MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015865	GAA	3	9	136257	136265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581206
2502	NC_015865	ACC	2	6	136690	136695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581207
2503	NC_015865	T	6	6	136883	136888	0 %	100 %	0 %	0 %	341581207
2504	NC_015865	ATC	2	6	136901	136906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581207
2505	NC_015865	TCG	2	6	136937	136942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581207
2506	NC_015865	CTT	2	6	136960	136965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581207
2507	NC_015865	GAA	2	6	136993	136998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581207
2508	NC_015865	ACC	2	6	137060	137065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581207
2509	NC_015865	TGA	2	6	137206	137211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581207
2510	NC_015865	GAA	2	6	137242	137247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581207
2511	NC_015865	GAA	2	6	137260	137265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581207
2512	NC_015865	TGT	2	6	137316	137321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581207
2513	NC_015865	TTG	2	6	137345	137350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581207
2514	NC_015865	ATA	2	6	137402	137407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581207
2515	NC_015865	TG	3	6	138522	138527	0 %	50 %	50 %	0 %	341581208
2516	NC_015865	CA	3	6	138550	138555	50 %	0 %	0 %	50 %	341581208
2517	NC_015865	ACGGAA	2	12	138566	138577	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	341581208
2518	NC_015865	GCCG	2	8	138582	138589	0 %	0 %	50 %	50 %	341581208
2519	NC_015865	CA	3	6	138616	138621	50 %	0 %	0 %	50 %	341581208
2520	NC_015865	CGT	2	6	138642	138647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581208
2521	NC_015865	CACCC	2	10	138665	138674	20 %	0 %	0 %	80 %	341581208
2522	NC_015865	CA	3	6	138682	138687	50 %	0 %	0 %	50 %	341581208
2523	NC_015865	GTA	2	6	140653	140658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581209
2524	NC_015865	C	6	6	140741	140746	0 %	0 %	0 %	100 %	341581209
2525	NC_015865	CTGC	2	8	140801	140808	0 %	25 %	25 %	50 %	341581209
2526	NC_015865	CTT	2	6	140857	140862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581209
2527	NC_015865	TCG	2	6	140886	140891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581209
2528	NC_015865	CCG	2	6	141023	141028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581209
2529	NC_015865	CAT	2	6	141034	141039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581209
2530	NC_015865	GC	3	6	141081	141086	0 %	0 %	50 %	50 %	341581209
2531	NC_015865	GA	3	6	141103	141108	50 %	0 %	50 %	0 %	341581209
2532	NC_015865	TGG	2	6	141131	141136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581209
2533	NC_015865	GAA	2	6	141166	141171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581209
2534	NC_015865	CGC	2	6	141201	141206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581209
2535	NC_015865	CGT	2	6	141300	141305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581209
2536	NC_015865	GGA	2	6	141381	141386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581209
2537	NC_015865	CTC	2	6	141388	141393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581209
2538	NC_015865	GA	3	6	141432	141437	50 %	0 %	50 %	0 %	341581209
2539	NC_015865	TC	3	6	141513	141518	0 %	50 %	0 %	50 %	341581209
2540	NC_015865	TC	4	8	141837	141844	0 %	50 %	0 %	50 %	341581210
2541	NC_015865	ATA	2	6	141855	141860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581210
2542	NC_015865	CGA	2	6	141863	141868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581210
2543	NC_015865	GGA	2	6	141887	141892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581210
2544	NC_015865	CGC	2	6	142115	142120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581210
2545	NC_015865	ACA	2	6	142177	142182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581210
2546	NC_015865	GAA	2	6	142187	142192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581210
2547	NC_015865	AGG	2	6	142231	142236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581210
2548	NC_015865	TGA	2	6	142252	142257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581210
2549	NC_015865	AACTTC	2	12	142266	142277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581210
2550	NC_015865	ACG	2	6	142546	142551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581211
2551	NC_015865	CGA	2	6	142571	142576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581211
2552	NC_015865	CTG	2	6	142589	142594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581211
2553	NC_015865	GAGCCA	2	12	142610	142621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581211
2554	NC_015865	ACA	2	6	142636	142641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581211
2555	NC_015865	CCGG	2	8	142716	142723	0 %	0 %	50 %	50 %	341581211
2556	NC_015865	GCC	2	6	142749	142754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581211
2557	NC_015865	GAA	2	6	142836	142841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581211
2558	NC_015865	TTC	2	6	142891	142896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581212
2559	NC_015865	T	6	6	142906	142911	0 %	100 %	0 %	0 %	341581212
2560	NC_015865	AAGG	2	8	142960	142967	50 %	0 %	50 %	0 %	341581212
2561	NC_015865	GCTG	2	8	142994	143001	0 %	25 %	50 %	25 %	341581212
2562	NC_015865	CGA	2	6	143085	143090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581212
2563	NC_015865	GAA	2	6	143161	143166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581212
2564	NC_015865	GGC	2	6	143242	143247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581212
2565	NC_015865	GAG	2	6	143263	143268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581212
2566	NC_015865	ACGG	2	8	143280	143287	25 %	0 %	50 %	25 %	341581212
2567	NC_015865	TGA	2	6	143306	143311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581212
