MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015865	TCC	2	6	167965	167970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581245
3002	NC_015865	CCT	2	6	168009	168014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581245
3003	NC_015865	GCCG	2	8	168128	168135	0 %	0 %	50 %	50 %	341581245
3004	NC_015865	GGGCAT	2	12	168195	168206	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	341581245
3005	NC_015865	AAT	2	6	168272	168277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581246
3006	NC_015865	CTCG	2	8	168362	168369	0 %	25 %	25 %	50 %	341581246
3007	NC_015865	CTT	2	6	168377	168382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581246
3008	NC_015865	CTC	2	6	168464	168469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581246
3009	NC_015865	TCT	3	9	168502	168510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581246
3010	NC_015865	TC	3	6	168629	168634	0 %	50 %	0 %	50 %	341581246
3011	NC_015865	CTC	2	6	168704	168709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581246
3012	NC_015865	CG	3	6	168844	168849	0 %	0 %	50 %	50 %	341581247
3013	NC_015865	GAG	2	6	168854	168859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581247
3014	NC_015865	TCG	2	6	168936	168941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581247
3015	NC_015865	TCC	2	6	169002	169007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581247
3016	NC_015865	TC	3	6	169069	169074	0 %	50 %	0 %	50 %	341581247
3017	NC_015865	GC	3	6	169080	169085	0 %	0 %	50 %	50 %	341581247
3018	NC_015865	CCT	2	6	169153	169158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581247
3019	NC_015865	TCGAGC	2	12	169212	169223	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341581247
3020	NC_015865	TCT	2	6	169348	169353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581247
3021	NC_015865	TCC	2	6	169389	169394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581247
3022	NC_015865	CG	3	6	169463	169468	0 %	0 %	50 %	50 %	341581247
3023	NC_015865	TTCC	2	8	169477	169484	0 %	50 %	0 %	50 %	341581247
3024	NC_015865	GCC	2	6	169500	169505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581247
3025	NC_015865	TCG	2	6	169506	169511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581247
3026	NC_015865	TTGC	2	8	169518	169525	0 %	50 %	25 %	25 %	341581247
3027	NC_015865	CCT	2	6	169590	169595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581248
3028	NC_015865	CT	3	6	169622	169627	0 %	50 %	0 %	50 %	341581248
3029	NC_015865	AATA	2	8	169637	169644	75 %	25 %	0 %	0 %	341581248
3030	NC_015865	CCT	2	6	169683	169688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581248
3031	NC_015865	CCA	2	6	169842	169847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581249
3032	NC_015865	TGG	2	6	169886	169891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581249
3033	NC_015865	CGA	3	9	169916	169924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581249
3034	NC_015865	TCG	2	6	169933	169938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581249
3035	NC_015865	TCA	2	6	169990	169995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581249
3036	NC_015865	CTC	2	6	170001	170006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581249
3037	NC_015865	CATACC	2	12	170023	170034	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	341581249
3038	NC_015865	T	6	6	170087	170092	0 %	100 %	0 %	0 %	341581249
3039	NC_015865	CTC	2	6	170220	170225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581250
3040	NC_015865	CCAG	2	8	170237	170244	25 %	0 %	25 %	50 %	341581250
3041	NC_015865	CTT	2	6	170250	170255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581250
3042	NC_015865	CCT	2	6	170261	170266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581250
3043	NC_015865	CT	3	6	170276	170281	0 %	50 %	0 %	50 %	341581250
3044	NC_015865	AG	3	6	170405	170410	50 %	0 %	50 %	0 %	341581250
3045	NC_015865	CGTT	2	8	170422	170429	0 %	50 %	25 %	25 %	341581250
3046	NC_015865	CCA	2	6	170463	170468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581250
3047	NC_015865	CTCC	2	8	170529	170536	0 %	25 %	0 %	75 %	341581250
3048	NC_015865	TCC	2	6	170575	170580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581250
3049	NC_015865	CCA	2	6	170591	170596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581250
3050	NC_015865	A	6	6	170596	170601	100 %	0 %	0 %	0 %	341581250
3051	NC_015865	TA	3	6	170676	170681	50 %	50 %	0 %	0 %	341581250
3052	NC_015865	CTC	2	6	170728	170733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581250
3053	NC_015865	CGT	2	6	170817	170822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581250
3054	NC_015865	AGT	2	6	170855	170860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581250
3055	NC_015865	TTC	2	6	170868	170873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581250
3056	NC_015865	CTC	2	6	170877	170882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581250
3057	NC_015865	AGGA	2	8	170911	170918	50 %	0 %	50 %	0 %	341581250
3058	NC_015865	AAT	2	6	170930	170935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581250
3059	NC_015865	CTC	2	6	171024	171029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581250
3060	NC_015865	CCTCG	2	10	171054	171063	0 %	20 %	20 %	60 %	341581250
3061	NC_015865	CAT	2	6	171141	171146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581250
3062	NC_015865	GGA	2	6	171215	171220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581250
3063	NC_015865	TCG	2	6	171262	171267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581250
3064	NC_015865	GAC	2	6	171270	171275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581250
3065	NC_015865	TCG	2	6	171355	171360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581250
3066	NC_015865	GAG	2	6	171426	171431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581250
3067	NC_015865	TCC	2	6	171446	171451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581250
3068	NC_015865	GAG	3	9	171462	171470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581250
3069	NC_015865	CCTTTC	2	12	171518	171529	0 %	50 %	0 %	50 %	341581250
3070	NC_015865	TC	3	6	171534	171539	0 %	50 %	0 %	50 %	341581250
3071	NC_015865	TGA	2	6	171569	171574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581250
3072	NC_015865	GGA	2	6	171778	171783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581251
3073	NC_015865	CGG	2	6	171867	171872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581251
3074	NC_015865	CTC	2	6	172008	172013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581251
3075	NC_015865	TCA	2	6	172043	172048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581251
3076	NC_015865	AGG	2	6	172075	172080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581251
3077	NC_015865	GAC	2	6	172089	172094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581251
3078	NC_015865	ACC	2	6	172125	172130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581252
3079	NC_015865	CCG	2	6	172138	172143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581252
3080	NC_015865	GAT	2	6	172187	172192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581252
