MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015865	AGG	2	6	193836	193841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581274
3502	NC_015865	CGA	2	6	193981	193986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581274
3503	NC_015865	AGGC	2	8	194013	194020	25 %	0 %	50 %	25 %	341581274
3504	NC_015865	ACC	2	6	194079	194084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581274
3505	NC_015865	AGT	2	6	194289	194294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581275
3506	NC_015865	CGTC	2	8	194295	194302	0 %	25 %	25 %	50 %	341581275
3507	NC_015865	ACG	2	6	194357	194362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581275
3508	NC_015865	CTCGG	2	10	194363	194372	0 %	20 %	40 %	40 %	341581275
3509	NC_015865	TCA	2	6	194400	194405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581275
3510	NC_015865	TTG	2	6	194525	194530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581275
3511	NC_015865	TTA	2	6	194538	194543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581275
3512	NC_015865	TGT	2	6	194547	194552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581275
3513	NC_015865	CCG	2	6	194724	194729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581275
3514	NC_015865	GCG	2	6	194745	194750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581275
3515	NC_015865	ATG	2	6	194783	194788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581275
3516	NC_015865	ATG	2	6	194792	194797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581275
3517	NC_015865	GCC	2	6	194984	194989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581275
3518	NC_015865	GGC	2	6	195233	195238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581276
3519	NC_015865	TGA	2	6	195241	195246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581276
3520	NC_015865	CTC	3	9	195248	195256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581276
3521	NC_015865	CGA	2	6	195283	195288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581276
3522	NC_015865	TAT	2	6	195323	195328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581276
3523	NC_015865	CGG	2	6	195418	195423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581276
3524	NC_015865	CT	3	6	195462	195467	0 %	50 %	0 %	50 %	341581276
3525	NC_015865	TGA	2	6	195544	195549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581276
3526	NC_015865	CCT	2	6	195577	195582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581276
3527	NC_015865	GCT	2	6	195608	195613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581276
3528	NC_015865	TGGA	2	8	195698	195705	25 %	25 %	50 %	0 %	341581276
3529	NC_015865	TGA	2	6	195712	195717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581276
3530	NC_015865	CTC	2	6	195761	195766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581276
3531	NC_015865	CGA	2	6	195820	195825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581276
3532	NC_015865	TGG	2	6	195844	195849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581276
3533	NC_015865	GT	3	6	195877	195882	0 %	50 %	50 %	0 %	341581276
3534	NC_015865	GTC	2	6	195894	195899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581276
3535	NC_015865	GT	3	6	195916	195921	0 %	50 %	50 %	0 %	341581276
3536	NC_015865	ATT	2	6	196089	196094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581276
3537	NC_015865	TGG	2	6	196096	196101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581276
3538	NC_015865	CGG	2	6	196174	196179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581276
3539	NC_015865	T	7	7	196207	196213	0 %	100 %	0 %	0 %	341581276
3540	NC_015865	GTG	2	6	196256	196261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581276
3541	NC_015865	T	6	6	196352	196357	0 %	100 %	0 %	0 %	341581277
3542	NC_015865	TCC	2	6	196362	196367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581277
3543	NC_015865	TCG	2	6	196390	196395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581277
3544	NC_015865	CGG	2	6	196519	196524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581277
3545	NC_015865	CTT	2	6	196538	196543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581277
3546	NC_015865	AG	3	6	196621	196626	50 %	0 %	50 %	0 %	341581277
3547	NC_015865	CTCGAC	2	12	196688	196699	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341581277
3548	NC_015865	GGA	2	6	196805	196810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581278
3549	NC_015865	GAA	2	6	196872	196877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581278
3550	NC_015865	CGG	2	6	196889	196894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581278
3551	NC_015865	AGA	2	6	196910	196915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581278
3552	NC_015865	GC	3	6	197027	197032	0 %	0 %	50 %	50 %	341581278
3553	NC_015865	CCG	2	6	197041	197046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581278
3554	NC_015865	ATT	2	6	197062	197067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581278
3555	NC_015865	CCTC	2	8	197281	197288	0 %	25 %	0 %	75 %	341581279
3556	NC_015865	TCA	2	6	197320	197325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581279
3557	NC_015865	CTG	2	6	197421	197426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581279
3558	NC_015865	CTA	2	6	197429	197434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581279
3559	NC_015865	GGT	2	6	197627	197632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581279
3560	NC_015865	GGA	2	6	197687	197692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581279
3561	NC_015865	ATC	2	6	197706	197711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581279
3562	NC_015865	ATA	2	6	197742	197747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581279
3563	NC_015865	TGG	2	6	197755	197760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581279
3564	NC_015865	CGG	2	6	197981	197986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581279
3565	NC_015865	GTT	2	6	197991	197996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581279
3566	NC_015865	TCG	2	6	198004	198009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581279
3567	NC_015865	TCG	2	6	198025	198030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581279
