MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_015865	AAG	2	6	1516368	1516373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582673
29003	NC_015865	GAG	2	6	1516388	1516393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582673
29004	NC_015865	CA	3	6	1516395	1516400	50 %	0 %	0 %	50 %	341582673
29005	NC_015865	AGG	2	6	1516407	1516412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582673
29006	NC_015865	GGGAGT	2	12	1516492	1516503	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	341582673
29007	NC_015865	GAG	3	9	1516545	1516553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582673
29008	NC_015865	CTC	2	6	1516572	1516577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582673
29009	NC_015865	CGA	2	6	1516628	1516633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582673
29010	NC_015865	GGGAA	2	10	1516673	1516682	40 %	0 %	60 %	0 %	341582673
29011	NC_015865	CAC	2	6	1516709	1516714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582673
29012	NC_015865	AGG	2	6	1516777	1516782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582673
29013	NC_015865	GGCGCC	2	12	1516836	1516847	0 %	0 %	50 %	50 %	341582673
29014	NC_015865	CAG	2	6	1516917	1516922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582673
29015	NC_015865	TG	3	6	1517001	1517006	0 %	50 %	50 %	0 %	341582673
29016	NC_015865	GAC	2	6	1517079	1517084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582673
29017	NC_015865	GGAGA	2	10	1517142	1517151	40 %	0 %	60 %	0 %	341582673
29018	NC_015865	TCC	2	6	1517244	1517249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582674
29019	NC_015865	CGT	2	6	1517305	1517310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582674
29020	NC_015865	CGG	2	6	1517328	1517333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582674
29021	NC_015865	ACC	2	6	1517351	1517356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582674
29022	NC_015865	GCG	2	6	1517373	1517378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582674
29023	NC_015865	CTGC	2	8	1517391	1517398	0 %	25 %	25 %	50 %	341582674
29024	NC_015865	GGT	2	6	1517467	1517472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582674
29025	NC_015865	CTA	2	6	1517491	1517496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582674
29026	NC_015865	GAAC	2	8	1517644	1517651	50 %	0 %	25 %	25 %	341582674
29027	NC_015865	GAGG	2	8	1517701	1517708	25 %	0 %	75 %	0 %	341582674
29028	NC_015865	GTT	2	6	1517741	1517746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582674
29029	NC_015865	G	6	6	1517822	1517827	0 %	0 %	100 %	0 %	341582674
29030	NC_015865	GGA	2	6	1517896	1517901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582674
29031	NC_015865	C	6	6	1517951	1517956	0 %	0 %	0 %	100 %	341582674
29032	NC_015865	CAT	2	6	1517959	1517964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582674
29033	NC_015865	ACT	2	6	1517967	1517972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582674
29034	NC_015865	GCG	2	6	1518188	1518193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582674
29035	NC_015865	TTC	2	6	1518227	1518232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582674
29036	NC_015865	CGG	2	6	1518239	1518244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582674
29037	NC_015865	AG	3	6	1518300	1518305	50 %	0 %	50 %	0 %	341582675
29038	NC_015865	GAT	2	6	1518355	1518360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582675
29039	NC_015865	CAC	2	6	1518598	1518603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582676
29040	NC_015865	CTC	2	6	1518604	1518609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582676
29041	NC_015865	TCA	2	6	1518621	1518626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582676
29042	NC_015865	ACG	2	6	1518647	1518652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582676
29043	NC_015865	ACC	3	9	1518695	1518703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582676
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29045	NC_015865	CCTC	2	8	1518927	1518934	0 %	25 %	0 %	75 %	341582676
29046	NC_015865	CGG	2	6	1518997	1519002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582676
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29050	NC_015865	CCA	2	6	1519253	1519258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582677
29051	NC_015865	GCC	2	6	1519267	1519272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582677
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29053	NC_015865	TCG	2	6	1519507	1519512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582677
29054	NC_015865	GAT	2	6	1519551	1519556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582677
29055	NC_015865	TTC	2	6	1519603	1519608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582677
29056	NC_015865	CGC	2	6	1519763	1519768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582678
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29059	NC_015865	CGT	2	6	1519816	1519821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582678
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29105	NC_015865	TGA	2	6	1522279	1522284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582680
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29233	NC_015865	GCA	2	6	1529191	1529196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582687
29234	NC_015865	TGC	2	6	1529233	1529238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582687
29235	NC_015865	TCA	2	6	1529370	1529375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582688
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29342	NC_015865	G	6	6	1534784	1534789	0 %	0 %	100 %	0 %	341582696
29343	NC_015865	GCC	2	6	1534800	1534805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582696
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29345	NC_015865	GCC	2	6	1534900	1534905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582696
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29493	NC_015865	GGCCG	2	10	1541298	1541307	0 %	0 %	60 %	40 %	341582703
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