3081	NC_015865	GGC	2	6	172221	172226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581252
3082	NC_015865	GT	3	6	172259	172264	0 %	50 %	50 %	0 %	341581252
3083	NC_015865	GCC	2	6	172292	172297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581252
3084	NC_015865	TTC	2	6	172346	172351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581252
3085	NC_015865	TCC	2	6	172355	172360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581252
3086	NC_015865	ATT	2	6	172422	172427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581252
3087	NC_015865	GT	4	8	172499	172506	0 %	50 %	50 %	0 %	341581252
3088	NC_015865	AAG	2	6	172544	172549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581252
3089	NC_015865	TAT	2	6	172758	172763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581253
3090	NC_015865	CCT	2	6	172799	172804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581253
3091	NC_015865	CGT	2	6	172848	172853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581253
3092	NC_015865	GTT	2	6	172869	172874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581253
3093	NC_015865	TCCC	2	8	172988	172995	0 %	25 %	0 %	75 %	341581253
3094	NC_015865	GTA	2	6	173037	173042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581253
3095	NC_015865	CAG	2	6	173067	173072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581253
3096	NC_015865	AAT	2	6	173079	173084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581253
3097	NC_015865	CGC	2	6	173093	173098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581253
3098	NC_015865	AGT	2	6	173214	173219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581254
3099	NC_015865	AGA	2	6	173247	173252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581254
3100	NC_015865	CTT	2	6	173266	173271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581254
3101	NC_015865	TCC	2	6	173276	173281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581254
3102	NC_015865	TGA	2	6	173301	173306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581254
3103	NC_015865	GTC	2	6	173326	173331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581254
3104	NC_015865	CAT	2	6	173335	173340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581254
3105	NC_015865	AGG	2	6	173417	173422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581254
3106	NC_015865	TTG	2	6	173426	173431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581254
3107	NC_015865	CCT	2	6	173445	173450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581254
3108	NC_015865	GAG	2	6	173452	173457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581254
3109	NC_015865	GCC	2	6	173462	173467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581254
3110	NC_015865	CGA	2	6	173502	173507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581254
3111	NC_015865	TGG	2	6	173513	173518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581254
3112	NC_015865	CTC	2	6	173560	173565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581254
3113	NC_015865	CCG	2	6	173640	173645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581254
3114	NC_015865	TGG	2	6	173669	173674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581254
3115	NC_015865	GGT	3	9	173676	173684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581254
3116	NC_015865	CCCT	2	8	173819	173826	0 %	25 %	0 %	75 %	341581254
3117	NC_015865	CGT	2	6	173877	173882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581254
3118	NC_015865	CCT	2	6	173901	173906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581254
3119	NC_015865	CGGGAA	2	12	173938	173949	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	341581254
3120	NC_015865	ACC	2	6	173956	173961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581254
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3122	NC_015865	CTC	2	6	174028	174033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581254
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3239	NC_015865	CA	3	6	180029	180034	50 %	0 %	0 %	50 %	341581262
3240	NC_015865	CGT	2	6	180075	180080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581262
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3243	NC_015865	GGAG	2	8	180196	180203	25 %	0 %	75 %	0 %	341581262
3244	NC_015865	TGT	2	6	180347	180352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581262
3245	NC_015865	TTA	2	6	180428	180433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581262
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3247	NC_015865	GTA	2	6	180615	180620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581262
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3251	NC_015865	CCAC	2	8	180974	180981	25 %	0 %	0 %	75 %	341581262
3252	NC_015865	TGC	2	6	180987	180992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581262
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3264	NC_015865	CT	3	6	181511	181516	0 %	50 %	0 %	50 %	341581263
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3360	NC_015865	TCG	2	6	186434	186439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581268
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3362	NC_015865	GCG	2	6	186530	186535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581268
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3366	NC_015865	AGG	2	6	186680	186685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581268
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3471	NC_015865	CT	3	6	191716	191721	0 %	50 %	0 %	50 %	341581272
3472	NC_015865	ATC	2	6	191975	191980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581272
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3474	NC_015865	ATCT	2	8	192211	192218	25 %	50 %	0 %	25 %	341581272
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3477	NC_015865	A	7	7	192550	192556	100 %	0 %	0 %	0 %	341581272
3478	NC_015865	AGA	2	6	192566	192571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581272
3479	NC_015865	CAT	2	6	192621	192626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581273
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3481	NC_015865	TTCC	2	8	192757	192764	0 %	50 %	0 %	50 %	341581273
3482	NC_015865	TGA	2	6	192781	192786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581273
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3484	NC_015865	CTC	2	6	192830	192835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581273
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3486	NC_015865	TGA	2	6	192880	192885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581273
3487	NC_015865	CGG	2	6	192925	192930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581273
3488	NC_015865	TGG	2	6	192934	192939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581273
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3491	NC_015865	GT	3	6	193063	193068	0 %	50 %	50 %	0 %	341581273
3492	NC_015865	GGC	2	6	193115	193120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581273
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3494	NC_015865	GTA	2	6	193256	193261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581273
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