3568	NC_015865	CAT	2	6	198035	198040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581279
3569	NC_015865	ACC	2	6	198058	198063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581279
3570	NC_015865	TTC	2	6	198069	198074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581279
3571	NC_015865	ACG	2	6	198127	198132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581279
3572	NC_015865	CTC	2	6	198168	198173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581279
3573	NC_015865	TGG	2	6	198229	198234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581279
3574	NC_015865	TCG	2	6	198250	198255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581279
3575	NC_015865	CCTC	2	8	198268	198275	0 %	25 %	0 %	75 %	341581279
3576	NC_015865	GTC	2	6	198369	198374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581279
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3579	NC_015865	TGC	2	6	198460	198465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581279
3580	NC_015865	AG	3	6	198633	198638	50 %	0 %	50 %	0 %	341581280
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3583	NC_015865	GCC	2	6	198791	198796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581280
3584	NC_015865	TCG	3	9	198889	198897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581280
3585	NC_015865	GTT	2	6	198901	198906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581280
3586	NC_015865	ATG	2	6	198939	198944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581280
3587	NC_015865	TCG	2	6	198966	198971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581280
3588	NC_015865	ACC	2	6	199008	199013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581280
3589	NC_015865	GCG	2	6	199030	199035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581280
3590	NC_015865	CTC	2	6	199049	199054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581280
3591	NC_015865	CCA	2	6	199183	199188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581280
3592	NC_015865	GAG	2	6	199259	199264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581280
3593	NC_015865	GTA	2	6	199283	199288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581280
3594	NC_015865	CCG	2	6	199335	199340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581280
3595	NC_015865	TC	3	6	199352	199357	0 %	50 %	0 %	50 %	341581280
3596	NC_015865	TGA	2	6	199369	199374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581280
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3599	NC_015865	AAGCTC	2	12	199755	199766	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341581281
3600	NC_015865	GGAAG	2	10	199799	199808	40 %	0 %	60 %	0 %	341581281
3601	NC_015865	TCG	2	6	199834	199839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581281
3602	NC_015865	GAG	2	6	199872	199877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581281
3603	NC_015865	GCC	2	6	200030	200035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581281
3604	NC_015865	CT	3	6	200040	200045	0 %	50 %	0 %	50 %	341581281
3605	NC_015865	GCT	2	6	200048	200053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581281
3606	NC_015865	CAAGG	2	10	200126	200135	40 %	0 %	40 %	20 %	341581281
3607	NC_015865	CTT	2	6	200136	200141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581281
3608	NC_015865	ACCA	2	8	200190	200197	50 %	0 %	0 %	50 %	341581281
3609	NC_015865	GT	3	6	200198	200203	0 %	50 %	50 %	0 %	341581281
3610	NC_015865	CCCG	2	8	200210	200217	0 %	0 %	25 %	75 %	341581281
3611	NC_015865	GGA	2	6	200225	200230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581281
3612	NC_015865	TCA	2	6	200269	200274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581281
3613	NC_015865	TCTT	2	8	200288	200295	0 %	75 %	0 %	25 %	341581281
3614	NC_015865	ACC	2	6	200299	200304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581281
3615	NC_015865	CCA	2	6	200356	200361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581282
3616	NC_015865	CGC	2	6	200387	200392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581282
3617	NC_015865	TCT	2	6	200416	200421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581282
3618	NC_015865	GAT	2	6	200426	200431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581282
3619	NC_015865	CTT	2	6	200495	200500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581282
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3621	NC_015865	GAC	2	6	200720	200725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581282
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3743	NC_015865	GGTCC	2	10	207450	207459	0 %	20 %	40 %	40 %	341581290
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3984	NC_015865	CG	3	6	218272	218277	0 %	0 %	50 %	50 %	341581301
3985	NC_015865	TCA	2	6	218278	218283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581301
3986	NC_015865	CGA	2	6	218294	218299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581301
3987	NC_015865	ATC	2	6	218304	218309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581301
3988	NC_015865	GAA	2	6	218357	218362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581301
3989	NC_015865	GAA	2	6	218417	218422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581301
3990	NC_015865	CG	3	6	218590	218595	0 %	0 %	50 %	50 %	341581301
3991	NC_015865	CGA	2	6	218606	218611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581301
3992	NC_015865	AAG	2	6	218628	218633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581301
3993	NC_015865	GAG	3	9	218636	218644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581301
3994	NC_015865	CGA	2	6	218699	218704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581301
3995	NC_015865	GGA	2	6	218744	218749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581301
3996	NC_015865	GTC	2	6	218838	218843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581301
3997	NC_015865	GCC	2	6	218870	218875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581301
3998	NC_015865	AGCTG	2	10	218881	218890	20 %	20 %	40 %	20 %	341581301
3999	NC_015865	GAG	2	6	218901	218906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581301
4000	NC_015865	CCG	2	6	218943	218948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581301

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