MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_015865	GAA	2	6	1809515	1809520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582996
34502	NC_015865	TCC	2	6	1809546	1809551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582996
34503	NC_015865	ACGT	2	8	1809600	1809607	25 %	25 %	25 %	25 %	341582996
34504	NC_015865	CCTCG	2	10	1809647	1809656	0 %	20 %	20 %	60 %	341582996
34505	NC_015865	TC	3	6	1809690	1809695	0 %	50 %	0 %	50 %	341582996
34506	NC_015865	G	6	6	1809772	1809777	0 %	0 %	100 %	0 %	341582996
34507	NC_015865	GTTC	2	8	1809796	1809803	0 %	50 %	25 %	25 %	341582996
34508	NC_015865	GAC	2	6	1809887	1809892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582996
34509	NC_015865	GC	3	6	1810086	1810091	0 %	0 %	50 %	50 %	341582996
34510	NC_015865	CT	3	6	1810092	1810097	0 %	50 %	0 %	50 %	341582996
34511	NC_015865	CGGA	2	8	1810208	1810215	25 %	0 %	50 %	25 %	341582997
34512	NC_015865	GTT	2	6	1810219	1810224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582997
34513	NC_015865	GGCT	2	8	1810276	1810283	0 %	25 %	50 %	25 %	341582997
34514	NC_015865	CGT	2	6	1810407	1810412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582997
34515	NC_015865	CCCCAA	2	12	1810419	1810430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582997
34516	NC_015865	GAA	2	6	1810449	1810454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582997
34517	NC_015865	TCC	2	6	1810457	1810462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582997
34518	NC_015865	AGA	2	6	1810541	1810546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582997
34519	NC_015865	AAG	2	6	1810738	1810743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582997
34520	NC_015865	TGG	2	6	1810744	1810749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582997
34521	NC_015865	CAT	2	6	1810752	1810757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582997
34522	NC_015865	GGA	2	6	1810791	1810796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582997
34523	NC_015865	CGC	2	6	1810862	1810867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582998
34524	NC_015865	CGG	2	6	1810949	1810954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582998
34525	NC_015865	AGC	2	6	1811001	1811006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582998
34526	NC_015865	GCC	2	6	1811034	1811039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582998
34527	NC_015865	CCG	2	6	1811097	1811102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582998
34528	NC_015865	CTT	2	6	1811110	1811115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582998
34529	NC_015865	ATGA	2	8	1811153	1811160	50 %	25 %	25 %	0 %	341582998
34530	NC_015865	GAG	2	6	1811183	1811188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582998
34531	NC_015865	CGA	2	6	1811222	1811227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582998
34532	NC_015865	GGC	2	6	1811229	1811234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582998
34533	NC_015865	GCG	2	6	1811252	1811257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582998
34534	NC_015865	GAA	2	6	1811285	1811290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582998
34535	NC_015865	GTC	2	6	1811403	1811408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582998
34536	NC_015865	TCC	2	6	1811431	1811436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582998
34537	NC_015865	AGG	2	6	1811457	1811462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582998
34538	NC_015865	TGC	2	6	1811498	1811503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582998
34539	NC_015865	CGCT	2	8	1811513	1811520	0 %	25 %	25 %	50 %	341582998
34540	NC_015865	G	6	6	1811734	1811739	0 %	0 %	100 %	0 %	341582998
34541	NC_015865	GAG	2	6	1811768	1811773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582998
34542	NC_015865	CGG	2	6	1811783	1811788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582998
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34544	NC_015865	CCT	2	6	1812174	1812179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582999
34545	NC_015865	CCG	2	6	1812433	1812438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583000
34546	NC_015865	TTG	2	6	1812453	1812458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583000
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34551	NC_015865	ATG	2	6	1812786	1812791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583000
34552	NC_015865	CGA	2	6	1812935	1812940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583001
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34554	NC_015865	GAA	2	6	1813093	1813098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583001
34555	NC_015865	CGA	2	6	1813127	1813132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583001
34556	NC_015865	GTC	2	6	1813212	1813217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583001
34557	NC_015865	ACA	2	6	1813237	1813242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583001
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34560	NC_015865	TA	3	6	1813441	1813446	50 %	50 %	0 %	0 %	341583002
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34567	NC_015865	TTC	2	6	1813734	1813739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583002
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34569	NC_015865	GGA	2	6	1813795	1813800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583002
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34571	NC_015865	GGAAGA	2	12	1814008	1814019	50 %	0 %	50 %	0 %	341583002
34572	NC_015865	TGGCA	2	10	1814063	1814072	20 %	20 %	40 %	20 %	341583002
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34578	NC_015865	CCAG	2	8	1814311	1814318	25 %	0 %	25 %	50 %	341583002
34579	NC_015865	CG	3	6	1814322	1814327	0 %	0 %	50 %	50 %	341583002
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34582	NC_015865	TA	3	6	1814593	1814598	50 %	50 %	0 %	0 %	341583003
34583	NC_015865	GTCG	2	8	1814733	1814740	0 %	25 %	50 %	25 %	341583003
34584	NC_015865	TC	3	6	1814746	1814751	0 %	50 %	0 %	50 %	341583003
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34589	NC_015865	GCC	2	6	1814995	1815000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583003
34590	NC_015865	CTT	2	6	1815067	1815072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583003
34591	NC_015865	AGG	2	6	1815170	1815175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583003
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34598	NC_015865	TGA	2	6	1815467	1815472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583003
34599	NC_015865	GAG	2	6	1815544	1815549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583003
34600	NC_015865	CTA	2	6	1815570	1815575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583003
34601	NC_015865	CTG	2	6	1815619	1815624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583003
34602	NC_015865	CCA	2	6	1815666	1815671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583003
34603	NC_015865	GCC	2	6	1815709	1815714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583003
34604	NC_015865	GAG	2	6	1815836	1815841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583004
34605	NC_015865	CGA	2	6	1815905	1815910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583004
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34607	NC_015865	AGA	2	6	1815978	1815983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583004
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34609	NC_015865	GAG	2	6	1816053	1816058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583004
34610	NC_015865	CTG	2	6	1816059	1816064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583004
34611	NC_015865	AGAA	2	8	1816074	1816081	75 %	0 %	25 %	0 %	341583004
34612	NC_015865	GGA	2	6	1816125	1816130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583005
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34614	NC_015865	AC	3	6	1816221	1816226	50 %	0 %	0 %	50 %	341583005
34615	NC_015865	ACC	2	6	1816228	1816233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583005
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34617	NC_015865	GTC	2	6	1816387	1816392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583005
34618	NC_015865	GT	3	6	1816489	1816494	0 %	50 %	50 %	0 %	341583005
34619	NC_015865	GTA	2	6	1816544	1816549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583006
34620	NC_015865	AG	4	8	1816593	1816600	50 %	0 %	50 %	0 %	341583006
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34622	NC_015865	TAT	2	6	1816631	1816636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583006
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34644	NC_015865	CGA	2	6	1817906	1817911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583008
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34664	NC_015865	GGAA	2	8	1818689	1818696	50 %	0 %	50 %	0 %	341583009
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34732	NC_015865	GGA	2	6	1822732	1822737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583013
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34734	NC_015865	CTC	2	6	1822886	1822891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583014
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34965	NC_015865	TTA	2	6	1835814	1835819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583031
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