MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_015865	GCC	2	6	1415307	1415312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582556
27003	NC_015865	CCA	2	6	1415437	1415442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582556
27004	NC_015865	CGG	2	6	1415462	1415467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582556
27005	NC_015865	ACC	2	6	1415490	1415495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582556
27006	NC_015865	GAG	2	6	1415549	1415554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582556
27007	NC_015865	GTA	2	6	1415624	1415629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582556
27008	NC_015865	AGGC	2	8	1415649	1415656	25 %	0 %	50 %	25 %	341582556
27009	NC_015865	GCC	2	6	1415688	1415693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582556
27010	NC_015865	AGG	2	6	1415700	1415705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582556
27011	NC_015865	CTC	3	9	1415858	1415866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582557
27012	NC_015865	CTC	2	6	1415904	1415909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582557
27013	NC_015865	TC	3	6	1415980	1415985	0 %	50 %	0 %	50 %	341582557
27014	NC_015865	GAC	2	6	1415999	1416004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582557
27015	NC_015865	GAG	2	6	1416080	1416085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582557
27016	NC_015865	GGC	2	6	1416095	1416100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582557
27017	NC_015865	CCTT	2	8	1416115	1416122	0 %	50 %	0 %	50 %	341582557
27018	NC_015865	GTC	2	6	1416149	1416154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582557
27019	NC_015865	TCC	2	6	1416213	1416218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582557
27020	NC_015865	GAC	2	6	1416314	1416319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582557
27021	NC_015865	CTTGTC	2	12	1416323	1416334	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	341582557
27022	NC_015865	GAA	2	6	1416341	1416346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582557
27023	NC_015865	CTCG	2	8	1416347	1416354	0 %	25 %	25 %	50 %	341582557
27024	NC_015865	TCG	2	6	1416381	1416386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582557
27025	NC_015865	CCT	2	6	1416403	1416408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582557
27026	NC_015865	TGA	2	6	1416418	1416423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582557
27027	NC_015865	CTTC	2	8	1416445	1416452	0 %	50 %	0 %	50 %	341582557
27028	NC_015865	CGG	2	6	1416455	1416460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582557
27029	NC_015865	GCC	2	6	1416467	1416472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582557
27030	NC_015865	CTT	2	6	1416521	1416526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582557
27031	NC_015865	ATG	2	6	1416555	1416560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582557
27032	NC_015865	CCCT	2	8	1416561	1416568	0 %	25 %	0 %	75 %	341582557
27033	NC_015865	CGC	2	6	1416634	1416639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582557
27034	NC_015865	TGA	2	6	1416643	1416648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582557
27035	NC_015865	CCG	2	6	1416687	1416692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582557
27036	NC_015865	TCGAGC	2	12	1416801	1416812	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341582557
27037	NC_015865	TTG	2	6	1416876	1416881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582557
27038	NC_015865	CCG	2	6	1416927	1416932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582557
27039	NC_015865	GACCTC	2	12	1417013	1417024	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341582557
27040	NC_015865	CTG	2	6	1417041	1417046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582557
27041	NC_015865	CGA	2	6	1417063	1417068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582557
27042	NC_015865	TCC	2	6	1417237	1417242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582558
27043	NC_015865	GTT	2	6	1417263	1417268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582558
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27047	NC_015865	GGA	2	6	1417538	1417543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582558
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27049	NC_015865	AGG	2	6	1417708	1417713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582558
27050	NC_015865	TG	3	6	1417782	1417787	0 %	50 %	50 %	0 %	341582558
27051	NC_015865	GGC	2	6	1417788	1417793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582558
27052	NC_015865	CGG	2	6	1417930	1417935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582558
27053	NC_015865	CTC	2	6	1418235	1418240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582558
27054	NC_015865	AG	3	6	1418256	1418261	50 %	0 %	50 %	0 %	341582558
27055	NC_015865	ACTA	2	8	1418309	1418316	50 %	25 %	0 %	25 %	341582558
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27057	NC_015865	CTG	2	6	1418391	1418396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582558
27058	NC_015865	GCTG	2	8	1418402	1418409	0 %	25 %	50 %	25 %	341582558
27059	NC_015865	GAG	3	9	1418417	1418425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582558
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27070	NC_015865	GTC	2	6	1419290	1419295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582560
27071	NC_015865	TCA	2	6	1419330	1419335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582560
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27084	NC_015865	CGT	2	6	1419777	1419782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582561
27085	NC_015865	GC	3	6	1419813	1419818	0 %	0 %	50 %	50 %	341582561
27086	NC_015865	AGG	2	6	1419823	1419828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582561
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27116	NC_015865	CTT	2	6	1421166	1421171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582563
27117	NC_015865	GAA	2	6	1421181	1421186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582563
27118	NC_015865	TTC	2	6	1421188	1421193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582563
27119	NC_015865	GAC	2	6	1421199	1421204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582563
27120	NC_015865	GCC	2	6	1421208	1421213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582563
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27123	NC_015865	GAA	2	6	1421400	1421405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582563
27124	NC_015865	CTG	2	6	1421412	1421417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582563
27125	NC_015865	CTTC	2	8	1421493	1421500	0 %	50 %	0 %	50 %	341582563
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27139	NC_015865	TCG	2	6	1422253	1422258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582564
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27219	NC_015865	GC	3	6	1426115	1426120	0 %	0 %	50 %	50 %	341582568
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27227	NC_015865	G	6	6	1426442	1426447	0 %	0 %	100 %	0 %	341582569
27228	NC_015865	GA	3	6	1426449	1426454	50 %	0 %	50 %	0 %	341582569
27229	NC_015865	GTT	3	9	1426467	1426475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582569
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