018632
48502	NC_015958	AATC	2	8	2400292	2400299	50 %	25 %	0 %	25 %	345018632
48503	NC_015958	TCCC	2	8	2400376	2400383	0 %	25 %	0 %	75 %	345018633
48504	NC_015958	ATC	2	6	2400482	2400487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018633
48505	NC_015958	CTC	2	6	2400667	2400672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345018633
48506	NC_015958	TGT	2	6	2400677	2400682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345018633
48507	NC_015958	CTA	2	6	2400694	2400699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018633
48508	NC_015958	AAATA	2	10	2400808	2400817	80 %	20 %	0 %	0 %	345018633
48509	NC_015958	ATT	2	6	2400888	2400893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018633
48510	NC_015958	T	7	7	2400956	2400962	0 %	100 %	0 %	0 %	345018633
48511	NC_015958	TCC	2	6	2400997	2401002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345018633
48512	NC_015958	CAC	2	6	2401036	2401041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345018633
48513	NC_015958	GAA	2	6	2401878	2401883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018634
48514	NC_015958	TTG	2	6	2401909	2401914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345018634
48515	NC_015958	TGA	2	6	2401919	2401924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018634
48516	NC_015958	AGA	2	6	2401928	2401933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018634
48517	NC_015958	GTT	2	6	2401965	2401970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345018634
48518	NC_015958	AGA	2	6	2402027	2402032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018634
48519	NC_015958	TAA	2	6	2402033	2402038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345018634
48520	NC_015958	TGT	2	6	2402089	2402094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345018634
48521	NC_015958	A	6	6	2402105	2402110	100 %	0 %	0 %	0 %	345018634
48522	NC_015958	TGAA	2	8	2402989	2402996	50 %	25 %	25 %	0 %	345018635
48523	NC_015958	GAA	2	6	2403019	2403024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018635
48524	NC_015958	AAG	2	6	2403179	2403184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018635
48525	NC_015958	AAG	2	6	2403197	2403202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018635
48526	NC_015958	GCT	2	6	2403214	2403219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345018635
48527	NC_015958	TAG	2	6	2403278	2403283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018635
48528	NC_015958	TA	3	6	2403295	2403300	50 %	50 %	0 %	0 %	345018635
48529	NC_015958	ACC	2	6	2403317	2403322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345018635
48530	NC_015958	GAA	2	6	2403344	2403349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018635
48531	NC_015958	TC	3	6	2403458	2403463	0 %	50 %	0 %	50 %	345018635
48532	NC_015958	GGAA	2	8	2403510	2403517	50 %	0 %	50 %	0 %	345018635
48533	NC_015958	CTA	2	6	2403578	2403583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018635
48534	NC_015958	TCT	2	6	2403589	2403594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018635
48535	NC_015958	CTT	2	6	2403672	2403677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018635
48536	NC_015958	ACA	2	6	2403683	2403688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345018635
48537	NC_015958	TTA	2	6	2403697	2403702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018635
48538	NC_015958	ATA	2	6	2403710	2403715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345018635
48539	NC_015958	A	6	6	2403766	2403771	100 %	0 %	0 %	0 %	345018635
48540	NC_015958	TGA	2	6	2403795	2403800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018635
48541	NC_015958	A	6	6	2403855	2403860	100 %	0 %	0 %	0 %	345018635
48542	NC_015958	TTA	2	6	2403930	2403935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018635
48543	NC_015958	TA	3	6	2403991	2403996	50 %	50 %	0 %	0 %	345018635
48544	NC_015958	CTC	2	6	2404001	2404006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345018635
48545	NC_015958	ATC	2	6	2404040	2404045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018635
48546	NC_015958	GCA	2	6	2404081	2404086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345018635
48547	NC_015958	GA	3	6	2404115	2404120	50 %	0 %	50 %	0 %	345018635
48548	NC_015958	CAGGGA	2	12	2404121	2404132	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345018635
48549	NC_015958	TGG	2	6	2404197	2404202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345018635
48550	NC_015958	AATT	2	8	2404217	2404224	50 %	50 %	0 %	0 %	345018635
48551	NC_015958	AGG	2	6	2404308	2404313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345018635
48552	NC_015958	AGA	2	6	2404380	2404385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018635
48553	NC_015958	A	7	7	2404385	2404391	100 %	0 %	0 %	0 %	345018635
48554	NC_015958	ATT	2	6	2404438	2404443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018635
48555	NC_015958	AG	3	6	2404477	2404482	50 %	0 %	50 %	0 %	345018635
48556	NC_015958	A	6	6	2404483	2404488	100 %	0 %	0 %	0 %	345018635
48557	NC_015958	TAT	2	6	2404504	2404509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018635
48558	NC_015958	CTT	2	6	2404570	2404575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018635
48559	NC_015958	TTA	2	6	2404651	2404656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018635
48560	NC_015958	GTA	2	6	2404730	2404735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018635
48561	NC_015958	CAG	2	6	2404794	2404799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345018635
48562	NC_015958	TCT	2	6	2404807	2404812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018635
48563	NC_015958	CT	3	6	2404815	2404820	0 %	50 %	0 %	50 %	345018635
48564	NC_015958	TGG	2	6	2404866	2404871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345018635
48565	NC_015958	AAG	2	6	2405003	2405008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018635
48566	NC_015958	CAGGA	2	10	2405386	2405395	40 %	0 %	40 %	20 %	345018636
48567	NC_015958	CTGTAG	2	12	2405398	2405409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345018636
