MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_015865	G	6	6	1567367	1567372	0 %	0 %	100 %	0 %	341582732
30002	NC_015865	CGA	2	6	1567386	1567391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582732
30003	NC_015865	GCA	2	6	1567487	1567492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582732
30004	NC_015865	TAC	2	6	1567552	1567557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582732
30005	NC_015865	GGA	2	6	1567584	1567589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582732
30006	NC_015865	TGT	2	6	1567590	1567595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582732
30007	NC_015865	GCT	2	6	1567659	1567664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582732
30008	NC_015865	TCG	2	6	1567682	1567687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582732
30009	NC_015865	GAA	2	6	1567689	1567694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582732
30010	NC_015865	CCT	2	6	1567713	1567718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582732
30011	NC_015865	ATG	2	6	1567729	1567734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582732
30012	NC_015865	GCT	2	6	1567752	1567757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582732
30013	NC_015865	TTC	2	6	1567762	1567767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582732
30014	NC_015865	GGC	2	6	1567807	1567812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582732
30015	NC_015865	AT	3	6	1567886	1567891	50 %	50 %	0 %	0 %	341582732
30016	NC_015865	TGA	2	6	1567973	1567978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582733
30017	NC_015865	C	6	6	1567993	1567998	0 %	0 %	0 %	100 %	341582733
30018	NC_015865	CAA	2	6	1568076	1568081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582733
30019	NC_015865	CGACC	2	10	1568094	1568103	20 %	0 %	20 %	60 %	341582733
30020	NC_015865	GCG	2	6	1568129	1568134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582733
30021	NC_015865	ACA	2	6	1568213	1568218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582733
30022	NC_015865	GGC	2	6	1568229	1568234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582733
30023	NC_015865	CG	3	6	1568264	1568269	0 %	0 %	50 %	50 %	341582733
30024	NC_015865	GGA	2	6	1568304	1568309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582733
30025	NC_015865	AGG	2	6	1568327	1568332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582733
30026	NC_015865	AGG	2	6	1568338	1568343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582733
30027	NC_015865	TCG	2	6	1568357	1568362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582733
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30029	NC_015865	ACT	2	6	1568441	1568446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582733
30030	NC_015865	ACC	2	6	1568504	1568509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582733
30031	NC_015865	GGGA	2	8	1568531	1568538	25 %	0 %	75 %	0 %	341582733
30032	NC_015865	GC	3	6	1568621	1568626	0 %	0 %	50 %	50 %	341582733
30033	NC_015865	GGCT	2	8	1568689	1568696	0 %	25 %	50 %	25 %	341582733
30034	NC_015865	C	6	6	1568729	1568734	0 %	0 %	0 %	100 %	341582733
30035	NC_015865	TAC	2	6	1568752	1568757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582733
30036	NC_015865	CGA	2	6	1568778	1568783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582733
30037	NC_015865	GGA	2	6	1568841	1568846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582733
30038	NC_015865	TAC	2	6	1568908	1568913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582733
30039	NC_015865	TC	3	6	1568914	1568919	0 %	50 %	0 %	50 %	341582733
30040	NC_015865	AGC	2	6	1568936	1568941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582733
30041	NC_015865	GAC	2	6	1568995	1569000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582733
30042	NC_015865	TAC	2	6	1569064	1569069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582733
30043	NC_015865	CGA	2	6	1569072	1569077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582733
30044	NC_015865	GAT	2	6	1569126	1569131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582733
30045	NC_015865	CAA	2	6	1569138	1569143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582733
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30047	NC_015865	GGC	2	6	1569153	1569158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582733
30048	NC_015865	ACT	2	6	1569239	1569244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582733
30049	NC_015865	GA	3	6	1569259	1569264	50 %	0 %	50 %	0 %	341582733
30050	NC_015865	CTCAAC	2	12	1569325	1569336	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	341582733
30051	NC_015865	AGAA	2	8	1569455	1569462	75 %	0 %	25 %	0 %	341582733
30052	NC_015865	CTC	2	6	1569537	1569542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582733
30053	NC_015865	TCA	2	6	1569551	1569556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582733
30054	NC_015865	CGG	2	6	1569558	1569563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582733
30055	NC_015865	TC	3	6	1569579	1569584	0 %	50 %	0 %	50 %	341582733
30056	NC_015865	TCG	2	6	1569605	1569610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582733
30057	NC_015865	CGT	2	6	1569648	1569653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582733
30058	NC_015865	CTA	2	6	1569696	1569701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582733
30059	NC_015865	CTA	2	6	1569825	1569830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582733
30060	NC_015865	AACGG	2	10	1569853	1569862	40 %	0 %	40 %	20 %	341582733
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30062	NC_015865	ACG	3	9	1570009	1570017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582733
30063	NC_015865	GA	3	6	1570037	1570042	50 %	0 %	50 %	0 %	341582733
30064	NC_015865	TCCCC	2	10	1570044	1570053	0 %	20 %	0 %	80 %	341582733
30065	NC_015865	CGC	2	6	1570062	1570067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582733
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30072	NC_015865	CTTC	2	8	1570217	1570224	0 %	50 %	0 %	50 %	341582734
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30074	NC_015865	CCGG	2	8	1570258	1570265	0 %	0 %	50 %	50 %	341582734
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30098	NC_015865	GCCG	2	8	1571063	1571070	0 %	0 %	50 %	50 %	341582735
30099	NC_015865	GGC	2	6	1571083	1571088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582735
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30101	NC_015865	GA	3	6	1571112	1571117	50 %	0 %	50 %	0 %	341582735
30102	NC_015865	CAGC	2	8	1571125	1571132	25 %	0 %	25 %	50 %	341582735
30103	NC_015865	TCT	2	6	1571158	1571163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582735
30104	NC_015865	C	7	7	1571173	1571179	0 %	0 %	0 %	100 %	341582735
30105	NC_015865	CTC	2	6	1571207	1571212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582735
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30114	NC_015865	GAC	2	6	1571626	1571631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582736
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30233	NC_015865	CAT	2	6	1578473	1578478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582740
30234	NC_015865	CTC	2	6	1578516	1578521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582740
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30332	NC_015865	GAT	2	6	1585818	1585823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582750
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30338	NC_015865	TGA	2	6	1586154	1586159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582751
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30340	NC_015865	CT	3	6	1586187	1586192	0 %	50 %	0 %	50 %	341582751
30341	NC_015865	TCC	2	6	1586285	1586290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582751
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30344	NC_015865	CTC	2	6	1586449	1586454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582752
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