MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_015865	GAA	2	6	1837503	1837508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583033
35002	NC_015865	CTC	2	6	1837626	1837631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583033
35003	NC_015865	CTT	2	6	1837806	1837811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583033
35004	NC_015865	GAA	2	6	1837881	1837886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583033
35005	NC_015865	TCA	2	6	1837919	1837924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583033
35006	NC_015865	GAG	2	6	1838203	1838208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583034
35007	NC_015865	TCA	2	6	1838232	1838237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583034
35008	NC_015865	TTC	2	6	1838238	1838243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583034
35009	NC_015865	CTG	2	6	1838258	1838263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583034
35010	NC_015865	TCAA	2	8	1838268	1838275	50 %	25 %	0 %	25 %	341583034
35011	NC_015865	AAG	2	6	1838414	1838419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583034
35012	NC_015865	CGC	2	6	1838515	1838520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583034
35013	NC_015865	CGT	2	6	1838548	1838553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583034
35014	NC_015865	GGA	2	6	1838593	1838598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583034
35015	NC_015865	TAC	2	6	1838600	1838605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583034
35016	NC_015865	CCG	2	6	1838612	1838617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583034
35017	NC_015865	GGA	2	6	1838673	1838678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583034
35018	NC_015865	CCG	2	6	1838751	1838756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583034
35019	NC_015865	GTC	2	6	1838822	1838827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583034
35020	NC_015865	CGG	2	6	1838830	1838835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583034
35021	NC_015865	CCT	2	6	1838859	1838864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583034
35022	NC_015865	GGA	2	6	1838916	1838921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583034
35023	NC_015865	AGGG	2	8	1839090	1839097	25 %	0 %	75 %	0 %	341583034
35024	NC_015865	ATG	2	6	1839120	1839125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583034
35025	NC_015865	GGT	2	6	1839157	1839162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583034
35026	NC_015865	GGC	2	6	1839169	1839174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583034
35027	NC_015865	AG	3	6	1839275	1839280	50 %	0 %	50 %	0 %	341583034
35028	NC_015865	GAG	2	6	1839287	1839292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583034
35029	NC_015865	CTT	2	6	1839353	1839358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583035
35030	NC_015865	CAG	2	6	1839387	1839392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583035
35031	NC_015865	TCC	2	6	1839409	1839414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583035
35032	NC_015865	GAG	2	6	1839462	1839467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583035
35033	NC_015865	ATCGT	2	10	1839535	1839544	20 %	40 %	20 %	20 %	341583035
35034	NC_015865	GAG	2	6	1839594	1839599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583035
35035	NC_015865	CGT	3	9	1839608	1839616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583035
35036	NC_015865	CCT	3	9	1839626	1839634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583035
35037	NC_015865	AGC	2	6	1839710	1839715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583035
35038	NC_015865	CG	3	6	1839719	1839724	0 %	0 %	50 %	50 %	341583035
35039	NC_015865	CCG	2	6	1839743	1839748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583035
35040	NC_015865	CTC	2	6	1839819	1839824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583035
35041	NC_015865	TC	3	6	1839848	1839853	0 %	50 %	0 %	50 %	341583035
35042	NC_015865	GAA	2	6	1839864	1839869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583035
35043	NC_015865	CCT	2	6	1839939	1839944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583036
35044	NC_015865	CTC	2	6	1839961	1839966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583036
35045	NC_015865	GAC	2	6	1840006	1840011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583036
35046	NC_015865	TCG	2	6	1840097	1840102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583036
35047	NC_015865	CCG	2	6	1840199	1840204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583036
35048	NC_015865	CAC	2	6	1840212	1840217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583036
35049	NC_015865	GAC	2	6	1840225	1840230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583036
35050	NC_015865	CGT	2	6	1840260	1840265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583036
35051	NC_015865	G	6	6	1840302	1840307	0 %	0 %	100 %	0 %	341583036
35052	NC_015865	CCG	2	6	1840323	1840328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583036
35053	NC_015865	CTCC	2	8	1840345	1840352	0 %	25 %	0 %	75 %	341583036
35054	NC_015865	CT	3	6	1840396	1840401	0 %	50 %	0 %	50 %	341583036
35055	NC_015865	AGG	2	6	1840445	1840450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583036