2568	NC_015865	GGAG	2	8	143316	143323	25 %	0 %	75 %	0 %	341581212
2569	NC_015865	CAA	2	6	143337	143342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581212
2570	NC_015865	CAG	2	6	143364	143369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581212
2571	NC_015865	GGA	2	6	143431	143436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581212
2572	NC_015865	GAT	2	6	143514	143519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581212
2573	NC_015865	TAC	2	6	143539	143544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581212
2574	NC_015865	ATG	2	6	143584	143589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581212
2575	NC_015865	ACG	2	6	143630	143635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581212
2576	NC_015865	CTT	2	6	143658	143663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581212
2577	NC_015865	CAA	2	6	143763	143768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581212
2578	NC_015865	GCC	2	6	143772	143777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581212
2579	NC_015865	GAG	2	6	143824	143829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581212
2580	NC_015865	CGA	2	6	143835	143840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581212
2581	NC_015865	CGG	2	6	143855	143860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581212
2582	NC_015865	CGC	2	6	143880	143885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581212
2583	NC_015865	TGGAGG	2	12	143908	143919	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	341581212
2584	NC_015865	TCC	2	6	143932	143937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581213
2585	NC_015865	GCTCC	2	10	143945	143954	0 %	20 %	20 %	60 %	341581213
2586	NC_015865	TAC	2	6	144015	144020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581213
2587	NC_015865	CGG	2	6	144044	144049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581213
2588	NC_015865	GAG	2	6	144063	144068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581213
2589	NC_015865	ATA	2	6	144138	144143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581213
2590	NC_015865	CTC	2	6	144222	144227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581213
2591	NC_015865	GGC	2	6	144239	144244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581213
2592	NC_015865	CTCTTC	2	12	144255	144266	0 %	50 %	0 %	50 %	341581213
2593	NC_015865	TCT	2	6	144268	144273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581213
2594	NC_015865	TTC	2	6	144363	144368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581213
2595	NC_015865	GATAGC	2	12	144410	144421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341581213
2596	NC_015865	GAC	2	6	144488	144493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581213
2597	NC_015865	GGA	2	6	144514	144519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581213
2598	NC_015865	CCA	2	6	144544	144549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581213
2599	NC_015865	TTCGA	2	10	144551	144560	20 %	40 %	20 %	20 %	341581213
2600	NC_015865	CTC	2	6	144600	144605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581213
2601	NC_015865	CTC	3	9	144680	144688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581214
2602	NC_015865	GGGA	2	8	144776	144783	25 %	0 %	75 %	0 %	341581214
2603	NC_015865	TCC	2	6	144803	144808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581214
2604	NC_015865	AGA	2	6	144856	144861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581214
2605	NC_015865	CGG	2	6	144952	144957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581214
2606	NC_015865	ACGATA	2	12	144977	144988	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	341581214
2607	NC_015865	GTT	2	6	145048	145053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581214
2608	NC_015865	CGG	2	6	145054	145059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581214
2609	NC_015865	CGG	3	9	145209	145217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581215
2610	NC_015865	CTC	2	6	145279	145284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581215
2611	NC_015865	GAC	2	6	145362	145367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581215
2612	NC_015865	GCC	2	6	145432	145437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581215
2613	NC_015865	AGG	2	6	145468	145473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581215
2614	NC_015865	CTC	2	6	145485	145490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581215
2615	NC_015865	TGT	2	6	145542	145547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581215
2616	NC_015865	CAT	2	6	145605	145610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581215
2617	NC_015865	GGGCAG	2	12	145623	145634	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	341581215
2618	NC_015865	TCA	2	6	145697	145702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581215
2619	NC_015865	GCG	2	6	145703	145708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581215
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2621	NC_015865	ATT	2	6	145814	145819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581216
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2742	NC_015865	ACG	2	6	152958	152963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581229
2743	NC_015865	GGT	2	6	153116	153121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581229
2744	NC_015865	AAGG	2	8	153155	153162	50 %	0 %	50 %	0 %	341581229
2745	NC_015865	GTG	2	6	153194	153199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581229
2746	NC_015865	TCA	2	6	153313	153318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581229
2747	NC_015865	ATC	3	9	153380	153388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581229
2748	NC_015865	TCG	2	6	153414	153419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581229
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2752	NC_015865	CCCTT	2	10	153662	153671	0 %	40 %	0 %	60 %	341581230
2753	NC_015865	GCC	2	6	153807	153812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581230