48568	NC_015958	ATGC	2	8	2405414	2405421	25 %	25 %	25 %	25 %	345018636
48569	NC_015958	TAA	2	6	2405426	2405431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345018636
48570	NC_015958	GGA	2	6	2405432	2405437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345018636
48571	NC_015958	CAC	2	6	2405463	2405468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345018636
48572	NC_015958	CAG	2	6	2405506	2405511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345018636
48573	NC_015958	GGT	2	6	2405550	2405555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345018636
48574	NC_015958	TCG	2	6	2405602	2405607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345018636
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48577	NC_015958	TGC	2	6	2405696	2405701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345018636
48578	NC_015958	CAAAA	2	10	2405800	2405809	80 %	0 %	0 %	20 %	345018636
48579	NC_015958	GCT	2	6	2405904	2405909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345018636
48580	NC_015958	AAG	2	6	2406097	2406102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018636
48581	NC_015958	GAA	2	6	2406189	2406194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018636
48582	NC_015958	TGC	2	6	2406478	2406483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345018637
48583	NC_015958	AGC	2	6	2406487	2406492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345018637
48584	NC_015958	TAG	2	6	2406516	2406521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018637
48585	NC_015958	CTT	2	6	2406538	2406543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018637
48586	NC_015958	GT	3	6	2406548	2406553	0 %	50 %	50 %	0 %	345018637
48587	NC_015958	ACTT	2	8	2406587	2406594	25 %	50 %	0 %	25 %	345018637
48588	NC_015958	TGG	3	9	2406640	2406648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345018637
48589	NC_015958	GCA	2	6	2406664	2406669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345018637
48590	NC_015958	AGT	2	6	2406715	2406720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018637
48591	NC_015958	TGA	2	6	2406753	2406758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018637
48592	NC_015958	TTA	2	6	2406834	2406839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018637
48593	NC_015958	GAG	2	6	2406863	2406868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345018637
48594	NC_015958	AAG	2	6	2406984	2406989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018637
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48596	NC_015958	A	6	6	2407060	2407065	100 %	0 %	0 %	0 %	345018637
48597	NC_015958	ACT	2	6	2407095	2407100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018637
48598	NC_015958	TGC	2	6	2407126	2407131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345018637
48599	NC_015958	ACT	2	6	2407155	2407160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018637
48600	NC_015958	ATA	2	6	2407285	2407290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345018637
48601	NC_015958	TGC	2	6	2407426	2407431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345018638
48602	NC_015958	AGT	2	6	2407451	2407456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018638
48603	NC_015958	GAA	2	6	2407551	2407556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018638
48604	NC_015958	CAGAG	2	10	2407642	2407651	40 %	0 %	40 %	20 %	345018638
48605	NC_015958	ACAGG	2	10	2407690	2407699	40 %	0 %	40 %	20 %	345018638
48606	NC_015958	GAG	2	6	2407797	2407802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345018638
48607	NC_015958	TAT	2	6	2408069	2408074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018638
48608	NC_015958	CTGC	2	8	2408094	2408101	0 %	25 %	25 %	50 %	345018638
48609	NC_015958	GA	3	6	2408199	2408204	50 %	0 %	50 %	0 %	345018638
48610	NC_015958	TAT	2	6	2408234	2408239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018638
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48614	NC_015958	TCCGC	2	10	2408392	2408401	0 %	20 %	20 %	60 %	345018638
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48735	NC_015958	ATG	2	6	2415144	2415149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018643
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48742	NC_015958	TGA	2	6	2415461	2415466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018643
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48745	NC_015958	AAG	2	6	2415575	2415580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018643
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48750	NC_015958	TTA	2	6	2415833	2415838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018643
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48842	NC_015958	GA	3	6	2423398	2423403	50 %	0 %	50 %	0 %	345018651
48843	NC_015958	CAT	2	6	2423497	2423502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018651
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48846	NC_015958	CACC	2	8	2423814	2423821	25 %	0 %	0 %	75 %	345018651
48847	NC_015958	TTC	2	6	2424533	2424538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018652
48848	NC_015958	TCA	2	6	2424611	2424616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018652
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48969	NC_015958	T	7	7	2431344	2431350	0 %	100 %	0 %	0 %	345018659
48970	NC_015958	TAT	2	6	2431364	2431369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018659
48971	NC_015958	CT	3	6	2431388	2431393	0 %	50 %	0 %	50 %	345018659
48972	NC_015958	TCA	2	6	2431410	2431415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018659
48973	NC_015958	GTA	2	6	2431433	2431438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018659
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48982	NC_015958	T	6	6	2431892	2431897	0 %	100 %	0 %	0 %	345018659
48983	NC_015958	TCAA	2	8	2431980	2431987	50 %	25 %	0 %	25 %	345018659
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48992	NC_015958	ATT	2	6	2432274	2432279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018659
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