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35057	NC_015865	TCC	2	6	1840568	1840573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583036
35058	NC_015865	GAG	2	6	1840603	1840608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583036
35059	NC_015865	TCC	2	6	1840622	1840627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583036
35060	NC_015865	AGG	2	6	1840631	1840636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583036
35061	NC_015865	CTC	2	6	1840667	1840672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583036
35062	NC_015865	ACG	2	6	1840724	1840729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583036
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35065	NC_015865	TCC	2	6	1840841	1840846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583036
35066	NC_015865	CGTTT	2	10	1840897	1840906	0 %	60 %	20 %	20 %	341583036
35067	NC_015865	CGA	2	6	1840911	1840916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583036
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35069	NC_015865	TCC	2	6	1841024	1841029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583037
35070	NC_015865	AGG	2	6	1841063	1841068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583037
35071	NC_015865	CTC	2	6	1841101	1841106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583037
35072	NC_015865	GGAAGC	2	12	1841211	1841222	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	341583037
35073	NC_015865	GCCTTC	2	12	1841243	1841254	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	341583037
35074	NC_015865	CGG	2	6	1841298	1841303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583037
35075	NC_015865	ATC	2	6	1841342	1841347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583037
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35083	NC_015865	ATC	2	6	1841874	1841879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583038
35084	NC_015865	GAC	2	6	1841943	1841948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583038
35085	NC_015865	TCTG	2	8	1841989	1841996	0 %	50 %	25 %	25 %	341583038
35086	NC_015865	CGAG	2	8	1842037	1842044	25 %	0 %	50 %	25 %	341583038
35087	NC_015865	GC	3	6	1842082	1842087	0 %	0 %	50 %	50 %	341583038
35088	NC_015865	GAG	2	6	1842132	1842137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583038
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35090	NC_015865	GTG	2	6	1842350	1842355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583038
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35092	NC_015865	GAG	2	6	1842562	1842567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583039
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35099	NC_015865	CGT	2	6	1842745	1842750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583039
35100	NC_015865	GGA	2	6	1842759	1842764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583039
35101	NC_015865	ACCTT	2	10	1842776	1842785	20 %	40 %	0 %	40 %	341583039
35102	NC_015865	AGC	2	6	1842848	1842853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583039
35103	NC_015865	GCC	2	6	1842914	1842919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583039
35104	NC_015865	AGG	2	6	1842959	1842964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583039
35105	NC_015865	GTA	2	6	1843150	1843155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583039
35106	NC_015865	GAG	2	6	1843217	1843222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583039
35107	NC_015865	GGTG	2	8	1843344	1843351	0 %	25 %	75 %	0 %	341583039
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35110	NC_015865	CAG	2	6	1843396	1843401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583039
35111	NC_015865	CAGGG	2	10	1843406	1843415	20 %	0 %	60 %	20 %	341583039
35112	NC_015865	ACG	2	6	1843591	1843596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583040
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35114	NC_015865	TTG	2	6	1843675	1843680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583040
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35116	NC_015865	CGGA	2	8	1843831	1843838	25 %	0 %	50 %	25 %	341583040
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35232	NC_015865	TC	3	6	1849458	1849463	0 %	50 %	0 %	50 %	341583047
35233	NC_015865	TTCC	2	8	1849526	1849533	0 %	50 %	0 %	50 %	341583047
35234	NC_015865	AGG	2	6	1849553	1849558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583047
35235	NC_015865	GCA	2	6	1849568	1849573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583047
35236	NC_015865	CCTTGT	2	12	1849763	1849774	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	341583048
35237	NC_015865	TTGG	2	8	1849823	1849830	0 %	50 %	50 %	0 %	341583048
35238	NC_015865	CTA	2	6	1849872	1849877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583048
35239	NC_015865	AGG	2	6	1849950	1849955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583048
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35242	NC_015865	GCGGG	2	10	1850120	1850129	0 %	0 %	80 %	20 %	341583049
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35247	NC_015865	GGC	2	6	1850325	1850330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583049
35248	NC_015865	ATC	2	6	1850359	1850364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583049
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35253	NC_015865	CCT	2	6	1850505	1850510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583049
