MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 55808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015958	GCAT	2	8	23479	23486	25 %	25 %	25 %	25 %	345016467
502	NC_015958	AAT	2	6	23600	23605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016467
503	NC_015958	AAG	2	6	23677	23682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016467
504	NC_015958	CATT	2	8	23710	23717	25 %	50 %	0 %	25 %	345016467
505	NC_015958	GA	3	6	23718	23723	50 %	0 %	50 %	0 %	345016467
506	NC_015958	TTTC	2	8	23743	23750	0 %	75 %	0 %	25 %	345016467
507	NC_015958	GA	3	6	23753	23758	50 %	0 %	50 %	0 %	345016467
508	NC_015958	A	6	6	23778	23783	100 %	0 %	0 %	0 %	345016467
509	NC_015958	TAG	2	6	23809	23814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016467
510	NC_015958	A	6	6	23815	23820	100 %	0 %	0 %	0 %	345016467
511	NC_015958	AGG	2	6	23930	23935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016467
512	NC_015958	GAAT	2	8	24034	24041	50 %	25 %	25 %	0 %	345016467
513	NC_015958	TA	3	6	24067	24072	50 %	50 %	0 %	0 %	345016467
514	NC_015958	TAC	2	6	24091	24096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016467
515	NC_015958	CAA	2	6	24098	24103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016467
516	NC_015958	CA	3	6	24162	24167	50 %	0 %	0 %	50 %	345016467
517	NC_015958	GGAA	2	8	24218	24225	50 %	0 %	50 %	0 %	345016467
518	NC_015958	ACA	2	6	24234	24239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016467
519	NC_015958	AGA	2	6	24242	24247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016467
520	NC_015958	A	6	6	24264	24269	100 %	0 %	0 %	0 %	345016467
521	NC_015958	A	6	6	24280	24285	100 %	0 %	0 %	0 %	345016467
522	NC_015958	TAT	2	6	24305	24310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016467
523	NC_015958	GAA	2	6	24577	24582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016468
524	NC_015958	ATA	2	6	24676	24681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016468
525	NC_015958	A	6	6	24735	24740	100 %	0 %	0 %	0 %	345016468
526	NC_015958	CTA	2	6	24764	24769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016468
527	NC_015958	CCT	2	6	24811	24816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345016468
528	NC_015958	GAA	2	6	24823	24828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016468
529	NC_015958	TA	4	8	24854	24861	50 %	50 %	0 %	0 %	345016468
530	NC_015958	AAG	2	6	24914	24919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016468
531	NC_015958	GAT	2	6	24942	24947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016468
532	NC_015958	AT	3	6	24987	24992	50 %	50 %	0 %	0 %	345016468
533	NC_015958	TAAT	2	8	25157	25164	50 %	50 %	0 %	0 %	345016468
534	NC_015958	ACA	2	6	25180	25185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016468
535	NC_015958	ATT	2	6	25216	25221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016468
536	NC_015958	TAG	2	6	25227	25232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016468
537	NC_015958	TAA	2	6	25259	25264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016468
538	NC_015958	ACA	2	6	25294	25299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016468
539	NC_015958	AGAA	2	8	25321	25328	75 %	0 %	25 %	0 %	345016468
540	NC_015958	TTA	2	6	25352	25357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016468
541	NC_015958	GA	3	6	25412	25417	50 %	0 %	50 %	0 %	345016468
542	NC_015958	ATTG	2	8	25434	25441	25 %	50 %	25 %	0 %	345016468
543	NC_015958	GGT	2	6	25444	25449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016468
544	NC_015958	AG	3	6	25476	25481	50 %	0 %	50 %	0 %	345016468
545	NC_015958	TTG	2	6	25484	25489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016468
546	NC_015958	T	6	6	25501	25506	0 %	100 %	0 %	0 %	345016468
547	NC_015958	AAT	2	6	25518	25523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016468
548	NC_015958	AGG	2	6	25524	25529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016468
549	NC_015958	ATAGA	2	10	25610	25619	60 %	20 %	20 %	0 %	345016468
550	NC_015958	TGA	2	6	25620	25625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016468
551	NC_015958	TAA	2	6	25631	25636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016468
552	NC_015958	GTA	2	6	25746	25751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016469
553	NC_015958	AT	3	6	25818	25823	50 %	50 %	0 %	0 %	345016469
554	NC_015958	AGCA	2	8	25867	25874	50 %	0 %	25 %	25 %	345016469
555	NC_015958	TGGG	2	8	25941	25948	0 %	25 %	75 %	0 %	345016469
556	NC_015958	A	7	7	26004	26010	100 %	0 %	0 %	0 %	345016469
557	NC_015958	GTT	2	6	26102	26107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016469
558	NC_015958	GAT	2	6	26117	26122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016469
559	NC_015958	ATT	2	6	26138	26143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016469
560	NC_015958	GAC	2	6	26161	26166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016469
561	NC_015958	GAAA	2	8	26269	26276	75 %	0 %	25 %	0 %	345016469
562	NC_015958	TA	3	6	26284	26289	50 %	50 %	0 %	0 %	345016469
563	NC_015958	GATAG	2	10	26334	26343	40 %	20 %	40 %	0 %	345016470
564	NC_015958	ATT	2	6	26379	26384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016470
