MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_015865	GGA	2	6	1463935	1463940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582622
28003	NC_015865	CGA	2	6	1463958	1463963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582622
28004	NC_015865	GGT	2	6	1463970	1463975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582622
28005	NC_015865	CAG	2	6	1464007	1464012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582622
28006	NC_015865	CTC	2	6	1464064	1464069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582622
28007	NC_015865	CTC	2	6	1464151	1464156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582622
28008	NC_015865	CTCC	2	8	1464165	1464172	0 %	25 %	0 %	75 %	341582622
28009	NC_015865	GCA	2	6	1464200	1464205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582622
28010	NC_015865	GTC	2	6	1464280	1464285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582622
28011	NC_015865	CGG	2	6	1464423	1464428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582622
28012	NC_015865	C	6	6	1464547	1464552	0 %	0 %	0 %	100 %	341582622
28013	NC_015865	GGA	2	6	1464553	1464558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582622
28014	NC_015865	ACG	2	6	1464674	1464679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582622
28015	NC_015865	CG	3	6	1464707	1464712	0 %	0 %	50 %	50 %	341582622
28016	NC_015865	CCT	2	6	1464714	1464719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582622
28017	NC_015865	ACG	2	6	1464767	1464772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582622
28018	NC_015865	GGT	2	6	1464786	1464791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582622
28019	NC_015865	CGT	2	6	1464801	1464806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582622
28020	NC_015865	CGG	2	6	1464818	1464823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582622
28021	NC_015865	CCT	2	6	1464855	1464860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582622
28022	NC_015865	GAC	2	6	1464864	1464869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582622
28023	NC_015865	CGA	2	6	1464933	1464938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582622
28024	NC_015865	GAGGT	2	10	1465081	1465090	20 %	20 %	60 %	0 %	341582622
28025	NC_015865	TGG	2	6	1465204	1465209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582623
28026	NC_015865	CTT	2	6	1465253	1465258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582623
28027	NC_015865	CGA	2	6	1465325	1465330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582623
28028	NC_015865	TCC	2	6	1465342	1465347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582623
28029	NC_015865	CCT	3	9	1465367	1465375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582623
28030	NC_015865	TGC	2	6	1465471	1465476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582623
28031	NC_015865	TGG	2	6	1465519	1465524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582623
28032	NC_015865	TTCATG	2	12	1465536	1465547	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341582623
28033	NC_015865	AAGG	2	8	1465560	1465567	50 %	0 %	50 %	0 %	341582623
28034	NC_015865	CGG	2	6	1465622	1465627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582623
28035	NC_015865	TTC	2	6	1465638	1465643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582623
28036	NC_015865	CGA	3	9	1465690	1465698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582623
28037	NC_015865	CTT	2	6	1465733	1465738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582623
28038	NC_015865	CCG	2	6	1465776	1465781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582623
28039	NC_015865	CGA	2	6	1465799	1465804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582623
28040	NC_015865	ACA	2	6	1465825	1465830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582623
28041	NC_015865	CGG	2	6	1465847	1465852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582623
28042	NC_015865	GGA	2	6	1465860	1465865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582623
28043	NC_015865	CGG	2	6	1465895	1465900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582623
28044	NC_015865	TCA	2	6	1465954	1465959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582623
28045	NC_015865	CTA	2	6	1465985	1465990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582623
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28048	NC_015865	CGT	2	6	1466186	1466191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582623
28049	NC_015865	AAG	2	6	1466199	1466204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582623
28050	NC_015865	TGG	2	6	1466230	1466235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582623
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28052	NC_015865	ATG	2	6	1466301	1466306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582623
28053	NC_015865	GCA	2	6	1466307	1466312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582623
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28059	NC_015865	CGC	2	6	1466477	1466482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582624
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28061	NC_015865	GCC	3	9	1466532	1466540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582624
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28068	NC_015865	GAG	3	9	1466877	1466885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582624
28069	NC_015865	GGA	3	9	1466939	1466947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582624
28070	NC_015865	TCG	2	6	1466962	1466967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582624
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28085	NC_015865	CGT	2	6	1467539	1467544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582624
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28088	NC_015865	CTGGC	2	10	1467690	1467699	0 %	20 %	40 %	40 %	341582624
28089	NC_015865	ATA	2	6	1467705	1467710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582624
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28094	NC_015865	TC	3	6	1467832	1467837	0 %	50 %	0 %	50 %	341582625
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28104	NC_015865	TCG	2	6	1468399	1468404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582625
28105	NC_015865	TCG	2	6	1468411	1468416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582625
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28112	NC_015865	CT	3	6	1468869	1468874	0 %	50 %	0 %	50 %	341582626
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28231	NC_015865	TGA	2	6	1475300	1475305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582633
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28344	NC_015865	T	6	6	1482503	1482508	0 %	100 %	0 %	0 %	341582638
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28465	NC_015865	GAGG	2	8	1488662	1488669	25 %	0 %	75 %	0 %	341582640
28466	NC_015865	GAG	2	6	1488701	1488706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582640
28467	NC_015865	GAGC	2	8	1488841	1488848	25 %	0 %	50 %	25 %	341582641
28468	NC_015865	GTT	2	6	1488899	1488904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582641
28469	NC_015865	GC	3	6	1488919	1488924	0 %	0 %	50 %	50 %	341582641
28470	NC_015865	CCT	2	6	1488946	1488951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582641
28471	NC_015865	GCCG	2	8	1488967	1488974	0 %	0 %	50 %	50 %	341582641
28472	NC_015865	GCC	2	6	1488980	1488985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582641
28473	NC_015865	GAG	2	6	1489004	1489009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582641
28474	NC_015865	ATC	2	6	1489049	1489054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582641
28475	NC_015865	CTC	2	6	1489187	1489192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582642
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28478	NC_015865	TTA	2	6	1489378	1489383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582642
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28480	NC_015865	GGC	2	6	1489412	1489417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582642
28481	NC_015865	CGG	2	6	1489427	1489432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582642
28482	NC_015865	CGA	2	6	1489499	1489504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582642
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28484	NC_015865	GTC	2	6	1489568	1489573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582642
28485	NC_015865	TGA	2	6	1489594	1489599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582642
28486	NC_015865	CCT	2	6	1489613	1489618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582642
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28489	NC_015865	TCAA	2	8	1489740	1489747	50 %	25 %	0 %	25 %	341582643
28490	NC_015865	AG	3	6	1489771	1489776	50 %	0 %	50 %	0 %	341582643
28491	NC_015865	TTG	2	6	1489782	1489787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582643
28492	NC_015865	TCT	2	6	1490009	1490014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582644
28493	NC_015865	CT	3	6	1490018	1490023	0 %	50 %	0 %	50 %	341582644
28494	NC_015865	TCC	2	6	1490029	1490034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582644
28495	NC_015865	CCT	2	6	1490054	1490059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582644
28496	NC_015865	ATC	2	6	1490167	1490172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582644
28497	NC_015865	CCG	2	6	1490280	1490285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582645
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28500	NC_015865	ACG	2	6	1490490	1490495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582645

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