35254	NC_015865	CGG	2	6	1850559	1850564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583049
35255	NC_015865	GAGAT	2	10	1850612	1850621	40 %	20 %	40 %	0 %	341583049
35256	NC_015865	GAG	2	6	1851077	1851082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583050
35257	NC_015865	GGT	2	6	1851116	1851121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583050
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35261	NC_015865	TCC	2	6	1851244	1851249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583050
35262	NC_015865	AAG	2	6	1851279	1851284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583050
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35264	NC_015865	GAG	2	6	1851314	1851319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583050
35265	NC_015865	GTTGCC	2	12	1851327	1851338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583050
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35300	NC_015865	TGGA	2	8	1853296	1853303	25 %	25 %	50 %	0 %	341583053
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35307	NC_015865	GC	3	6	1853737	1853742	0 %	0 %	50 %	50 %	341583054
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35314	NC_015865	GAG	2	6	1853955	1853960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583054
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35320	NC_015865	TCC	2	6	1854272	1854277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583054
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35322	NC_015865	GCTC	2	8	1854320	1854327	0 %	25 %	25 %	50 %	341583054
35323	NC_015865	ATC	2	6	1854384	1854389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583055
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35325	NC_015865	GGGT	2	8	1854491	1854498	0 %	25 %	75 %	0 %	341583055
35326	NC_015865	CGA	2	6	1854613	1854618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583055
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35329	NC_015865	GAG	2	6	1854785	1854790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583055
35330	NC_015865	GCCATC	2	12	1854804	1854815	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341583055
35331	NC_015865	CCTCTG	2	12	1854827	1854838	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	341583055
35332	NC_015865	GCC	2	6	1854839	1854844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583055
35333	NC_015865	TGG	2	6	1854852	1854857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583055
35334	NC_015865	GTA	2	6	1854860	1854865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583055
35335	NC_015865	CGGG	2	8	1854877	1854884	0 %	0 %	75 %	25 %	341583055
35336	NC_015865	GAG	2	6	1854899	1854904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583055
35337	NC_015865	TCC	2	6	1854930	1854935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583055
35338	NC_015865	CTC	2	6	1855055	1855060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583055
35339	NC_015865	CAG	2	6	1855073	1855078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583055
35340	NC_015865	TCCGCT	2	12	1855166	1855177	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	341583055
35341	NC_015865	CGA	2	6	1855183	1855188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583055
35342	NC_015865	GAC	2	6	1855241	1855246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583055
35343	NC_015865	GTA	3	9	1855259	1855267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583055
35344	NC_015865	AGC	2	6	1855290	1855295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583055
35345	NC_015865	CATTAT	2	12	1855372	1855383	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	341583056
35346	NC_015865	GAA	2	6	1855390	1855395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583056
35347	NC_015865	CCA	2	6	1855402	1855407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583056
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35349	NC_015865	CGG	2	6	1855465	1855470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583056
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35464	NC_015865	TGA	2	6	1861522	1861527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583061
35465	NC_015865	GAG	2	6	1861571	1861576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583061
35466	NC_015865	CCAC	2	8	1861582	1861589	25 %	0 %	0 %	75 %	341583061
35467	NC_015865	GGA	2	6	1861600	1861605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583061
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35469	NC_015865	CCCT	2	8	1861677	1861684	0 %	25 %	0 %	75 %	341583061
35470	NC_015865	GC	3	6	1861723	1861728	0 %	0 %	50 %	50 %	341583061
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35484	NC_015865	ACG	2	6	1862504	1862509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583063
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35486	NC_015865	GGA	2	6	1862553	1862558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583063
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35491	NC_015865	TG	3	6	1862725	1862730	0 %	50 %	50 %	0 %	341583063
35492	NC_015865	TCAG	2	8	1862735	1862742	25 %	25 %	25 %	25 %	341583063
35493	NC_015865	GGGAG	2	10	1862855	1862864	20 %	0 %	80 %	0 %	341583063
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