565	NC_015958	GCA	2	6	26430	26435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016470
566	NC_015958	TAC	2	6	26606	26611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016470
567	NC_015958	TAG	2	6	26653	26658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016470
568	NC_015958	AGA	2	6	26675	26680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016470
569	NC_015958	TGG	2	6	26723	26728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016470
570	NC_015958	AGC	2	6	26756	26761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016470
571	NC_015958	CTG	2	6	26794	26799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345016470
572	NC_015958	GAT	2	6	26823	26828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016470
573	NC_015958	A	7	7	26867	26873	100 %	0 %	0 %	0 %	345016470
574	NC_015958	CAA	2	6	26965	26970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016470
575	NC_015958	GAA	2	6	27000	27005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016470
576	NC_015958	AT	3	6	27100	27105	50 %	50 %	0 %	0 %	345016470
577	NC_015958	AGGA	2	8	27166	27173	50 %	0 %	50 %	0 %	345016470
578	NC_015958	AGGA	2	8	27196	27203	50 %	0 %	50 %	0 %	345016470
579	NC_015958	AAT	2	6	27372	27377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016470
580	NC_015958	A	6	6	27382	27387	100 %	0 %	0 %	0 %	345016470
581	NC_015958	ATT	2	6	27451	27456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016470
582	NC_015958	CAAAA	2	10	27473	27482	80 %	0 %	0 %	20 %	345016470
583	NC_015958	A	7	7	27479	27485	100 %	0 %	0 %	0 %	345016470
584	NC_015958	A	6	6	27487	27492	100 %	0 %	0 %	0 %	345016470
585	NC_015958	GAAA	2	8	27626	27633	75 %	0 %	25 %	0 %	345016471
586	NC_015958	TAA	2	6	27833	27838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016471
587	NC_015958	GAG	2	6	27839	27844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016471
588	NC_015958	AAATA	2	10	28046	28055	80 %	20 %	0 %	0 %	345016471
589	NC_015958	TTATT	2	10	28070	28079	20 %	80 %	0 %	0 %	345016472
590	NC_015958	AGG	2	6	28084	28089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016472
591	NC_015958	AAT	2	6	28090	28095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016472
592	NC_015958	TAC	3	9	28120	28128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016472
593	NC_015958	ACC	2	6	28262	28267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345016472
594	NC_015958	AT	3	6	28288	28293	50 %	50 %	0 %	0 %	345016472
595	NC_015958	ATG	2	6	28316	28321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016472
596	NC_015958	AAG	2	6	28390	28395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016472
597	NC_015958	ATT	2	6	28466	28471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016472
598	NC_015958	T	6	6	28526	28531	0 %	100 %	0 %	0 %	345016472
599	NC_015958	A	7	7	28603	28609	100 %	0 %	0 %	0 %	345016472
600	NC_015958	A	6	6	28640	28645	100 %	0 %	0 %	0 %	345016472
601	NC_015958	TTG	2	6	28656	28661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016472
602	NC_015958	T	6	6	28688	28693	0 %	100 %	0 %	0 %	345016472
603	NC_015958	AT	3	6	28704	28709	50 %	50 %	0 %	0 %	345016472
604	NC_015958	ATTG	2	8	28718	28725	25 %	50 %	25 %	0 %	345016472
605	NC_015958	TGT	2	6	28728	28733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016472
606	NC_015958	AT	3	6	28864	28869	50 %	50 %	0 %	0 %	345016472
607	NC_015958	T	8	8	28963	28970	0 %	100 %	0 %	0 %	345016472
608	NC_015958	ATT	2	6	28994	28999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016472
609	NC_015958	AAAGC	2	10	29007	29016	60 %	0 %	20 %	20 %	345016472
610	NC_015958	AAT	2	6	29041	29046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016472
611	NC_015958	ATA	2	6	29069	29074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016472
612	NC_015958	CAA	2	6	29082	29087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016472
613	NC_015958	T	8	8	29097	29104	0 %	100 %	0 %	0 %	345016472
614	NC_015958	ATT	2	6	29131	29136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016472
615	NC_015958	T	6	6	29239	29244	0 %	100 %	0 %	0 %	345016473
616	NC_015958	TTCGC	2	10	29291	29300	0 %	40 %	20 %	40 %	345016473
617	NC_015958	CTA	2	6	29317	29322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016473
618	NC_015958	AGA	2	6	29391	29396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016473
619	NC_015958	TC	3	6	29406	29411	0 %	50 %	0 %	50 %	345016473
620	NC_015958	T	6	6	29607	29612	0 %	100 %	0 %	0 %	345016474
621	NC_015958	AAAT	2	8	29687	29694	75 %	25 %	0 %	0 %	345016474
622	NC_015958	TA	3	6	29718	29723	50 %	50 %	0 %	0 %	345016474
623	NC_015958	GAG	2	6	29744	29749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016474
624	NC_015958	GTA	2	6	29755	29760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016474
625	NC_015958	GAC	2	6	29773	29778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016474
626	NC_015958	TGG	2	6	29814	29819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016474
627	NC_015958	A	6	6	29835	29840	100 %	0 %	0 %	0 %	345016474
628	NC_015958	TAA	2	6	29849	29854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016474
629	NC_015958	AGT	2	6	29865	29870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016474
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