MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_015865	TCA	2	6	1390169	1390174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582531
26502	NC_015865	CGG	2	6	1390182	1390187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582531
26503	NC_015865	GAG	2	6	1390249	1390254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582531
26504	NC_015865	TTCC	2	8	1390276	1390283	0 %	50 %	0 %	50 %	341582531
26505	NC_015865	GTC	2	6	1390360	1390365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582531
26506	NC_015865	CGA	2	6	1390371	1390376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582531
26507	NC_015865	CTC	2	6	1390390	1390395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582531
26508	NC_015865	GCC	2	6	1390407	1390412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582531
26509	NC_015865	GCT	2	6	1390521	1390526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582531
26510	NC_015865	GCC	2	6	1390567	1390572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582531
26511	NC_015865	GAT	2	6	1390709	1390714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582532
26512	NC_015865	CA	3	6	1390740	1390745	50 %	0 %	0 %	50 %	341582532
26513	NC_015865	ACG	2	6	1390803	1390808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582532
26514	NC_015865	G	6	6	1390814	1390819	0 %	0 %	100 %	0 %	341582532
26515	NC_015865	AGG	2	6	1390831	1390836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582532
26516	NC_015865	CGG	2	6	1390837	1390842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582532
26517	NC_015865	CAT	2	6	1390845	1390850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582532
26518	NC_015865	CTC	2	6	1390857	1390862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582532
26519	NC_015865	GACGTT	2	12	1390911	1390922	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341582532
26520	NC_015865	CGT	2	6	1390964	1390969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582532
26521	NC_015865	GCG	2	6	1391095	1391100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582532
26522	NC_015865	GGC	2	6	1391127	1391132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582532
26523	NC_015865	CATAGG	2	12	1391162	1391173	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341582532
26524	NC_015865	TTCC	2	8	1391375	1391382	0 %	50 %	0 %	50 %	341582532
26525	NC_015865	GTC	2	6	1391451	1391456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582532
26526	NC_015865	TCG	2	6	1391458	1391463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582532
26527	NC_015865	GCG	2	6	1391464	1391469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582532
26528	NC_015865	CAA	2	6	1391477	1391482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582532
26529	NC_015865	TGA	2	6	1391506	1391511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582532
26530	NC_015865	CTT	2	6	1391531	1391536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582532
26531	NC_015865	TCC	2	6	1391540	1391545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582532
26532	NC_015865	GAT	2	6	1391573	1391578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582532
26533	NC_015865	G	7	7	1391607	1391613	0 %	0 %	100 %	0 %	341582532
26534	NC_015865	GGA	2	6	1391627	1391632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582532
26535	NC_015865	GTA	2	6	1391673	1391678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582532
26536	NC_015865	TGT	2	6	1391716	1391721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582533
26537	NC_015865	TCC	2	6	1391724	1391729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582533
26538	NC_015865	AGG	2	6	1391762	1391767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582533
26539	NC_015865	TGG	2	6	1391856	1391861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582533
26540	NC_015865	TCT	2	6	1391916	1391921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582533
26541	NC_015865	AGC	2	6	1391960	1391965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582533
26542	NC_015865	GAG	2	6	1391971	1391976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582533
26543	NC_015865	GGAGG	2	10	1391996	1392005	20 %	0 %	80 %	0 %	341582533
26544	NC_015865	CGG	2	6	1392025	1392030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582533
26545	NC_015865	GGA	2	6	1392166	1392171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582533
26546	NC_015865	CGA	2	6	1392183	1392188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582533
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26548	NC_015865	GCG	2	6	1392231	1392236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582533
26549	NC_015865	CTG	2	6	1392353	1392358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582533
26550	NC_015865	GAA	2	6	1392380	1392385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582533
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26552	NC_015865	TCC	2	6	1392512	1392517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582534
26553	NC_015865	AGGT	2	8	1392556	1392563	25 %	25 %	50 %	0 %	341582534
26554	NC_015865	TAT	2	6	1392588	1392593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582534
26555	NC_015865	CTCC	2	8	1392594	1392601	0 %	25 %	0 %	75 %	341582534
26556	NC_015865	ATC	2	6	1392646	1392651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582534
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26559	NC_015865	GTA	2	6	1392816	1392821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582534
26560	NC_015865	AGGT	2	8	1392904	1392911	25 %	25 %	50 %	0 %	341582534
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26575	NC_015865	GTA	2	6	1393628	1393633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582535
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26582	NC_015865	CAT	2	6	1394006	1394011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582535
26583	NC_015865	CT	3	6	1394047	1394052	0 %	50 %	0 %	50 %	341582535
26584	NC_015865	GTA	2	6	1394060	1394065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582535
26585	NC_015865	TGT	2	6	1394107	1394112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582535
26586	NC_015865	GAA	2	6	1394114	1394119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582535
26587	NC_015865	CGA	2	6	1394125	1394130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582535
26588	NC_015865	GAG	2	6	1394180	1394185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582535
26589	NC_015865	CAGCG	2	10	1394193	1394202	20 %	0 %	40 %	40 %	341582535
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26593	NC_015865	CTATGA	2	12	1394317	1394328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341582535
26594	NC_015865	A	7	7	1394340	1394346	100 %	0 %	0 %	0 %	341582535
26595	NC_015865	T	6	6	1394351	1394356	0 %	100 %	0 %	0 %	341582535
26596	NC_015865	ATG	2	6	1394364	1394369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582535
26597	NC_015865	GTC	2	6	1394413	1394418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582536
26598	NC_015865	CAG	2	6	1394521	1394526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582536
26599	NC_015865	TAT	2	6	1394593	1394598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582536
26600	NC_015865	CGA	3	9	1394631	1394639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582536
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26602	NC_015865	GAC	2	6	1394653	1394658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582536
26603	NC_015865	GAG	2	6	1394668	1394673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582536
26604	NC_015865	TGA	2	6	1394694	1394699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582536
26605	NC_015865	GGAGC	2	10	1394710	1394719	20 %	0 %	60 %	20 %	341582536
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26610	NC_015865	TCT	3	9	1394919	1394927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582536
26611	NC_015865	TTA	2	6	1394958	1394963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582536
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