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2755	NC_015865	GGA	2	6	153840	153845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581230
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2759	NC_015865	TGG	2	6	154149	154154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581231
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2764	NC_015865	GTC	2	6	154361	154366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581231
2765	NC_015865	CCGC	2	8	154395	154402	0 %	0 %	25 %	75 %	341581231
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2768	NC_015865	CAT	2	6	154471	154476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581231
2769	NC_015865	TCCT	2	8	154499	154506	0 %	50 %	0 %	50 %	341581231
2770	NC_015865	TGC	2	6	154524	154529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581231
2771	NC_015865	C	6	6	154529	154534	0 %	0 %	0 %	100 %	341581231
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2781	NC_015865	GCG	2	6	155283	155288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581232
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2832	NC_015865	GAC	2	6	158064	158069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581234
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2841	NC_015865	AAG	2	6	158560	158565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581236
2842	NC_015865	GATTCT	2	12	158598	158609	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341581236
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2849	NC_015865	CAT	2	6	158871	158876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581236
2850	NC_015865	GAG	2	6	158932	158937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581236
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2852	NC_015865	AGA	2	6	159200	159205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581236
2853	NC_015865	ACCT	2	8	159217	159224	25 %	25 %	0 %	50 %	341581236
2854	NC_015865	CAGG	2	8	159246	159253	25 %	0 %	50 %	25 %	341581236
2855	NC_015865	GGC	2	6	159294	159299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581236
2856	NC_015865	GTC	2	6	159451	159456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581236
2857	NC_015865	GAA	2	6	159480	159485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581236
2858	NC_015865	TCA	2	6	159494	159499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581236
2859	NC_015865	AG	3	6	159505	159510	50 %	0 %	50 %	0 %	341581236
2860	NC_015865	GGT	2	6	159537	159542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581236
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2862	NC_015865	CGC	3	9	159639	159647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581236
2863	NC_015865	ACC	2	6	159665	159670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581236
2864	NC_015865	GA	3	6	159691	159696	50 %	0 %	50 %	0 %	341581236
2865	NC_015865	TCA	2	6	159770	159775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581236
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2868	NC_015865	AGG	2	6	159851	159856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581236
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2870	NC_015865	GGATA	2	10	159927	159936	40 %	20 %	40 %	0 %	341581236
2871	NC_015865	GAGG	2	8	159948	159955	25 %	0 %	75 %	0 %	341581236
2872	NC_015865	GAG	2	6	160036	160041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581236
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2883	NC_015865	TCG	2	6	160715	160720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581237
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2967	NC_015865	CTT	2	6	165426	165431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581244
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2972	NC_015865	GTT	2	6	165549	165554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581244
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2975	NC_015865	CGA	2	6	165689	165694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581244
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2978	NC_015865	CTC	2	6	165891	165896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581244
2979	NC_015865	GAAC	2	8	165965	165972	50 %	0 %	25 %	25 %	341581244
2980	NC_015865	AGT	2	6	165992	165997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581244
2981	NC_015865	GTGG	2	8	166017	166024	0 %	25 %	75 %	0 %	341581244
2982	NC_015865	ATC	2	6	166561	166566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581245
2983	NC_015865	TG	3	6	166570	166575	0 %	50 %	50 %	0 %	341581245
2984	NC_015865	GAG	2	6	166617	166622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581245
2985	NC_015865	CCT	2	6	166820	166825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581245
2986	NC_015865	GAG	2	6	166872	166877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581245
2987	NC_015865	GGT	2	6	166943	166948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581245
2988	NC_015865	TC	3	6	166971	166976	0 %	50 %	0 %	50 %	341581245
2989	NC_015865	CTC	2	6	167077	167082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581245
2990	NC_015865	AGGC	2	8	167097	167104	25 %	0 %	50 %	25 %	341581245
2991	NC_015865	TA	3	6	167123	167128	50 %	50 %	0 %	0 %	341581245
2992	NC_015865	TTC	2	6	167469	167474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581245
2993	NC_015865	TCG	2	6	167506	167511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581245
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2996	NC_015865	GAC	2	6	167619	167624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581245
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2998	NC_015865	CTC	2	6	167733	167738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581245
2999	NC_015865	CCT	2	6	167780	167785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581245
3000	NC_015865	CTT	2	6	167940	167945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581245

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